analyses génomique et transcriptionelle des gènes de susceptibilité

JESSYKA FORTIN
ANALYSES GÉNOMIQUE ET
TRANSCRIPTIONELLE DES GÈNES DE
SUSCEPTIBILITÉ AUX CANCERS DU SEIN ET DE
L’OVAIRE BRCA1 ET BRCA2 CHEZ LES
CANADIENNES FRANÇAISES
Mémoire présenté
à la Faculté des études supérieures de l'Université Laval
dans le cadre du programme de physiologie-endocrinologie
pour l’obtention du grade de maître ès sciences (M.Sc.)
Département d’anatomie physiologie
FACULTÉ DE MÉDECINE
UNIVERSITÉ LAVAL
QUÉBEC
NOVEMBRE 2005
© Jessyka Fortin, 2005

RÉSUMÉ
BRCA1 et BRCA2 sont deux gènes majeurs impliqués dans la susceptibilité génétique aux
cancers du sein et/ou de l’ovaire. D’une part, nos investigations concernant la
caractérisation de la mutation fondatrice R1443X du gène BRCA1, détectée dans une
cohorte de Canadiennes françaises à risque élevé pour ces cancers, nous ont permis
d’identifier un nouveau transcrit. Celui-ci est généré par un épissage alternatif créant un
nouvel exon, appelé exon 13A, constitué d’un segment de 66 nucléotides (IVS13-2786_-
2720) inséré entre l’exon 13 et 14 tout en conservant le cadre de lecture. D’autre part, en
s’appuyant sur nos analyses exhaustives, de type Southern et MPLA, non biaisées par les
approches de type PCR , il ne semble pas y avoir dans cette même population Canadienne
française de réarrangements chromosomiques récurrents impliquant les gènes BRCA1 et
BRCA2.

ABSTRACT
The discovery of two genes, BRCA1 and BRCA2, which, when altered, confer markedly
increased susceptibility to breast and ovarian cancer, has facilitated the identification of
individuals at particularly high-risk of these diseases. First, extensive screening for
germline mutations in the French-Canadian high risk breast/ovarian cancer families led to
the detection of the first BRCA1 splice variant caused by an in-frame insertion. This
transcript, designated exon 13A, is generated by an insertion of 66 nucleotides between
exon 13 and 14, due to an alternative splicing of parts of intron 13 (IVS13-2786_-2720).
Second, based on our current extensive analysis, without using PCR-based methods, there
is no evidence supporting the existence of any deleterious BRCA1/2 recurrent genomic
rearrangement in these same French-Canadian breast/ovarian cancer families.

REMERCIEMENTS
Je tiens à remercier le Dr Jacques Simard pour la qualité plus que remarquable de mes
études sous sa direction et c’est pourquoi je lui témoigne ma sincère reconnaissance et mon
respect. En effet, c’est avec une grande latitude dans la réalisation de mes projets de
recherche tout en restant vigilant quant à leurs finalités ainsi que par sa rigueur scientifique
et circonspection remarquable que le Dr Jacques Simard m’a apporté son soutient. Je me
fais un honneur de le remercier particulièrement pour son accueil dans son équipe ainsi
qu’à tout le personnel et les étudiants du Laboratoire de Génomique des Cancers qui sont
d’une amabilité remarquable et qui ont fait preuve d’une grande disponibilité et générosité
tout au long de mes études.
Je voudrais aussi exprimer ma reconnaissance et mes sentiments respectueux au Dr
Francine Durocher pour son écoute et ses conseils avisés, sa grande disponibilité et
accessibilité ainsi que pour la confiance qu’elle m’a témoignée. Je souhaite également
souligner ses talents exceptionnels à partager ses connaissances avec rigueur et simplicité :
source d’admiration et d’inspiration.
Je remercie tout particulièrement Anne-Marie Moisan pour sa prévenance, son amabilité et
sa persévérance ainsi que pour la qualité incroyable de notre collaboration pendant nos
études graduées. Je souligne aussi le travail intense et le dévouement incroyable dont elle a
souvent fait preuve dans des situations de dernière minute tout en gardant son
professionalisme. Ainsi, je la remercie du fond de mon cœur tout comme Sylvie Desjardins,
Dre Martine Dumont et Carolle Samson qui font aussi preuve de ce dévouement et
professionalisme. De plus, tout les autres membres du personnel et étudiants du Laboratoire
de Génomique des Cancer que j’ai côtoyés m’ont marquées par leurs qualités et je les
remercie pour tous les bons moments que j’ai passée avec eux : Frédéric Guénard, Marie
Plourde, Mahinès Ivanga, Denis Mathon, Dre Penny Soucy, Gilles Leblanc, Martine
Tranchant, Geneviève Ouellette, Dr Yvan Labrie, Lucie Larouche, Lise Thériault, Jean-

iii
Claude Simard, Pascale Léger, Claire Brousseau, Marie-Andrée Lajoie, Josée Rhéaume et
Hélène Malouin.