Forces intra-et intermoléculaires

Forces intra et intermoléculaires
Dr. Ammar Azioune ENSB
30/11/2014

Motivation
Connaitre les fonction des biomolécules
1. Les biomolécules (ex. protéines) communiquent
(interagissent) entre elles selon leur structures.
2. La structure des protéines (conformation) dépend de la
nature des diverses liaisons chimiques (ou non) existantes.
3. La forme (conformation) offre à la protéine des propriétés
spécifiques.
4. Ses propriétés permettent à la protéine l’accomplissement
de sa fonction précise que l’organisme attend d’elle.
Le vivant communique via la reconnaissance moléculaire

Objectif du cours
-Liaisons ioniques qui se forment entre les parties positives et négatives de la chaine
protéique (flèche en bleu).
-Liaisons covalentes polaires peuvent se former au sein de cette protéine (flèche violette).
-Ponts hydrogènes, faibles, mais ils peuvent assurer la conservation de la conformation
adéquate (flèche noire).
-Attractions hydrophobes pour le maintien de la forme moléculaire (flèche rouge).
Avoir des notions sur les différents types de liaisons chimiques et physiques.
𝑯𝑵 − 𝑪 = 𝑶 (liaison peptidique)

1. a. Liaisons ioniques
Les liaisons ioniques sont des liaisons chimiques fortes, qui peuvent
apparaitre suite à un transfert complet d’un ou plusieurs électrons d’un atome
vers un autre.
Le transfert d’électrons induit une perturbation de la neutralité des atomes
impliqués dans ce processus.
L’atome qui perd un électron possède un proton surnuméraire portant une
charge positive: l’ion formé porteur de charge positive est appelé cation.
L’atome qui acquiert cet électron gagne la charge négative de celui-ci, et
devient globalement porteur de charge négative. Il s’agit d’un anion.

Le cas du Chlorure de Sodium: 𝑵𝒂𝑪𝒍
Le chlorure de sodium est un sel impliqué dans l’équilibre ionique au travers
des membranes. Il s’agit d’un composé ionique qui s’est formé suite à un transfert
d’électron.
𝑵𝒂: 1s22s22p63s1 : 2. 8. 1
𝑪𝒍: 1s22s22p63s23p5: 2. 8. 7
L’électron isolé de la couche
externe du Sodium est
transféré à la couche externe
quasi complète du Chlore
Na+: 2. 8
Cl-: 2. 8. 8
Couches
extérieures
saturées
Les charges positives (+)et négatives (-)se compensent exactement, de sorte que le
chlorure de sodium (NaCl) est un composé qui, globalement, est neutre.