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LE B. A. BA de la bactériologie : Qu’est ce que la bactériologie? Dr O. BELLON Centre hospitalier du pays d’Aix septembre 2011 1 Les micro-organismes • • • • Microbiologie : étude des micro-organismes Bactériologie : étude des bactéries Virologie, mycologie, parasitologie…… Centré sur la bactériologie mais aussi sur les autres micro-organismes… 2 Définitions générales • Êtres vivants • Petite taille – Microscopes • Ubiquitaires – Animaux – environnement • Limitation du cours – Bactéries – Virus – champignons 3 Les bactéries • Besoins culturaux – – – – Eau Aliments Chaleur Atmosphère • Classifications 4 Les bactéries • Atmosphère – Aérobies • Besoin d’oxygène – Anaérobies • Oxygène toxique – Microaérophiles 5 Les bactéries • Température – Mésophiles – Cryophiles (froid) – Thermophiles (chaleur) • Explication – Des pathologies observées – Des modes de dissémination (Yersinia, Legionella) – Des modes de contamination (Listeria) 6 Les bactéries • Nourriture – Nécessaires à la croissance • Cystéine et légionelle – Favorable à la croissance • Glucose : assez mais pas trop…… • Eau 7 Les bactéries • Structure – – – – UNICELLULAIRE procaryotes Microscope optique Cytoplasme • Entouré d’une membrane cytoplasmique • Protégé par la paroi : support de l’affinité tinctoriale (gram) – Contenant • Chromosome circulaire : noyau sans membrane nucléaire • Plasmides • Éléments figurés – Éléments inconstants • Capsule • Spore • flagelles 8 9 Coloration de Gram : BGN 10 Coloration de ZIELH 11 Les bactéries • Structure – La capsule • Facteur de virulence • Protection contre la phagocytose • Support antigénique – Pneumocoque 12 Eléments facultatifs : capsule 13 Les bactéries • Structure – La spore • Forme de résistance – Chaleur – Pression – Rayonnements – Produits chimiques : • alcool entre autre • Pas à l’eau de Javel • Sporulation lors de conditions défavorables • Germination lors de conditions favorables • Clostridium : – gangrène, – C. difficile 14 Eléments facultatifs : spore 15 Les bactéries • Structure – Les flagelles • Support de la mobilité • Support antigènique – Les pili sexuels • Conjugaison • Recombinants génétiques 16 Eléments facultatifs : flagelles 17 Les bactéries • Culture – – – – Étuves Milieux de culture Atmosphère Multiplication • E.coli : rapide • B.K. : lent 18 Les virus • • • • • • • Unicellulaires ACARYOTES Parasites stricts Un seul acide nucléique en général Structure particulaire spécifique Ultrafiltrables Microscope électronique 19 Les virus • Parasites stricts – – – – reproduction à partir de son matériel génétique détournement du système de la cellule parasitée Réplication Ne pousse pas sur les milieux habituels de la bactériologie 20 Les virus • Stucture – un seul acide nucléique • ou ADN • ou ARN – protégé dans une capside • support de la classification morphologique – cubique – hélicoidale – double 21 Virus : cubique 22 Virus : helicoidal 23 Virus : mixte (bactériophage) 24 Les champignons • • • • • • • Entre le règne végétal et le règne animal Mycètes Eucaryotes Uni ou pluricellulaires Présence de bétaglucanes et chitine Paroi constituée d’ergostérol Deux grands groupes – Levures – Champignons filamenteux 25 candida 26 Champignons filamenteux 27 Caractéristiques des MO • Entérobactéries : BGN du tube digestif – Enterobacter : un des genres parmi les entérobactéries • Entérocoque : CGP du tube digestif. • Staphylocoque : aspect en grappe de raisin, h stafulh • Colibacille : le bacille du colon • Méningocoque : responsable de méningites…. 28 • Vibrion : BGN en virgule Modes de vie des MO • Commensaux : vis en commun sans produire de maladie • Pathogènes – Entraînent une maladie – Nécessite des conditions particulières pour exprimer la pathogénicité • Notions de flores 29 Ce qu’on vient de voir • Les bactéries: – Leur morphologie • • • • Bacilles Coques Gram zielh – Leur anatomie 30 Mise en évidence des MO • Les voir : diagnostic direct – – – – Examen direct Culture Antigènes solubles Biologie moléculaire • Voir les réactions spécifiques de l’organisme : diagnostic indirect – Recherche d’anticorps 31 Informations données par l’examen direct 32 Mise en évidence des MO • Examen direct – Rapide – Préciser ce que l’on cherche : colorations spéciales – Germe mort ou vivant…… – Nécessite un nombre important de germe présent…… 33 Mise en évidence des MO • Culture – Milieux spécifiques – Atmosphères spécifiques – Le germe DOIT être VIVANT à l’ensemmencement 34 Mise en évidence des MO 35 Mise en évidence des MO Recherche d’antigènes solubles - mise en évidence de fragments de bactéries - par des méthodes immunologiques - pour certaines bactéries À demander spécifiquement 36 Mise en évidence des MO • Nouvelles techniques de biologie moléculaire – – – – PCR……. PCR spécifiques Attention aux inhibiteurs +++++ Prix……. 37 Mise en évidence des MO • Typages – Sérotypages • pour certaines bactéries seulement – Pyocyanique – Salmonelle – Carte d’identité complète – Biologie moléculaire • Étude de fragments • Séquençage 38 Mise en évidence des MO • Sérologie – Mise en évidence des anticorps – Préciser lesquels +++++ – Attention à la cinétique de production • Latence (légionelles) • Taux – Différentes classes d’immunoglobulines • IGM • IGG… 39 Mise en évidence des MO • Attention – Demander spécifiquement ce que l’on veut – Prescription médicale • • • • • Obligatoire Précise Concise Centrée sur la clinique Respectant la chronologie de l’infection et de son évolution – Bien prélever et bien transporter 40 Intérêt pour les hygiénistes • Connaître – les conditions favorables de développement et de multiplication des germes • Comprendre – Les noms, les examens, les diagnostics, les délais nécessaires etc… • Pour pouvoir discuter avec les autres membres de l’équipe de soin. 41
