Génétique – Dr Vinciguerra Dahlem - Deau
11/04/2008
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A. Gène du facteur VIII (Approche directe)
Diapos 8 à 22
Il s'agit d'un gène énorme, de 3000pb, la protéine est donc très longue. (retenir que le
gène est très long). L'exon 14 en particulier contient beaucoup de mutations.
Dans l'approche indirecte on utilise quatre polymorphismes intragéniques et deux
extragéniques, mais seuls 70% des cas peuvent être renseignés, les autres ne sont pas
informatifs. De plus même si le cas est informatif, il existe un risque d'erreur non négligeable au
moment de donner un conseil génétique: 3 à 5% !
1)
Inversion de l'intron 22 Diapos 11 à 19
En 1993 on a découvert le phénomène d'inversion de l'intron 22. En utilisant une technique
de criblage on trouvait des mutations dans 90% des cas, mais chez les hémophiles sévères on ne
trouvait un mutation que dans 50% des cas.
On a donc étudié les transcrits du gène du facteur VIII, assez difficile quand on les trouve
principalement au niveau du foie et qu'il faut faire une biopsie chez un hémophile… On a
découvert qu'en utilisant des primers dans la région de jonction des exons 22 et 23 l'amplification
était impossible. On a alors trouvé un gène dans l'intron 22:
FVIII A
qui code dans l'autre sens, et
possède une copie située au niveau de chacun des télomères. Quand le chromosome se replie sur
lui-même on peut avoir une recombinaison de la région des exons 1 à 22 qui se retrouve sur le
télomère, tandis que les exons 23 à 26 restent en place. La transcrit n'est donc plus continu, et il
n'y a plus de facteur VIII. Ce phénomène est appelé inversion de l'intron 22.
Ceci explique les cas d'hémophilie sporadique, en effet 20% des hémophiles n'ont pas
d'antécédents familiaux.
Avec le Southern blot, on observe pour la conductrice un dédoublement des bandes, 6 au
lieu de 3, mais avec toujours la même quantité d'ADN.
2)
Inversion de l'intron 1 Diapos 20 et 21
Le mécanisme ressemble à celui de l'intron 22: la séquence Int1h-1 code dans le même
sens que le facteur VIII, et la séquence Int1h-2 code dans le sens inverse un peu plus loin.
3)
Mutations dans le gène du facteur VIII Diapo 22
"Small deletion" = moins de 50 pb, la protéine est tronquée ou le cadre de lecture est
décalé.
On a 4% de délétions de grande taille, 12,7% de faux sens.
"Splice" = épissage
Pour les 2 à 3% de cas pour lesquels on ne trouve rien, on réessaye l'analyse indirecte.
Dans le cas de mutations faux sens nouvelles il est très difficile de savoir si la mutation est
effectivement responsable de la maladie.
B. Gène du facteur IX
Diapos 23 à 25
C'est un gène plutôt court (35 kb), situé sur le chromosome X, et il est mieux connu que le
gène du facteur VIII (parce qu'il est plus petit).
Avec les polymorphismes on obtient 80% d'informativité, donc avec la seule approche
indirecte 80% des familles peuvent être renseignées.
On a ainsi pu caractériser de nombreux patients.