bioinfo - automatictn

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La bioinformatique
Concepts de base de la biologie moléculaire
De l’ADN aux protéines
Notion de réseaux de régulation génétique
Modélisation, simulation et analyse (Copasi et Range)

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La bioinformatique est un champ de recherche multi-disciplinaire où travaillent
des biologistes, informaticiens, mathématiciens et physiciens, dans le but de
résoudre un problème scientifique posé par la biologie.
Pour les biologistes:
Utilisation de logiciels informatiques pour traiter rapidement les
données biologiques.
Base de données permettant de stocker et gérer l’information
biologique.
Pour les informaticiens:
Modélisation de problèmes de biologie moléculaire.
Développement de méthodes mathématiques ou informatiques
formelles pour les résoudre.
Implémentation d’algorithmes permettant d’analyser les données
biologiques.
Validation sur des données simulées et réelles.

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S’applique à tout type de données biologiques:
Séquences d’ADN et de protéines.
Structures d’ARN et de protéines.
Contenu en gènes des génomes.
Alignement des séquences.
Puces à ADN (Microarrays)
Réseaux d’interactions entre protéines.
Réseaux de régulation génétique.
Défis principaux de la bioinformatique:
Indentification de l’ensemble des gènes
Prédire les fonctions des gènes.

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Concepts de base de la biologie
moléculaire
Définitions…