Proposition de thèse : Interactions Wolbachia

Proposition de thèse : Interactions Wolbachia-Arthropodes, LEES Poitiers
Sujet : Approche in situ de la régulation des interactions Arthropodessymbiotes
Les arthropodes sont connus pour héberger de nombreuses bactéries
symbiotiques
si bien que des stratégies de lutte biologique basées sur les endosymbiotes
sont déjà en cours de développement dans le but de réguler localement des
populations de ravageurs ou de vecteurs. C’est par exemple envisagé avec
Wolbachia, l’une des bactéries symbiotiques les plus répandues chez les
arthropodes. Les applications potentielles reposent sur l'introduction
contrôlée de souches naturelles de Wolbachia dans des individus non
porteurs.
Ces dernières doivent se maintenir et rester confinées aux hôtes et aux
populations cibles. Comprendre les mécanismes qui régulent les populations
de
Wolbachia chez leurs hôtes est donc un préalable indispensable.
Notre modèle central est la symbiose Wolbachia/Armadillidium vulgare. Les
Wolbachia manipulent la reproduction via la féminisation des mâles
génétiques.
Elles colonisent principalement les ovaires et la chaîne nerveuse, mais
aussi
le système immunitaire (hémocytes, organes hématopoïétiques). Leur
biovolume
par cellule, quantifiable en Hybridation in situ Fluorescente (FISH), est
très
hétérogène au sein d'un même organe. Dans le but d'identifier les gènes de
l'hôte impliqués dans la symbiose, plusieurs banques d'ESTs ont été
réalisées
(ANR EndoSymbArt, banques soustractives, challenges bactériens). Les ADNc
ont
été affiliés à des voies métaboliques potentielles (liste de termes GO,
Gene
Ontology).
Le candidat participera à la sélection de gènes d'intérêts impliqués dans
des
voies métaboliques de processus affectés par la symbiose : réponse
immunitaire
de l'hôte, développement (embryogenèse, gonadogenèse), tolérance à
Wolbachia
(communication hôte-symbiote, stress cellulaire, tropisme). La position de
ces
gènes dans les chaînes métaboliques les désignera comme des marqueurs
privilégiés de la voie correspondante. Après avoir vérifié leur expression
dans
les tissus cibles en RT-qPCR, le candidat quantifiera leur expression in
situ à
l'échelle de la cellule. La variation de biovolume de Wolbachia offre une
gamme
naturelle qui permettra de mettre en évidence des effets-dose et des seuils
d'expression. Pour cela le candidat développera un protocole de détection
fluorescente des ARNm compatible avec la détection FISH de Wolbachia.
Le laboratoire de "Ecologie, Evolution, Symbiose" (LEES) est une Unité
Mixte de
Recherche (UMR 6556) de l’Université de Poitiers. Nos activités de
recherche
s’inscrivent dans le cadre général de l’analyse des associations
symbiotiques
et concernent l’étude des interactions entre des crustacés isopodes et
leurs
bactéries intracellulaires Wolbachia. Deux programmes financés par l'Agence
Nationale de la Recherche sont en rapport avec la thèse proposée.
EndoSymbArt
(EndoSymbiosis in Arthropods) a pour but de déchiffrer les bases
génétiques,
moléculaires et cellulaires qui gouvernent la dynamique et l’évolution des
symbioses bactériennes chez les arthropodes. ADaWOL (Adaptive Success of
Wolbachia in Arthropods) évalue la prédisposition d'un hôte à accueillir de
nouvelles souches de Wolbachia et les capacités des Wolbachia à changer
d'hôte.
Une allocation de recherche de trois ans est attachée à la thèse. L’école
doctorale de rattachement est l'ED Sciences pour l’Environnement Gay Lussac
(http://gaylussac.ed.univ-poitiers.fr). Le candidat devra être titulaire
d'un
Master en Biologie. Une bonne connaissance des interactions symbiotiques
bactéries/invertébrés sera appréciée, de même que des connaissances en
biologie
moléculaire et en traitement de séquences ADN. Des compétences dans le
domaine
de la microscopie à fluorescence voire de l'Hybridation in situ constituent
un
plus. Les candidats enverront un CV détaillé comprenant les résumés des
stages
effectués, une lettre de motivation et au moins une lettre de référence à:
[email protected].
Date limite de dépôt de candidature: 12/05/2010.