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Introduction 
 
Il apparait aujourd’hui que les données recueillies dans les établissements de santé pour la 
prise  en  charge  médicale  du  patient  ou  dans  les  bases  médico-économiques  (PMSI) 
constituent un potentiel majeur pour la recherche clinique et épidémiologique, les vigilances, 
l’évaluation de la  qualité  des  soins et  des  pratiques  professionnelles,  la  santé  publique  en 
général. Le croisement de bases de données cliniques et génomiques devient incontournable 
dans le domaine de la recherche biomédicale. 
Le  dossier  patient  informatisé  se  déploie  sur  les  établissements  facilitant  l’accès  à 
l’information, en la rendant plus disponible et exploitable directement.  
Des entrepôts de données biomédicaux se mettent en place ainsi que des entrepôts de données 
médico-économiques.  Ils  sont  alimentés  à  partir  du  système  d’information  hospitalier.  Ils 
permettent  par  exemple  d’étudier  la  faisabilité  d’une  étude,  de  constituer  des  cohortes  de 
patients,  ils  peuvent  être  le  support  pour  la  production  d’indicateurs  de  santé  ou  des 
indicateurs de pilotage de l’établissement. 
Les demandes d’accès aux dossiers médicaux des établissements se multiplient que ce soit en 
interne ou par des organismes extérieurs. On peut citer les audits IPAQSS, l’évaluation de la 
prise  en  charge  dans  un  réseau,  les  enquêtes  auprès  des  établissements  par  des  sociétés 
extérieures, les phases de pre-screening en recherche clinique, l’évaluation multicentrique des 
pratiques de soins, la validation d’un recueil par des enquêteurs extérieurs à l’établissement. 
De même les DIM sont de plus en plus souvent sollicités pour transmettre les données des 
fichiers PMSI (audits, registres, études d’évaluation, production d’indicateurs). 
Il faut souligner que la réutilisation des données de santé en dehors du contexte des soins 
constitue un changement de finalité du traitement des données par rapport au contexte de leur 
collecte, en  effet  elles  ont été initialement recueillies afin de permettre  la prise  en  charge 
médicale  des  personnes.  La  mise  en  place  d’un  dossier  médical  informatisé  dans  un 
établissement  de  santé  nécessite  une  déclaration  auprès  de  la  CNIL.  Dès  lors,  toute 
réutilisation à d’autres fins que le suivi des personnes nécessite une nouvelle démarche auprès 
de la CNIL afin de déclarer cette nouvelle finalité.  Si pour la recherche biomédicale
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 ou la 
recherche épidémiologique prospective les démarches semblent connues
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, l’encadrement des 
autres utilisations mérite d’être précisé.  
Le guide ne concerne pas les situations couvertes de façon réglementaire comme par exemple 
les contrôles externes ou les visites d’accréditation. 
 
Deux cas de figure sont distingués ci-après : 
-  l’accès aux données de santé à caractère personnel au sein de l’établissement par 
les  professionnels  de  l’établissement  sans  communication  à  l’extérieur  de 
l’établissement 
-  l’accès aux données de santé à caractère personnel au sein de l’établissement par 
des professionnels extérieurs à l’établissement ou leur communication à l’extérieur 
de l’établissement 
Dans  chaque  cas  sont  précisés  les  professionnels  susceptibles  d’effectuer  une  demande 
d’accès, des exemples de situations pratiques rencontrées, les règles de bonnes pratiques, un 
rappel  sur  l’information  du  patient,  les  formalités  à  effectuer  auprès  de  la  CNIL  par  le 
demandeur d’accès. 
Des schémas décisionnels sont fournis en annexe. 
                                                 
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Méthodologie de référence MR-001adoptée par la CNIL le 5 janvier 2006
 
2
 Voir Loi Informatique et libertés du 6 janvier 1978 modifiée (notamment chapitre IX)