Diagnostic de Ralstonia solanacearum et Clavibacter

Agence fédérale
pour la Sécurité
de la Chaîne alimentaire
LFSAGx
MET-LFSAGX-081
MET-LFSAGX-082
I-MET
Diagnostic de Ralstonia solanacearum et Clavibacter
michiganensis sepedonicus sur tubercule de pomme de
terre et boutures de Pélargonium
Version
04
Date d’application
2013-08-20
Rédaction par :
Sandrine Léonard, Responsable section
Phytopathologie ; 2013-07-18
Révision par :
Alain Dubois, Responsable Qualité LFSAGx ; 2013-08-19
Autorisation de publication par :
Franck Defeijt, Manager laboratoire LFSAGx ; 2013-08-19
Gestion et localisation de la
version valide :
M:\LFSAGx-QSE\A 3-Instructions\A30-Qualité
Destinataires :
COLLABORATEURS SECTION PHYTOPATHOLOGIE -
LFSAGX
Mots clefs :
Ralstonia solanacearum, Clavibacter michiganensis
sepedonicus, diagnostic.
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DIAGNOSTIC DE R. SOLANACEARUM ET C. MICHIGANENSIS
SEPEDONICUS SUR TUBERCULE DE POMME DE TERRE ET
BOUTURES DE PÉLARGONIUM
Aperçu des modifications*
Révision
par/date Motif de la révision Partie du texte/portée de la
révision
SL-09/12/09 Document original : «Diagnostic de
Ralstonia
solanacearum et
Clavibacter michiganensis
sepedonicus sur tubercule de pomme de terre».
SL-16/08/11 Audit interne 24/06/11 et mise à jour en lien avec les
pratiques actuelles. Mise à jour des schémas d’analyse
des annexes 1 et 2
et adaptation
conséquente du
texte du point 5.
Suppression de la
ligne faisant
référence à une
annexe 3 non
présente. Ajout de
précisions sur la
gestion du matériel
contaminé. Ajout du
contact avec le
laboratoire national
de référence.
SL-24/05/13 Ajout de la matrice boutures pour R. solanacearum Titre, Objectif,
Documents légaux,
Principe,
Caractéristiques de
performance,
Consignes de
sécurité, Références
à d’autres
documents, Schéma
annexe 2.
SL-17/07/13 Audit interne du 20/06/13 : correction des schémas
d’analyses Clavibacter et Ralstonia. Annexes 1 et 2 :
surpression de la
réitération de la
PCR en cas de
résultat positif.
* L’écart entre la date actuelle et celle de la dernière révision ne peut pas dépasser 5 ans.
Les modifications par rapport à la version précédente sont reprises en rouge.
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DIAGNOSTIC DE R. SOLANACEARUM ET C. MICHIGANENSIS
SEPEDONICUS SUR TUBERCULE DE POMME DE TERRE ET
BOUTURES DE PÉLARGONIUM
TABLE DES MATIERES
1 OBJECTIF .......................................................................................................................... 4
2 CHAMP D’APPLICATION ................................................................................................. 4
3 DOCUMENTS LÉGAUX ET NORMATIFS ........................................................................ 4
4 DÉFINITIONS ET ABRÉVIATIONS ................................................................................... 5
5 PRINCIPE ........................................................................................................................... 6
6 CARACTÉRISTIQUES DE PERFORMANCE ................................................................... 6
7 CONSIGNES DE SÉCURITÉ ET MESURES SPÉCIFIQUES ........................................... 6
8 RÉACTIFS .......................................................................................................................... 7
9 APPAREILLAGE ............................................................................................................... 7
10 MÉTHODE .................................................................................................................... 7
11 CONTRÔLES DE LA QUALITÉ .................................................................................. 7
12 CALCUL ET RAPPORTAGE ....................................................................................... 8
13 RÉFÉRENCE À DES PROCÉDURES AFFÉRENTES, INSTRUCTIONS,
DOCUMENTS, FORMULAIRES OU LISTES ........................................................................... 8
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DIAGNOSTIC DE R. SOLANACEARUM ET C. MICHIGANENSIS
SEPEDONICUS SUR TUBERCULE DE POMME DE TERRE ET
BOUTURES DE PÉLARGONIUM
1 Objectif
Cette méthode a pour objectif la détection des bactéries phytopathogènes de quarantaine
Ralstonia solanacearum et Clavibacter michiganensis sepedonicus sur tubercule de pomme
de terre infecté et bouture de Pélargonium (cette dernière uniquement pour R.
solanacearum) de manière latente ou symptomatique.
2 Champ d’application
Cette méthode est applicable aux tubercules de pomme de terre et aux boutures de
Pélargonium.
3 Documents légaux et normatifs
Norme/Fil conducteur Clauses
Pour R. solanacearum :
Bulletin OEPP 2004 34, 173-178 PM 7/21(1):
Proto
coles de diagnostic pour les
organismes réglementés : Ralstonia
solanacearum.
Point “Isolation”, page 174.
Journal officiel de l’Union européenne L
206/36 : Directive 2006/63/CE de la
Commission du 14 juillet 2006 modifiant les
annexes II à VII de la directive 98/57/CE du
Conseil concernant la lutte contre Ralstonia
solanacearum (Smith) Yabuuchi et al.
Section III, point 1 et 2.
Section IV, points A.4.1., A.6., B.4.
Appendice 2.b.
Appendice 4.
Appendice 6.3.
Annexes III et VII.
Pour C. m. sepedonicus :
Bulletin OEPP 2006 36, 99-109 PM 7/59(1):
Diagnostic : Clavibacter michiganensis
subsp. sepedonicus.
Point « Screening for latent infection », page
102: les 3 premiers paragraphes.
Point “IF Test”, page 103.
Journal officiel de l’Union européenne L
182/1-43 : Directive 2006/56/CE de la
Commission du 12 juin 2006 modifiant les
annexes de la directive 93/85/CEE du
Conseil concernant la lutte contre le
flétrissement bactérien de la pomme de
terre.
Point 3.1.
Point 6.
Point 9.2.
Appendices 2., 3., 5.b., 6.1.
Annexes II et V.
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DIAGNOSTIC DE R. SOLANACEARUM ET C. MICHIGANENSIS
SEPEDONICUS SUR TUBERCULE DE POMME DE TERRE ET
BOUTURES DE PÉLARGONIUM
4 Définitions et abréviations
Terme
Origine de la définition
Définition
Ralstonia LFSAGx Dans la présente procédure,
le terme
s’applique à Ralstonia solanacearum :
bactérie gram-néga
tive phytopathogène de
quarantaine causant notamment
la pourriture
brune de la pomme de terre.
Clavibacter LFSAGx Dans la présente procédure,
le terme
s’applique à Clavibacter michiganensis
sous-espèce sepedonicus : bactérie gram-
positive phytopathogène de quarantaine
causant la pourriture annulaire de la pomme
de terre.
Talon de pomme de
terre Zone circulaire d’environ 5-
10 millimètres de
diamètre présentant un léger relief visible en
surface du tubercule, correspondant au canal
vasculaire, à l’endroit où le tubercule était relié
à la plante pendant la cu
lture. Le talon est
prélevé sur le tubercule à une profondeur
d’environ 5-
10 millimètres, selon un volume
conique.
Séro-agglutination LFSAGx Test visuel de mise en évidence des bactéries
d’intérêt au moyen d’un sérum spécifique : un
test positif donne lieu à la formation de
complexes antigène-anticorps s’agglutinant
entre eux et détectables à l’œil nu.
Milieu de culture semi-
spécifique LFSAGx Milieu nutritif gélosé contenant des substances inhibitrices de la croissance de certains (mais
pas tous) micro-organismes susceptibles d’être
extraits de l’échantillon étudié conjointement à la
bactérie d’intérêt.
Milieu de culture non
spécifique LFSAGx Milieu nutritif gélosé ne contenant pas de substances inhibitrices de la croissance des
micro-organismes.
Pathogénicité sur
plantes LFSAGx T
ests consistant à inoculer une bactérie d’intérêt
à une plante hôte afin d’observer le
développement de la maladie causée par cette
bactérie.
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