Analyse du risque d`émergence au Sénégal de l`Influenza Aviaire

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ANNEE : 2008
N
0
: 02
THESE
Présentée et soutenue publiquement le 05 Janvier 2008 à 12h00 devant la
Faculté de Médecine, de Pharmacie et d’Odonto-Stomatologie de Dakar
Pour obtenir le Grade de
DOCTEUR EN MEDECINE VETERINAIRE
(Diplôme d’Etat)
Par
Landry Ndriko MAYIGANE*
Né le 20 Août 1981 à Lubumbashi (RDC)
JURY
UIVERSITE CHEIKH ATA DIOP DE DAKAR
ECOLE ITER-ETATS DES SCIECES ET MEDECIE VETERIAIRES
(E.I.S.M.V.)
* contact
: [e-mail]
ANALYSE DU RISQUE D’EMERGENCE AU SENEGAL DE
L’INFLUENZA
AVIAIRE HAUTEMENT PATHOGENE
Président
:
M. Berna
rd Marcel DIOP
Professeur à la faculté de Médecine, de Pharmacie et d’Odonto-
Stomatologie de Dakar
Directeur et Rapporteur
de Thèse :
M. Justin Ayayi AKAKPO
Professeur à l’E.I.S.M.V. de Dakar
M. Yalacé Yamba KABORET
Professeur à l’E.I.S.M.V. de Dakar
Membres :
M. Serge Niangoran BAKOU
Maître de Conférences Agrégé à l’E.I.S.M.V. de Dakar
Co-directeur de Thèse : Dr Eric ETTER, DVM, PhD
UR16, Épidémiologie et Ecologie des Maladies Animales, CIRAD

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« …Le ciel était gris de nuages ; Il y volait des oies sauvages
Qui criaient la mort au passage… »
Louis Aragon, 1980
(Bierstube Magie allemande)

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Le Sénégal n’est pas à l’abri de l’Influenza Aviaire Hautement Pathogène vue
la part importante que jouent les importations de volailles domestiques et
produits dérivés dans l’aviculture nationale, l’importance des échanges
internes et la prééminence du Parc National des Oiseaux du Djoudj par
rapport à l’effectif d’oiseaux migrateurs qui y nichent chaque année pendant
l’hiver nordique.
Nous avons procédé à une analyse de risque en vue de connaître réellement le
niveau du risque d’introduction et de dissémination du virus H5N1 au Sénégal,
lié à l’importation légale et illégale de volailles et produits dérivés, et
l’avifaune au cours de l’année 2006.
Pour ce faire, une collecte de données ainsi que des entretiens avec des
experts ont été diligentés pour la construction des modèles événementiels.
Différents scénarii d’émergence de l’épizootie ont été proposés à partir des
modèles.
Nous avons distingué 30 et 60 scénarii possibles pour l’émergence de
l’épizootie liée à l’importation légale respectivement des poussins
reproducteurs et des œufs à couver et 30 autres dans le cas des
importations illégales
Nous avons par la suite procédé à la combinaison des probabilités
d’occurrence des événements constituant les scénarii pour l’estimation du
risque.
L’analyse qualitative effectuée a permis de caractériser la probabilité
d’émergence de l’influenza aviaire hautement pathogène comme variant de
nulle à faible dans le cas des importations légales des poussins d’un jour et
des œufs à couver et négligeable à modérée dans le cas des importations
illégales suivant les scénarii.
L’appréciation du risque lié à l’avifaune s’est limitée au risque de
dissémination du virus estimé comme élevée. Cela est du fait du niveau élevé
d’incertitude inhérente à l’introduction de l’épizootie par l’avifaune.
RESUME

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Le réseau national d’épidémiosurveillance des pathologies aviaires devra ainsi
être suffisamment renforcé pour une action rapide et efficace en cas de
foyer de grippe aviaire et une meilleure communication sur le risque devra
être envisagée pour permettre aux gestionnaires du risque et décideurs de
prendre des actions idoines.
Mots clés : Influenza Aviaire Hautement Pathogène, Analyse de risque,
volailles domestiques, Avifaune, Sénégal
Title :
EMERGENCE RISK ANALYSIS OF THE HIGHLY PATHOGENIC AVIAN
INFLUENZA IN SENEGAL
The threat of Avian Influenza in Africa is still present as the epizootic
continues to spread slowly within the west and central Africa.
Senegal is at risk of the epizootic emergence with regards to the importance
of the poultry industry and the Djoudj National Parc that host yearly a large
number of water birds for overwintering.
A qualitative risk assessment was carried out using the OIE methodology to
determine the risk associated with the legal imports of breeding chicks and
hatching eggs, the illegal imports of poultry products and the migration of
water birds during the year 2006.
30 and 60 scenarios were established for Avian Influenza emergence via
respectively the legal imports of breeding chicks and hatching eggs in
Senegal.
For the two legal products, 13,4 percents of the scenarios have a null to
negligible risk of occurrence, 53,3 percents negligible and 33,3 percents low.
On the other end, we had 30 scenarios associated with illegal imports of
poultry products, out of which 40 percents have a negligible risk of
occurrence, 30 percents low, 16,6 percents low to moderate and 13,4
percents moderate.
Due to the importance of uncertainty inherent to water birds in terms of
HPAI emergence, only the risk of virus dissemination was considered and
estimated as high.
Recommendations have been made concerning the risk communication and
management to the decision makers, stakeholders and farmers.
Keywords : Highly Pathogenic Avian Influenza, Risk analysis, poultry, Water
Birds, Senegal

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GLORY BE TO THEE GOD ALMIGHTY for thy unconditional love, favour
and grace bestowed on me. Take this moment as a token of my innermost
appreciation for thy omnipresent faithfulness to me
. Que toute louange et
gloire te reviennent Seigneur !
 A ma très chère mère Thérèse KARARA que j’appelle très
affectueusement « MERE NA BISSO » (Notre Maman), femme
combattante et entrepreneuse, tes bras de forteresse nous ont toujours
protégés des avatars de la vie depuis l’aube de la naissance, merci pour
tout le sacrifice que tu ne cesses de faire pour nous tes enfants !
 A mon très cher père Dénis NIZEYIMANA, Homme de principe : tu n’as
jamais cessé de croire en moi et de m’inculquer les vertus qui maintenant
animent ma vie, merci pour l’ESPRIT SALESIEN, merci pour ton sens
d’humour et tout le sacrifice, merci pour «
L’Homme n’est pas, l’Homme
est à faire
». Ce travail n’est que le fruit de ton investissement en moi.
 A mes parents Dénis et Thérèse, que le Seigneur Dieu vous prêtent encore
longue vie afin que vous puissiez manger aux fruits de l’arbre que vous
avez semé.
 A mon feu grand frère Narcisse MUTATEN, « AD MEMORIAM
AETERNAM », je te dédie très sincèrement ce travail !!! Tu vas toujours
nous manquer !!
 A mon petit frère, Patrick dit PATY : ne croises jamais les bras car le
meilleur reste à venir ! Du courage et bonne chance dans tes entreprises !
 A ma sœur Marlène, maman Megane, merci pour ta gentillesse et que Dieu
bénisse ta famille !!!
 A mes petites sœurs Aline, Diane, Joyce : je vous aime beaucoup.
Continuons ensemble à faire honneur à notre famille ! Joyce, merci pour
tes prières !
 A ma tante PASSI, maman Vicky, merci pour toutes les prières que tu as
dites pour moi !
DEDICACES