Master de Biochimie - M1 UE1 – Biophysicochimie cellulaire et m

Chapitre 1 – Structure des protéines
Chapitre 2 – Le repliement des protéines
I. Expérience d'Anfinsen
II. Facteurs déterminant le repliement des protéines
III. Etudes du repliement in vitro
III.1 – Aspects thermodynamique et cinétique du repliement
III.2 – Méthodes d'études in vitro
III.2 – 1. Le dichroïsme circulaire
Ellipticité et dichroïsme circulaire molaire
Chromophores
Estimation du contenu en structures secondaires
Chapitre 1 – Structure des protéines
Chapitre 2 – Le repliement des protéines
I. Expérience d'Anfinsen
II. Facteurs déterminant le repliement des protéines
III. Etudes du repliement in vitro
III.1 – Aspects thermodynamique et cinétique du repliement
III.2 – Méthodes d'études, suivi du repliement
III.2 – 1. Le dichroïsme circulaire
III.2 – 2. Méthode du flux interrompu
Chapitre 1 – Structure des protéines
Chapitre 2 – Le repliement des protéines
I. Expérience d'Anfinsen
II. Facteurs déterminant le repliement des protéines
III. Etudes du repliement in vitro
III.1 – Aspects thermodynamique et cinétique du repliement
III.2 – Méthodes d'études, suivi du repliement
III.2 – 1. Le dichroïsme circulaire
III.2 – 2. Méthode du flux interrompu
III.2 – 3. RMN 2D du proton : échange H/D pulsé
Cinétique de la formation des liaisons hydrogènes
Chapitre 1 – Structure des protéines
Chapitre 2 – Le repliement des protéines
I. Expérience d'Anfinsen
II. Facteurs déterminant le repliement des protéines
III. Etudes du repliement in vitro
III.1 – Aspects thermodynamique et cinétique du repliement
III.2 – Méthodes d'études, suivi du repliement
III.2 – 1. Le dichroïsme circulaire
III.2 – 2. Méthode du flux interrompu
III.2 – 3. RMN 2D du proton : échange H/D pulsé
III.3 – Mécanismes de repliement
Le globule fondu : Etat intermédiaire
=> coeur hydrophobe formé
=> struct. IIaire + repliement global
= Structure moins compacte => rayon > état N
Molten Globule (MG) = moins compact (50% + large que l’état natif),
partiellement replié, possédant la plupart des hélices
=> Même spectre DC mais UV et Fluo ~ état dénaturé
Minimum locaux
Minimum global
III.4 – Théorie du paysage énergétique
-Formation de tous les contacts natifs d’une manière
hautement coopérative
-Repliement via un globule fondu
-Repliement via des intermédiaires cinétiques
-Condensation des cœurs hydrophobes antérieurement à
la formation des structures secondaire et tertiaire
=> Réduire l’espace conformationnel que doit explorer la
protéine afin d’éviter le paradoxe de Lévinthal
=> Représentation par des paysages énergétiques qui
dirigent la protéine vers un entonnoir énergétique
IV – Repliement in vivo