sujet 2012

PROPOSITION DE STAGE M2 Océanographie
2012-2013
Equipe d’accueil :
- Intitulé de l’équipe : Microbiologie Environnementale Biotechnologie (MEB)
- Nom du responsable de l’équipe d’accueil : Patricia Bonin
- Nom du Maître de stage (si différent) : préciser le titre ou grade du responsable,
HDR ou pas : Nathalie Pradel, CR1, HDR.
- Tel : [phone] Fax : [phone] email : [e-mail]
Projet de Stage
Titre du projet proposé :
Etude de la diversité des procaryotes multicellulaires magnétotactiques.
Les bactéries magnétotactiques ont été mises en évidence dans les sédiments d’eau douce et
d’eau de mer; cependant, leur distribution, leur diversité, et leur rôle biogéochimique dans ces
habitats restent peu clair. Ces bactéries minéralisent des nanocristaux intracellulaires de
magnétite ou de greigite. Elles semblent jouer un rôle important dans les cycles du soufre et
du fer. Nos objectifs sont d’étudier (i) la diversité des bactéries magnétotactiques marines sur
les côtes françaises; (ii) cultiver et caractériser de nouvelles souches, avec un intêret
particulier pour les procaryotes magnétotactiques multicellulaires (MMPs).
Lors de nos précédents travaux, nous avons étudié les communautés de bactéries
magnétotactiques dans des sites soumis à des activités intensives de l'industrie pétrolière, sur
la côte méditerranéenne française. Nous avons mis en évidence une grande diversité et une
variation des communautés de bactéries magnétotactiques au cours du temps (Postec et al.,
2012). L'étude de cette diversité bactérienne est une des priorités de notre travail. Certaines de
ces bactéries sont des MMPs. Ils peuvent être de deux types : (i) composés de 10-16 cellules
arrangées symétriquement en spirale, appelés "rosettes"; (ii) semblables à des "ananas" avec
30-48 cellules arrangées en cercles entrelacés. Nous étudierons la phylogénie des ces
microorganismes en utilisant la technique DGGE, et nous développerons des techniques
d’isolement afin de caractériser des souches de MMPs.