t - Medinvita

TEST OFTA
23.02.2015
Rapport personnel: JOE SAMPLE
0
OFTA
www.medinvita.ch
NOM DU PATIENT
JOE SAMPLE
DATE DE NAISSANCE
14/04/1960
DATE EXAMEN
17/07/2015
Merci d'avoir choisi les tests génétiques MEDINVITAgen
Bienvenue dans votre profil MEDINVITAgen OFTA!
Pour l'étude de la prédisposition génétique à la dégénérescence maculaire (DMLA), au glaucome
exfoliatif et au glaucome à angle ouvert (GPAO).
Nous vous conseillons de partager toujours les résultats avec votre ophtalmologue.
La méthode d'analyse utilise le système d'amplification compétitive allèle-spécifique (KASP).
Le test génétique OFTA concerne uniquement le risque génétique. Pour l'évaluation globale du
risque clinique il est nécessaire intégrer des données génétiques avec les antécédents médicaux et
les données comportementales du sujet.
Le test OFTA n'est pas un test qui pose un diagnostic. Le test analyse uniquement les variations
génétiques - qui sont actuellement pertinentes d'un point de vue scientifique - associées à la
DMLA, au glaucome exfoliatif et au glaucome à angle ouvert.
Avoir une prédisposition génétique à la DMLA, au glaucome exfoliatif et/ou au glaucome à angle
ouvert, ne signifie pas l'on développera la maladie. D'autre part, un risque génétique bas n'assure
pas non plus une protection complète pour ces maladies.
La réalisation de ce test ne remplace en aucun cas les consultations régulières chez le propre
médecin.
1
INTRODUCTION
La dégénérescence maculaire sénile (ou DMLA, en anglais Age-related Macular Degeneration) est
une maladie multifactorielle dégénérative qui affecte la macula, partie centrale de la rétine qui
permet la vision distincte et des couleurs. La fréquence de la dégénérescence maculaire est plus
élevée chez les personnes âgées: 12 % de la population entre 65 ans et 75 ans présente une
DMLA. C'est la première cause de malvoyance après 50 ans dans les pays développés et la cause
principale de cécité non corrigeable de la personne âgée dans le monde occidental. Du fait du
vieillissement de la population, sa prévalence pourrait augmenter de près de 50 % d'ici 2020
Si la dégénérescence maculaire n'est pas traitée, elle peut conduire à la cécité légale, le dépistage
précoce est donc important.
Ces dernières années, on a découvert que certaines variations génétiques peuvent augmenter
considérablement les chances d'être atteint de la maladie: parmi celles-ci les plus importantes sont
celles sur le gène CFH (qui joue un rôle important dans le système immunitaire) et le gène ARMS2
(actif dans la rétine) .
Il est possible prévenir la maladie en mangeant sainement, en évitant de fumer et en contrôlant le
poids, la pression artérielle et le cholestérol. Des consultations régulières chez l'ophtalmologue
sont essentielles pour un dépistage précoce de la maladie, en particulier pour les personnes
génétiquement prédisposées, qui peuvent ainsi réduire considérablement leurs chances de tomber
malade en consommant des quantités suffisantes d'antioxydants, de zinc et d'acides gras oméga-3.
La supplémentation en antioxydants et en sels minéraux est également recommandée pour ceux
qui souffrent déjà de la dégénérescence maculaire à un stade avancé dans un œil.
Le glaucome est un groupe de maladies oculaires caractérisées par la présence d'un dommage
chronique et progressif du nerf optique qui se manifeste avec une perte du champ visuel. On
estime que dans le monde entier plus de 80 millions de personnes souffrent d'une forme de
glaucome. Plus fréquente chez les adultes, la maladie peut apparaitre à tout âge. Le glaucome à
angle ouvert (GPAO) est la forme la plus fréquente, associée à l'hypertension oculaire et est
caractérisée par une dégénérescence progressive du nerf optique causée par la mort des cellules
ganglionnaires de la rétine. Étant essentiellement asymptomatique, le patient s'en rend compte à
un stade avancé de la maladie quand il est plus difficile intervenir.
Il existe aussi une forme de glaucome exfoliatif qui a une forte composante héréditaire.
Vu que le glaucome à angle ouvert est asymptomatique, de nombreux cas ne sont pas
diagnostiqués, et il est important pour cette raison de faire des examens réguliers de la vue, surtout
après 40 ans. Si le glaucome est diagnostiqué rapidement, il peut être traité. Parmi les facteurs de
risque, certaines variations génétiques (connues) augmentent le risque de maladie.
Les individus génétiquement prédisposés devraient donc effectuer des examens ophtalmologiques
plus fréquemment. Le test OFTA de MEDINVITAgen analyse également le risque lié à une forme
particulière de glaucome, le glaucome exfoliatif: en l'absence de la variation du risque, il est très
peu probable que le patient développe cette condition.
2
RÉSULTATS DMLA
GÈNE
VARIATION
TESTÉE
FRÉQUENCE DU
GÉNOTYPE
RÉSULTAT
RISQUE
RELATIF (RR)
ARMS2 /
LOC387715 A69S
rs10490924 GT
GG
61%
0,63
CFH exon 9 .Y402H
rs1061170 TC
TC
57%
1,22
CFI
rs10033900 CT
CC
30%
0,85
C2
rs547154 CA
CC
88%
1,07
C2
rs9332739 GC
GG
88%
1,06
C3
rs2230199 CG
GC
25%
1,25
CFB
rs641153 CT
CC
87%
1,07
RISQUE RELATIF COMBINÉ RR 0,99
Explication des résultats du test
Selon la littérature scientifique on peut dire qu'environ 8% des personnes d'origine européenne
avec un génotype identique au votre développera la maladie avant l'âge de 75 ans. Cela signifie
que votre risque de tomber malade est réduit (0,99 fois) par rapport à la moyenne européenne
(8%).
Votre risque de développer une dégénérescence maculaire augmente si vous fumez et / ou si vous
avez un IMC (IMC = indice de masse corporelle) élevé. Le risque relatif combiné RR ne comprend
pas ces deux facteurs de risque.
Sensibilité et spécificité du test2
Indice de sensibilité = 83%
Indice de spécificité = 68%
Informations
supplémentaires
(pharmacogénétique)
pour
le
médecin
ophtalmologue
Votre patient a le génotype CFH = TC (rs1061170).
D'après certaines publications récentes3-5, la thérapie anti-VEGF semble moins efficace chez les
patients avec le génotype CFH-CC, les patients CFH-CC également pourraient ne pas avoir
besoin d'un plus grand nombre d'injections.
Bien que ces informations soient utiles pour le suivi du patient, elles n'ont pas encore été
suffisamment validées dans un contexte clinique: nous déconseillons donc de les utiliser pour
déterminer la thérapie à adopter.
Risque Environnemental
Il existe d'autres facteurs qui augmentent le risque de développer une dégénérescence maculaire:
le tabagisme, l'excès de poids, une alimentation pauvre en antioxydants, oméga3 et en sels
minéraux tels que le zinc. Leur effet combiné augmente le risque génétique, mais pour définir
l'interaction entre l'environnement et la génétique il est nécéssaire d'attendre les résultats d'autres
études scientifiques.
3
Bibliographie, DMLA
1. Klein R., et al., Fifteen-year cumulative incidence of age-related macular degeneration: the Beaver
Dam Eye Study. Ophthalmology. 2007 Feb;114(2):253-62.
2. Seddon et al., Prediction Model for Prevalence and Incidence of Advanced Age-Related Macular
Degeneration, Investigative Ophthalmology & Visual Science, May 2009, Vol. 50
3. Lee et al., Pharmacogenetics of complement factor H (Y402H) and treatment of exudative agerelated macular degeneration with ranibizumab.Br J Ophthalmol. 2009 May;93(5):610-3
4. Agosta et al., Pharmacogenetics of antiangiogenic and antineovascular therapies of age-related
macular degeneration. Pharmacogenomics. 2012 Jul;13(9):1037-53.
5. Schwartz SG, Brantley MA. Pharmacogenetics and age-related macular degeneration. J
Ophthalmol. 2011;2011:252549.
6. Ho L, van Leeuwen R, Witteman JC, van Duijn CM, Uitterlinden AG, Hofman A, de Jong PT,
Vingerling JR, Klaver CC. Reducing the genetic risk of age-related macular degeneration with
dietary antioxidants, zinc, and ω-3 fatty acids: the Rotterdam study.
Arch Ophthalmol. 2011 Jun;129(6):758-66.
7. Chen H, Yu KD, Xu GZ Association between variant Y402H in age-related macular degeneration
(AMD) susceptibility gene CFH and treatment response of AMD: a meta-analysis.
PLoS One. 2012;7(8):e42464. doi: 10.1371/journal.pone.0042464. Epub 2012 Aug 14.
8. Hammond CJ, Liew SH, Van Kuijk FJ, Beatty S, Nolan JM, Spector TD, Gilbert CE. The heritability of
macular response to supplemental lutein and zeaxanthin: a classic twin study.
Invest Ophthalmol Vis Sci. 2012 Jul 26;53(8):4963-8. doi: 10.1167/iovs.12-9618.
9. Lim LS, Mitchell P, Seddon JM, Holz FG, Wong TY. Age-related macular degeneration.
Lancet. 2012 May 5;379(9827):1728-38. Review.
10. Elliott JG, Williams NS. Nutrients in the battle against age-related eye diseases.
Optometry. 2012 Jan;83(1):47-55.
11. Sangiovanni JP, Neuringer M. The putative role of lutein and zeaxanthin as protective agents against
age-related macular degeneration: promise of molecular genetics for guiding mechanistic and
translational research in the field. Am J Clin Nutr. 2012 Nov; 96(5):1223S-33S. doi:
10.3945/ajcn.112.038240. Epub 2012 Oct 10.
12. Weikel KA, Chiu CJ, Taylor A. Nutritional modulation of age-related macular degeneration.
Mol Aspects Med. 2012 Aug;33(4):318-75.
4
RÉSULTATS GLAUCOME
Glaucome exfoliatif
GÈNE
VARIATION
VARIATION
D’INTÉRÊT
VOTRE
RÉSULTAT
FRÉQUENCE DE
VOTRE GÉNOTYPE
LOXL1
rs1048661
GT
TG
47%
LOXL1
rs3825942
GA
GG
67%
RISQUE
RELATIF (RR)
0,87
Explication des résultats des tests
Vos résultats pour le gène LOXL1 indiquent que, bien que votre risque soit peu élevé (environ 0,87
fois par rapport à la moyenne), vous ne pouvez pas exclure la possibilité de développer cette
forme de glaucome. Selon la littérature scientifique1-6, nous pouvons dire que 3,5% des personnes
avec votre génotype sera atteint d'un glaucome exfoliatif par rapport au 4% de la population
générale.
Note: les variants génétiques découverts sur le gène LOXL1 n'influence pas le risque de développer
le GPAO
Sensibilité et spécificité du test1-3
Indice de sensibilité = 99%
Indice de spécificité = 73%
Glaucome à angle ouvert
GÈNE
VARIATION
VARIATION
D’INTÉRÊT
VOTRE
RÉSULTAT
FRÉQUENCE DE
VOTRE
GÉNOTYPE
RISQUE
RELATIF (RR)
nr ATOH7
rs1900005
GT
GG
73%
0,97
nr
CDKN2B
rs1063192
AG
GA
26%
0,94
nr SIX1
rs10483727
CT
TC
49%
1,02
TMCO1
rs4656461
AG
AA
74%
0,89
nr CAV
rs4236601
GA
AA
8%
1,39
RISQUE RELATIF COMBINÉ RR 1,15
Explications des résultats du test
Selon la litérature scientifique7-14 on peut affirmer qu'environ 6% des individus d'origine
européenne avec un génotype identique au votre développera la maladie avant l'âge de 75 ans.
Cela signifie que votre risque de tomber malade est légèrement plus élevé (1,15 volte) par rapport
à la moyenne européenne (5%).
5
Bibliographie, Glaucome
1. Fan BJ, Pasquale L, Grosskreutz CL, Rhee D, Chen T, DeAngelis MM, Kim I, del Bono E, Miller JW,
Li T, Haines JL, Wiggs JL. DNA sequence variants in the LOXL1 gene are associated with
pseudoexfoliation glaucoma in a U.S. clinic-based population with broad ethnic diversity. BMC Med
Genet. 2008 Feb 6;9:5.
2. Aragon-Martin JA, Ritch R, Liebmann J, O'Brien C, Blaaow K, Mercieca F, Spiteri A, Cobb CJ,
Damji KF, Tarkkanen A, Rezaie T, Child AH, Sarfarazi M. Evaluation of LOXL1 gene polymorphisms
in exfoliation syndrome and exfoliation glaucoma.Mol Vis. 2008 Mar 17;14:533-41.
3. Mayinu, Chen X. Evaluation of LOXL1 polymorphisms in exfoliation syndrome in the Uygur
population. Mol Vis. 2011;17:1734-44. Epub 2011 Jun 28.
4. Jaimes M, Rivera-Parra D, Miranda-Duarte A, Valdés G, Zenteno JC. Prevalence of high-risk alleles
in the LOXL1 gene and its association with pseudoexfoliation syndrome and exfoliation glaucoma in
a Latin American population.Ophthalmic Genet. 2012 Mar;33(1):12-7. Epub 2011 Oct 4.
5. Pasutto F, Krumbiegel M, Mardin CY, Paoli D, Lämmer R, Weber BH, Kruse FE, SchlötzerSchrehardt U, Reis A. Association of LOXL1 common sequence variants in German and Italian
patients with pseudoexfoliation syndrome and pseudoexfoliation glaucoma. Invest Ophthalmol Vis
Sci. 2008 Apr;49(4):1459-63.
6. Chen H, Chen LJ, Zhang M, Gong W, Tam PO, Lam DS, Pang CP. Ethnicity-based subgroup metaanalysis of the association of LOXL1 polymorphisms with glaucoma. Mol Vis. 2010 Feb 6;16:16777.
7. Axenovich T, Zorkoltseva I, Belonogova N, van Koolwijk LM, Borodin P, Kirichenko A, Babenko V,
Ramdas WD, Amin N, Despriet DD, Vingerling JR, Lemij HG, Oostra BA, Klaver CC, Aulchenko Y,
van Duijn CM. Linkage and association analyses of glaucoma related traits in a large pedigree from
a Dutch genetically isolated population. J Med Genet. 2011 Dec;48(12):802-9. Epub 2011
8. Osman W, Low SK, Takahashi A, Kubo M, Nakamura Y. A genome-wide association study in the
Japanese population confirms 9p21 and 14q23 as susceptibility loci for primary open angle
glaucoma. Hum Mol Genet. 2012 Jun 15;21(12):2836-42. Epub 2012 Mar 13.
9. Wiggs JL, et al Common variants at 9p21 and 8q22 are associated with increased susceptibility to
optic nerve degeneration in glaucoma. PLoS Genet. 2012;8(4):e1002654. Epub 2012 Apr 26.
10. Sharma S, Burdon KP, Chidlow G, Klebe S, Crawford A, Dimasi DP, Dave A, Martin S, Javadiyan S,
Wood JP, Casson R, Danoy P, Griggs K, Hewitt AW, Landers J, Mitchell P, Mackey DA, Craig JE.
Association of genetic variants in the TMCO1 gene with clinical parameters related to glaucoma
and characterization of the protein in the eye. Invest Ophthalmol Vis Sci. 2012 Jul 24;53(8):491725.
11. Takamoto M, Kaburaki T, Mabuchi A, Araie M, Amano S, Aihara M, Tomidokoro A, Iwase A,
Mabuchi F, Kashiwagi K, Shirato S, Yasuda N, Kawashima H, Nakajima F, Numaga J, Kawamura
Y, Sasaki T, Tokunaga K. Common variants on chromosome 9p21 are associated with normal
tension glaucoma. PLoS One. 2012;7(7):e40107. Epub 2012 Jul 5.
12. Wiggs JL, Kang JH, Yaspan BL, Mirel DB, Laurie C, Crenshaw A, Brodeur W, Gogarten S, Olson
LM, Abdrabou W, DelBono E, Loomis S, Haines JL, Pasquale LR; GENEVA Consortium Common
variants near CAV1 and CAV2 are associated with primary open-angle glaucoma in Caucasians
from the USA.. Hum Mol Genet. 2011 Dec 1;20(23):4707-13. Epub 2011 Aug 26.
13. Burdon KP. Genome-wide association studies in the hunt for genes causing primary open-angle
glaucoma: a review. Clin Experiment Ophthalmol. 2012 May-Jun;40(4):358-63.
14. Ulmer M, et al. Genome-wide analysis of central corneal thickness in primary open-angle glaucoma
cases in the NEIGHBOR and GLAUGEN consortia. Invest Ophthalmol Vis Sci. 2012 Jul
3;53(8):4468-74.
6
Stefania Ubaldi MD, Phd
Tel
(Ch) +41.788.43.48.01
Mob (IT) +39.333.36.88.561
Email
[email protected]
Web
www.medinvita.ch
7