METABOLISME DES ACIDES AMINES

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UNIVERSITE DE RENNES I
FACULTE DE MEDECINE DE RENNES
DEPARTEMENT DE BIOCHIMIE ET BIOLOGIE MOLECULAIRE
P.C.E.M. 2
BIOCHIMIE METABOLIQUE
METABOLISME DES ACIDES AMINES
PROFESSEUR ANDRE LE TREUT
ANNEE UNIVERSITAIRE 2006 - 2007
1
VUE D’ ENSEMBLE SUR LE MÉTABOLISME DES ACIDES AMINÉS
Interrelations métaboliques
Glucose
Phospho Enol Pyruvate
Acides Gras
LEU, ILE, TRP
CYS
THR → GLY → SER
TRP → ALA
Pyruvate
Glutaryl-CoA
Acétyl-CoA
TYR ← PHE
Acétoacétyl-CoA
ASN → ASP
Oxaloacétate
Citrate
PHE → TYR
LYS, TRP
Fumarate
Succinate
Isocitrate
α-Cétoglutarate
Acétoacétate
LEU
Corps Cétoniques
GLU
ARG
ORN
PRO
HIS
GLN
Succinyl-CoA
Propionyl-CoA
THR, MET, VAL, ILE
2
VUE D’ENSEMBLE SUR LE MÉTABOLISME DES ACIDES AMINÉS
Classification selon le caractère glucoformateur et/ou cétogène, indispensable ou non
ACIDE AMINE
Alanine
Arginine
Aspartate
Cystéine
Glutamate
Glycocolle
Histidine
Isoleucine
Leucine
Lysine
Méthionine
Ornithine
Phénylalanine
Proline
Sérine
Thréonine
Tryptophane
Tyrosine
Valine
GLUCOFORMATEUR
ALA
ARG
ASP
CYS
GLU
GLY
HIS
ILE
LEU
LYS
MET
ORN
PHE
PRO
SER
THR
TRP
TYR
VAL
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
CETOGENE
INDISPENSABLE
CHEZ L’HOMME
(croissance)
(+)
+
+
+
(+)
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
3
Métabolisme général des acides aminés
LES REACTIONS DE TRANSAMINATION
A-
MECANISME GENERAL
acide a-cétonique (R1)
acide aminé donneur (R 1)
COOH
R1
CH
Transaminase
(aminotransférase)
NH2
R1
α
CO COOH
(CoE : B6PO4)
α
R2
COOH
R2
CO COOH
CH
NH2
acide a-cétonique
accepteur (R2)
B-
acide aminé (R2)
PRINCIPALES TRANSAMINASES
„ Alanine aminotransférase (ALAT)
– ou Transaminase Glutamo-Pyruvique (TGP)
COOH
CH3
CH
CH3
CO
COOH
NH2
ALAT
L-alanine
acide pyruvique
(TGP)
COOH
HOOC
CH2
CH2
CO COOH
HOOC
acide a-cétoglutarique
CH2
CH2
CH
NH2
acide L-glutamique
„ Aspartate aminotransférase (ASAT)
– ou Transaminase Glutamo-Oxaloacétique (TGO)
COOH
HOOC
CH2
CH
HOOC
CH2
CO COOH
NH2
acide L-aspartique
ASAT
acide oxalo-acétique
(TGO)
COOH
HOOC
CH2
CH2
CO COOH
acide a-cétoglutarique
HOOC
CH2
CH2
CH
acide L-glutamique
NH2
4
LES REACTIONS DE DESAMINATION
A-
LA DESAMINATION OXYDATIVE
„ Mécanisme général
acide a-iminé
intermédiaire
acide aminé
R
COOH
CH
R
NH2
C
COOH
NH
CoEnz
acide a-cétonique
H2O
CoEnz (H2)
CO
R
O
H2
COOH
NH3
hydrolyse
spontanée
déshydrogénation
enzymatique
„ Exemple de la L-glutamate déshydrogénase
L-Glutamate
déshydrogénase
NAD+
(NADP+)
NADH,H+
(NADPH,H+)
COOH
HOOC
CH2
CH2
CH
HOOC
CH2
CH2
CO COOH
NH2
acide a-cétoglutarique
acide L-glutamique
H2O
B-
NH3
AUTRES MECANISMES DE DESAMINATION
„ Désamination par désaturation
acide a-b-insaturé
acide aminé
R
CH
COOH
R
CH
β
CH
α
COOH
NH2
NH3
Exemple : désamination de l'Histidine
histidase
Histidine
acide urocanique
NH3
„ Désamination avec déshydratation
acide aminé
hydroxylé
R
CHOH
CH
déshydratation
enzymatique
COOH
R
NH2
CH
C
COOH
NH2
H2O
(Sérine ou
Thréonine)
hydrolyse
spontanée
R
CH2 C
NH
COOH
acide a-cétonique
R
O
H2
H2O
CH2
CO
COOH
NH3
5
„ Désamidation
Asparaginase
COOH
H OH
H2N
CO
CH2
COOH
CH
HOOC
CH2
CH
NH2
NH2
acide aspartique
Asparagine
H2O
CO
Glutaminase
COOH
H OH
H2N
CH2
CH2
NH3
COOH
CH
HOOC
CH2
CH2
CH
NH2
NH2
acide glutamique
Glutamine
H2O
NH3
LES REACTIONS DE DECARBOXYLATION
A-
MECANISME
COOH
R
Aminoacide
Décarboxylase
(CoE : B6PO4)
CH
R
CH2 NH2
NH2
acide aminé
B-
amine
PRINCIPAUX PRODUITS
ACIDE AMINE
CH2 CH
N
CO2
NH
AMINE CORRESPONDANTE
CH2 CH2
COOH
N
NH2
L-Histidine
NH
Histamine
CH2 CH COOH
NH2
HO
CH2 CH2 NH2
HO
Tyramine
L-Tyrosine
CH2 CH COOH
CH2 CH2 NH2
NH2
N
H
NH2
N
H
L-Tryptophane
HO
Tryptamine
CH2 CH COOH
N
NH2
H
5-Hydroxy-Tryptophane
HO
CH2 CH2 NH2
N
H
5-Hydroxy-Tryptamine
(sérotonine)
6
HO CH2 CH COOH
HO CH2 CH2 NH2
NH2
Ethanolamine
L-Sérine
β
γ
α
HOOC CH2 CH2 CH2 NH2
HOOC CH2 CH2 CH COOH
NH2
acide L-Glutamique
acide g-amino-butyrique
(GABA)
α
β
HOOC CH2 CH2 NH2
HOOC CH2 CH COOH
NH2
acide L-aspartique
HS
b-alanine
CH2 CH COOH
HS CH2 CH2 NH2
NH2
L-Cystéine
HO3S
Cystéinamine
CH2 CH COOH
HO3S CH2 CH2 NH2
NH2
Acide Cystéique
Taurine
H2N (CH2)4 CH COOH
H2N (CH2)5 NH2
NH2
L-Lysine
Cadavérine
H2N (CH2)3 CH COOH
H2N (CH2)4 NH2
NH2
L-Ornithine
Putrescine
NH2
HN
HN
C
NH2
NH (CH2)4 NH2
NH (CH2)3 CH COOH
NH2
Agmatine
L-Arginine
C-
C
CATABOLISME DES AMINES D’ACIDES AMINES
„ mécanisme : désamination oxydative
R
CH2
NH2
Aminoacide
Oxydase
½ O2
NH3
R
CHO
– MAO : monoamine oxydase
– DAO : diamine oxydase
(histaminase)
7
D-
LES POLYAMINES :
„ groupe d’amines comprenant :
–
–
–
–
–
La cadavérine
La putrescine
L’agmatine
La spermidine
La spermine
„ Interrelations métaboliques
NH2
C
NH (CH2)3 CH COOH
H2N (CH2)3 CH COOH
NH2
HN
NH2
CO2
acide L-Glutamique
Décarboxylase
Décarboxylase
L-Ornithine
CO2
CO2
NH2
C
HO
HOOC CH2 CH2 CH COOH
NH2
L-Arginine
Décarboxylase
HN
H
NH (CH2)4 NH2
Agmatinase
H2N (CH2)4 NH2
Agmatine
Oxydase
acide g-amino-butyrique
(GABA)
Putrescine
H2O
HOOC CH2 CH2 CH2 NH2
Urée
S-Adénosyl
S-Adénosyl Décarboxylase
3-méthyl
mercapto
méthionine
propylamine
CO2
Méthyl-thio
ad énosine
H2N
(CH2)3
NH (CH2)4 NH2
Spermidine
Décarboxylase S-Adénosyl
S-Adénosyl
3-méthyl mercapto
méthionine
propylamine
CO2
Méthyl-thio
ad énosine
H2N
(CH2)3
NH (CH2)4 NH
(CH2)3
NH2
Spermine
8
Métabolisme et transport de l’ammoniac
CARACTERISTIQUES
A-
PRODUCTION : DOUBLE ORIGINE
1. endogène
2. exogène
B-
TOXICITE DE L’AMMONIAC
C-
MECANISMES DE LUTTE CONTRE L’HYPERAMMONIEMIE
– Glutaminogenèse (tissus périphériques)
NH3
+ ATP
Glutamine
HOOC
CH2 CH2 CH
COOH
ADP
+ Pi
synthétase
H2N
OC
CH2
NH2
CH2
CH
COOH
NH2
acide L-Glutamique
Glutamine
– Transport plasmatique sous forme de glutamine
– Libération dans les reins et le foie
H OH
HOOC CH2 CH2 CH COOH
H2N
OC CH2 CH2 CH COOH
NH2
NH2
acide L-Glutamique
Glutaminase
NH3
Glutamine
H2O
– Ammoniogenèse (reins)
– Uréogenèse (foie)
9
– Résumé
Glutaminogenè
Glutaminogenèse
Acide Glutamique
NH3
Glutamine
Acide Glutamique
synthé
synthétase
Glutamine
S A N G
Glutamine
Acide Glutamique
Acide Glutamique
Glutaminase
NH3
H+
₣ðþ³Ğ
ݽþð
Glutaminase
NH3
NH4+
Uré
Urée
Uré
Uréogenè
ogenèse
Ammoniogenè
Ammoniogenèse
URINES
UREOGENESE : CYCLE DE KREBS – HENSELEIT
A-
VUE D’ENSEMBLE
Acides Aminés
GLU
GLN
NH3
Carbamyl-Phosphate
ORN
UREE
1
CO2
5
H2 O
2
ARG
Citrulline
4
Fumarate
3
ASP
Arginino-Succinate
10
B-
DESCRIPTION DES REACTIONS
NH3
COOH
NH2
O
CO2
2 ATP + H2O
C
(CH2)3
H2 N
O
O ~ P OH
2 ADP + Pi
CH
NH2
Ornithine
OH
Carbamyl-Phosphate
synthétase I (CPS)
Ornithine Trans Carbamylase (ATC)
Ornithine Carbamyl Transférase (OCT)
Acide Carbamyl
Phosphorique
COOH
HOOC
CH
CH2
PO4H3
NH2
NH2
O
COOH
C
Acide Aspartique
NH
CH
NH2
Citrulline
ATP
Arginino-succinate
synthétase
(CH2)3
O
AMP + PPi
OH
COOH
HOOC
CH2
CH
P OH
= PPi
OH
Acide Pyrophosphorique
NH2
N
O
HO P O
COOH
C
NH
(CH2)3
CH
Acide Arginino-succinique
NH2
Arginino-succinase
NH2
HOOC
CH
CH
COOH
HN
COOH
C
NH
(CH2)3
HO
H
Arginine
Acide Fumarique
CH
NH2
H2O
HN
C
COOH
H2 N
(CH2)3
Ornithine
C-
NH2
NH2
Arginase
O
OH
UREE
C
NH2
CH
NH2
COUPLAGE AVEC LE CYCLE DE KREBS
ORNITHINE
CARBAM YL
PH O SPH ATE
UREE
CO 2 + NH 3
cycle de l’urée
ARG ININ E
CITRU LLIN E
ARG IN IN O -S U CCIN ATE
ASPARTATE
FUMARATE
ACIDE a-CETONIQUE
cycle de Krebs
ACIDE a-AMINE
MALATE
OXALO-ACETATE
11
D-
ANOMALIES ENZYMATIQUES D’ORIGINE GENETIQUE
„ Hyperammoniémie Congénitale type I : déficit en CarbamylPhosphate Synthétase I
„ Hyperammoniémie Congénitale type II : déficit en Ornithyl
Transcarbamylase
„ Citrullinémie : déficit en Arginino-Succinate Synthétase
„ Argininosuccinurie : déficit en Argininosuccinase
„ Argininémie-Argininurie : déficit en Arginase
METABOLISME DE LA CREATINE ET DE LA CREATININE
NH2
HN
COOH
C
NH
(CH2)3
CH
H 2N
NH2
Arginine
CH2
COOH
Glycocolle
Transamidinase
NH2
HN
COOH
H 2N
(CH2)3
C
NH
CH
NH2
CH2
COOH
Acide guanidoacétique
(Glycocyamine)
Ornithine
S-Adénosyl-Méthioninine
Transméthylase
S-Adénosyl-Homocystéine
Créatine
Phospho Kinase
(CPK)
HN
NH ~ PO3H2
HN
C
N
CH2
COOH
NH2
C
N
ADP
ATP
CH3
CH2
COOH
CH3
Créatine
(acide méthyl-guanido-acétique)
Phosphocréatine
H 2O
NH
HN
CO
Créatinine
C
N
CH2
CH3
12
Métabolisme spécifique des acides aminés
METABOLISME DES ACIDES AMINES
CONDUISANT AU PYRUVATE
SCHEMA GENERAL
THR
Cystine
CYS
GLY
TRP
SER
ALA
Pyruvate
1. METABOLISME DE LA L-ALANINE
A-
BIOSYNTHESE : PAR TRANSAMINATION
CH3
CO
COOH
a-céto
glutamate glutarate
CH3
CH
COOH
NH2
Acide Pyruvique
Alanine
Transaminase
(ALAT ou TGP)
2. METABOLISME DE LA L-SERINE
A-
BIOSYNTHESE : PAR TRANSAMINATION
3-Phospho-Glycérate
déshydrogénase
COOH
NAD+ NADH,H+
CO
COOH
CHOH
CH2
O
P
Acide 3-Phospho
Glycérique
CH2
Transaminase
Glutamate
O
P
Acide 3-Phospho
Hydroxy-Pyruvique
Phospho-Sérine
Phosphatase
COOH
a-céto
glutarate
CH NH2
CH2
O
H2O
P
Phospho Sérine
PO4H3
COOH
CH
NH2
CH2
OH
Sérine
13
B-
CATABOLISME :
„ Désamination en acide pyruvique
Sérine désaminase
(Sérine déshydratase)
(B6-PO4)
COOH
COOH
COOH
CH
H2O
NH2
C
CH2OH
C
NH2
CH2
O H2
NH
H2O
NH3
CH3
COOH
CO
CH3
Acide Pyruvique
L-Sérine
„ Conversion en glycocolle (Glycine)
Sérine Hydroxyméthyl Transférase
ou Sérine aldolase
(B6-PO4)
COOH
COOH
NH2
CH
CH2
NH2
OH
CH2
Sérine
FH4
FH4-CH2OH
Acide tétrahydrofolique
Glycocolle
„ Conversion en éthanolamine par décarboxylation
Sérine Décarboxylase
(B6-PO4)
COOH
CH
CO2
NH2
CH2
NH2
OH
CH2
OH
CH2
Sérine
Ethanolamine
(Colamine ou
Amino-éthanol)
14
„ Synthèse de la sphingosine
CH3
(CH2)12
CH2
CH2
CO~SCoA
CoA-SH + CO2
Palmityl-CoA
Synthétase
(B6-PO4)
CH3
COOH
CH
NH2
CH2
CH2
CO
3-Déshydro-Sphinganine
H2N
CH
CH2OH
(CH2)12
CH2OH
NADPH,H+
Sérine
Oxydo
Réductase
NADP+
CH3
(CH2)12
CH2
Sphinganine
CH2
CHOH
H2N
CH
CH2OH
FAD
Oxydo
Réductase
FADH2
CH3
(CH2)12
Sphingosine
CH
CH
H2N
CHOH
CH
CH2OH
„ Synthèse de la L-Cystéine :
– (Cf. métabolisme de la Cystéine : réaction de
transsulfuration)
Homocystéine
Cystathionine synthétase
Sérine
Homosérine
Cystathionine
Cystathionase
Cystéine
15
3. METABOLISME DU GLYCOCOLLE (GLYCINE)
AB-
BIOSYNTHESE :
„ à partir de la L-sérine (sérine aldolase)
CATABOLISME :
„ Conversion en L-sérine
– Puis transformation en acide pyruvique (sérine
aldolase)
„ Conversion en acide glyoxylique
a-céto
glutarate glutamate
CH2
NH2
CHO
COOH
Glycocolle
COOH
Transaminase
Acide Glyoxylique
Glyoxylate
oxydase
COOH
Décarboxylation oxydative
CO2
FH4
H
CHO
Formaldéhyde
"formiate"
COOH
Acide Oxalique
FH4
Acide
TétrahydroFolique
Synthétase
CHO
N5 ou N10 - Formyl
Tétrahydrofolate
„ Cycle de Shemin Russel (en dérivation du cycle de Krebs)
- Schéma général
CYCLE de KREBS
ACIDE SUCCINIQUE
ACIDE a-CETOGLUTARIQUE
SUCCINYL-CoA
GLYCOCOLLE
ACIDE d-AMINO-LEVULINIQUE
PORPHYRINES
ALDEHYDE a-CETOGLUTARIQUE
16
– Description des étapes
Succinyl-CoA
COOH
COOH
COOH
CH2
CH2
CoA SH
CH2
α CH2
CO2
CH2
CO ~ SCoA
β CH2
β CO
γ CO
d-amino-lévulinate
α CH
COOH
synthétase
CH2
COOH
δ CH2
NH2
NH2
NH2
Acide a-amino-b-céto-adipique
Glycocolle
Acide d-amino-lévulinique
Devenir de l’acide δ-amino-lévulinique :
1- Précurseur des porphyrines et de l’Hème
COOH
CH2
CH2
Porphobilinogène
CO
δ CH2
condensation
de 4 molécules
condensation
de 2 molécules
Protoporphyrine
HEME
2 H2O
NH2
Acide d-amino-lévulinique
2- Transamination en α-cétoglutaraldéhyde et interaction avec le cycle de Krebs
COOH
CH2
a-céto
glutarate glutamate
CH2
CO
δ CH2
COOH
COOH
CH2
Oxydation
CH2
Transaminase
CH2
CH2
CO
CO
CHO
COOH
NH2
Acide d-amino-lévulinique
Acide a-cétoglutarique
a-cétoglutaraldéhyde
FH4
FH4
CHO
COOH
CH2
CH2
Cycle de Krebs
COOH
Acide succinique
17
„ Autres destinées métaboliques du Glycocolle
1- Rôle de précurseur du noyau purine (C4, C5 et N7)
2- Rôle de précurseur de la créatine et de la créatine phosphate
- réaction de transamidination
- réaction de transméthylation
3- Rôle de précurseur du Glutathion
HOOC
CH2
CH
γ
CH2
CO
NH
CO
NH
CH2
COOH
CH
H2N
CH2
SH
g-Glutamyl - Cystéinyl - Glycocolle
4- conjugaison avec les acides biliaires et les stéroïdes : donnant des glycoconjugués
5- conjugaison avec l’acide benzoïque : donnant l’acide hippurique
CO
NH
Acide benzoïque
CH2
COOH
Glycocolle
Acide Hippurique
4. METABOLISME DE LA CYSTEINE
SCHEMA GENERAL
S- Adénosyl- Homocystéine
L- SER
L- MET
S- Adénosyl-Méthionine
Homocystéine
1
Cystathionine synthétase
CYSTATHIONINE
2
Homo-Sérine
Cystathionase
L- CYS
Thioéthanolamine
Acide Cystéique
Acide Cystéine
Sulfinique
Acide Sulfinyl
Pyruvique
Taurine
Hypotaurine
SO2
Coenzyme A
Acide Pyruvique
SO3
SO4
sulfite
sulfate
18
A-
BIOSYNTHESE
„ Réaction de transméthylation
S-Adénosyl - Méthionine
Méthionine
Adénosyl-Transférase
COOH
NH2
CH
CH2
N
N
S
PPi + Pi
ATP + H2O
~
CH2
S
CH3
CH3
B12
OH OH
B12
CH3
CH3
FH4
COOH
COOH
CH
N5- Méthyl FH4
Homocystéine Méthyltransférase
Méthyl - Transférase
R
NH2
CH2
N
CH2
O
R
COOH
CH
NH2
N
CH2
L- Méthionine
NH2
CH2
Adénosyl
Homocystéinase
NH2
N
CH2
N
N
S
H
OH
CH
NH2
CH2
CH2
N
H2O
CH2
O
Adénosine
SH
Homocystéine
OH OH
-2H
R SH
Homocystine
R S S R
S-Adénosyl - Homocystéine
„ Réaction de transsulfuration
Homocystéine
COOH
COOH
CH
CH
NH2
CH2
Cystathionine
Synthétase
SH
CH2OH
CH
CH
NH2
NH2
COOH
CH2
S
OH
H
Cystathionase
(B6-PO4)
CH
NH2
H2O
COOH
CYSTATHIONINE
B-
CH2OH
SH
CH2
H2O
NH2
CH2
CH2
CH2
Sérine
Homosérine
COOH
CH2
CH
NH2
COOH
Cystéine
ANOMALIES ENZYMATIQUES D’ORIGINE GENETIQUE
„ Homocystinurie : déficit en cystathionine synthétase
„ Cystathionurie : déficit en cystathionase
19
CATABOLISME DE LA CYSTEINE
C-
„ Décarboxylation en thioéthanolamine
CO2
COOH
HS
CH2
CH
HS
NH2
CH2
CH2
NH2
Coenzyme A
Cystéine décarboxylase
(B6-PO4)
Thioéthanolamine
(Cystéinamine)
L- Cystéine
„ Oxydation en acide cystéine sulfinique
– Formation d’acide pyruvique et de sulfates
– Formation de Taurine
COOH
HS
CH
CH2
L- Cystéine
NH2
O2
Cystéine
oxygénase
COOH
HO3S
CH2
COOH
½ O2
CH
HO2S
NH2
Acide Cystéique
a-céto
glutarate glutamate
CH2
CH
NH2
Acide Cystéine
sulfinique
CO2
CH2
Taurine
CO
COOH
Acide sulfinyl
pyruvique
NH2
SO2
HO2S
CH2
CH2
NH2
CH3
Hypotaurine
CO
COOH
Acide pyruvique
--
SO3
sulfite
D-
CH2
CO2
½ O2
CH2
HO2S
Décarboxylase
Décarboxylase
HO3S
Transaminase
Sulfite
oxydase
--
SO4
sulfate
PRECURSEUR DU GLUTATHION : (Cf. GLYCOCOLLE)
20
METABOLISME DES ACIDES AMINES
CONDUISANT A L’ACETOACETYL-COA
SCHEMA GENERAL
PHE → TYR
Fumarate
LEU
LYS
Acétoacétate
TRP
ALA
Glutaryl-CoA
Pyruvate
Acéto-acétyl-CoA
Acétyl-CoA
Corps Cétoniques
1. METABOLISME DE LA L-PHENYLALANINE ET DE LA L-TYROSINE
VUE D’ENSEMBLE
Phényl
Ethylamine
L- PHE
1
PHE Hydroxylase
Hormones Thyroïdiennes
L- TYR
4
2
TYR Transaminase
Hydroxylase
p-Hydroxy-Phényl-Pyruvate
Phényl
Acétate
L- DOPA
Phényl
Pyruvate
5
Oxydase
3
Homogentisate
6
Phényl
Acétyl
Glutamine
Oxydase
Tyrosinase
Mélanines
Maléyl-Acétoacétate
Phényl
Lactate
7
Catécholamines
Isomérase
Fumaryl-Acétoacétate
8
Fumarate
Fumaryl-Acétoacétase
Acétoacétate
21
CONVERSION DE LA PHENYLALANINE EN TYROSINE
A-
L-Phénylalanine
CH2
CH
COOH
NH2
O2
NADP+
Tétrahydro-Bioptérine
L-phénylalanine hydroxylase
H2O
Dihydro Bioptérine Réductase
NADPH, H+
Dihydro-Bioptérine
CH2
CH
COOH
NH2
HO
L-Tyrosine
OH
N
H2N
OH
H
N
5
34
2
1
87
N
N
CHOH CHOH
CH
6
CH3
bioptérine réductase
CH2
H2N
H
NADP +
5
8
N
N
6
CHOH
C
CHOH
CH3
CH2
H
NADPH, H +
5,6,7,8-Tétrahydro
Bioptérine
B-
N
N
7,8-Dihydro
Bioptérine
CATABOLISME DE LA L-TYROSINE
„ La voie de l’acide homogentisique
COOH
COOH
CH
CO
NH2
CH2
CH2
a-céto
glutarate glutamate
O
Transaminase
OH
OH
L-Tyrosine
p-hydroxy phényl
pyruvate oxydase
(O2, Cu, Vit C)
CH2
COOH
OH
Homogentisate oxydase
(O2, Cu, Vit C)
Acide acétoacétique
CO
CH2
O
Acide
homogentisique
(alcaptone)
Acide p-hydroxy
phényl pyruvique
CH3
OH
CO2
COOH
HOOC
OC
HOOC
H2O
COOH
Acide fumarique
fumaryl-acéto
acétase
HO
CH2
COOH
H
O
Acide fumaryl
acétoacétique
22
„ Biosynthèse des catécholamines
Cf. chapitre Hormonologie
„ Biosynthèse des mélanines : mélanogenèse
HO
CH2
CH
COOH
O
NH2
HO
CH2
Tyrosinase
COOH
NH2
O
L-DOPA
CH
DOPA quinone
Cyclisation
O
CO2
O
N
H
O
O
N
Décarboxylase
COOH
H
DOPA chrome
Indole quinone
Polymérisation
MELANINES
„ Biosynthèse des hormones thyroïdiennes
Cf. chapitre Hormonologie
C-
ANOMALIES ENZYMATIQUES D’ORIGINE GENETIQUE
„ Enzyme 1 : Phénylcétonurie (déficit en Phénylalanine
hydroxylase ou Bioptérine réductase)
„ Enzyme 3 : Albinisme (déficit en Tyrosinase)
„ Enzyme 4 : Tyrosinémie congénitale type II (déficit en
Transaminase, TAT)
„ Enzyme 5 : Tyrosinémie congénitale type I (Tyrosinose)
„ Enzyme 6 : Alcaptonurie
2. METABOLISME DE LA L-LEUCINE
„ Cf. métabolisme des autres acides aminés aliphatiques à chaîne
ramifiée : valine et isoleucine
23
3. METABOLISME DU L-TRYPTOPHANE
A - LA VOIE CATABOLIQUE PRINCIPALE : VOIE DE LA
CYNURENINE
Vue d’ensemble
L- TRP
1
Tryptophane Pyrrolase
Formyl-Cynurénine
2
Formylase
4
Acide
Cynurénique
3
Cynurénine
Cynurénine
transaminase
Acide
Xanthurénique
Cynuréninase
Acide
Anthranilique
+
L- ALA
Acide 3-Hydroxy
Anthranilique
+
L- ALA
Cynurénine
hydroxylase
4
3
3-Hydroxy
Cynurénine
Cynurénine
transaminase
Cynuréninase
Oxydase
semi-aldéhyde
2-amino- 3-carboxy
muconique
NAD +
Acide
Nicotinique
Nicotinamide
Acide
Quinolinique
Glutaryl-CoA
NADP +
Acétoacétyl-CoA
„ Dégradation en acétoacétyl-CoA
O
O
CH
CH2
NH2
N
CO
COOH
O2
CH
NH
Tryptophane
CO
COOH
CHO
H OH
H2O
H
Cynurénine
HOOC
O2
NH2
COOH
CO
NH2
ALA
Acide 3-hydroxy
anthranilique
H2O
CH2
OH H
Cynuréninase
(B6-PO4)
OH
semi-aldéhyde 2-amino
3-carboxy muconique
NADPH,H + + O2
NADP + +
O
O
CHO
COOH
COOH
Cynurénine
hydroxylase
3-hydroxy
anthranilate
oxygénase
CH
NH2
N-Formyl cynurénine
COOH
CH2
NH2
Cynurénine
formylase
NH2
Tryptophane
pyrrolase
H
CH2
H2O
CH
COOH
NH2
NH2
OH
3-hydroxy Cynurénine
Pyruvate
H2O
+
O
Acétyl-CoA
CO2 + NH3
CO2
HOOC
HOOC
HOOC
CO
CO
Décarboxylase
Acide a-cétoadipique
S
CoA
Acétoacétyl CoA
Glutaryl-CoA
24
„ La voie des acides anthranilique et cynurénique
OH H
CO
CH2
CH
COOH
COOH
Cynuréninase
(B6-PO4)
NH2
NH2
ALA
Cynurénine
Cynurénine
Transaminase
NH2
H2O
Acide anthranilique
Pyruvate
NH3
Acétyl-CoA
OH
CO
CH2
CO
Cyclisation
spontanée
COOH
NH2
N
H2O
COOH
Acide Cynurénique
„ La voie des acides 3-hydroxy- anthranilique et
xanthurénique
OH H
CO
CH2
CH
COOH
COOH
Cynuréninase
(B6-PO4)
NH2
NH2
OH
ALA
NH2
H2O
OH
3-hydroxy
Cynurénine
Acide 3-hydroxy
anthranilique
Pyruvate
Cynurénine
Transaminase
NH3
Acétyl-CoA
OH
CO
CH2
CO
Cyclisation
spontanée
COOH
NH2
N
H2O
OH
COOH
OH
Acide Xanthurénique
„ La voie du nicotinamide
COOH
COOH
CHO
Cyclisation
spontanée
NH2
HOOC
N
COOH
CO
NH2
N
Ribose
NAD
+
P
O
N
5 PRPP
H2O
semi-aldéhyde 2-amino
3-carboxy muconique
COOH
Quinolate
Phosphoribosyl
transférase
PPi
COOH
Ribose
P
Ribonucléotide
de l'acide
Quinolique
acide quinolique
CO2
Amidification
ATP + H2O
ADP + Pi
COOH
COOH
Glutamate Glutamine
N
AMP
Ribose
PPi
P
O
Désamido - NAD
+
ATP
AMP
N
Ribose
P
Ribonucléotide
de l'acide
Nicotinique
25
B - LA VOIE DE LA SEROTONINE (VOIE DES HYDROXYINDOLES)
CH2
CH
NH2
N
HO
COOH
CH2
Tryptophane
hydroxylase
COOH
NH2
N
H
CH
H
Tryptophane
NADPH,H
O2
+
5-hydroxy Tryptophane
NADP +
H2O
Décarboxylase
CO2
HO
CH2
CH2
NH2
N
H
5-hydroxy Tryptamine
(Sérotonine)
C-
LA VOIE DES INDOLES NON SUBSTITUES
Tryptophanase
(B6-PO4)
Acide
pyruvique
NH3
CH2
N
H
CH
COOH
NH2
Transaminase
(B6-PO4)
Tryptophane
CH2
N
H
CO
COOH
N
Indole
H
Acide Indole
pyruvique
Décarboxylase
(B6-PO4)
CO2
O
N
H
SO3H
Indoxyle
sulfate
(indican)
CH2
COOH
N
H
Acide Indole
acétique
Décarboxylase
(B6-PO4)
CH3
N
Scatole
H
D-
ANOMALIES ENZYMATIQUES D’ORIGINE GENETIQUE
„ Tryptophanurie congénitale : déficit en tryptophane pyrrolase
„ Cynuréninurie et Hydroxy-Cynuréninurie congénitales : déficit en
cynuréninase
26
METABOLISME DES ACIDES AMINES
CONDUISANT A L’α-CETOGLUTARATE
SCHEMA GENERAL
ARG
PRO
ORN
γ- semi-aldéhyde Glutamique
HIS
GLN
GLU
α-cétoglutarate
1. METABOLISME DE LA L- HISTIDINE
VUE D’ENSEMBLE
L-Histidine
Décarboxylase
Histamine
Histidase
L- HIS
Acide Urocanique
1
Histaminase
Imidazole
Acétaldéhyde
L-Histidine
Transaminase
Acide Imidazole
Pyruvique
Urocanase
Acide Imidazolone
Propionique
Imidazolone
Propionase
Acide Imidazole
Acétique
Acide Imidazole
Lactique
Acide Formimino
Glutamique
(FIGLU)
FH4
2
Glutamate
Formimino
Transférase
Formimino- FH4
L- GLU
27
LA VOIE CATABOLIQUE PRINCIPALE : VOIE DE L’ACIDE
GLUTAMIQUE
A-
CH2
N
CH
COOH
NH2
NH
O
Histidine
désaminase
(Histidase)
H
CH
N
NH3
H
CH
NH
O
H
CH2
CH2
OH
N
COOH
NH
Acide
imidazolone
propionique
H2O
Acide
urocanique
Histidine
COOH
urocanase
H2O
Imidazolone
propionase
glutamate formimino
transférase
HOOC
CH
CH2
NH2
B-
CH2
HOOC
COOH
Acide
glutamique
Formamino
FH4
HN
FH4
CH CH2
CH
CH2
COOH
NH
Acide formimino
glutamique
(FIGLU)
AUTRES DESTINEES METABOLIQUES
„ Décarboxylation en histamine
CH2
N
CH
CO2
COOH
NH2
NH
CH2
N
CH2
NH2
NH
Histidine
décarboxylase
Histidine
Histamine
½ O2
Histaminase
NH3
½ O2
CH2
N
CH2
COOH
N
oxydase
NH
Acide Imidazole
acétique
CHO
NH
Imidazole
acétaldéhyde
„ Transamination
a-céto
glutarate glutamate
CH2
N
NH
Histidine
CH
NH2
CH2
COOH
N
CO
NH
Transaminase
Acide imidazole
pyruvique
COOH
CO2
Décarboxylase
CH2
N
COOH
NH
Acide imidazole
acétique
28
„ Dérivés de l’histidine
– Dérivés méthylés
CH2
1
N
N
CH
COOH
CH2
NH2
H3C
CH3
N3
1-Méthyl-Histidine
N
CH
COOH
NH2
3-Méthyl-Histidine
– Dérivés iodés
C-
ANOMALIES ENZYMATIQUES D’ORIGINE GENETIQUE
„ Histidinémie : déficit en Histidase
„ Le déficit en Glutamate Formimino-transférase
2. METABOLISME DE LA L-ARGININE
A-
LA VOIE CATABOLIQUE PRINCIPALE : ROLE DE
PRECURSEUR DE L’ORNITHINE, DE L’ACIDE GLUTAMIQUE
ET DE LA PROLINE
„ Transamidination avec l’eau
NH2
HN
Arginase
C
OH
H
H2N (CH2)3 CH COOH
NH2
NH (CH2)3 CH COOH
NH2
H2O
L-Arginine
Urée
L-Ornithine
„ Transamidination avec le glycocolle
NH2
HN
Arginase
C
OH
H
H2N (CH2)3 CH COOH
NH (CH2)3 CH COOH
NH2
NH2
L-Arginine
Glycocolle
Glyco
cyamine
L-Ornithine
Créatine
29
„ δ-Transamination
H2N CH2
CH2
CH2
CH
COOH
a-céto
glutarate glutamate
γ
OHC CH2
CH2
NH2
g-semi-aldéhyde
glutamique
ornithine
Transaminase
NAD + + H2O
Pyrroline 5-carboxylate déshydrogénase
NADH, H +
Cyclisation
H2O
3
2
CH2
CH
COOH
NH2
L-Ornithine
HOOC CH2
CH
COOH
acide glutamique NH2
4
5
1
N
COOH
acide D1 - pyrroline
- 5 carboxylique
NADH, H +
Transaminase
Proline oxydase
NAD
HOOC CH2
CH2
CO
+
COOH
acide a-cétoglutarique
COOH
N
H
Proline
B-
DECARBOXYLATION EN AGMATINE
Cf. chapitre Polyamines
3. METABOLISME DE L’ACIDE GLUTAMIQUE ET DE LA GLUTAMINE
A-
ROLES DE L’ACIDE GLUTAMIQUE
„ dans les réactions de transamination
„ réactions de conversion avec Ornithine et Proline
„ rôle structural : glutathion, folates (acides
ptéroyl-polyglutamiques)
30
„ précurseur de l’acide g-aminobutyrique (GABA) :
le shunt g-aminobutyrique
CYCLE de KREBS
HOOC
CH2
CH2
COOH
HOOC
ACIDE SUCCINIQUE
CH2
CH2
CH2
CO
COOH
ACIDE a-CETOGLUTARIQUE
SUCCINYL-CoA
Oxydase
HOOC
CH2
CHO
Transaminase
HOOC
CH2
CH2
CH
COOH
NH2
SEMI ALDEHYDE SUCCINIQUE
CO2
Transaminase
HOOC
ACIDE GLUTAMIQUE
CH2
CH2
CH2
Décarboxylase
NH2
ACIDE g-AMINO BUTYRIQUE
(GABA)
B-
ROLES DE LA GLUTAMINE
„ transport sanguin de l’ammoniac
„ biosynthèse de novo des purines
„ rôle de détoxification : la phénylacétylglutamine
4. METABOLISME DE LA PROLINE
„ Cf. métabolisme de l’arginine
31
METABOLISME DES ACIDES AMINES
CONDUISANT AU FUMARATE
SCHEMA GENERAL
TYR
PHE
FUMARATE
„ Cf. métabolisme de la phénylalanine et de la tyrosine
(notamment la voie de l’acide homogentisique)
COOH
NH2
CH
CH2
Acide Acéto-acétique
C
HC
Acide Fumarique
CH
CH
HC
CH
METABOLISME DES ACIDES AMINES
CONDUISANT A L’OXALO-ACETATE
SCHEMA GENERAL
ASN
OXALO-ACETATE
ASP
1. METABOLISME DE LA L-ASPARAGINE
A-
BIOSYNTHESE
NH3 + ATP
Asparagine
HOOC
CH2 CH
COOH
NH2
acide L-Aspartique
ADP
+ Pi
synthétase
H2N
OC
CH2
CH
COOH
NH2
L-Asparagine
32
B-
DEGRADATION
H OH
HOOC CH2 CH COOH
H2N
Glutaminase
NH2
OC
acide L-Aspartique
CH2
CH
COOH
NH2
L-Asparagine
NH3
H2O
2. METABOLISME DE L’ACIDE L-ASPARTIQUE
A-
REACTION DE DECARBOXYLATION
B-
REACTION DE TRANSAMINATION
„ Précurseur de la b-Alanine
„ précurseur de l’acide oxalo-acétique
C - FOURNISSEUR D’UN ATOME D’AZOTE DE L’UREE LORS DE
L’UREOGENESE
D-
PRECURSEUR DES PURINES ET PYRIMIDINES
„ Purines : atome N1
„ Pyrimidines : atomes N1 et C4, C5 et C6
METABOLISME DES ACIDES AMINES
CONDUISANT AU SUCCINYL-COA
SCHEMA GENERAL
MET
VAL
THR
ILE
Propionyl - CoA
Méthyl Malonyl - CoA
Succinyl - CoA
33
1. METABOLISME DE LA L- METHIONINE
A-
TRANSMETHYLATION ET TRANSSULFURATION
„ Cf. métabolisme de la L-Cystéine
B-
DEVENIR DE L’HOMOSERINE
COOH
CH
COOH
NH3
NH2
CO ~ S CoA
CO2
CO
CH2
Décarboxylation
oxydative
CH3
Acide a-céto butyrique
Homosérine
CH2
CH2
CH2
CH2
CH2OH
CO2
CO ~ S CoA
CH3
Propionyl-CoA
carboxylase
Propionyl - CoA
CH3
Succinyl - CoA
2. METABOLISME DES ACIDES AMINES ALIPHATIQUES A CHAINE
RAMIFIEE : L-VALINE, L-ISOLEUCINE ET L-LEUCINE
A-
VUE D’ENSEMBLE
L- VAL
L- ILE
1
L- LEU
2
α-céto-Isovalérate
2
α-céto-β-méthyl-valérate
3
α-céto-Isocaproate
3
3
α-méthyl-butyryl-CoA
Isobutyryl-CoA
Isovaléryl-CoA
4
β-méthyl-crotonyl-CoA
5
Semi-aldéhyde
méthylmalonique
α-méthyl-acétoacétyl-CoA
Propionyl-CoA
β-Hydroxyβ-méthyl-glutaryl-CoA
Acétyl-CoA
Acétoacétyl-CoA
6
Méthyl-malonyl-CoA
Corps cétoniques
7
Succinyl-CoA
CYCLE DE KREBS
34
B-
DESCRIPTION DES DEUX PREMIERES ETAPES
CH3
CH3
CH
CH3
CH
CH2
COOH
CH3
CH
CH3
NH2
Valine
Transaminase
a-céto
glutarate
CH
CH
α
CO
CH3
CH2 β
CH
CH3
Acide a-céto
Isovalérique
CH3
CH
CO
S ~ CoA
CH3
C-
α
CO
CH
a-céto
glutarate
glutamate
CH3
CH
CH2
α
CO
a-céto-acide
déshydrogénase
(décarboxylase)
Acide a-cétoIsocaproïque
a-céto-acide
déshydrogénase
(décarboxylase)
CO2
CO2
CH2
α
CH
COOH
CH3
Acide a-céto-b-méthyl
valérique
CH3
COOH
NH2
LEU - ILE
Transaminase
COOH
CO
S
~ CoA
CH3
Isobutyryl-CoA
CH2
glutamate
COOH
CO2
CH
CH3
a-céto
glutarate
LEU - ILE
Transaminase
CH3
a-céto-acide
déshydrogénase
(décarboxylase)
COOH
NH2
glutamate
CH3
L-LEUCINE
L-ISOLEUCINE
L-VALINE
a-méthyl-butyryl-CoA
CH3
CH
CH2
CO
S
~ CoA
CH3
isovaléryl-CoA
ANOMALIES ENZYMATIQUES D’ORIGINE GENETIQUE
„ Hypervalinémie : déficit en Valine transaminase (enzyme 1)
„ Déficit en Leucine et Isoleucine transaminase (enzyme 2)
„ Leucinose : maladie des urines à odeur de sirop d’érable (déficit
en α-cétoacide décarboxylase, enzyme 3)
„ Acidémie isovalérique : déficit en isovaléryl-CoA déshydrogénase
(enzyme 4)
„ Déficit en β-méthyl-crotonyl-CoA carboxylase (enzyme 5)
„ Acidémie propionique : déficit en propionyl-CoA carboxylase
(enzyme 6)
„ Acidémie méthyl-malonique : déficit en méthyl-malonyl-CoA
isomérase (enzyme 7)
35
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