Puces à ADN - Ovidiu Radulescu

AACTGCTGCATGACTGCTAGCTGATCGAGTACAAACTGCTGC11101000111000101000110011001011101110100111010001110001010001100110010111011
TTGACGACGTACTGACGATCGACTAGCTCATGTTTGACGACG00010111000111010111001100110100010001011000101110001110101110011001101000100
Les puces à ADN
ou Microarrays
Antony Le Béchec
Pierre Zindy
Nathalie Théret
INSERM Unité 456

AACTGCTGCATGACTGCTAGCTGATCGAGTACAAACTGCTGCATGACTGCTAGCTGATCG11101000111000101000110011001011101110100111010001110001010001100110010111011011
TTGACGACGTACTGACGATCGACTAGCTCATGTTTGACGACGTACTGACGATCGACTAGC00010111000111010111001100110100010001011000101110001110101110011001101000100100
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Introduction
Objectifs
Contexte
Thème
Technique
Données & Traitements
Problèmes
Les puces à ADN

AACTGCTGCATGACTGCTAGCTGATCGAGTACAAACTGCTGCATGACTGCTAGCTGATCG11101000111000101000110011001011101110100111010001110001010001100110010111011011
TTGACGACGTACTGACGATCGACTAGCTCATGTTTGACGACGTACTGACGATCGACTAGC00010111000111010111001100110100010001011000101110001110101110011001101000100100
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Objectifs
Analyser simultanément
l’expression de plusieurs milliers de gènes
dans des conditions biologiques particulières
Recherche fondamentale
Caractérisation des fonctions des gènes
Régulation du transcriptome (Clustering, Promoteurs, …)
Réseaux géniques (Annotation relationnelle)
Recherche appliquée
Identification de cibles thérapeutiques
Diagnostique / Pronostique clinique
(Classification des pathologies, Profils moléculaires, …)

AACTGCTGCATGACTGCTAGCTGATCGAGTACAAACTGCTGCATGACTGCTAGCTGATCG11101000111000101000110011001011101110100111010001110001010001100110010111011011
TTGACGACGTACTGACGATCGACTAGCTCATGTTTGACGACGTACTGACGATCGACTAGC00010111000111010111001100110100010001011000101110001110101110011001101000100100
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Contexte : le transcriptome
ARN
Genome
Transcriptome
Protéome
ADN
ADN
ARN
Protéine
Transcription
Traduction

AACTGCTGCATGACTGCTAGCTGATCGAGTACAAACTGCTGCATGACTGCTAGCTGATCG11101000111000101000110011001011101110100111010001110001010001100110010111011011
TTGACGACGTACTGACGATCGACTAGCTCATGTTTGACGACGTACTGACGATCGACTAGC00010111000111010111001100110100010001011000101110001110101110011001101000100100
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Thème : de la fibrose au cancer
Virus
Alcool
Toxique
Fibrose cirrhose
Cancer
Carcinome
Hépatocellulaire
Réparation
Cellules du foie
Nombreux mécanismes moléculaires
régulés par de nombreux gènes
Profils moléculaires aux différents stades évolutifs
Réseaux de gènes impliqués dans les mécanismes
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