Sequence 5

Séquence 5
Professeur Jeremías González
1 re S SVT
Q1
1. La séquence primaire d’une protéine correspond à
l’enchaînement linéaire des acides aminés. Cette
chaîne linéaire se replie spontanément et adopte
une structure en trois dimensions. Cette
conformation est stabilisée par des interactions entre
les chaînes latérales des résidus d’acides aminés
composant la chaîne. Selon la séquence initiale des
acides aminés, le mode de repliement ne sera pas le
même, les interactions entre les acides aminés ne
seront pas les mêmes et la conformation finale de la
protéine pourra être radicalement différente.
Q2
2.
Le document 3 montre les conséquences d’une
modification d’un acide aminé dans la séquence du
lysozyme sur la conformation de cette protéine. Si un
acide aminé est remplacé par un autre acide aminé
dont la chaîne latérale possède des propriétés
différentes, les interactions que vont pouvoir exercer
ces deux acides aminés au sein de la protéine ne
seront pas les mêmes. Une telle substitution peut
entraîner la réalisation d’une nouvelle conformation
de la molécule.
Q3
1.-
La G6PD est une protéine de 515 acides aminés. Le
tableau du document 4 indique le pourcentage d’activité
(par rapport à une enzyme de référence) de trois variants
de cette protéine qui diffèrent de l’enzyme de référence par
un ou deux acides aminés. On constate que selon la version
de l’enzyme, l’activité est variable (de 3 à 100 %). Ces
variations d’activités sont la conséquence de la
modification de la séquence primaire de la molécule. On
peut penser que la modification de la séquence d’acides
aminés se répercute sur la conformation de la molécule.
Selon la région de la protéine qui sera modifiée, l’activité
enzymatique sera plus ou moins altérée. Si, par exemple, le
site actif est modifié on peut s’attendre à une diminution
importante de l’activité enzymatique.
SYNTHÈSE
S
L’activité enzymatique est basée sur une
reconnaissance spécifique de l’enzyme avec son substrat.
Cette reconnaissance a lieu au niveau d’une région de la
molécule appelée site actif : il s’agit d’une région dont la
conformation s’adapte à celle du substrat. Le site actif
apparaît à la suite de la fabrication de l’enzyme. La chaîne
linéaire d’acides aminés se replie et adopte une
conformation stabilisée par des interactions entre certains
de ces acides aminés. Une modification de la séquence
d’acides aminés peut aboutir à une modification de la
conformation d’une partie de la protéine et par conséquent
peut aboutir à une modification de son activité.