CYTOLOGIE RESUME
1 Chimie Préparatoire ........................................................................................................... 4
1.1 organisation moléculaire ............................................................................................ 4
1.2 chimie ......................................................................................................................... 4
1.2.1 Atome ..................................................................................................................... 4
1.2.1.1 Organisation de l'atome ................................................................................... 4
1.2.1.2 Valence ............................................................................................................ 4
1.2.2 La molarité ............................................................................................................. 4
1.2.3 Liaisons chimiques ................................................................................................. 5
1.2.3.1 liaison covalente .............................................................................................. 5
1.2.3.2 liaison ionique ................................................................................................. 5
1.2.3.3 liaison hydrogène ............................................................................................ 5
1.3 Propriétés physico-chimique en relation avec le maintien du vivant ........................ 5
1.3.1 Importance de l'eau ................................................................................................ 5
1.3.2 la solvatation .......................................................................................................... 5
1.3.3 Acidité / Ph ............................................................................................................ 6
2 Biochimie ........................................................................................................................... 6
2.1 Molécules organiques ................................................................................................ 6
2.1.1 Les glucides ........................................................................................................... 6
2.1.2 Les lipides .............................................................................................................. 7
2.1.3 Les protéïnes .......................................................................................................... 7
2.1.3.1 structures chimiques ........................................................................................ 7
3 Thermodynamique ............................................................................................................. 9
3.1.1 conservation de l'énergie ........................................................................................ 9
3.1.2 évolution en physique macroscopique ................................................................... 9
3.1.2.1 Entropie ......................................................................................................... 10
3.1.3 Le concept de l'énergie libre ................................................................................ 10
3.1.3.1 Réactions exergoniques (ou exothermiques) ................................................ 10
3.1.3.2 Réactions endergoniques (endothermiques) ................................................. 10
4 La cellule .......................................................................................................................... 10
4.1 Technique d'études ................................................................................................... 11
4.1.1 La microscopie (pp: 4-6) ...................................................................................... 11
4.1.1.1 microscopie optique (ou photonique): .......................................................... 11
4.1.1.2 microscopie électronique .............................................................................. 11
4.1.1.3 microscopie à fluorescence ........................................................................... 11
4.1.1.4 préparation des échantillons .......................................................................... 12
4.1.2 Autres techniques ................................................................................................. 12
4.2 Théorie cellulaire (p 6) ............................................................................................. 12
4.3 Types de cellules (p 7-8) .......................................................................................... 12
4.3.1 Les cellules procaryotes ....................................................................................... 12
4.3.2 Les cellules eucaryotes ........................................................................................ 12
4.3.2.1 Tailles des différents éléments ...................................................................... 13
4.3.2.2 Exemple de cellules eucaryotes .................................................................... 13
5 La membrane ................................................................................................................... 14
5.1 définition .................................................................................................................. 14
5.2 Composition chimique ............................................................................................. 14
5.3 Dynamique membranaire ......................................................................................... 15
6 Métabolisme: énergie de la cellule .................................................................................. 15
6.1 Introduction .............................................................................................................. 15
6.1.1 Termes de base ..................................................................................................... 15
6.1.2 Autotrophes .......................................................................................................... 15
6.1.3 Hétérotrophe ........................................................................................................ 15
6.2 Energie cellulaire ..................................................................................................... 15
6.2.1 respiration cellulaire ............................................................................................. 15
6.2.1.1 Glycolyse....................................................................................................... 15
6.2.1.2 La molécule d'ATP ........................................................................................ 16
6.3 les mitochondries ..................................................................................................... 16
6.3.1 morphologie ......................................................................................................... 17
6.3.1.1 membrane externe ......................................................................................... 17
6.3.1.2 chambre externe ............................................................................................ 17
6.3.1.3 membrane interne .......................................................................................... 17
6.3.1.4 matrice ........................................................................................................... 17
6.3.2 Transformation de l'ADP en ATP ........................................................................ 17
7 le cytosquelette ................................................................................................................. 18
7.1 Généralités ............................................................................................................... 18
7.1.1 Définition ............................................................................................................. 18
7.1.2 3 types de filaments ............................................................................................. 18
7.1.2.1 Microfilaments d'actine ................................................................................. 18
7.1.2.2 Microtubules ................................................................................................. 18
7.1.2.3 Filaments intermédiaires ............................................................................... 18
7.2 Les microfilaments d'actine ..................................................................................... 18
7.2.1 La forme G ........................................................................................................... 18
7.2.2 La forme F ............................................................................................................ 19
7.2.2.1 Polymérisation de l'actine ............................................................................. 19
7.2.2.2 Fonctions ....................................................................................................... 19
7.2.3 Types d'arrangements des fibres d'actine ............................................................. 19
7.2.3.1 protéines associés à l'actine: exemple ........................................................... 19
7.2.4 Poisons de l'actine ................................................................................................ 19
7.3 Les filaments intermédiaires .................................................................................... 20
7.4 Les microtubules ...................................................................................................... 20
7.4.1 Centrioles, centrosomes et COMT ....................................................................... 20
7.4.2 Fonctions .............................................................................................................. 21
7.4.3 Cils et flagelles ..................................................................................................... 21
8 Noyau / mitose / meiose ................................................................................................... 21
8.1 Noyau cellulaire ....................................................................................................... 21
8.2 Interphase ................................................................................................................. 21
8.2.1 Phase G1 .............................................................................................................. 21
8.2.2 Phase S ................................................................................................................. 22
8.2.3 Phase G2 .............................................................................................................. 22
8.2.4 Les "check-point" du cycle cellulaire .................................................................. 22
8.3 Mitose ...................................................................................................................... 22
8.3.1 Prophase ............................................................................................................... 22
8.3.2 Métaphase ............................................................................................................ 22
8.3.3 Anaphase .............................................................................................................. 23
8.3.4 Télophase ............................................................................................................. 23
8.4 méiose ...................................................................................................................... 23
8.4.1 termes de base ...................................................................................................... 23
8.4.2 Première division (division réductionnelle: sépare les paires de chromosomes
homologues) 23
8.4.2.1 Prophase 1 ..................................................................................................... 23
8.4.2.2 Métaphase 1 .................................................................................................. 24
8.4.2.3 Anaphase 1 .................................................................................................... 24
8.4.2.4 Télophase 1 ................................................................................................... 24
8.4.3 Deuxième division: Division équationnelle (sépare les chromatides- soeurs) .... 24
8.4.3.1 Prophase 2 ..................................................................................................... 24
8.4.3.2 Métaphase 2 .................................................................................................. 24
8.4.3.3 Anaphase 2 .................................................................................................... 24
8.4.3.4 Télophase 2 ................................................................................................... 25
8.5 Conclusion ............................................................................................................... 25
8.5.1 mitose ................................................................................................................... 25
8.5.2 meïose .................................................................................................................. 25
8.5.3 possibilité d'évolution?......................................................................................... 25
9 Le réticulum endoplasmique- Golgi- Lysosomes ............................................................ 25
9.1 Le réticulum endoplasmique .................................................................................... 25
9.1.1 Réticulum endoplasmique Granuleux .................................................................. 26
9.1.1.1 Synthèse des protéines .................................................................................. 26
9.1.1.2 Glycosylation ................................................................................................ 26
9.1.1.3 Détoxification ................................................................................................ 26
9.1.1.4 Accumulation d'ions Ca2+ ............................................................................. 26
9.1.2 Le réticulum Endoplasmique lisse (REL) ............................................................ 27
9.1.2.1 Fonctions ....................................................................................................... 27
9.1.2.2 Synthèse des lipides ...................................................................................... 27
9.1.2.3 Détoxification ................................................................................................ 27
9.2 Appareil de Golgi (AG) ........................................................................................... 27
9.2.1 Fonction ............................................................................................................... 27
9.2.2 les Dyctiosomes ................................................................................................... 27
9.2.2.1 Région "Cis" .................................................................................................. 27
9.2.2.2 Région "médiane" ......................................................................................... 27
9.2.2.3 Région "Trans" .............................................................................................. 28
9.2.3 Glycosylation ....................................................................................................... 28
9.3 Les Lysosomes ......................................................................................................... 28
9.3.1 Formation des lysosomes ..................................................................................... 28
9.3.2 Membrane lysosomale ......................................................................................... 28
10 Trafic cellulaire ................................................................................................................ 28
10.1 transport passif ......................................................................................................... 28
10.2 Transport Actif ......................................................................................................... 29
10.3 Endocytose ............................................................................................................... 29
10.3.1 Pinocytose (action de "boire") ........................................................................... 29
10.3.2 phagocytose (action de "manger") ..................................................................... 29
10.3.3 endocytose par récepteurs interposés ................................................................. 30
10.3.3.1 Exemples ..................................................................................................... 30
10.4 Exocytose ................................................................................................................. 31
1 CHIMIE PREPARATOIRE
1.1 ORGANISATION MOLECULAIRE
du plus simple au plus complexe:
particule atome molécule protéine cellule
1.2 CHIMIE
1.2.1 ATOME
Particule d'un élément chimique qui forme la plus petites quantités susceptible de se
combiner
élément indivisible sans perte de propriétés physique" (c'est le cas de la fission
nucléaire)
1.2.1.1 Organisation de l'atome
A. particules
proton [p+] : charge positive masse = 1 dans le noyau
neutron [n0] : charge neutre masse = 1 dans le noyau
électron [e-] : charge négative masse ~ 0 en périphérie
Dans un atome il y a autant de proton que d'électron (pour maintenir une charge neutre).
B. Les isotopes
c'est une variante du même atome (même nombre de p+ mais nombre différent de n°
ex: 12C (carbone 12) p+= 6 n° = 6
14C (carbone 14) p+= 6 n° = 8
les isotopes ont donc la même propriété chimique (autant de charge positive et de charge
négative), mais pas le même poids.
C. nombre et masse atomique
Z (nombre atomique)= nombre de proton = nombre d'électron
M (masse atomique)= nombre de proton + nombre de neutron
1.2.1.2 Valence
C'est le nombre d'électron qu'un atome peut échanger avec un autre dans le but d'atteindre
l'octet. règle de l'octet: la dernière couche d'un atome est stable quand elle possède 8 électrons
1.2.2 LA MOLARITE
une mole = 6,023 . 1023 atomes ou molécule dans 1 litre de solvant
A. Poids moléculaire
M= poids relatif à l'atome d'H ou 1/12 12C = 1 D(alton)
1 D * 6,023.1023 = 1 g => si M = 180 D pM= 180g
B. Molarité
mesure de concentration.
1 molaire= 1 mole/litre de solution
1.2.3 LIAISONS CHIMIQUES
liaisons chimiques = échange d'e-
1.2.3.1 liaison covalente
mise en commun d'e- pour arriver à l'octet
1.2.3.2 liaison ionique
attraction et perte définitive d'au moins un e- d'un "élément positif" (cation) en faveur d'un
"élément négatif" (anion)
stabilité de la molécule assurée par interaction entre charges opposées
=> partage inégal de e- entre 2 atomes
1.2.3.3 liaison hydrogène
liaison faible et temporaire
atome déjà lié attiré par un atome très électronégatifs
délocalisation de charge
1.3 PROPRIETES PHYSICO-CHIMIQUE EN RELATION AVEC LE
MAINTIEN DU VIVANT
réaction chimique du vivant nécessite forcément milieu acqueux
1.3.1 IMPORTANCE DE L'EAU
échange et transport de molécule
intervient dans l'ensemble des réactions du métabolisme
régulation de la pression osmotique
chaleur spécifique inertie thermique
grande chaleur de vaporisation => température interne constante à forte
température (transpiration)
1.3.2 LA SOLVATATION
Capacité des molécules polaires à venir interagir avec d'autres atomes ou molécules.
+
+
-
molécule polaire
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