Spécialité Ecologie, Biodiversité et Evolution Proposition de stage de M2 PRO* Année 2008/2009 A envoyer à : [email protected] Titre du stage : Modélisation du réseau trophique de l’estuaire de la Loire Laboratoire ou structure d’accueil : Intitulé du laboratoire ou de la structure : Groupement d’Intérêt Public LOIRE ESTUAIRE (GIP Loire Estuaire) Responsable du stage : Nom : Jérémy LOBRY Tél : 02 51 72 93 65 Fax : 02 51 82 35 67 Email : [email protected] Références dans le domaine : Organisme : Le Groupement d’Intérêt Public LOIRE ESTUAIRE (GIP Loire Estuaire) a été chargé de l’élaboration puis du suivi à long terme d’une grille d’indicateurs représentatifs des phénomènes caractéristiques de la vie de la Loire et de son estuaire et ceci afin de permettre la construction régulière de bilans sur l’état et l’évolution du fleuve. Encadrant : Jérémy Lobry, docteur en océanographie biologique, spécialiste en écologie halieutique côtière et estuarienne. A publié le premier modèle trophique de l’estuaire de la Gironde (Lobry et al. 2008, Marine Ecology Progess Series) Description du stage Problématique générale et état de l’art Les écosystèmes estuariens sont donc des écosystèmes sensibles dont il est nécessaire de mieux appréhender la vulnérabilité et les capacités de résistance et de résilience aux effets conjugués directs et indirects des activités humaines. Dans le contexte actuel, lié notamment à la mise en place de la Directive Cadre Européenne sur l’Eau qui impose que les estuaires accèdent à un bon état écologique à l’horizon 2015, les outils dont on dispose aujourd’hui pour évaluer l’état écologique de ces systèmes reposent essentiellement sur des mesures de la diversité taxonomique des groupes faunistiques et sur la caractérisation de la structure (composition spécifique et abondance) des peuplements biologiques. Par ailleurs, les indicateurs mis en place sont généralement calculés à l’échelle de la masse d’eau ou par grande zone de salinité et peuvent ne pas tenir compte des hétérogénéités spatiales. Différentes approches visent à dépasser cette approche « structurelle » et à considérer aussi le fonctionnement écologique ainsi que l’hétérogénéité spatiale des systèmes estuariens afin de caractériser l’état écologique de ces masses d’eau. Objectifs du travail L’objectif du stage est de construire un modèle du réseau trophique de l’estuaire de la Loire. Ce modèle s’appuiera sur les connaissances synthétisées dans l’outil SIG de modélisation des habitats fonctionnels de l’estuaire de la Loire développé par le GIP Loire Estuaire, sur la bibliographie disponible, notamment au GIP, sur l’écologie de l’estuaire ainsi que sur les données des différentes campagnes d’inventaires réalisées depuis de nombreuses années sur l’estuaire dont la plupart sont disponibles au GIP. Ce modèle sera, dans un premier temps, non spatialisé et pourra être comparé aux modèles similaires construits sur la Seine et la Gironde. Les résultats de ce modèle devront permettre de définir différents indicateurs relatifs au fonctionnement du réseau trophique et les comparaisons avec la Seine, la Gironde mais aussi avec d’autres systèmes estuariens serviront à qualifier ce fonctionnement. Ceci devra servir à proposer une lecture critique des indicateurs définis dans le cadre de la DCE. Une analyse des résultats du modèle permettra d’identifier des espèces et/ou des compartiments écologiques particulièrement importants dans le fonctionnement du réseau trophique (compartiments clés). In fine, les habitats des espèces clés identifiées pourront être mis en perspective à l’aide de l’outil SIG du GIP afin d’identifier des habitats-clés qui pourraient donc avoir un intérêt particulier en terme de gestion. Ce stage s’inscrit dans le projet de recherche intitulé Bon Etat Ecologique des Estuaires (BEEST) financé dans le cadre du programme national de recherche LITEAU et dans le programme d’action du GIP Loire Estuaire. Valorisations envisagées Les résultats de ce travail seront présentés lors du 9ème Forum de l’Association Française d’Halieumétrie qui se déroulera au début de l’été 2009. Ils pourront aussi faire l’objet d’une publication dans une revue scientifique de premier rang. Références Lobry J, David V, Pasquaud S, Lepage M, Sautour B & Rochard E, 2008. Diversity and stability of an estuarine trophic network. Marine Ecology Progress Series 358:13-25 Rybarczyk H, Elkaim B (2003) An analysis of the trophic network of a macrotidal estuary: the Seine Estuary (Eastern Channel, Normandy, France). Estuar Coast Shelf Sci 58:775–791 Pour les stages de M2 UNIQUEMENT (effacez les phrases inutiles) Ce stage est destiné aux étudiants EBE inscrits dans un parcours Pro o Ce stage ne se poursuivra pas par une thèse * la date limite de proposition de stage R est désormais dépassée