Caractérisation d`entités moléculaires de surface impliquées dans la

UNIVERSITE DE LIMOGES
Ecole doctorale Biologie – Santé
Faculté des Sciences et Techniques
Laboratoire de Chimie des Substances Naturelles
Thèse N° [7/2010]
THÈSE
Pour l’obtention du grade de
DOCTEUR DE L’UNIVERSITE DE LIMOGES
Discipline : Biologie-Santé
Présentée et soutenue publiquement par
Naima SAAD
Le 03 Février 2010
Caractérisation d’entités moléculaires de surface impliquées
dans la relation de la bactérie probiotique Lactobacillus
plantarum 299v avec l’hôte : approche in vitro
Thèse dirigée par : M. Philippe Bressollier, Professeur
M. Jean Marie Schmitter, Professeur
Jury :
Rapporteurs M. J.M Chobert Directeur de recherche, INRA Nantes
M. D. Drider Maître de conférences, HDR, ONIRIS de Nantes
Examinateurs M. P. Bressollier Professeur, Université de Limoges
M. P. Krausz Professeur, Université de Limoges
M. J.M. Schmitter Professeur, Université de Bordeaux I
Mme. M. Urdaci Professeur, ENITA de Bordeaux
Invité M. J.P. Picot PDG Société ID-BIO, Limoges

UNIVERSITE DE LIMOGES
Ecole doctorale Biologie – Santé
Faculté des Sciences et Techniques
Laboratoire de Chimie des Substances Naturelles
Thèse N° [7/2010]
THÈSE
Pour l’obtention du grade de
DOCTEUR DE L’UNIVERSITE DE LIMOGES
Discipline : Biologie-Santé
Présentée et soutenue publiquement par
Naima SAAD
Le 03 Février 2010
Caractérisation d’entités moléculaires de surface impliquées
dans la relation de la bactérie probiotique Lactobacillus
plantarum 299v avec l’hôte : approche in vitro
Thèse dirigée par : M. Philippe Bressollier, Professeur
M. Jean Marie Schmitter, Professeur
Jury :
Rapporteurs M. J.M Chobert Directeur de recherche, INRA Nantes
M. D. Drider Maître de conférences, HDR, ONIRIS de Nantes
Examinateurs M. P. Bressollier Professeur, Université de Limoges
M. P. Krausz Professeur, Université de Limoges
M. J.M. Schmitter Professeur, Université de Bordeaux I
Mme. M. Urdaci Professeur, ENITA de Bordeaux
Invité M. J.P. Picot PDG Société ID-BIO, Limoges

Remerciements
J’adresse mes profonds remerciements :
Au Conseil Régional du Limousin et à la société ID-BIO, qui ont financé ce travail.
Au Professeur Pierre Krausz, directeur du Laboratoire de Chimie des Substances
Naturelles, pour m’avoir accueillie au sein de son laboratoire.
J’exprime toute ma profonde gratitude au Pr. Philippe Bressollier, sans lequel ce
travail n’aurait pu aboutir. Je tiens à le remercier vivement pour sa confiance durant les
trois années de thèse, pour son soutien lors des moments difficiles pour faire évoluer ce
projet. Je le remercie encore pour son encadrement, sa disponibilité et les nombreuses
discussions scientifiques que nous avons eues. Je le remercie également pour sa patience lors
de la rédaction de thèse, je l’ai mis à rude épreuve, surtout lors de la phase finale.
Je souhaite témoigner mes remerciements tout aussi sincères au Pr. Jean Marie
Schmitter du laboratoire de Génomique Fonctionnelle-CBMN-Bordeaux 2, co-directeur de
cette thèse. Je tiens à le remercier pour m’avoir accueillie dans son laboratoire lors de mes
séjours bordelais, pour sa disponibilité, et l’attention qu’il m’a accordée lors de mon
initiation au monde de la « spectrométrie de masse ».
J’adresse également toute ma reconnaissance à Madame le Pr. Maria Urdaci, directrice
du Laboratoire de Microbiologie et de Biochimie Appliquée-CBMN, ’ENITA de Bordeaux,
pour sa rigueur et sa disponibilité. Je vous remercie vivement pour vos précieux conseils et les
discussions scientifiques enrichissantes que nous avons eues ensemble. Enfin, je vous suis
reconnaissante d’avoir accepté d’examiner ce travail.
Je remercie Monsieur Jean Pierre Picot, PDG de la société ID-BIO pour avoir
cofinancé cette thèse et pour l’intérêt qu’il a porté à ce sujet.
J’adresse également tous mes remerciements à Monsieur Jean Marc Chobert, Directeur
de l’équipe Fonctions et Interactions des Protéines Laitières de l’’INRA-BIA de Nantes et à
Monsieur Djamel Drider, MCF-HDR à l’Ecole Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et
de l’Alimentation Nantes-Atlantique (ONIRIS), Laboratoire de Microbiologie Alimentaire
et Industrielle, qui ont accepté d’être rapporteurs de ce travail. Les remarques constructives
qu’ils ont formulées ont contribué à l’amélioration de mon manuscrit.
Je remercie tout mes collègues du Département Génie Biologique de l’IUT du
Limousin, Raymonde Faure et la "Petite " Karine Grenier pour toute l’aide qu’elles m’ont
apportée, pour leur patience devant ma farouche détermination « à épuiser tous les stocks du
département ». Je tiens à remercier l’ensemble des membres de Génie-Bio, BIOLO, la
"Grande" Carinne Belzanne, Catherine Decourt, Dominique Soulé, François Letourneau,