La lettre de la Cryobanque n° 10

Les organismes participant au Groupement d'Intérêt Scientifique "Cryobanque nationale" NUMERO 10
CONTACT: Secrétariat exécutif de la Cryobanque nationale
Delphine DUCLOS, Institut de l'Elevage, Département Génétique 149 rue de Bercy 75595 Paris Cedex 12
Tél.: 01 40 04 52 84 – Fax: 01 40 04 49 50 – mél: [email protected]
Site Internet de la Cryobanque nationale: http://www.cryobanque.org
DES COLLECTIONS QUI S’ETOFFENT
GRACE AU PROJET CRB-ANIM
Le projet d’infrastructure CRB-Anim a débuté en 2013. L’un de ses principaux objectifs pour la
Cryobanque Nationale est l’enrichissement des collections et l’aide à la gestion des ressources
génétiques. CRB-Anim apporte un financement conséquent pour la collecte de matériel
génétique dans des espèces et/ou races pour lesquelles la cryoconservation n’avait pas encore
pu être réalisée pour des raisons techniques ou financières.
Des races locales de volailles bien représentées
En 2014, les races locales de volailles se sont distinguées une nouvelle fois par l’augmentation
de leurs effectifs en Cryobanque. Ainsi, la poule d’Alsace, la Grise du Vercors, la Houdan et
la Merlerault ont rejoint nos collections.
Race
Poule d’Alsace
Grise du Vercors
Houdan
Merlerault
Nombre de donneurs
15
42
43
39
Nombre de paillettes
500
1740
1765
1637
Pour la première fois, une population de Pintade fait également son entrée en Cryobanque. Il
s’agit de la population de Beghin : 4 familles sont représentées pour un total de 810 paillettes.
(cette collecte s’est faite hors financement CRB-Anim).
Du nouveau pour les petits ruminants
Pour les ovins, 6 béliers Southdown, 2 béliers Belle-Ile et 2 béliers de race Grivette ont rejoint
les collections de la Cryobanque avec en moyenne 200 doses chacun.
Des béliers d’autres races sont en cours de collecte actuellement : 3 béliers Boulonnais, cette
race existe déjà en Cryobanque mais avec des stocks faibles (moins de 700 doses provenant
de 6 béliers), il est donc important de compléter les collections. Le mouton est l’espèce la plus
représentée avec près de 40 races différentes.
En caprins, ce sont 2 boucs Provençaux (seulement 3 donneurs existaient pour le moment en
Cryobanque) qui ont pu être collectés. 2 boucs Angora avaient déjà rejoint les stocks de la
Cryobanque en 2013 avec un peu plus de 200 doses en tout.
On rappelle que la préconisation pour reconstituer une race de ruminant par croisement
d’absorption est de disposer du matériel génétique de 20 mâles non apparentés afin de rétablir
une diversité génétique équivalente à la population des donneurs. Cet objectif est le plus
souvent inatteignable, pour les races à petits effectifs en particulier, étant donné que les
animaux sont tous plus ou moins apparentés. Il est donc impossible de trouver 20 mâles
d’origines totalement distinctes. Il faut néanmoins essayer d’avoir une bonne représentation de
la diversité génétique de chacune des populations par le choix des mâles cryoconservés.
Avril 2015 - Institut de l’Elevage Ed. – Paris - Référence : 00150203009
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En porcin, on insémine puis on collecte…
Pour les races locales porcines, le choix a été fait d’utiliser de la semence de verrats anciens dont les
origines ne sont plus représentées dans la population actuelle pour réinjecter de la diversité dans les
troupeaux des truies receveuses, puis de collecter quelques-uns des verrats nés de ces inséminations,
en procédant ainsi chaque année pour une race locale différente. En 2014, ce sont 2 verrats Cul Noir
Limousin qui ont ainsi pu être collectés. Ils étaient issus des inséminations réalisées en 2013 avec des
verrats anciens.
Les inséminations de 2014 ont quant à elles été réalisées sur des truies de race Gasconne.
En complément, 2 races en sélection ont aussi eu des verrats collectés afin de compléter leur collection
en cryoconservation, il s’agit du Landrace avec 23 donneurs collectés et du Large White, lignée mâle
avec 12 verrats.
Dans les autres espèces
En lapin, 4 lignées expérimentales ont bénéficié de collectes d’embryons en 2014. Une dizaine de races
locales de lapins dont le Fauve de Bourgogne et le Gris du Bourbonnais devraient être collectées au
cours du projet CRB-Anim.
Et pour finir, une nouvelle espèce aquacole va faire son entrée en Cryobanque, il s’agit de l’huître
creuse dont la semence a pu être collectée en 2014. Plusieurs lignées seront cryoconservées dans les
années à venir.
LES CRYOBANQUES DANS LE MONDE
Lors du congrès mondial de génétique appliquée aux animaux d’élevage, qui s’est déroulé au Canada
en août 2014, un inventaire d’une partie des cryobanques et de leurs collections à travers le monde a
été dressé dans l’article suivant : Conservation of Animal Genetic Resources: the Next Decade, S. R.
Paiva, C. McManus, H. Blackburn*. Le tableau reproduit ci-dessous permet de mesurer l’importance des
collections dans différents pays.
Tableau : Exemples des tailles de collection in vitro des pays étudiés sélectionnés*
Avril 2015 - Institut de l’Elevage Ed. – Paris - Référence : 00150203009
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Les pays qui possèdent une cryobanque se sont multipliés depuis 1999 où la France faisait figure de
précurseur avec les Etats-Unis et les Pays-Bas puisque ces pays furent les premiers à se doter d’une
cryobanque, identifiée comme telle, dont le but était la préservation à long terme des ressources
génétiques animales.
On constate que la Cryobanque Nationale française figure aujourd’hui parmi les plus conséquentes.
C’est en particulier celle où le nombre de races ou lignées en collection est le plus élevé. Elle se classe
3ème pour ce qui est du nombre d’espèces, de donneurs et de paillettes.
Les auteurs de l’article insistent sur le fait que les programmes de conservation in situ et ex situ
doivent être complémentaires alors que cela est, en réalité, rarement le cas. On peut se féliciter que
l’un des objectifs du projet CRB-Anim soit justement d’améliorer la complémentarité entre ces 2 types
d’actions.
Ils préconisent également d’envisager la préservation d’échantillons permettant des analyses ADN afin
de réaliser des analyses génomiques, celles-ci se multipliant pour les différentes espèces d’élevage. Là
encore, cette action est déjà prévue dans le cadre du projet CRB-Anim puisque tout animal collecté pour
du matériel reproductif est également censé avoir un prélèvement d’ADN (par exemple prise de sang ou
biopsie d’oreilles selon les espèces). Par contre, cet échantillon n’est pas confié à la Cryobanque
Nationale qui se concentre, elle, sur le matériel reproductif mais à un autre Centre de Ressources
Biologiques spécialisé dans la conservation d’échantillons pour extraction d’ADN tel que le CRB GADIE
maintenu par l’INRA de Jouy-en-Josas ou l’entreprise LABOGENA également à Jouy-en-Josas.
UNE MEILLEURE EVALUATION DES COLLECTIONS GRACE A
L’OBSERVATOIRE DE LA VARIABILITE GENETIQUE
Le projet VARUME (pour VARiabilité génétiques des RUMinants et des Equidés), financé par le
CASDAR, s’est terminé en 2014. L’objectif était d’automatiser des procédures permettant de publier
régulièrement des bilans de variabilité génétique, calculés à partir des généalogies. C’est un moyen
pour les gestionnaires de race de piloter au mieux la gestion des races dont ils sont responsables. Pour
le secrétariat de la Cryobanque, c’est aussi un appui pour repérer les races les plus en danger du point
de vue de leur « santé génétique », ce qui peut aider à prioriser les populations ou les animaux à
collecter.
Pour les ruminants, les premiers bilans seront publiés à la fin du premier semestre 2015 sur le site de
l’Institut de l'Elevage (http://www.idele.fr), pour toutes les races disposant de « suffisamment »
d’information généalogique. Pour les équidés, les associations d’éleveurs se positionneront cette année
quant à la diffusion, restreinte ou généralisée, de ces informations.
En dehors de la publication de ces bilans, l’automatisation de ces procédures permet de faciliter la
réalisation d’autres travaux en lien avec la variabilité génétique. Par exemple, avant de décider la
destruction totale de doses, un centre d’insémination peut contacter le secrétariat de la Cryobanque afin
que ce dernier évalue l’intérêt de ces stocks pour une conservation patrimoniale, en se basant sur les
généalogies des donneurs. C’est après une évaluation de ce type que, en bovins, des stocks de
taureaux Rouge des Prés et Parthenais ont rejoint les collections, et que de nouveaux béliers Charollais
et Vendéens devraient bientôt connaitre une destination identique. Toujours pour les collections de la
Cryobanque, il reste à formaliser une automatisation de leur évaluation génétique par rapport aux
populations actives afin d’actualiser leur contribution à la variabilité génétique de chaque race.
BREVE
Déménagement du site secondaire équin : le site II des équidés a quitté le Haras des Bréviaires (78) en
début d’année 2015 et a déménagé à la Jumenterie du Pin à Exmes dans l’Orne. Cela fait suite aux
réorganisations qui ont été opérées au sein de l’IFCE.
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