Proposition de sujet de stage Dynamique des Interactions Parasite

Proposition de sujet de stage
Dynamique des Interactions Parasite
Nom et fonction
de l’encadrant (maître de stage
Laurent GAVOTTE (MCU - ISEM) -
Montpellier
Coralie MARTIN (CR - MNHN) - Paris
Cyril d’HAESE (CR - MNHN) - Paris
Structure d’accueil / Host Institution:
Institut des Sciences de l’Evolution (ISEM)
Muséum National d’Histoire Naturelle (MNHN)
Responsable de l’institution/
Host Institution Head
Agnès MIGNOT - ISEM
Adresses mail (encadrant et
contact structure)
Encadrants :
[email protected]
[email protected]
Structure :
Stage proposé en : Année 1
Training proposed for : first Year/ second year
Intitulé /Title of the training
Emergence des bactéries
Résumé du sujet proposé
(context
(problematic and context,
Program proposed and training schedule
Contexte :
Les bactéries intracellulaires
obligatoires du g
monde vivant, infectant de 20 à 60% des espèces d’arthropodes. Présentes chez différents groupes
taxonomiques (nématodes filaires, insectes, arachnides etc...), leur diversité et leur
très mal connues.
Au sein de la classe des Collemboles (4 ordres
bactérie présente chez l’espèce
Folsomia
Ces d
onnées restent faiblement représentatives de la réelle diversité de ce groupe taxonomique dont la
phylogénie est relativement bien connue.
Proposition de sujet de stage
de Master
Dynamique des Interactions Parasite
-Hôte-Environnement (DIPHE)
de l’encadrant (maître de stage
)/ Training supervisor
(Name and function)
Montpellier
Institut des Sciences de l’Evolution (ISEM)
- Montpellier
Muséum National d’Histoire Naturelle (MNHN)
- Paris
Host Institution Head
:
contact structure)
/ mail adresses (
supervisor and
Training proposed for : first Year/ second year
Emergence des bactéries
Wolbachia
: étude des symbiotes de collemboles
(context
e et thématique, protocoles, attendus…)
/
Program proposed and training schedule
...)
obligatoires du g
enre Wolbachia
sont les symbiotes les plus répandus du
monde vivant, infectant de 20 à 60% des espèces d’arthropodes. Présentes chez différents groupes
taxonomiques (nématodes filaires, insectes, arachnides etc...), leur diversité et leur
Au sein de la classe des Collemboles (4 ordres
; ~7000 espèces décrites
), le génome d’une souche de
Folsomia
candida
a été séquencé et la bactérie typée chez 5 autres espèces.
onnées restent faiblement représentatives de la réelle diversité de ce groupe taxonomique dont la
phylogénie est relativement bien connue.
(Name and function)
supervisor and
Institution contact) :
: étude des symbiotes de collemboles
/
Contents of the training
sont les symbiotes les plus répandus du
monde vivant, infectant de 20 à 60% des espèces d’arthropodes. Présentes chez différents groupes
taxonomiques (nématodes filaires, insectes, arachnides etc...), leur diversité et leur
évolution restent encore
), le génome d’une souche de
a été séquencé et la bactérie typée chez 5 autres espèces.
onnées restent faiblement représentatives de la réelle diversité de ce groupe taxonomique dont la

L’objectif du présent stage est de :
i) rechercher la présence de la bactérie Wolbachia au sein d’un ensemble d’espèces de collemboles jusque là non
étudiées à l’aide de marqueur moléculaire (PCR spécifique) ;
ii) typer les nouvelles souches de bactéries identifiées par séquençage de plusieurs gènes ;
iii) déterminer la position phylogénétique des nouvelles souches au sein de la diversité connue des Wolbachia ;
iv) rechercher des marqueurs de co-évolution entre les hôtes collemboles et leurs bactéries.
Protocoles :
Le travail se déroulera en étroite collaboration entre le Paris et Montpellier, l’étudiant choisi sera peut-être
amené à réaliser un ou plusieurs déplacements au MNHN.
Les expérimentations moléculaires seront réalisées à Montpellier.
Le travail consistera à réaliser un ensemble d’extraction d’acides nucléiques, de PCR spécifiques (gènes
wsp, 16S, ORF7, etc...) et de les séquencer. Nous étudierons un maximum d'espèces disponibles au MNHN
(collection et élevages).
Attendu :
Nous espérons améliorer grandement la connaissance de la diversité des Wolbachia de collemboles en
étudiant un ensemble d’espèces pour lesquelles aucune donnée n’est disponible. La détermination de la
position phylogénétique exacte des Wolbachia de collemboles nous permettra également d’affiner nos
hypothèses sur l’histoire évolutive de cette bactérie.
Enfin ce travail permettra à terme de travailler sur la co-évolution Wolbachia-collemboles et d’apprécier
l’importance écologique et évolutive de cette bactérie au sein de ce groupe taxonomique.
Facilités offertes à l’étudiant / facilities provided for the student **
 Indemnités de stages /Training stipend provided (**)
Non/No Oui /Yes
Montant/ amount :
 Voyage financé (si besoin)/Plane ticket provided (if needed) Non/No Oui /Yes
Logement gratuit/ Accomodation provided Non/No Oui /Yes
 Restauration gratuite /free meal Non/No Oui /Yes
 Moyens de déplacement gratuits (si terrain)/ Field trips : refund of expenses (If needed)
Non/No Oui /Yes
**obligatoire pour toute structure française au delà de 2 mois de stage-décrets ministériels du 31mars 2006 (privé) et du 21juillet
2009 (public)- mandatory for french institutions only
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