Stage proposé par Claire Chazaud Fonctions et Organismes d’appartenance CR INSERM Nom et adresse du Laboratoire ou de l’Unité : GReD (Génétique, Reproduction & Développement) UMR CNRS 6293/INSERM U1103/Clermont Université UFR Médecine, 28 place Dunant BP38 63001 Clermont-fd cedex Téléphone : 04 73 17 83 80 Mail : [email protected] Site internet : http://www.gred-clermont.fr/ Directeur du Laboratoire ou de l’Unité : Chantal Vaury Intitulé de l ‘équipe d’accueil : Contrôle génétique et épigénétique de la spécification cellulaire au cours du développement de la souris. Responsable de l’équipe : Claire Chazaud/ Philippe Arnaud Résumé du thème de recherche de l’équipe (une dizaine de lignes maximum) L'identité cellulaire est contrôllée par des mécanismes génétiques et épigénétiques. Notre équipe analyse en particulier la spécification des lignages cellulaires pendant la préimplantation (CC) et le développement neural (PA) au cours du développement de la souris. Nous étudions ces programmes développementaux qui requièrent l'action concertée de facteurs de transcription et de voies de signalisation cellulaire, et sont accompagnés ou causés par des modifications épigénétiques. Titre du projet de stage : Différenciation des cellules souches de l'embryon: régulation de l'expression de Gata6 pendant la préimplantation Responsable du stage: Claire Chazaud Tel: 04 73 17 83 80 Mail: [email protected] Projet de stage : Au troisième jour de développement, l'embryon de souris est constitué de trois types cellulaires distincts: les cellules souches du trophectoderme, de l'épiblaste et de l'endoderme primitif (EPr). Notre équipe analyse les mécanismes moléculaires de la différenciation des cellules en épiblaste ou en EPr. Nous avons montré que cette différenciation dépend des interactions antagonistes de deux facteurs de transcription, Nanog et Gata6 ainsi que de la voie de signalisation Fgf. En effet, sans Nanog ou sous l'action du Fgf, toutes les cellules deviennent de l'EPr et à l'inverse sans Gata6 ou en inhibant le Fgf toutes les cellules deviennent de l'épiblaste. Le projet de Master2 est d'analyser le contrôle de l'expression de Gata6 à ces stades de développement. L'étudiant(e) analysera les régions régulatrices "en cis" du gène Gata6 par immunoprécipitaion de chromatine (ChIP) et par transgenèse grâce à des gènes rapporteurs fluorescents. La transgenèse sera effectuée à la fois dans des modèles de cellules souches in vitro (ES, Xen, F9) et aussi dans l'embryon, grâce à des cultures ex vivo. L'expression des transgènes sera comparée à des marqueurs moléculaires par immunofluorescence et/ou hybridation d'ARN in situ. Techniques mises en œuvre par le stagiaire : culture cellulaire, culture d'embryons, transgenèse, ChIP, analyse expression de gènes (RTqPCR, hybridation in situ, western, immunofluorescence), microscopie confocale, clonage. Publications du Responsable de stage au cours des 5 dernières années : - Lavial F., Bessonnard S, Ohnishi Y, Tsumura A, Chandrashekran A, Fenwick M, Hardy K, Chambers I, Hiiragi T, Chazaud C and Azuara V. Bmi1 facilitates primitive endoderm formation by stabilizing Gata6 in the early embryo. Genes and Development, sous presse. (IF: 13) - Frankenberg, S, Gerbe F, Bessonnard S., Belville C., Pouchin P., Bardot O. et Chazaud C. (2011) Primitive endoderm differentiates via a three-step mechanism involving Nanog and RTK signalling. Developmental Cell, 21: 1005, 1013. (IF: 14) - Elatmani H, Dormoy-Raclet V, Dubus P, Dautry , Chazaud C and Jacquemin-Sablon F. (2011) The RNA-binding protein Unr prevents mouse embryonic stem cells differentiation toward the primitive endoderm lineage. Stem Cells 29: 1504-16. (IF: 8) - Gerbe F., Cox B., Rossant J. and Chazaud C (2008): Dynamic expression of LRP2 pathway members reveals progressive epithelial differentiation of Primitive Endoderm in mouse blastocyst. Developmental Biology 313, 594-602. (IF: 4) - Chazaud C (2008). L’embryogenèse précoce des mammifères : premières différenciations cellulaires et cellules souches. Médecine/Sciences 24, 1043-8. Autres informations: Etudiants actuellement en thèse ou en M2 dans l’équipe d’accueil. Sylvain Bessonnard (doctorant 4eme annee, resp C. Chazaud) Maxime Gasnier (doctorant 2eme année, resp C. Chazaud) Amandine Charras (master 2, resp P. Arnaud) Etudiants ayant préparé ou soutenu leur thèse ou leur M2 dans l’équipe d’accueil au cours des six dernières années. - François Gerbe (thèse 2004-2007, Université d'Auvergne, resp C. Chazaud). Présent: Post-doc à Montpellier - Nina Wustrack (thèse en 2008-2010, U. d'Auvergne, resp C. Chazaud). Présent: ALMA consulting (financement de la Recherche) - Séverine Montaron (M2 en 2006, resp C. Chazaud). Présent: enseignante - Valérie Borel (M2 en 2005, resp C. Chazaud). Présent: Post-doc à Londres Cette proposition de stage s’adresse-t-elle spécifiquement à un étudiant scientifique, médecin ou vétérinaire ou bien est-il ouvert à tous les profils ? Ouvert à toute personne motivée Ce sujet peut-il donner lieu à une thèse ? Oui