Modélisation en biologie systémique

Modélisation en biologie
systémique
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TIMC-IMAG
2013

Plan du cours
•Introduction : Biologie systémique, modélisation, ...
•Systèmes dynamiques, bifurcations,
cycle
cellulaire
• Abstractions discrètes, réseaux génétiques
•Modèles stochastiques,
phage λ
•... ?

Cours 1 : Introduction
•Partie 1 : rappels de bio, mécanismes
fondamentaux
•Partie 2 : vers la complexité...
•Réseaux, etc...
•Partie 3 :
•Biologie systémique
•Complexité, réductionnisme...
•Pourquoi modéliser...? Quels formalismes ?

Les processus cellulaires
fondamentaux
Universels :
•Réplication de l’ADN
•Expression des gènes
•transcription
•traduction
•Certaines parties du métabolisme

Qu'est-ce qu'un gène"?
•"Genes are instruction manuals for our bodies. They are the
directions for building all the proteins that make our bodies
function"
http://learn.genetics.utah.edu/content/begin/dna/tour_gene.html
•"A gene is the basic physical and functional unit of heredity.
Genes, which are made up of DNA, act as instructions to make
molecules called proteins."
http://ghr.nlm.nih.gov/handbook/basics/gene
•Gène;: facteur héréditaire, transmis de génération en
génération.
•Les gènes fixent le répertoire des protéines d'un individu