Projet Spirales 2013

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PROJET SPIRALES 2013
JOUVENCE DU CALCULATEUR DE NOUMEA, POUR UN
MODELISATION DANS LE PACIFIQUE SUD
USAGE A LA
Modernisation des serveurs de calcul intensif
Modernisation de l’espace de stockage
Hébergement de la chaîne de traitement ‘’Couleur de l’eau’’ (Valhysat)
Acteurs
Jérôme Lefèvre, IPRA UMR 65 / UMR 235 IRD NOUMEA ([email protected])
Michel.Ménézo, Responsable SIL Nouméa ([email protected])
Christophe Menkes, Chercheur LOCEAN IRD NOUMEA ([email protected])
Pascal Douillet, Chercheur MIO IRD NOUMEA ([email protected])
Morgan Mangeas, Chercheur ESPACE-DEV IRD NOUMEA ([email protected])
Frédéric Marin, Chercheur LEGOS IRD NOUMEA ([email protected])
Serge Andrefouet, Chercheur COREUS IRD NOUMEA ([email protected])
Décembre 2012
Version 1.0
SOMMAIRE
Résumé ................................................................................................................................ 3
1. Introduction ..................................................................................................................... 4
2. Partenaires au Sud du projet .......................................................................................... 4
3. Description de l'équipement et son usage dans le contexte scientifique local .......... 5
4. Objet et détails de la demande financière...................................................................... 9
2
Résumé
Depuis 2005, plusieurs laboratoires du centre IRD de Nouméa peuvent conduire des
expériences numériques originales au moyen d’un calculateur construit à l’aide de deux
financements Spirales (DSI) et un financement ANR. Le fonctionnement et la maintenance du
calculateur sont supportés par les utilisateurs sur fonctionnements propres mais, après 7
années d’usage intensif, ponctuées d’optimisation et d’upgrade, les équipements de base sont
aujourd’hui vieillissants et deviennent de moins en moins adaptés aux codes de plus en plus
sophistiqués. Le projet GOPS*-EQUIPEX, dans lequel le besoin d’une jouvence du calculateur
avait été exprimé par les UMRs et les institutions partenaires du GOPS, est malheureusement
resté sans suite. Pourtant, en facilitant les expériences numériques complexes et longues, cet
outil permet d’accompagner les jeunes chercheurs dans leurs projets scientifiques, en plus
d’offrir une expertise numérique indispensable dans le cadre des programmes pluridisciplinaires
orientés vers l’observation et la compréhension de notre environnement régional. Le projet de
renouvellement prévoit une refonte du calculateur à travers le rééquipement en machines de
calcul de dernière génération. L'estimation de la jouvence du calculateur est basée sur
plusieurs devis sollicités auprès de fournisseurs locaux et nationaux, mais également auprès
d'un intégrateur australien de solutions High Performance Computing (HPC). Nous présentons
ici le projet de jouvence en considérant les leçons acquises au cours de l’exercice 2005-2012,
le potentiel de réutilisation de la structure existante et les nouveaux challenges en matière de
calculs numériques parallélisés et de traitement de larges jeux de données satellites qui se
présentent dans les prochaines années.
* Grand Observatoire de l’environnement et de la biodiversité terrestre et marine du Pacifique
Sud
3
1. Introduction
La présente demande de soutien budgétaire porte sur la jouvence du cluster de calcul (ci-après
calculateur) abrité dans les locaux de l’IRD Nouméa et dédié aux études de l’Océan et de
l’Atmosphère dans le Pacifique Sud. Outre l’ancrage et le développement en NouvelleCalédonie de l’expertise numérique à travers des modèles Océan et Atmosphère massivement
parallélisés, le calculateur a permis d’accompagner les Chercheurs dans l’étude du Climat,
moyennant une meilleure compréhension des processus atmosphériques et océaniques
régionaux ou locaux. Le calculateur permet également d’intégrer la dimension dynamique et la
variabilité climatique dans les investigations biogéochimiques ou biologiques (transport larvaire)
employant la modélisation.
Après un rappel de l’usage et des gains apportés par le système dans le paysage scientifique
local, la justification scientifique de la demande est exposée, à travers une synthèse des
prochains axes d’investigations numériques exprimés par les Chercheurs du Centre de
Nouméa.
En dernière partie, le projet technique et financier est résumé.
2. Partenaires au Sud du projet
Le cluster de Nouméa constitue une plateforme de calcul au service de trois UMR (213-MIO,
182-LOCEAN, 065-LEGOS), historiquement impliqués dans l’initiation et la montée en
puissance de l’équipement. Aujourd’hui, le projet de jouvence s’accompagne de plus de
partenariats avec les laboratoires du Centre de Nouméa, dont l’UR COREUS et l’UMR
ESPACE-DEV. Ces partenaires ont déjà par le passé directement ou indirectement bénéficié
des facilités de la plateforme et souhaitent initier de nouveaux programmes en s’appuyant
l’équipement. Cette expérience de plateforme a été portée concrètement au Sud notamment
vers le Pérou (Boris Dewitte) et le Mexique (Pascal Douillet). Mais c’est surtout en facilitant les
expériences numériques complexes et longues des Chercheurs et jeunes Chercheurs (Master,
Thèse et Post-doctorant) que l’’équipement permet d’initier et de donner de la valeur ajoutée
aux programmes tissés par les laboratoires avec la communauté du Pacifique (programme IRDIfremer huîtres perlières, fertilisation par les émissions volcaniques au Vanuatu, liens climat et
dengue, cyclogenèse et aléas naturels, …voir ci-après).
UMR IRD porteurs du projet
UMR 235 MIO (Institut Méditerranéen d’Océanologie) : Circulation lagonaire MARS 3D : transport
sédimentaire, production primaire, assimilation des données couleur de l’eau, houle et déferlement, …
UMR 182 LOCEAN (Laboratoire d’Océanographie et du Climat): Lien cyclogenèse et risque épidémiologique
avec le réchauffement climatique, interactions océan-atmosphère, Fertilisation océanique autour du Vanuatu,
Environnement des thonidés, …
UMR 065 LEGOS (Laboratoire d’Etudes en Géophysique et Océanographie Spatiales) : Climat,
Océanographie physique régional, circulation lagonaire, circulation atmosphérique, transport des polluants et
échanges Océan-Atmosphère et côtes-Large, …
UR 128 COREUS (Biocomplexité des Ecosystèmes Coralliens de l’Indo-Pacifique) : Lien hydroclimat
assemblage coralliens, vulnérabilité climatique et aléas naturels, indicateurs et gestion des ressources, perliculture,
…
UMR 228 ESPACE-DEV : Modélisation climatique, aléas naturels
Autres UMR IRD impliqués à travers des projets communs
UMR 202 ECOLAG : Transport et Fertilisation par le carbone suie du milieu marin
UMR 163 LMV: Transformations chimiques, transport et conséquences du dégazage volcanique associé au Vanuatu
Autres utilisateurs potentiels
IFREMER, sous réserve d’une participation significative à la capacité de calcul
4
3. Description de l'équipement et son usage dans le contexte
scientifique local
Mis en production en 2005, l’équipement de base a fait l’objet de nombreux upgrades à
périmètre constant, dont augmentation de mémoire vive, upgrade des CPUs AMD/Opteron en
technologie Dual-Core, ajout de nœuds de calcul, réseau rapide Infiniband, protection électrique
et augmentation régulière des espaces d’archivage. Ces principales étapes ont bénéficié de
l’appui de la DSI, mais également des sources d’auto-financement apportées par les projets
scientifiques s’appuyant sur le calculateur.
Résumé des principales étapes qui ont jalonné la montée en puissance du calculateur du Centre
Néanmoins, et comme cela avait signalé dans les échanges dans le cadre du projet de
financement GOPS-EQUIPEX en 2010, les composants de base du calculateur formant les
nœuds de calcul (cartes mères, processeurs et mémoires) montrent des signes d’obsolescence
(7 années d’usage à fonctionnement 24/24) en plus d’être de technologie dépassée. Leur
renouvellement, jusqu’ici repoussé, devient critique. Avec l’augmentation des besoins en
résolution spatiale des modèles, l’émergence de schémas numériques de plus en plus
sophistiqués et les nouveaux challenges associés au couplage entre physique et biogéochimie
(ROMS-PISCES, MARS-ECO3M) ou la chimie atmosphérique (WRF-CHEM), la demande pour
une augmentation de la vitesse d’intégration des modèles est de plus en plus pressante.
5
Justification du Calculateur dans le contexte régional
Une synthèse des usages du calculateur est
présentée en annexe A. Les projets et résultats
numériques produits grâce au calculateur du
Centre démontrent localement la place
importance de l’investigation numérique au côté
du Chercheur, dans le cadre de l’interprétation
des processus observés, la vérification
d’hypothèses, la construction d’indicateurs ou la
confection
de
canevas
expérimentaux
d’acquisition de la donnée in situ. Son utilité a
été à plusieurs reprises démontrée en
accompagnant les jeunes Chercheurs.
Dans les prochaines années, au moins 4 axes de Recherche porteurs et mobilisant le
calculateur sont identifiés :
Meilleure représentation de la SPCZ dans les modèles de climat et réponse de la
cyclogenèse au changement climatique (porteur LOCEAN):
Il s’agit de mieux comprendre la
dynamique et le devenir de la zone de
convergence du Pacifique Sud
(SPCZ) qui est au cœur de la
machine climatique du Pacifique Sud
et dans laquelle naissent les cyclones
de la région. Les modèles de climat
de l'IPCC du précédent round (AR4)
et du nouveau round (AR5) ont une
représentation
de
la
SPCZ
désastreuse
(congrès
ICSHMO,
Nouméa, 2012, meeting CLIVAR,
avril 2012) ce qui empêche de
conclure sur, par exemple, le devenir
des cyclones de la région à forte Anomalie de précipitation due au changement climatique
vulnérabilité et limite la portée des donnée par le modèle WRF en descente d’échelle (source M.
Bador)
exercices de descente d’échelle
statistique ou dynamique.
Le calculateur sera mobilisé dans le cadre d’expériences régionales portant sur la réponse de la
SPCZ et de la cyclogenèse au changement climatique. Les configurations atmosphériques du
modèle WRF testées à Nouméa et publiées (e.g Jourdain et al., 2011, Lefèvre et al., 2011,
thèses de S. Jullien et J. Lefèvre) permettent d’isoler les schémas de turbulence, de convection
et de microphysique les plus aptes à capturer la SPCZ. L’étude de la cyclogenèse s’appuiera
sur ces schémas testés dans des runs longs en mode changement climatique où le modèle
WRF sera alors forcé aux frontières par l'ensemble de modèles de l'IPCC AR4 et R5 sur la
période 1979-2000 et 2070-2099 selon un scénario de type SRESA2 (scénario dit "réaliste ou
pessimiste"). La comparaison entre les deux périodes permettra d'évaluer la modification
possible de la SPCZ et des cyclones avec notre climat changeant.
6
L’impact climatique et environnemental du volcanisme de l’arc Mélanésien (porteurs
LOCEAN, LEGOS, MIO et LMV):
L'île volcanique d'Ambrym émet quotidiennement l'équivalent de la moitié des émissions en
dioxyde de soufre du continent voisin Australien. Outre l’impact du dégazage sur les
populations locales, il est démontré, à travers l’analyse conjointe des observations satellites et
la modélisation (Lefèvre, in prep), que l’oxydation du SO2 conduit à la formation d’un panache
d’aérosols sulfatés très singulier pour cette région maritime. A travers leurs propriétés optiques
et microphysiques particulières, ces aérosols sont susceptibles de modifier localement le
forçage radiatif, la nébulosité et le transport méridien de chaleur et de vapeur sur la partie Ouest
de la SPCZ. Déjà mal appréciée à l’échelle globale, la question du forçage des aérosols sur la
SPCZ reste entière. Le calculateur du Centre est mobilisé pour creuser deux questions
particulièrement sensibles et concourant à l’amélioration des modèles de climat de prochaine
génération: la première porte sur le rôle du dégazage passif des volcans du Vanuatu et de
Papouasie Nouvelle-Guinée sur la composition atmosphérique, la seconde s’intéressera aux
interactions aérosols-nuages-précipitations, dont la représentation dans les modèles de
prévision climatique est très incertaine, mais dont on sait que la réponse est significative, car du
même ordre de grandeur que l'impact radiatif des gaz à effets de serre, mais de signe opposé.
Ces questions soulevées par la modélisation effectuée à Nouméa sont à la base d’un
programme en cours de montage associant l’Institution Océanographique Scripps, le LOA de
Lille et l’IRD, comportant des campagnes aéroportées d’observations des propriétés radiatives
des aérosols au Vanuatu et de la modélisation de chimie atmosphérique.
Par ailleurs, de récentes mesures en mer,
supportées par les simulations de
trajectoires des panaches volcaniques, ont
montré l’influence des produits de
dégazage sur la chimie atmosphérique des
îles tropicales situées sous le vent des
volcans, avec la manifestation de pluies
acides à plusieurs centaines de km des
sources volcaniques (par exemple pH 3.5
enregistré au Nord de la Nelle-Calédonie en
2008).
A partir de 2013, Il est prévu que le
calculateur vienne appuyer les nouveaux
programmes d’études pluri-disciplinaires
sur la question de la fertilisation et de la
spéciation du phytoplancton par les
cendres et les gaz volcaniques du Vanuatu
Mesure de pluie acides sous le vent d’Ambrym pendant la
(projets
financés
SAVALEFER, campagne Pandora (2012), vérifiée par la simulation de
CNES/TOSCA et COMEVA, LEFE).
panache volcanique avec le système WRF-flexpart (source
J.Lefèvre)
Outre la modélisation avec les gros codes Océan-Atmosphère permettant d’étudier le rôle de la
turbulence océanique et de la déposition des espèces atmosphériques, les projets SAVALEFER
et COMEVA comportent des investigations sur la spéciation des groupes phytoplanctoniques
qui nécessite l’exécution d’algorithmes bio-optiques et la manipulation de gros jeux de données
satellites. Spécialement pour ce projet, il est prévu d’héberger la chaîne de traitement
Valhysat (http://www.ird.fr/informatique-scientifique/projets/valhysat/), moyennant la
réutilisation d’une partie des anciens serveurs AMD-Opteron pour l’exécution de tâches de
traitement intensif en mode distribué en utilisant les avantages du réseau Infiniband (large
bande passante, faible latence).
7
Modélisation régionale et lagonaire en appui aux activités de surveillance, Recherche
fondamentale et aléas naturels (porteurs LEGOS, LOCEAN, MIO, COREUS):
Avec le portage concluant sur le calculateur d’une suite de codes massivement parallélisés de
très grande valeur scientifique (ROMS, WRF, MARS, FVCOM, SELFE, ADCIRC), des activités
de modélisation à multiples échelles (hauturier, lagon, estuaire), multiples échéances (analyse,
prévision) et multiples forçages (vent, marée, houle) sont aujourd’hui accessibles. Interfacés
avec d’autres modules, ces codes constituent aujourd’hui la composante dynamique de
nombreuses applications utilisées ou développées par les UMR ou leurs partenaires (transport
sédimentaire, larvaire, de contaminants, variabilité de la production primaire, qualité de l’air, …).
L’UMR LEGOS prévoit de nombreuses campagnes in situ de collecte d’observations
océanographiques dans les prochaines années (campagnes SprayAlis et LOSS, radiales
répétitives AltiGlidex à l’aide d’un planeur sous-marin ou glider, et bientôt mouillage hauturier
multi-disciplinaire SPOT), afin de documenter plus fidèlement la distribution des masses d’eau,
l’hydroclimat, le transfert de chaleur et d’énergie dans les eaux de la ZEE ; un modèle régional
de haute-résolution de la Nouvelle-Calédonie est indispensable pour interpréter ces
observations dans le contexte de la circulation océanique du Pacifique Sud. Dans le même
temps, l’UMR MIO porte le projet de représenter dans des configurations MARS et ROMS très
haute résolution, la houle et l’apport des eaux continentales afin d’évaluer la vulnérabilité des
petits territoires côtiers aux aléas naturels ou qui peuvent découler du changement climatique.
Enfin, l’unité CoRéUS dans le cadre de l’ANR Polyperl (Février 2012-Février 2015) consacrée
aux atolls perlicoles de Polynésie utilise des modèles MARS depuis 4 ans pour la simulation de
la dispersion larvaire des huitres perlières. Les premières configurations MARS-3D, créées en
2009 dans le cadre d’un projet européen FED ont été mises au point sur le cluster de Nouméa.
Distribution après ponte des larves d’huitres perlières à T=5,15 et 30 jours, atoll de Ahe, source Y. Thomas
Pour Polyperl, les simulations sont pour l’instant lancées sur le calculateur Caparmor de
l’Ifremer Brest, mais à terme pourraient être exécutées sur le calculateur de Nouméa. La
troisième année du projet demandant de nombreuses simulations pour la création d’un atlas
numérique des courants et de la dispersion lagrangienne dans 2 lagons d’atolls (Ahe et
Takaroa). Des exercices comparables sont en cours sur le lagon Calédonien à l’aide du logiciel
de transport larvaire de l’IRD ICHTHYOP, dans lesquelles le calculateur permettra de répondre
aux demandes d’augmentation de la résolution des champs hydrodynamiques autour des
passes et des récifs.
Modélisation des dynamiques spatiales pour le suivi des zones côtières et des milieux
terrestres à une échelle locale et régionale en exploitant l'imagerie satellitaire (porteur
ESPACE-DEV)
Les images satellites possèdent des résolutions spatiales, spectrales et temporelles de plus en
plus fines et nécessitent des capacités en termes de mémoire et temps de calcul importantes.
Cette tendance va aller en s'accentuant avec l'avènement de satellites de plus en plus
performants. Partant de ce constat, le cluster pourrait servir ponctuellement à effectuer du
traitement d'image et à mettre au point des modèles des dynamiques spatiales d'origine
naturelle ou anthropique sachant que la plupart des calculs peuvent être parallélisés.
Les produits numériques du calculateur interviennent déjà dans les thématiques prioritaires
8
identifiées dans le cadre de l'EQUIPEX GEOSUD et du GOPS, dont en particulier celle de la
dynamique d'émergence et de réémergence des maladies vectorielles (ESPACE-DEVLOCEAN) en tenant compte des données climatiques et environnementales. Les autres
thématiques dans lequel le calculateur est susceptible d’apporter une aide, à la manière du
projet de portage de la chaîne Valhysat sur le calculateur, sont :
-
le suivi des milieux et détection de changements (mangroves, sols nus, milieu urbain,
feux.)
-
La spatialisation et la modélisation de l’érosion hydrique des sols
4. Objet et détails de la demande financière
La demande porte sur le financement d’un calculateur de nouvelle génération composé de
serveurs à base de processeurs Xeon Intel Sandy Bridge, interconnecté par un réseau rapide
Infiniband sur port PCIe et équipé de mémoires vives et espace de stockage en adéquation
avec les besoins des grosses configurations utilisées par les UMRs, notamment celles
employant les codes ROMS-PISCES, WRF-CHEM ou MARS-ECO3M. Il est prévu sur la
période 2013-2014 de renouveler le calculateur en 2 tranches. La première tranche est détaillée
ci-après et repose sur des sources de cofinancement variées (MESR/GOPS, CNES et
expertise). La seconde tranche concernera l’achat de nœuds de calcul supplémentaires
moyennant leur financement sur projets et/ou l’ouverture à de nouveaux utilisateurs. Par
exemple, l’IFREMER est un utilisateur potentiel du calculateur, mais dont la jouissance du
calculateur fait actuellement l’objet de négociation, sous la forme d’une participation significative
à l’augmentation de la capacité de calcul mais également à son administration.
D’une capacité initiale de 60 unités de calculs pour une puissance théorique de 574 GFlops
rassemblés dans 8 serveurs Opteron, la puissance de calcul de l’ancien calculateur sera
remplacée par une capacité de 2688 GFlops moyennant l’achat de 6 serveurs dual-socket
comportant les nouveaux processeurs 8-cores Xeon E5-2687W en technologie Sandy Bridge.
En outre, la capacité de stockage sera considérablement augmentée moyennant l’ajout au sein
du cluster de calcul d’un serveur NAS d’une capacité de 30 To extensible jusqu’à 108 To. Dans
cette configuration, les équipements réseaux actuels (Switch Gigabit-Ethernet et Infiniband,
protection électrique) sont conservés. Pour bénéficier du réseau rapide Infiniband à haut débit
et faible latence, les nouveaux serveurs sont dotés chacun d’une carte réseau Infiniband
(modèle MHGH29B-XTR).
L’enveloppe financière de l’opération a été évaluée en consultant un intégrateur australien
spécialisé en solution HPC (Xenon), mais également les fournisseurs de serveurs de calcul en
France (Transtec, Serviware) et en Nouvelle-Calédonie (Infocom). L’évaluation ci-dessous est
établie sur la base des offres offrant le meilleur rapport qualité/prix. La solution intégrateur (à
base de serveurs rackables 4U quadri-motherboard & quadri-socket Xeon E5-2650) n’est pas
retenue car trop cher pour des performances moindre comparées à la solution grappe de PC
sur base de stations de travail Asus Z9PE-D8 et Xeon E5-2687W proposé par Infocom ou
Serviware. D’autre part, la solution grappe de PC sous Linux sur base de serveurs bi-socket a
fait ses preuves à Nouméa, en permettant de conjuguer performance et flexibilité en cas de
défaillance d’un des serveurs.
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4.1. Origine des cofinancements
Pour mener à bien cette opération de jouvence du calculateur, un travail en amont depuis fin
2011 a été réalisé afin de disposer de plusieurs sources de cofinancement totalisant à ce jour
40 k€. Ces dernières sont :
-
Un soutien MESR/GOPS de 25 000 € pour le maintien et le développement du calcul
intensif en Nouvelle-Calédonie. Ces crédits proviennent du Ministère de l’Enseignement
Supérieur et de la Recherche après évaluation de l’AllEnvi du projet de Jouvence du
cluster de Nouméa,
-
Une réservation pour équipement informatique sur projet SAVALEFER CNES/TOSCA,
pour un montant de 8 250 €,
-
Une indemnité locale pour expertise SOPRONER-AEL-IRD, pour un montant de 6 750 €
4.2. Réutilisation du cluster de première génération
Bien que vieillissant (3 serveurs défaillants sur 11 initiaux), le projet de jouvence prévoit
également une seconde vie aux serveurs AMD-Opteron composant le calculateur de première
génération (capacité: 60 cpus cadencés à 2.5 ghz) en, d’une part, les conservant pour des
tâches parallélisées intensives de priorité moindre, et d’autre part en les réutilisant pour le
traitement d’images hyperspectrales en mode distribué (continuité du projet Valhysat et son
utilisation intensive programmée dans le cadre du projet SAVALEFER). Des projets similaires
de manipulations de données hyperspectrales sont envisagés par l’UMR Espace-Dev et les
chaînes de traitement de cette UMR seront portées sur le calculateur AMD-Opteron.
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ANNEXE A
Contribution du cluster de calcul du Centre de Nouméa à la Recherche
Projets de Recherche réalisés en appui sur le calculateur
Chantier PREVIMER : Océanographie opérationnelle ROMS dans Ocean-Mercator (Marchesiello P., et
al, 2008: Keys to affordable regional marine forecast systems. Mercator Ocean Quarterly Newsletter,
N°30, 38-48, July 2008.)
ANR VULN 0002 : Cyclones et climat, 2007-2009, Menkes et al. 2006
ZONECO 2008-2010 Marchesiello et al.: Modélisation de l’environnement des thonidés dans la ZEE
calédonienne
ZONECO 2010-2012 : Menkes et al. Modélisation de l’environnement du micronecton dans la ZEE
calédonienne
Projets de Recherche en cours s’appuyant sur le calculateur
Projet SAVALEFER (CNES/TOSCA) 2012-2015. Menkes et al. (LOCEAN, LEGOS, MIO, LMV,
Scripps)
Projet COMéVA (LEFE/CYBER) 2012-2015. Rodier et al. (MOI, LOCEAN, LEGOS, LOG, Scripps)
Projet OWEN (CNES) 2012-2015 Cravatte et al. (LEGOS, LOCEAN)
Thèses et Post-Doctorants:
Xavier Couvelard (LEGOS, 2007): Thèse : Dynamique des jets barotropes dans la Pacifique Sud-Ouest
Xavier Couvelard (LEGOS, 2010): Post doc : Modélisation des thonidés dans la ZEE calédonienne
Vincent Faure (LOPB, 2006) : Thèse : Modélisation biogéochimique tridimensionnelle du lagon de
Nouméa
Nicolas Jourdain (LOCEAN, 2009) : Post doc : Cyclogenèse dans le Pacifique Sud-Ouest
Vincent Faure (LOCEAN, 2009-2010) : Post Doc : Etude régionale du Pacifique Sud-Ouest à l'aide d'un
modèle 3D couplé physique-biogéochimique (ROMS+PISCES)
Jérôme Lefèvre (LEGOS, 2012): Effet du dégazage volcanique du Vanuatu sur la composition et la
dynamique atmosphérique (WRF-CHEM)
Andres Vega Post Doc (LEGOS 2008-2010): Previmer ; mise en place d’un démonstrateur de prévision
océanique.
Andres Vega Post Doc (LOCEAN 2010-2012): ZONECO : Modélisation du micronecton dans la ZEE
calédonienne.
Rosalie Fuchs (LOPB, 2012) : Modélisation lagonaire et assimilation des données couleur de l’eau
(MARS3D)
Masters effectués sur le Cluster conduisant à des sujets de thèse :
Swen Jullien: Interactions et échanges de flux Cyclones-Océan, 2010
Severin Thibaut: Variabilité et projection des cyclones dans les scénarios de réchauffement climatique,
2011
Antoine Babonneix: Alimentation du sous courant équatorial. 2011
Margot Bador. Cyclogénèse dans le Pacifique Sud ouest 2012
Lucie Bordois. Circulation dans le grand Passage. 2012
Autres (expertises) :
Modélisation haute résolution des conditions de rejets du multi-diffuseur de Vale INCO (Convention IRD
LOPB – Vale Inco)
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Travaux publiés s’appuyant sur le Cluster de calcul de Nouméa :
Martinez E., Ganachaud Alexandre, Lefèvre Jérôme, Maamaatuaiahutapu K. Central South Pacific
thermocline water circulation from a high-resolution ocean model validated against satellite data :
seasonal variability and El Nino 1997-1998 influence. Journal of Geophysical Research-Oceans, 2009,
114, C05012
Marchesiello Patrick, Debreu L., Couvelard Xavier. Spurious diapycnal mixing in terrain-following
coordinate models : the problem and a solution. Ocean Modelling, 2009, 26 (3-4), p. 156-169. ISSN
1463-5003
Ouillon Sylvain, Douillet Pascal, Lefebvre Jean-Pierre, Le Gendre Romain, Jouon A., Bonneton P.,
Fernandez Jean-Michel, Chevillon Christophe, Magand O., Lefèvre Jérôme, Le Hir P., Laganier R.,
Dumas F., Marchesiello Patrick, Bel Madani A., Andréfouët Serge, Panché Jean-Yves, Fichez Renaud.
Circulation and suspended sediment transport in a coral reef lagoon : the south-west lagoon of New
Caledonia. In : Grenz Christian (ed.), Le Borgne Robert (ed.). New Caledonia tropical lagoons : an
overview of multidisciplinary investigations. Marine Pollution Bulletin, 2010, 61 (7-12), p. 269-296.
ISSN 0025-326X
Marchesiello Patrick, Lefèvre Jérôme, Vega Andres, Couvelard Xavier, Menkes Christophe, Coastal
upwelling, circulation and heat balance around New Caledonia's barrier reef. In : Grenz Christian (ed.),
Le Borgne Robert (ed.). New Caledonia tropical lagoons : an overview of multidisciplinary
investigations. Marine Pollution Bulletin, 2010, 61 (7-12), p. 432-448. ISSN 0025-326X
Lefèvre Jérôme, Marchesiello Patrick, Jourdain Nicolas, Menkes Christophe, Leroy A. Weather regimes
and orographic circulation around New Caledonia. In : Grenz Christian (ed.), Le Borgne Robert (ed.).
New Caledonia tropical lagoons : an overview of multidisciplinary investigations. Marine Pollution
Bulletin, 2010, 61 (7-12), p. 413-431. ISSN 0025-326X
Couvelard Xavier, Marchesiello Patrick, Gourdeau Lionel, Lefèvre Jérôme. Barotropic zonal jets induced
by islands in the southwest Pacific. Journal of Physical Oceanography, 2008, 38, p. 2185-2204.
Jourdain N. C., Marchesiello Patrick, Menkès Christophe, Lefèvre Jérôme, Vincent E. M., Lengaigne
Matthieu, Chauvin F. Mesoscale simulation of tropical cyclones in the South Pacific : climatology and
interannual variability. Journal of Climate, 2011, 24 (1), p. 3-25. ISSN 0894-8755
Faure V., Pinazo, C., Torréton, J. P., Douillet, P, Modelling the spatial and temporal variability of the SW
lagoon of New Caledonia, II: Realistic 3D simulations compared with in situ data, Marine Pollution
Bulletin, 61, 480-502 (2010).
Fuchs Rosalie, Pinazo C., Douillet Pascal, Dupouy Cécile, Faure Vincent, Mangin A. New Caledonia
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(ed.), Won J.S. (ed.), Feng A. (ed.) Remote sensing of the coastal ocean, land, and atmosphere
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Toulouse (FRA), 2010/09/20-23. ISSN 0277-786X
Mari, Xavier, Jérôme Lefèvre, Jean-Pascal Torréton, Yvan Bettarel, Olivier Pringault, Emma RochelleNewall, Patrick Marchesiello, Christophe Menkes, Martine Rodier, Christophe Migone, Chiaki Motegie,
Markus G. Weinbauere, and Louis Legendre, The effects of soot on organic matter dynamics and
microbial processes in the water column" Submitted, Limnology & Oceanography L&O 11-222 "
Jullien S.; Christophe Menkes; Patrick Marchesiello; Nicolas Jourdain; Matthieu Lengaigne; Ariane
Koch-Larrouy; Jérôme Lefèvre; Emmanuel Vincent; Vincent Faure, "Impact of tropical cyclones on the
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