Rapport état des lieux cohortes_pour site web sans mention
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ATELIER DE REFLEXION PROSPECTIVE 2009 DE L’ANR « LES OUTILS DE LA RECHERCHE EN SANTE PUBLIQUE » Recensement des cohortes dans le champ de la Santé Publique Atelier de Réflexion Prospective « Les outils de la recherche en Santé Publique » Cet Atelier de Réflexion Prospective (ARP) a été lancé en 2008 et financé en 2009 par l’Agence Nationale de la Recherche. Il a pour objectif de faire un état des lieux de la recherche en Santé Publique et de proposer la création d’outils pouvant contribuer au renforcement d’une recherche en Santé Publique populationnelle pluri-disciplinaire, tout en facilitant l’émergence et la structuration d’une recherche opérationnelle de qualité, reconnue et soutenue par les organismes de recherche et les organismes financeurs. Cet ARP doit permettre de : - contribuer à définir les questions de recherche prioritaires pour le court, le moyen et le long terme ; - identifier des outils opérationnels efficaces ; - améliorer le transfert des connaissances du monde de la recherche vers la société d’une part, vers les décideurs d’autre part, en particulier par une collaboration étroite avec le ministère de la santé, l’ensemble des ministères concernés par la santé (c’est-à-dire pratiquement tous), les organismes de protection sociale et les professionnels de la santé, le monde industriel. 2 Sommaire 1 Description du recensement ............................................................................................... 4 1.1 Objectif et contexte ............................................................................................................... 4 1.2 Définition utilisée................................................................................................................... 4 1.3 Méthode de collecte des données .................................................................................... 5 1.4 Description des cohortes dans la base de données .................................................... 6 2 Analyse ......................................................................................................................................... 6 2.1 Organismes hébergeurs des cohortes ............................................................................ 6 2.2 Cohortes observationnelles / interventionnelles .......................................................... 7 2.3 Cohortes prospectives / rétrospectives .......................................................................... 8 2.4 Insertion des cohortes dans un projet plus large......................................................... 8 2.5 Les cohortes thématisées et les cohortes généralistes ............................................. 8 2.6 Analyse des pathologies étudiées par les cohortes .................................................... 9 2.7 Taille des cohortes – Nombre de sujets nécessaires ................................................ 11 2.8 Collections biologiques et examens .............................................................................. 12 2.9 Les grandes cohortes ........................................................................................................ 12 3 Une base accessible et évolutive .................................................................................... 15 3.1 Accessibilité ......................................................................................................................... 15 3.2 Interrogation de la base ..................................................................................................... 15 3.3 Limites de ce recensement et améliorations possibles ............................................ 16 4 Conclusion ................................................................................................................................ 16 3 1 Description du recensement 1.1 Objectif et contexte La recherche en Santé Publique repose principalement sur la collecte et l’analyse d’informations concernant des personnes, des institutions et des systèmes. Celles-ci sont recueillies lors d’investigations de taille variable. Compte tenu de l’état actuel des connaissances acquises dans le domaine de la santé, les hypothèses de recherche qui sont investiguées concernent de plus en plus souvent des risques de faible ampleur, des déterminants ou des phénomènes de santé relativement peu fréquents dans la population générale. Ceci a pour conséquence que les recherches entreprises portent sur des sous-groupes très spécifiques de la population, et que les études doivent souvent (pas toujours) concerner des échantillons d’effectifs très importants, de façon à réunir un nombre suffisant d’événements d’intérêt et à garantir une puissance adéquate aux recherches entreprises. Différents schémas d’investigation correspondent à cette approche : études de cohortes, études cas-témoins, (et toutes leurs variantes), registres de pathologies, regroupement de bases de données, etc. Au cours des dernières années, pour des raisons diverses, les études de cohortes ont fait l’objet d’une attention et de développements particuliers. C’est donc sur ce type d’études, qui ne résument pas la totalité des recherches de Santé Publique, qu’un état des lieux a été réalisé. En effet, l’IReSP, en liaison avec le travail initié par l’Institut Santé Publique de l’Inserm, a réalisé une base de données appelée Epigramme recensant toutes les cohortes ayant une dimension « santé » (qu’elles soient terminées, en cours ou en phase pilote). L’objectif de cette base est de rassembler pour la première fois des données issues de différentes institutions afin d’avoir un panorama complet des études de cohortes portant sur la santé. Par ailleurs, cette base permettra aux chercheurs d’avoir connaissance de l’ensemble des cohortes réalisées en France et de favoriser les interactions entre cohortes. La création de cette base rejoint la mise en place d’une cellule de coordination nationale des cohortes par le ministère délégué à la recherche avec la participation du ministère en charge de la santé, dans le cadre de l’inscription des cohortes en santé dans le dispositif TGIR (Très Grandes Infrastructures de Recherche). Cette cellule est gérée par l’IReSP. 1.2 Définition utilisée Une cohorte est la réunion d’un groupe de sujets partageant ensemble un certain nombre de caractéristiques, suivis longitudinalement, à l’échelle individuelle. Elle repose sur la collecte d’informations concernant des caractéristiques et des expositions des sujets suivis qui sont recueillies avant le moment d’apparition des effets analysés, susceptibles de modifier le risque de survenue de phénomènes de santé divers. Une cohorte est dite prospective lorsque les sujets sont inclus et suivis alors qu’ils sont indemnes des problèmes de santé étudiés. Elle est dite historique (ou rétrospective) lorsque les informations ont été 4 collectées au fur et à mesure de leur survenue au cours du temps, pour des raisons autres que la réalisation de la recherche reposant sur la cohorte, et qu’elles ont été colligées a posteriori. Une cohorte repose sur le respect d’un protocole pré-établi, concernant le suivi des personnes et la collecte d’informations. En particulier, il est nécessaire que le suivi des personnes soit programmé à l’avance et protocolisé. Les données peuvent provenir d’interrogatoires ou du rassemblement d’informations disponibles auprès de diverses sources (y compris des personnes, des fichiers ou des dossiers médicaux, etc.). Elles sont d’ordre clinique, démographique, psychologique, social et économique. Elles peuvent émaner des résultats de prélèvements biologiques, d’examens invasifs ou non invasifs. Les objectifs d’une cohorte peuvent être multiples : - description, suivi, évolution et surveillance de l’exposition à des facteurs de risque et de phénomènes de santé, mesurés à l’échelle individuelle ; - analyse des effets potentiels de l’exposition à des facteurs de risque sur des phénomènes de santé ; - évolution de l’efficience et de l’efficacité d’interventions de nature préventive ou réparatrice. On distingue habituellement deux grands types de cohortes : • les études de cohortes “thématisées” qui portent sur une pathologie ou une famille de pathologies soit dans les critères d’inclusion soit dans les évènements de santé observés. Ces études permettent de suivre la survenue et l’évolution dans le temps des pathologies étudiées (en particulier des pathologies chroniques) ainsi que les effets des prises en charge dans une perspective d’évaluation des traitements. • les études de cohortes “généralistes” dont le recrutement s’opère en population générale, qui couvrent un champ ouvert de problèmes de santé. 1.3 Méthode de collecte des données Dans un premier temps, les données ont été collectées à partir du recensement des cohortes réalisées dans un laboratoire Inserm, recensement effectué début 2008 par l’ex Département de la Recherche en Santé Publique (DRSP). Quatre-vingt-six cohortes Inserm avaient été recensées et décrites par un questionnaire. D’autre part, 96 projets de cohortes ont été soumis lors de l’appel à financement de cohortes santé fin 2008 ; ce qui nous a permis de recenser de nouvelles cohortes. Certaines cohortes sont communes à ces deux premières sources. Par ailleurs, des contacts directs ont été pris avec des organismes abritant des cohortes comme l’Institut de Veille Sanitaire ou l’Assistance Publique – Hôpitaux de Paris. Enfin, de nombreuses recherches sur Internet ont été entreprises pour compléter ce recensement. Une base de données informatique a été construite et les données collectées y ont été saisies. 5 1.4 Description des cohortes dans la base de données Dans la base, chaque cohorte est décrite par : - les données administratives (promoteur/déclarant CNIL, nom du ou des responsables scientifiques, existence d’un comité scientifique, existence d’un comité de pilotage) ; - les données financières et les données de ressources humaines ; - le thème, les objectifs, la population étudiée ; - les évènements de santé observés ; - le type d’étude (prospective/rétrospective, observationnelle/interventionnelle) ; - le protocole de suivi (durée de suivi, périodicité des visites de recueil, date de début et de fin des inclusions, date de fin de suivi) ; - les critères d’inclusion, le nombre de sujets ; - les outils de recueil des données et les procédures qualité ; - la valorisation des résultats (communications, brevets). 2 Analyse Nous estimons qu’environ 250 cohortes seront recensées à terme dans la base Epigramme. Actuellement, 189 cohortes sont complètement décrites dans cette base, cohortes utilisées dans la présente analyse. 2.1 Organismes hébergeurs des cohortes Nous avons recensé 18 structures qui hébergent les 189 cohortes. Dans le tableau ci-dessous est représenté le nombre de cohortes hébergées par chacune de ces 18 structures. L’organisme qui abrite le plus grand nombre de cohortes est l’Inserm (62%), viennent ensuite l’hôpital (14%) et l’ANRS (8%). D’autres organismes hébergent des cohortes mais en nombre beaucoup plus restreint : l’IRSN avec 5 cohortes ou encore l’IRDES avec une cohorte par exemple. 6 Organismes Nombre de cohortes hébergées Cohortes avec participation d'un labo Inserm (hors cohortes ANRS) 118 Cohortes hébergées par un hôpital 27 Cohortes ANRS 16 Cohortes hébergées par l'InVS 5 Cohortes hébergées par l'IRSN 5 Cohortes hébergées par le CNRS 3 Cohortes hébergées par une Université 3 Cohortes hébergées par le CNAM 2 Cohorte hébergée par un CNLCC 1 Cohorte hébergée par la Fondation MGEN 1 Cohorte hébergée par l’INED 1 Cohorte hébergée par l'INRETS 1 Cohorte hébergée par l'INRS 1 Cohorte hébergée par l'Institut Pasteur 1 Cohorte hébergée par l'IRDES 1 Cohorte hébergée par le Ministère de la Défense 1 Cohorte hébergée par un ORS 1 Cohorte hébergée par une structure privée 1 Tableau 1 : Organismes hébergeurs des 189 cohortes (Inserm : Institut national de la santé et de la recherche médicale ; ANRS : Agence Nationale de Recherche sur le Sida et les hépatites virales ; InVS : Institut de Veille Sanitaire ; IRSN : Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire ; CNRS : Centre National de la Recherche Scientifique ; CNAM : Conservatoire National des Arts et Métiers ; CNLCC : Centre National de Lutte Contre le Cancer ; INED : Institut National d’Etudes Démographiques ; INRETS : Institut National de Recherche sur les Transports et leur Sécurité ; INRS : Institut National de Recherche et de Sécurité ; IRDES : Institut de Recherche et Documentation en Economie de la Santé ; ORS : Observatoire Régional de Santé). 2.2 Cohortes observationnelles / interventionnelles Parmi les 189 cohortes décrites dans la base, 172 sont des cohortes observationnelles (91%) et 17 sont interventionnelles (9%). Ces dernières apportent de l'information longitudinale sur les modifications introduites après un changement décidé (dans l'exposition ou dans la prise en charge médicale) et pour lequel une hypothèse d'effet ou d'efficacité a été antérieurement formulée. Les cohortes observationnelles relèvent de l'information "vie-courante", c'est-à-dire sans intervention programmée par l'équipe de recherche. 7 2.3 Cohortes prospectives / rétrospectives Parmi les 189 cohortes décrites dans la base, 162 sont prospectives (86%) et 27 sont rétrospectives (14%). Les cohortes rétrospectives informent sur la situation des sujets - relative à la santé, aux soins, ou à l’environnement - antérieure à leur inclusion dans la cohorte, à partir de l’historique des dossiers médicaux, hospitaliers ou professionnels. Les données peuvent être collectées ou non à l’aveugle de l’état de santé au moment de l’inclusion. Certaines cohortes rétrospectives peuvent avoir un prolongement prospectif. Les cohortes prospectives recueillent toute l’information au fil du temps de l’observation. Elles ont le mérite de recueillir, lors de l’inclusion et aux étapes ultérieures de suivi, des données indemnes de biais d’information – de toutes parts (sujet, soignant, investigateur) – lié aux événements qui se produiront ultérieurement. 2.4 Insertion des cohortes dans un projet plus large Parmi les 189 cohortes décrites dans la base, 50 s’insèrent dans un réseau de cohortes (26%) et 41 dans un projet européen (22%). Au total, 37% des cohortes sont insérées dans un projet plus large. Voici une liste d’exemples de projets européens dans lesquels les cohortes recensées sont insérées : CASCADE, DAD, ART-CC, EURO-SIDA, COHERE, HIV-TUBERCULOSIS, Etude européenne sur l’ostéoporose masculine (NEMO), Reference values for arterial stiffness projet, Consortium européen EURAGEDIC, EPIC (European Prospective Investigation on Cancer and Nutrition), Etude européenne P.A.R.I.S, EUCCONET, European Early Prevention Network, European Paediatric Stroke Registry, European Skeletal Dysplasia Network, EVI, GENORET, Fighting Aneurysmal Disease, GENE-RADRISK, EURODEM, EUROPARKINSON, EURODEP, REVES, DESCRIPA, Réseau Européen Huntington, Registre EUROFEVER, Projets européens HEPADIP ET ADAPT, Réseau d’excellence européen EQUAL-SOC, Projet « Socioeconomic inequalities in health in 15 cities in Europe » (DG SANCO). Cette liste montre que la notion d’insertion dans un projet européen recouvre des situations très différentes, pouvant aller de simples collaborations jusqu’à une véritable participation à un projet financé par l’Union Européenne. Ces chiffres sont donc à interpréter avec précaution. 2.5 Les cohortes thématisées et les cohortes généralistes Pour l’analyse, nous avons choisi de séparer les cohortes dont le critère d’inclusion est lié à la santé et celles dont le critère d’inclusion n’est pas lié à la santé. Pour celles dont le critère d’inclusion n’est pas lié à la santé, nous avons distingué celles qui présentent une pathologie principale dans les évènements de santé observés et les autres. Nous avons ensuite analysé les pathologies recensées dans les critères d’inclusion ou dans les évènements de santé observés (voir chapitre 2.6). 8 Parmi les 189 cohortes décrites dans la base : - 112 cohortes ont un critère d’inclusion lié à la santé (59%). Elles sont donc “thématisées” par leur critère d’inclusion qui peut être le fait d’être atteint de maladies cardiovasculaires par exemple. - 77 cohortes n’ont pas de critère d’inclusion lié à la santé (41%). Parmi ces 77 cohortes, 58 présentent une pathologie principale dans les évènements de santé observés (31%). Elles sont donc “thématisées” par la pathologie observée. Les 19 autres cohortes ne présentent pas de pathologie principale dans les évènements de santé observés (10%). Ces 10% représentent des cohortes “généralistes” selon la définition décrite précédemment. 2.6 Analyse des pathologies étudiées par les cohortes Afin d’analyser les cohortes en fonction des pathologies recensées soit dans les critères d’inclusion soit dans les évènements de santé observées, nous avons utilisé la classification des domaines médicaux qui correspond à la définition des instituts thématiques de l’Inserm (tableau 2). Ce découpage arbitraire a l’avantage de correspondre à une réalité institutionnelle. Nom Neurosciences, sciences cognitives, neurologie, psychiatrie Génétique et développement Cancer Microbiologie et Maladies infectieuses Acronyme Domaines médicaux couverts Cancer neurosciences, sciences cognitives, neurologie, psychiatrie, santé mentale, addictions, organes des sens, maladie d’Alzheimer et maladies apparentées génétique, reproduction, développement, vieillissement, muscle, maladies rares maladies tumorales, oncologie, oncogenèse Mal Inf microbiologie, maladies infectieuses et parasitaires Circulation, métabolisme, nutrition Circulation circulation, cardiologie, nutrition, diabète, obésité, endocrinologie, gastro-entérologie, hépatologie, néphrologie, système ostéoarticulaire Immunologie, hématologie, pneumologie Immuno immunologie, hématologie, hémostase, allergologie, pneumologie, dermatologie, biothérapies SP santé publique et sciences humaines et sociales, handicap, épidémiologie, biostatistiques, systèmes sanitaires, économie de la santé, méthodologie en recherche clinique, santé et environnement, toxicologie Santé Publique Neuro Génétique Tableau 2 : Les instituts thématiques de l’Inserm utilisée pour l’analyse des cohortes. Nous avons analysé les 112 cohortes dont le critère d’inclusion est lié à la santé ainsi que les 77 cohortes dont le critère d’inclusion n’est pas lié à la santé (tableau 3) en les décrivant par les domaines médicaux exposés ci-dessus. Pour rappel : Pour les cohortes dont le critère d’inclusion n’est pas lié à la santé, les domaines médicaux ont été analysés à partir des pathologies recensées dans les évènements de santé observés. 9 Cohortes dont le critère d’inclusion est lié à la santé Cohortes dont le critère d’inclusion n’est pas lié à la santé Neuro 15 (13%) 10 (13%) Génétique 13 (12%) 7 (9%) Cancer 14 (13%) 9 (12%) Maladies Infectieuses 19 (17%) 3 (4%) Circulation 36 (32%) 16 (21%) Immuno 6 (5%) 1 (1%) Santé Publique 1 (1%) 19 (25%) 2 domaines médicaux 8* (7%) 12** (15%) Domaines médicaux simultanés Tableau 3 : Répartition des cohortes selon les différents domaines médicaux correspondant à la définition des instituts thématiques de l’Inserm. * Huit cohortes dont le critère d’inclusion est lié à la santé correspondent simultanément aux domaines médicaux suivants : Immuno/Génétique, Neuro/Immuno, Circulation/Génétique, Circulation/Immuno, Santé Publique/Neuro. ** Douze cohortes dont le critère d’inclusion n’est pas lié à la santé correspondent simultanément aux domaines médicaux suivants : Immuno/Maladies Infectieuses, Neuro/Génétique, Circulation/Neuro, Circulation/Génétique, Cancer/Immuno, Neuro/Immuno, Neuro/Santé Publique, Circulation/Santé Publique. Au niveau des 112 cohortes dont le critère d’inclusion est lié à la santé, les domaines médicaux les plus représentés sont la “Circulation” (32%), les “Maladies Infectieuses” (17%), la “Neuro” (13%), le “Cancer” (13%) et la “Génétique” (12%). Les domaines “Immuno” (5%) et “Santé Publique” (1%) sont les moins représentés au sein des cohortes dont le critère d’inclusion est lié à la santé. Au sein des 77 cohortes dont le critère d’inclusion n’est pas lié à la santé, les domaines médicaux les plus représentés sont : la “Santé Publique” (25%), la “Circulation” (21%), la “Neuro” (13%) et le “Cancer” (12%). Les domaines “Génétique” (9%), “Maladies Infectieuses” (4%) et “Immuno” (1%) sont les moins représentés au niveau de ces cohortes. Il faut noter que le domaine “Santé Publique” est fortement représenté grâce à la présence des cohortes “généralistes” dans ce groupe. 10 2.7 Taille des cohortes – Nombre nécessaire de sujets 2.7.1 Nombre nécessaire de sujets pour les cohortes dont le critère d’inclusion est lié à la santé En terme de nombre nécessaire de sujets à inclure dans les cohortes dont le critère d’inclusion est lié à la santé (figure 1), on constate qu’une très large majorité des cohortes (83%) sont de petite taille avec moins de 5 000 sujets et que les cohortes de grande taille (supérieures à 20 000 sujets) sont peu nombreuses (4%). 5% 8% 4% < 5 000 [5 000 - 10 000[ [10 000 - 20 000[ 83% ≥ 20 000 Figure 1 : Nombre nécessaire de sujets à inclure dans les 112 cohortes dont le critère d’inclusion est lié à la santé. 2.7.2 Nombre nécessaire de sujets pour les cohortes dont le critère d’inclusion n’est pas lié à la santé En terme de nombre nécessaire de sujets à inclure dans les cohortes dont le critère d’inclusion n’est pas lié à la santé (figure 2), on constate que la part de petites cohortes (moins de 5 000 sujets) est moins importante (55%) comparée aux cohortes dont le critère d’inclusion est lié à la santé (83%). Nous observons davantage de cohortes incluant un plus grand nombre de sujets, ce qui n’est pas étonnant dans la mesure où les grandes cohortes “généralistes” font partie de ce groupe. < 5 000 18% [5 000 - 10 000[ 13% 55% 14% [10 000 - 20 000[ ≥ 20 000 Figure 2 : Nombre nécessaire de sujets à inclure dans les 77 cohortes dont le critère d’inclusion n’est pas lié à la santé. 11 2.8 Collections biologiques et examens Parmi les 189 cohortes décrites dans la base, 123 disposent de données issues de prélèvements biologiques (65%) et 85 réalisent des examens morphologiques (45%). 2.8.1 Collections biologiques et examens pour les cohortes dont le critère d’inclusion est lié à la santé Parmi les 112 cohortes dont le critère d’inclusion est lié à la santé, 71% disposent de données issues de prélèvements biologiques. Voici quelques exemples de prélèvements biologiques réalisés dans ces cohortes : prélèvement sanguin principalement, prélèvement salivaire, prélèvement urinaire, prélèvement de tissus tumoraux. Par ailleurs, parmi les 112 cohortes dont le critère d’inclusion est lié à la santé, 48% réalisent des examens morphologiques. Voici quelques exemples d’examens réalisés dans ces cohortes : imagerie principalement, mesures anthropométriques, examen spirographique, pression artérielle centrale, index hémodynamiques, acuité visuelle, électrorétinographie, endosonographie, explorations électrophysiologiques, tests allergologiques, exploration fonctionnelle respiratoire, endoscopie digestive, bioimpédancemétrie, mesure de l’activité locomotrice. 2.8.2 Collections biologiques et examens pour les cohortes dont le critère d’inclusion n’est pas lié à la santé Parmi les 77 cohortes dont le critère d’inclusion n’est pas lié à la santé, 56% disposent de données issues de prélèvements biologiques. Voici quelques exemples de prélèvements biologiques réalisés dans ces cohortes : prélèvement de sang principalement, de cheveux, d’urine, de salive, de selles, de lait maternel, écouvillonnage nasal. Par ailleurs, parmi les 77 cohortes dont le critère d’inclusion n’est pas lié à la santé, 40% réalisent des examens morphologiques. Voici quelques exemples d’examens réalisés dans ces cohortes : imagerie principalement, données anthropomorphiques, absorptiométrie, mesure de la densité minérale osseuse, données anthropométriques, doppler trans-cranien, impédancemétrie bioélectrique, tests physiques (test du souffle, test de marche), tests cognitifs, ostéodensitométrie, polysomnographie. 2.9 Les grandes cohortes Les tableaux 4 et 5 décrivent les principales informations disponibles pour les grandes cohortes, c’està-dire celles dont le nombre nécessaire de sujets à inclure dépasse 10 000. Elles sont présentées en deux groupes distincts, selon qu’elles sont généralistes ou non. 12 Nom ELEN COSET EVREST CORONS Objectif Etude et surveillance de la santé physique et mentale des assurés adultes de la MGEN Surveillance épidémiologique en milieu de travail Indicateurs d'exposition et de santé concernant les salariés Observatoire des risques d'une cohorte d'affiliés à la caisse autonome de la sécurité sociale dans les mines, dans le nord de la France Nbre sujets Début inclusion Prélévements Examens 13 000 inclus 2005 Non Non Privé (MGEN) Plus de 20 000 nécessaires Pas démarré Non Non Public (InVS) 10 000 - 20 000 inclus 2007 Non Non Public 106 000 inclus 2000 Non Non Privé (Pfizer, Novartis Chiron) Financement E3N Recherche de facteurs de risques des cancers et des pathologies chroniques chez la femme 100 000 inclus 1990 Oui Non Public (Ligue contre le Cancer, Inserm, IGR) GAZEL Constitution d'une plateforme épidémiologique permettant d'étudier des problèmes de santé très divers 20 625 inclus 1989 Oui Non Public (CCAS, ANR, Afsset, FDF, ARC, Inserm) Comprendre les relations entre la nutrition et la santé et connaître les NUTRINET-SANTE déterminants des comportements alimentaires 500 000 nécessaires 2009 Non Non Mixte (DGS, INPES, InVS, Inserm, INRA, CNAM, FRM) SU.VI.MAX ELFE CONSTANCES Cohorte OMG Etablir le lien entre l'apport de nutriments antioxydants et le risque de cancer, de cardiopathie ischémique ou la mortalité Suivre l'évolution du cadre de vie de l'enfant (famille, environnement social, etc) et en mesurer les conséquences sur son développement Cohorte des consultants des centres d'examens de santé. Décrire l'état de santé et la prévalence de divers facteurs de risque de la population française adulte. Produire des données sur les pathologies rencontrées et les soins apportés aux patients en médecine de premiers secours 13 000 inclus 1994 Oui Oui Mixte (Inserm, INRA, CNAM, Fruit d'Or recherche, Lipton, Candia, Kellog's, Sodexho, L'Oréal, etc) 20 000 nécessaires Pas démarré Oui Oui Public (INED, InVS, INSEE, Inserm, DGS, DREES, DGPR, DRI, CNAF) 200 000 nécessaires Pas démarré Oui Oui Public (CNAMTS, DGS, Inserm) Non Mixte (Union régionale des médecins libéraux, SFMG, Industrie pharmaceutique) Plus de 20 000 nécessaires Pas démarré Oui Tableau 4 : Les cohortes généralistes de plus de 10 000 sujets. 13 Nom TARIS SID ARDCO CESAME ANRS CO4 FHDH Employés France Telecom PRIME Prise en charge médicale des couples traités pour infertilité TRAVNUCL VENUS EPP III EFEMERIS SPIRALE EURO2K RIETE EVADEF Objectif Etude de mortalité visant à évaluer le risque de cancers et de pathologies non cancéreuses liés à des expositions chroniques à de faibles doses de rayonnements ionisants Etude de l'association éventuelle entre des expositions aux oxydes de fer et la mortalité par cancer du poumon Dépistage des affections liées à l'amiante Cancers et sur-risque associé aux maladies inflammatoires intestinales en France Critère d'inclusion lié à la santé Evènement de santé observé Prélévements Examens Financements 1946 Mélanomes, leucémies Non Non Mixte (IRSN, Communauté européenne, AREVA) 17 700 inclus 1960 Cancer Non Non Privé 16 800 inclus 2003 Cancer Nbre sujets Début inclusion 50 500 inclus Public (CNAM via la CRAMIF, Afsset) Mixte (PHRC, Ligue contre le Cancer, AFA, SNFGE, FERRING) Non Oui Oui Non Non Non Mixte (Inserm, ANRS, Sidaction, Abbott, Janssen, BMS, Gilead) 20 800 inclus 2006 Maladies inflammatoires chroniques de l'intestin 120 800 inclus 1987 VIH 100 800 inclus 1978 Cancer Non Non Privé (France Telecom) Etude prospective et épidémiologique des évènements cardioischémiques 10 600 inclus 1991 Cardiopathie ischémique, évènements cardiovasculaires Oui Oui Mixte Etude de la fréquence des traitements par inducteurs d'ovulation et la survenue de grossesse 10 000 suivis 2004 Non Non Privé (SERONO) Non Non Mixte (Afsset, EDF, CEA, COGEMA, ARC, Entreprises du nucléaire) Non Oui Mixte (Europe, EDF, Ligue contre le Cancer) Oui Oui Public (ANR, DGS, IReSP, DIM cardiovasculaire) Non Non Public (DHOS, PHRC, Afssaps) Non Non Public (CNAMTS, INCa) Contribuer à la surveillance épidémiologique de l'infection à VIH en France, évaluer l'impact clinique à moyen et long terme des stratégies thérapeutiques Etude des facteurs professionnels et la mortalité par cancer chez les employés des services techniques de France Telecom Traitement inducteur d'ovulation Etude de la mortalité des cancers chez les travailleurs des entreprises contractantes du secteur nucléaire français Etude du devenir médical à long terme et de la descendance des patients traités pour un cancer de la thyroïde Identification de nouveaux paramètres du rythme cardiaque prédictifs de la morbi-mortalité cardiovasculaire 11 000 nécessaires 2002 15 500 inclus 1992 10 000 nécessaires 2008 Evaluation chez la femme enceinte des médicaments et de leurs risques 40 000 nécessaires 2004 10 000 - 20 000 nécessaires 2006 10 000 - 20 000 nécessaires 1990 Cancer Oui Oui Mixte (EDF, MGEN, Europe, LNCC, Fondation Weyth) 30 000 nécessaires 2006 Thrombose veineuse Non Non Privé (GSK) Plus de 20 000 nécessaires 2003 Défibrillateur automatique implantable Non Non Public (Ministère de la santé) Oui Non Mixte (Afsset, INCa, Mutualité sociale agricole, Fondation de France, Ligue contre le Cancer, ARC) Non Non Public (InVS, INPES, CNAMTS, RSI, HAS) Oui Oui Privé (Institutions de retraite complémentaire sous la tutelle de l'AGIRC et l'ARRCO) Surveillance postprofessionnelle des travailleurs exposés Etude du devenir global à long terme des sujets guéris d'un cancer durant leur enfance Etude prospective des patients hospitalisés pour un évènement thromboembolique Evaluation médicoéconomique du défibrillateur automatique implantable Cancer Cancer de la thyroïde Evènements cardiovasculaires Prématurité, malformations, pathologies néonatales Cancer, pathologies respiratoires AGRICAN Etude de l'incidence des cancers et de la mortalité des agriculteurs en France 188 000 inclus 2005 ENTRED 20012003 Description de l'état de santé des personnes diabétiques et la qualité de leur prise en charge médicale 10 000 - 20 000 inclus 2006 Mesure de l'impact sur la santé et la qualité de vie des bilans de prévention médico-psycho-sociaux 10 000 - 20 000 nécessaires Pas démarré Etude des facteurs génétiques, environnementaux, sociofamiliaux qui conditionnent le diabète. Description de l'histoire du diabète autoimmun. 10 000 - 20 000 nécessaires 2008 Diabète Oui Oui Mixte (PHRC, Inserm, Ministère de l'environnement, Fondation Novonordisk) 10 489 inclus 1985 Traitement par l'hormone de croissance Non Oui Public (Afssaps, DGS, INCa, FP7) 22 400 inclus 1968 Cancer Non Non Public (Electricité de France) 30 000 inclus 2000 Cancer Non Non Public (IRSN) VIVA HORUSSENTINELLE SAGHE Cohorte EDF Enfant Scanner Réponse aux questions non résolues sur l'insuffisance somatotrope et le syndrome de Turner Evaluation du risque de mortalité par cancers et par pathologies non cancéreuses liés à des expositions chroniques à de faibles doses de rayonnements ionisants Evaluation du risque de cancer ou de leucémie associé à l'utilisation du scanner au cours de la petite enfance Cancer Diabète Vieillissement, autonomie Tableau 5 : Les cohortes non généralistes de plus de 10 000 sujets. 14 Parmi les 11 grandes cohortes généralistes, 6 (55%) ont ou auront des “prélèvements” et 3 (27%) des “examens” ; parmi les 23 cohortes non généralistes, respectivement 7 (30%) et 8 (35%) sont ou seront dans cette situation. La part plus importante de cohortes dotées de prélèvements parmi les cohortes généralistes s’explique par le fait que ces cohortes sont plus récentes. Cela témoigne du développement des grandes cohortes, de bonne qualité méthodologique et multidisciplinaire, dans notre pays. 3 Une base accessible et évolutive 3.1 Accessibilité Un prestataire privé, la société 3ES-Cegedim, a réalisé la base Epigramme et mis en place l’interface qui permet de la consulter sur le site de l’IReSP (www.iresp.net). Seules les cohortes dont les responsables ont donné leur accord sont accessibles dans la base Epigramme depuis juillet 2009. Début septembre 2009, 103 cohortes sont visibles dans la base. 3.2 Interrogation de la base Dans cette base, la recherche peut se faire selon plusieurs critères : les caractéristiques administratives des cohortes (acronyme, nom du responsable scientifique ou de l’investigateur principal, financeurs) et/ou les thématiques de recherche (recherche par mots clés dans le nom de la cohorte, dans les catégories « thème principal de la cohorte » et « type de population étudiée », dans les évènements de santé observés). L’exemple ci-dessous (figure 3) montre la recherche des cohortes décrites par le mot clé « cancer » dans la catégorie « thème principal de la cohorte ». Après avoir lancé la recherche, nous obtenons la liste des cohortes décrites par ce mot clé. Nous pouvons ensuite exporter ces données obtenues sous forme d’un tableau Excel. Ce dernier contiendra la description complète de chaque cohorte correspondant à nos critères de recherche. 15 Figure 3 : Exemple de recherche dans la base Epigramme qui recense les cohortes en santé. 3.3 Limites de ce recensement et améliorations possibles Une difficulté importante de ce recensement est de juger de l’adéquation des études répertoriées ou proposées par les équipes de recherche avec la définition précise d’une cohorte que nous avons adoptée dans Epigramme. Chaque étude est examinée au cas par cas à travers son protocole, ses publications et des échanges avec les responsables de l’étude si nécessaire. Cette base va nécessiter une mise à jour régulière afin de maintenir les informations décrites valides au cours du temps. Nous pensons effectuer cette mise à jour annuellement en reprenant contact avec les responsables de cohortes. Concernant les améliorations possibles, il est envisageable par la suite de faire évoluer la fiche de description des cohortes dans la base Epigramme afin d’y ajouter des données complémentaires. Enfin, l’ajout de nouvelles cohortes dans la base est possible à tout moment. 4 Conclusion C’est à notre connaissance la première fois qu’une tentative de recensement exhaustif d’une catégorie de recherches épidémiologiques est réalisé en France, en dehors des essais thérapeutiques réalisés dans certains domaines particuliers (cancer, infections à VIH, etc.) et des registres de pathologies. 16 On est d’emblée frappé par le nombre très important de cohortes qui existent, plus de 200 au total. Alors que l’on estime généralement que la recherche en épidémiologie et en Santé Publique est insuffisamment développée en France, il y a là le témoignage d’une très grande vitalité. Mais ce nombre traduit également la nécessité vraisemblable de mise en commun des études développées. On peut imaginer que la complémentarité de certaines problématiques de recherche aurait permis de les regrouper et de tenter de les aborder dans des cohortes mutualisées (il n’existe par exemple que 20 cohortes, parmi celles recensées, qui abordent deux grands domaines de pathologies simultanément). Il s’agit là de l’un des objectifs du programme Predecob de soutien à la mise en œuvre et au pilotage des cohortes en santé au sein du dispositif des Très Grandes Infrastructures de Recherche (TGIR), piloté par le ministère de la recherche, le ministère de la santé et l’Inserm. L’objectif de la constitution de cette base de données, qui sera régulièrement mise à jour, est donc de permettre aux équipes de chercheurs, mais également aux instances qui contribuent à la programmation et à la réalisation de la recherche, de disposer d’un outil opérationnel, qui permette la mise en commun et le partage d’informations, ainsi que des éléments utiles pour décider de mettre éventuellement en place de nouvelles études. Ceci nécessite que les équipes de chercheurs acceptent de se plier à la contrainte de fournir les informations détaillées concernant leurs travaux. On peut espérer que l’utilisation de ce fichier et les bénéfices que tous en retireront leur montreront que nos efforts communs n’ont pas été vains. Nous les remercions très sincèrement d’avoir accepté nos contraintes pour cette pour cette première réalisation. 17
