ECOLE DOCTORALE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA SANTE

Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l’Hôte, M2iSH, UMR INSERM/Université
d’Auvergne U1071 (Pr Darfeuille-Michaud)
Directeur de thèse : N. BARNICH (MCU)
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Etude de l’évolution et du rôle des flagelles dans la virulence de souches de Escherichia coli
adhérentes-invasives impliquées dans l’inflammation intestinale chronique
Les lésions iléales de patients maladie de Crohn (MC) sont anormalement colonisées par des
souches pathogènes de Escherichia coli appartenant au pathovar AIEC (Adherent-Invasive E. coli).
L’infection de souris par des bactéries AIEC induit l’expression de deux récepteurs de l’immunité
innée, TLR5 et IPAF, capables de détecter la présence de flagelline, expliquant la potentialisation de
la réponse immunitaire mucosale. La souche de référence LF82 exprimant une protéine FliC modifiée
par rapport à une souche commensale, nous proposons d’étudier (i) la réponse de l’hôte à l’infection
sur cellules épithéliales intestinales et en modèle murin en fonction du type de flagelle exprimé par
différentes souches AIEC, (ii) l’évolution pathoadaptative de la protéine FliC dans une collection de
souche AIEC récemment établie au laboratoire (iii), l’impact des polymorphismes sur la virulence en
remplaçant sur le chromosome de la souche de référence AIEC LF82 le gène fliC par différents
variants du gène fliC identifiés. L’induction de la réponse inflammatoire au niveau intestinal sera
évaluée dans différents modèles murins en réponse à l’infection par les différents mutants construits.
Ce travail permettra d’identifier les variants FliC impliqués dans la modulation du pouvoir pathogène
des AIEC, et donc de nouvelles cibles potentielles pour des molécules d’anti-virulence qui pourront
être testées sur ces modèles cellulaires, animaux et à plus long terme chez les patients.
- DREUX N et al., BARNICH N. Plos Pathogens, 2013.