laboratoire de recherche des relations matrices

LABORATOIRE DE RECHERCHE DES RELATIONS MATRICES
EXTRACELLULAIRE-CELLULE (ERRMECE)
Présentation de l'équipe :
Regroupant des biochimistes, des biologistes cellulaires, des microbiologistes, des
biologistes moléculaires, des physico-chimistes, ERRMECE a fédéré ces diverses
compétences pour entreprendre un ensemble de recherches sur une thématique unique :
les interactions entre protéines et/ou cellules et leur régulation dans la cadre de
pathologies.
Les études sont menées à deux niveaux :
à des niveaux moléculaire et supramoléculaire sur la constitution et la dynamique
d'assemblage de la matrice extracellulaire,
au niveau cellulaire sur les interactions cellules - matrice ou cellules - cellules dans
l'angiogénèse tumorale ou l'infection bactérienne ainsi que sur la régulation génomique
de plusieurs pathologies.
Thèmes de recherche :
A l'échelle moléculaire, la plupart des recherches concernent les protéines de la matrice
extracellulaire. La fibronectine fait l'objet de plusieurs études car elle coexiste sous une
forme soluble et une forme insoluble assimilable à un gel dans la matrice extracellulaire.
Elle possède des affinités fortes pour d'autres protéines et pour elle -même et participe
donc à l'assemblage de la matrice, elle joue en outre un rôle majeur sur l'adhérence
cellulaire. Les travaux sur les interactions intramoléculaires concernent la structure, la
conformation et la dynamique de protéines de très haute masse moléculaire issues de la
matrice extracellulaire.
A l'échelle supramoléculaire, le laboratoire étudie par des approches de modélisation, de
physique, de physico - chimie ou de biochimie, la création, la dissociation et la dynamique
d'assemblages supramoléculaires avec un intérêt particulier sur les transitions de gel-sol
et sol-gel.
Mots clés : structure des protéines, dynamique conformationnelle, modélisation,
biophysique, lois d'échelle, protéines de la matrice extracellulaire, enzymologie,
transitions de phases.
Participants à la thématique : 6 enseignants chercheurs, un chercheur post doctoral, 4
étudiants de troisième cycle.
Principales collaborations :
48
thèses, publications et/ou contrats de recherche communs :
Dr F. Goubard : dpt chimie : FTIR,
Pr A Tabuteau, dpt chimie : fabrication de céramiques
Dr D. Lairez, CEA Saclay : diffusion de rayonnement,
Pr M. Djabourov : ESPCI : rhéologie, polarimétrie, microcalorimétrie,
Dr K. Anselme, IRRB, Université du Littoral, reprise osseuse
Pr S Qian, Académie des Sciences de Pékin : transglutaminase
Thèses récentes ou en cours :
Hugues Berry : gélification et catalyse enzymatique, 1999
Giulia Fadda : protéolyse enzymatique d'un gel , 2002 Laurent Poulouin : propriétés
d'un fragment de fibronectine , 2002
Salima Patel : états transitoires de la fibronectine , en cours
Sébastien Giraudier : remodelage enzymatique de gels de matrice extracellulaire, en
cours
Delphine Pellenc : structuration de protéines sur des modèles de matrice osseuse, en
cours.
La seconde thématique développée dans le laboratoire concerne le comportement
cellulaire soit en relation avec son environnement matriciel, soit en présence de cellules
hétérologues. Les études sont centrées autour de plusieurs pathologies.
L'une d'elles est le cancer ovarien où l'équipe étudie le remodelage de la matrice
extracellulaire impliqué dans la néoangiogénèse tumorale. Les transformations de la
matrice extracellulaire ainsi que la contribution des facteurs angiogéniques sur la
prolifération, l'adhérence et la migration des cellules endothéliales et/ou tumorales, en
culture ou en co-culture sont abordées.
Un autre travail concerne l'étude des mécanismes de la pathogénicité de Pseudomonas
aeruginosa, de Pseudomonas fluorescens et de Escherichia coli impliquées dans des
infections nosocomiales à travers les relations entre l'hôte et les bactéries : formation de
biofilms sur surfaces abiotiques et biologiques, interactions avec les surfaces des tissus
épithéliaux, facteurs de virulence, réponse immunitaire.
Le gène humain (Fic1) responsable de deux formes de cholestase intrahépatique
familiale a été identifié. Cette maladie génétique se caractérise par la diminution de la
sécrétion des acides biliaires. Les travaux concernent les bases moléculaires de la
sécrétion hépatique en relation avec l'expression, la fonction et la régulation du gène Fic1
.
Mots clés : A ngiogénèse, tumeur ovarienne, infections nosocomiales, pathogénicité
bactérienne, cholestase.
Participants à la thématique :
8 enseignants chercheurs , 3 chercheurs post doctoraux, un étudiant en thèse.
Collaborations :
Equipes du centre Anticancéreux François Baclesse de Caen
Laboratoire d'Imagerie Paramétrique ,Université Paris VI-CNRS UMR 7623
49
Pr Nicole Orange, IUT d'Evreux,
Dr Mark Blight, IGM, Université de Paris Sud
Pr. Arlette Darfeuille Michaud, Université de Clermont Ferrand
Pr. Chantal Housset, équipe INSERM à l'hôpital Saint-Antoine
Dr. Laura Bull Université de San Francisco USA
Dr. Gregory Fitz Université de Denver USA
Pr Francisco de Assis T+Rocha Neves, Universitéd e Brasilia, Brésil
Pr Robert Phillips, Université de Ahens, Georgie, USA
Thèse :
Julie REBIERE - HUET : adhérence bactérienne aux surfaces cellulaires, 2001
Johanne LEROY-DUDAL : interrelation tumeur ovarienne - environnement endothélial,
en cours
Publications récentes les plus significatives
BERRY, H. Nonequilibrium phase transition in a self-activated biological network, Phy.
Rev. E., in p ress.
LAIREZ, D., PAUTHE, E., PELTA, J. Refolding of a high molecular weight protein : salt
effect on collapse, Biophys. J., in press.
CARREIRAS F., B.THIEBOT, J. LEROY-DUDAL, S. MAUBANT, MF. BRETON and H.
DARBEIDA. Involvement of avb3 integrin and disruption of endothelial fibronectin network
during the adhesion of the human ovarian adenocarcinoma cell line IGROV1 on the
human umbilical vein cell extracellular matrix. International Journal of Cancer, 99, 6, 800808,2002
DI MARTINO, P., GAGNIERE, H., BERRY, H. and BRET, L. Antibitotic resistance and
virulence properties of Pseudomonas aeruginosa strains from ventilated patients with
pneumonia in intensive care units : comparison with imipenem resistant extra-respiratory
tract isolates from uninfected patients, Microbes Infect., 4, 613-620, 2002.
DI MARTINO P., MERIEAU A., ORANGE N., HULEN C. Relationship between
adhesion to A549 cells, to fibronectin and biofilm formation on polystyrene in Escherichia
coli. Canadian Journal of Microbiology 48, 132-137,2002
LARRETA GARDE, V. , BERRY, H. Modeling extracellular matrix degradation balance
with proteinase / transglutaminase cycle, J. Theor. Biol., 217, 105-124, 2002.
PAUTHE, E., PELTA, J., PATEL, S., LAIREZ, D., GOUBARD, F. Temperature induced
beta-aggregation of fibronectin. Biochim. Biophys. Acta, 1597, 12-21,.2002
NEVES F., CAVALIERI R., SIMEONI L., GARDNER D., BAXTER J., SCHARSCHMIDT,
LOMMRI N , RIBEIRO R., Thyroid hormone export capacity varies in primary cells and
appears to differ from the uptake mechanism, Endocrinology, 143, 476-483, 2002
Publications 1999-2002 : 45 communications dans des colloques nationaux et 40
internationaux
50
Thèses soutenues 1999-2002 : 4 doctorats, 1 HDR.
Statuts :
Type : EA du MJENR
Numéro : 1391
Effectifs :
5 Professeurs : Véronique Larreta-Garde, Jean-Marie Imhoff, Halima Darbeida,
Christian Hulen et Noureddine Lomri
10 Maîtres de conférences : H. Berry, M.-F. Breton, F. Carreiras, A. de Lima Pimenta,
P. Di Martino, O. Gallet, P. Luchetta, E. Pauthe, J. Pelta, B. Thiebot : 10
3 ATER
5 Doctorants
1 Post doctorant(+ 3 ATER)
1 technicien
1 secrétaire à mi-temps
Equipements :
Ultracentrifugeuse, rhéomètre, microscope inversé, poste de sécurité microbiologique,
Chromatographies liquide haute pression, purification et ana lyse de protéines,
spectrofluorimétrie, cultures de cellules procaryotes et eucaryotes, microscopie à
fluorescence, PCR, traitement d'images
Contact :
Responsable : Pr. Véronique Larreta-Garde
Université de Cergy-Pontoise
site de Saint-Martin
UFR de sciences et techniques - Département de Biologie
2, rue Adolphe Chauvin
? 01 34 25 66 05
? 01 34 25 65 52
Email : [email protected]
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