M2iSH « Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l’Hôte », UMR 1071 Inserm/Université d’Auvergne, USC INRA 2018 (Pr. A. Darfeuille-Michaud) Directeur de thèse: Hang NGUYEN (CR2 Inserm) [email protected] Rôle de la voie de signalisation GCN2/eIF2/ATF4 dans la réponse de l’hôte à l’infection par des E. coli associés à la maladie de Crohn. La muqueuse iléale des patients atteints de la maladie de Crohn (MC) est anormalement colonisée par des E. coli adhérents et invasifs (AIEC) ayant la capacité d’envahir les cellules épithéliales intestinales et de se multiplier en macrophages en induisant une forte réponse inflammatoire. Suite à l’infection par les AIEC, l’autophagie-un processus permettant la dégradation du contenu cytoplasmique par le lysosome-est induite dans les cellules hôtes afin de limiter la multiplication intracellulaire des bactéries. Cependant, les voies de signalisations cellulaires permettant l’induction de l’autophagie en réponse à l’infection restent mal connues. Il a été montré que la voie GCN2/eIF2/ATF4 est nécessaire pour activer l’autophagie en réponse à un stress cellulaire. Afin de définir le rôle de cette voie dans la réponse de l’hôte à l’infection par des AIEC, nous proposons d’étudier (i) la capacité des AIEC à moduler cette voie, (ii) l’importance de cette voie dans la régulation de l’autophagie afin de contrôler la multiplication intracellulaire des AIEC et la réponse inflammatoire, et (iii) l’implication de cette voie dans la régulation de la composition du microbiote intestinal, qui a été montré comme étant modifié dans la MC, en condition physiologique et en réponse à l’infection par des AIEC. Ces travaux seront effectués en utilisant des modèles d’infections cellulaires et des souris invalidées pour le gène GCN2 ou ATF4. Nguyen H, et al. Crohn's disease-associated adherent invasive Escherichia coli affect levels of microRNAs in intestinal epithelial cells to reduce autophagy. Gastroenterology 2014, 146:508-19.