Initiation à la microbiologie

Le projet Génome à l’école
2012-2013
Initiation à la microbiologie
• Nous avons reçu une souche:
Pectobacterium atrosepticum.
• Nous cherchons à savoir si la souche que
nous avons reçu est bien Pectobacterium
atrosepticum.
• Pour cela nous avons fait une orientation
et une identification bactérienne.
Orientation Bactérienne
• Nous réalisons un gram.
• Résultat :
Coccobacille, Gram-
• On réalise un test d’oxydase qui est oxydase - .
• Nous avons effectué un état frais qui a montré
que les bactéries sont mobiles.
• On a ensemencé un milieux Hugh et Leifson qui
a démontré que la bactérie fermente le glucose
en anaérobiose.
• On a ensuite ensemencé un milieu viande foie
qui donne un type respiratoire aérobie anaérobie
facultatif.
Hugh et
Leifson
Viande
foie
Orientation :
famille des entérobactéries
Identification bactérienne
• On ensemence une galerie API 20 E (E pour
Entérobactérie), à l’aide d’une suspension bactérienne
réalisée à partir d’une colonie isolée, Après incubation les
résultats sont les suivants:
aractère
Lecture de la
galerie
Erwinia spp
selon API
ONPG
ADH
LDC
ODC
CIT
H2S
URE
TDA
IND
VP
GEL
GLU
MAN
INO
SOR
RhA
SAC
91MEL
AMY
ARA
+ - - - + - - - - + - + + - - - + + + +
13
3
1
0
5
0
0
0
0
88
17
97
77
3
26
1
91
19
42
41
On remarque que les résultats expérimentaux sont en accord avec les pourcentages
de réaction positives mentionnés dans le tableau d’identification proposé par
biomérieux .En effet Pectobactérium atrosepticum appartient à l’ancien genre Erwinia.
• Après lecture de la galerie API, on a confirmé que la
souche reçue est bien Pectobacterium atrosepticum.
Par ailleurs, après ensemencement sur pomme de
terre nous avons bien vu que la souche cause une
maladie chez la pomme de terre.
• Nous disposons donc bien au laboratoire
d’une souche de
Pectobacterium atrosepticum.