Analyse microbiologique d`un produit polymicrobien

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Thème Thème
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Analyse
microbiologique
d'un produit
polymicrobien
La démarche de l’analyse microbiologique
La recherche d’une flore particulière
Dénombrement d’une flore d’un produit microbien

1
Chapitre
1
Chapitre
1. Méthode qualitative et/ou méthode quantitative 14
2. Démarche de l’analyse microbiologique dans
le domaine médical 14
3. Démarche de l’analyse microbiologique dans
le domaine des bio-industries 18
N°1 Infection nosocomiale ou communautaire ? 25
N°2 Analyse de plan d’échantillonnage en
industrie agroalimentaire 28
N°3 Interprétation de résultats d’une analyse d’un
produit cosmétique 30
ACTIVITÉS COURS
La démarche de l’analyse
microbiologique
Les objectifs du
programme
Les compétences développées
en classe de première seront
réinvesties dans l’analyse
microbiologique d’un produit
polymicrobien.
L’objectif est de comprendre
la démarche choisie,
dénombrement ou recherche,
et de permettre à l’élève
de différencier les deux
méthodologies.

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Chapitre 1La démarche de l’analyse microbiologique : recherche et/ou dénombrement
Dans le domaine médical, l’analyse microbiologique cor-
respond à la recherche d’un micro-organisme pathogène.
C’est donc le plus souvent une analyse qualitative.
Elle permet de poser un diagnostic direct, c’est-à-dire la
mise en évidence, dans le prélèvement eectué chez un
patient, du micro-organisme responsable des symptômes
observés.
Le micro-organisme pathogène isolé du prélèvement
subit une identication la plus complète possible. Tra-
ditionnellement, cette identication repose sur la re-
cherche de nombreux caractères biochimiques, associée
si nécessaire à la recherche d’antigènes de surface (voir
sérogroupage/sérotypage).
Une fois le diagnostic posé grâce à la mise en évidence
et à l’identication du micro-organisme responsable, un
antibiogramme (ou un «anti-fongigramme») est réalisé
pour mettre en place un traitement ecace.
L’analyse urinaire est relativement à part dans ce do-
maine: une urine normale est stérile mais ce produit bio-
logique se retrouve souvent faiblement contaminé lors du
prélèvement (ore cutanée du méat urinaire, ore intes-
tinale). Une «urine pathologique» caractéristique d’une
infection est par contre riche en bactéries. C’est donc le
dénombrement des bactéries urinaires qui constitue dans
ce cas un des critères les plus ables pour le diagnostic:
on considère qu’une bactériurie supérieure à 105bacté-
ries par mL d’urine signe une infection. Le plus souvent
on retrouve une seule espèce bactérienne responsable de
l’infection (infection mono-microbienne).
L’analyse microbiologique dans le domaine médical peut
également être réalisée dans un but épidémiologique
et/ou dans le cadre de la recherche d’un portage sain
(cf. 2.1.2. «La ore pathogène» p. 17).
2.1. Les différents types de ores
microbiennes chez l’homme
Certains prélèvements biologiques eectués chez un pa-
tient, en plus de contenir le micro-organisme pathogène,
sont polymicrobiens en raison de l’existence d’une ore
commensale importante.
2.1.1. La ore commensale
Le commensalisme est une association entre un hôte (ici
l’homme) et un micro-organisme qui ne provoque pas de
trouble chez l’hôte. L’hôte fournit la «nourriture» et le
«gîte» au micro-organisme et peut tirer prot de cette
association.
Dès la naissance, l’organisme humain est en contact
constant avec les micro-organismes de son environnement
au niveau des interfaces milieu extérieur / milieu intérieur
que sont la peau et les muqueuses. Certains de ces micro-
organismes colonisent ces interfaces et constituent une
ore commensale résidente (document 1 ).
L’analyse microbiologique est réalisée dans diérents
domaines:
- le domaine médical où cette analyse est menée sur un
prélèvement biologique eectué chez un patient dans
un but de diagnostic et de mise en place d’un traite-
ment adapté;
- le domaine des bio-industries (industries agroalimen-
taire, pharmaceutique, cosmétique) où cette analyse est
menée:
· sur les matières premières et les produits nis dans le
but de vérier leur état sanitaire,
· sur les produits en cours de fabrication, les outils ou
les appareils utilisés…, dans le but de valider un pro-
cédé de fabrication;
- le domaine de l’environnement où cette analyse est
menée sur un prélèvement d’eau, d’air, de surface…,
dans le but de mettre en évidence la pollution micro-
bienne d’un écosystème.
Quel que soit le domaine dans lequel elle est réalisée,
l’analyse microbiologique permet:
- soit de rechercher dans l’échantillon au moins un
micro-organisme spécique, le plus souvent patho-
gène. L’analyse doit permettre de l’isoler et de l’iden-
tier même s’il n’est présent qu’en très faible quantité.
L’analyse est qualitative et le résultat est rendu sous
forme de présence ou d’absence du micro-organisme
recherché dans l’échantillon ;
- soit de quantier dans l’échantillon une ore particu-
lière. Cette quantication est le plus souvent appelée
dénombrement. L’analyse est quantitative et le résultat
est rendu sous forme d’une concentration en micro-
organismes (appartenant à une ore particulière) par
mL ou par g d’échantillon.
Le but, la démarche et les techniques développées lors de
l’analyse microbiologique dans le domaine médical sont
très diérents de ceux développés dans les domaines des
bio-industries et de l’environnement. En eet, dans ces
domaines, contrairement au domaine médical, les mé-
thodes utilisées reposent le plus souvent sur des normes
et les résultats sont interprétés en fonction de critères
microbiologiques.
1. MÉTHODE QUALITATIVE ET/OU MÉTHODE QUANTITATIVE
2. DÉMARCHE DE L’ANALYSE MICROBIOLOGIQUE DANS LE
DOMAINE MÉDICAL