Quelle est la contribution des milieux semi

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$ÏLIVRÏPAR
$ISCIPLINEOUSPÏCIALITÏ
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4ITRE
%COLEDOCTORALE
5NITÏDERECHERCHE
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2APPORTEURS
LE
MEMBRESDUJURY:
Institut National Polytechnique de Toulouse (INP Toulouse)
Sciences Ecologiques, Vétérinaires, Agronomiques et Bioingénieries (SEVAB)
Quelle est la contribution des milieux semi͈naturels à la diversité et à la
répartition des assemblages de Carabidae circulants et hivernants
dans un paysage rural tempéré ?
j
eudi 9 juin 2011
Anthony ROUME
Ecologie, Biodiversité et Evolution
Sandrine PETIT, Directrice de recherche, INRA Dijon
Marc DUFRÊNE, Professeur, Université Libre de Bruxelles
Marc DECONCHAT, Directeur de recherche, INRA Toulouse
INRA Toulouse UMR 1201 INPT/ENSAT DYNAFOR
Sandrine PETIT, Directrice de recherche, INRA Dijon, Présidente du jury, rapporteur
Marc DUFRÊNE, Professeur, Université Libre de Bruxelles, rapporteur
Yannick DELETTRE, Chercheur, CNRS de Rennes, Examinateur
Christophe BOUGET, Ingénieur Chercheur, CEMAGREF Nogent, Examinateur
Annie OUIN, Maître de conférences, ENSAT Toulouse, Exmaninateur

Remerciements
Jevoudraistoutd’abordremerciertousceuxquim’ontrendupossibleetagréablecette
thèse.
JeremerciedoncenpremierlieuMarcDeconchatetGérardBalent,pourm’avoirdonné
machancealorsquejevenaisd’unautreunivers,celuidelabiologiecellulaireetdela
rechercheclinique.Ilsm’ontaccueillitrèschaleureusementetm’ontpermisdefairema
placedansl’unitéDynafor.MerciaussiàIoanNegrutiupoursonsoutienpendantcette
phasedetransition.
J’adresseencoremesremerciementsàMarcainsiqu’àAnnieOuin,pourm’avoiraidé
tout au long de ce travail. Merci donc de m’avoir guidé sur les sentiers parfois
incertains de l’écologie, en me laissant suffisamment de libertépourquejem’y
éprouve,etd’avoirfaitcelaavecbienveillance,sympathieethumour.
JenesauraispassersoussilencelacontributionmajeuredeLaurentRaisonàcetravail,
quecesoitsurleterrainoùnousavonsforméunbinômeefficaceetserein,ouaulabo
oùLaurentàlargementparticipéautrideséchantillonsrécoltésetàladétermination
des Carabidae qu’il m’a par ailleurs enseignée. Merci Laurent pour ton intense
implication, ta générosité, ta patience et ta sérénité efficace, ainsi que pour tous les
bons moments passés ensembles sur le terrain et la simplicité etlavaleurdenos
échanges.
J’exprime toute ma gratitude à Emmanuelle Dauffy‐Richard, Luc Barbaro, Jean‐Louis
HemptinneetRolandAllemandpouravoiracceptédefairepartieducomitédepilotage
decettethèse,pourleursobservationsetleursidéesconstructives.
JeremercietoutaussisincèrementSandrinePetitetMarcDufrêne,quiontacceptéla
lourdetâchederapporteurdecetravail,ainsiqueYannickDelettre,présidentdemon
jurydethèsepourunjour,etChristopheBouget,pouravoiracceptédefairepartiede
mon jury de thèse. Merci à eux tous pour leur disponibilité et leurs remarques
enrichissantes.MerciaussiàThierryTatoni,quin’apaspufairepartiedujurypourdes
raisonsconjoncturalesmaiss’estnéanmoinsinvestidanslalecturedemonmanuscrit.
Merci aux propriétaires forestiers et aux agriculteurs, d’une part pour avoir accepté
quenouséchantillonnionslafaunedansleursparcelles,d’autrepartpourleurintérêt
sincèrepournosrecherchesetnosrésultats.
MerciàGuillaumeDavidpoursaparticipationàunepartiedestravauxprésentésici,
durant son stage de Master 2, ainsi que pour sa curiosité entomologique, sa bonne
humeurconstitutiveetlaconnaissancequ’ilm’aapportéedetouteslessériestélévisées
quejen’auraiprobablementjamaisl’occasionderegarder.

Merciàtousceuxqui m’ontaidéponctuellementdanscetravail,notammentpourla
préparation de ma soutenance, ou pour les aspects plus logistiques:LaurentBurnel
(Bubu), Jérôme Willm, Aude Vialatte, Jean‐Pierre Sarthou, BrunoDumora,Marc
Fakorellis,MathildeRedon,Michel,FranceDecerleetValérieCalvo,etmerciàtousceux
quim’ontconseillélorsdelapréparationdemasoutenance.
Enfin,merciàceuxquiontrendulavietoulousaineagréable,festive et sportive.
Audrey,maco‐bureauàlacuriositéinsatiable,toujourspartantepoursortirdansles
endroitslesplusimprobables,mercidem’avoirextirpédemacoquille.Séb,mercipour
tacompagnieagréablelorsdenosrandosetsortiesvélo,tasimplicité et ton
authenticité,etboncouragepourlafindetathèse,j’espèrequetesvolatiles,pouillot
féroce et canard des arbres entre autres, te porteront chance. Will, toulousain dans
l’âmeadaptéàl’humiditéetaufroidlocaux,tessifflementsperpétuelsnesontmême
pasarrivésàmedécouragerdetesuivreàtraverslescolsjusqu’auxcimesenneigées
desPyrénées.Mercipourtoutcequetum’yafaitdécouvrir.Ons’yretrouveraencore.
Julie,onsecroisedanslebureaunoshorairessemblablesd’épicuriens.Jesuissûrque
çateréussiras,boncourage!Sylvie,mercipourtabonnehumeur et ton soutien
indéfectibledanslesmomentslesplusintensesduparcoursdedoctorant.Merciaussià
Camille,Emilie(bientôtfinidefairela baleine),Jean‐Phi(abonnésaumêmebanc de
poissons)etBubuducomitédesfêtes,Florent,(DJ)ArietCécile.
Aux soirées mémorables que nous avons passées entre amis, au refugeRussel,chez
AndréàVaychis,auGypaète,auxEspuguettes…!
Merci à mes amis lyonnais pour leur sympathie malgré la distance, Mumu, Benoît,
Angèle,HéloetCat.
Lacerisesurlecageot:merciàPistouzi,lesjoursdegrisailleteséclatsderireviennent
encoreréchauffermesoreillesendolories.LesdeuxannéesdetaprésenceàToulouse
ont été un véritable délice. Merci pour les discussions que nous avons eu et cette
débauched’humourquitecaractérise.
Merciàtousceuxquim’ontaidé.
Enfin,merciàmafamille,enparticuliermesparents,monfrère, mon grand‐père,
MichelJoëlle,FrançoiseetJosiane.Mercidevotreprésence.

Sommaire
Introduction
Premièrepartie. ContexteScientifiqueetcadreméthodologiquedel'étude
 Chapitre1. Desorganismesmobilesdansunemosaïquedemilieux
nonpermanents
 Chapitre2. Matérielsetméthodesgénéraux
Deuxièmepartie. Résultats
 Chapitre3. Assemblagesdecarabidésactifsdanslesdifférents
milieuxdupaysage
 Chapitre4. Effetsdelisièresurlesassemblagesdecarabidés
    circulantsàl'interfacebois‐milieuagricole 
 Chapitre5. Hivernationdescarabidésdanslesculturesetdifférents
    typesdemilieuxsemi‐naturels 
 Chapitre6. RépartitiondesCarabidaehivernantsdansunbois
hétérogène
Troisièmepartie. Discussion 
 Chapitre7. Discussiongénérale 
Conclusion
Bibliographie 
Annexes
Indexdesfigures 
Indexdestableaux 
7
11
13
29
41
43
59
77
101
117
119
135
137
153
183
187