P. aeruginosa, Acinetobacter

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SEMINAIRE INFECTIOLOGIE
9 Janvier 2006
M. Archambaud – B. Georges
Laboratoire Bactériologie-Hygiène
BRR
CHU Rangueil
Toulouse
Quand la prescription antibiotique est décidée
3 acteurs : bactérie, antibiotique, patient
Données microbiologiques
Données pharmacologiques
Données économiques
Règles établies par experts :
Antibiotique
Consensus (SFAR, SFPILF, SFM)
Guide de bonne utilisation des antibiotiques
Comité des antibiotiques : au sein d’un hôpital
Sur Intranet au CHU Toulouse
Vidal
Bactérie
Hôte
Diversité des Infections en réanimation
Infections communautaires sévères, monomicrobiennes
méningites
pneumopathies sévères
pneumopathies d ’inhalation
Choc septique gram - (origine urinaire, hépato-vésiculaire…)
Choc toxique Streptococcique, Staphylococcique…..
Infections acquises, mono ou plurimicrobiennes
pneumopathies aiguës sur ventilation mécanique
plusieurs sites infectés
post-traumatiques
post chirurgicales : infection du site opératoire
sur matériel : cathéter, sonde urinaire, ventilation
septicémies, (endocardites)
Diversité des infections en réanimation
Diversité des espèces bactériennes
Bactéries communautaires
N. meningitidis, S. pneumoniae,
S. aureus
E. coli
Streptococcus pyogenes………..
Bactéries nosocomiales
SARM, Staphylocoques à coagulase négative
P. aeruginosa
Entérobactéries : Serratia, Enterobacter….
Acinetobacter baumannii
S. maltophilia
BMR : SARM, Entérobactéries BLSE,….
BTR : P. aeruginosa, Acinetobacter …….
Choix des antibiotiques : données microbiologiques
Bactérie / Antibiotique
Antibiothérapie prophylactique
en Anesthésie Règles de consensus
Antibiothérapie probabiliste
site de l ’infectionbactéries en cause
terrain: état de colonisation du patient
écologie bactérienne du service
Site
Bactérie
Terrain
Antibiothérapie documentée
documentation microbiologique,
avec la lecture éclairée de l ’antibiogramme
Pour une bonne utilisation des antibiotiques
il faut connaître
• Spectre de l ’antibiotique utilisé
• Mode d ’action
• Mécanismes de résistance
Pour éviter la sélection de bactéries résistantes
il faut savoir adapter l’antibiothérapie
(désescalade)
Spectre d ’activité des Antibiotiques : Vidal
Pour une espèce bactérienne, le % de souches S, I ou R sera déterminé
sur un grand nombre de souches. Ce spectre est révisé régulièrement
- Espèce habituellement sensible :
plus de 90% des souches sont sensibles
- Espèce modérément sensible :
plus de 90% des souches se situent dans la zone intermédiaire
- Espèce résistante :
au moins 50% des souches sont résistantes
Ce spectre tient compte
de la résistance naturelle et acquise des espèces
de la détermination des CMI 50% et CMI 90% :
Pharmacodynamie
pour chaque
antibiotique la liste
des espèces
bactériennes
de ces trois
catégories est
donnée
Résistance naturelle
•Caractéristique propre à toutes les souches
d’une même espèce bactérienne :
définit le phénotype sauvage
•Exemples :
-Entérobactéries R Pénicilline G
-Klebsiella R Ampicilline, Ticarcilline
•Importance de sa connaissance :
- identification des bactéries
- antibiothérapie probabiliste et prophylactique
Résistance acquise
• Caractéristique de certaines souches
d’une même espèce bactérienne :
définit le phénotype de résistance acquise
résulte de modifications génétiques :
mutation gènes endogènes
acquisition de gènes exogènes
Acquisition de gènes exogènes
Transformation
Conjugaison
Transduction
Résistance acquise
Caractéristique de certaines souches
d’une même espèce bactérienne :
définit le phénotype de résistance acquise
résulte de modifications génétiques :
mutation gènes endogènes
acquisition de gènes exogènes
Caractère évolutif de la résistance acquise
BMR……….BTR
Emergence de cette résistance sous la dépendance
de la pression de sélection par les antibiotiques
Mode d ’action
Conditions d ’activité
Différents Mécanismes
Mode d ’action
Les cibles bactériennes des antibiotiques
L ’ADN
Quinolones
Rifamycines
Nitroimidazolés
Sulfamides
Le ribosome
La paroi
β-lactamines
Glycopeptides
Fosfomycine
La membrane externe
Polymyxines
Aminosides
Macrolides, kétolides
Lincosamides
Synergistines
Tétracyclines
Acide fusidique
Phénicolés
Linezolid
Conditions d ’activité des ATB
ATB
porine
Mne externe
Paroi
• Atteindre la cible : pénétrer
-membrane externe des gramporines, LPS
caractère hydrophile / hydrophobe des ATB
- paroi :peptidoglycane
- membrane cytoplasmique
• Persister à des concentrations
suffisantes
Mne cytoplasmique
Gram-
• Reconnaître la cible
Mécanismes de résistance des bactéries aux ATB
♦ Imperméabilité :
défaut pour atteindre la cible
♦ ATB actif à des concentrations insuffisantes :
- inactivation enzymatique
- efflux
♦ Cible non reconnue : modification de cible
Association possible de différents mécanismes de résistance
Imperméabilité chez Gramnombre de porines- altération des porines
β-lactamines
Aminosides
Quinolones
Inactivation enzymatique
β-lactamines / β-lactamases
EFFLUX
β-lactamines
Quinolones
ACTIF
Macrolides
Cyclines
Modification de cible
Enzymes modifiés
ADN gyrase
Topoisomérase
PLP modifiée
β-lactamines
Quinolones
Les β-lactamines
Les glycopeptides
Les aminosides
Les oxazolidinones
Les fluoroquinolones
Résistance
naturelle
Spectre d ’activité
Résistance acquise
Pénicilline M : oxacilline
Gram négatif
Spectre étroit
Staphylocoques
Modification PLP
PLP 2a, gène mecA

SARM
• Modification PLP nouvelle PLP2a,
PLP2a
• Codée par gène mec A, résistance hétérogène
• Association à d’autres résistances
phénotype le plus courant en 2005
Genta S, Tobra, Amik R
Péfloxacine R
Implications sur la prescription antibiotique
- si genta S
- si genta R: attention CMI glycopeptides 
• Distribution clonale
• Transmission manuportée
• Portage nasal, dépistage
Bactérie cutanée : infections de cathéter, de matériel étranger
• S. epidermidis souvent R à oxacilline (PLP 2a)
• Phénotypes divers
Amoxicilline
GramE. coli, P. mirabilis,
Salmonella,
Shigella
Gram+
S. pneumoniae,
E. faecalis
Klebsiella,
Enterobacter,Serratia …
P. aeruginosa, Acinetobacter
S. maltophilia
Pénicillinases fréquentes
E. coli, P.mirabilis
S. aureus
Modification PLP
S. pneumoniae
E. faecium
Amoxicilline + acide clavulanique (inhibiteur de pénicillinases)
GramE. coli, P. mirabilis,
Salmonella,
Shigella
Klebsiella
Gram+
S. pneumoniae,
E. faecalis,
S. aureus
Anaérobies
Enterobacter,Serratia …
P. aeruginosa, Acinetobacter
S. maltophilia
Pénicillinases hyperproduites
E. coli, Klebsiella
Modification PLP
Ticarcilline -Pipérilline
Klebsiella
GramE. coli, P. mirabilis,
Enterobacter, Serratia, Morganella...
P. aeruginosa, Acinetobacter,
Anaérobies
Entérocoques
Pénicillinases fréquentes
E. coli, P; mirabilis
P. aeruginosa, Acinetobacter
BLSE Entérobactéries
Céphalosporinases
Enterobacter, Serratia, Morganella
P. aeruginosa, Acinetobacter
Ticarcilline+ acide clavulanique
Pipérilline + tazobactam
E. coli, P. mirabilis, Klebsiella
Enterobacter, Serratia, Morganella...
P.aeruginosa, Acinetobacter
Anaérobies
Entérocoques
Pénicillinase hyperproduite
BLSE Entérobactéries
Céphalosporinase déréprimée
Enterobacter, Serratia, Morganella
P. aeruginosa, Acinetobacter
Différence
Ticarcilline+ acide clavulanique
Pipérilline + tazobactam
Acide clavulanique et tazobactam
Inhibiteurs de pénicillinases
Acide clavulanique
Inducteur de céphalosporinase
Bactéries avec céphalosporinases chromosomiques ?
P. aeruginosa, Entérobactéries Enterobacter, Serratia...
Céphalosporinase
naturelle
inductible
réversible
déréprimée
stable
Cefotaxime, Ceftriaxone
Toutes les entérobactéries
E. coli, P. mirabilis,
Entérocoques Anaérobies
Enterobacter, Serratia,
P. aeruginosa, S. maltophilia,
Morganella…
Acinetobacter
Gram+
S. pneumoniae
Céphalosporinase déréprimée
Enterobacter, Serratia, Morganella
P. aeruginosa, Acinetobacter
BLSE
BLSE : β−lactamase à spectre étendu / Entérobactéries
Saga des mutations des TEM et SHV :
Hydrolyse des Céphalo 3 (spectre étendu)
• 1 ou n substitutions d’aa proches du site actif
• modification de la structure quaternaire de l’enzyme
Décrite en France en 1984 Clermont Ferrand CTX1 =TEM3, dérive de TEM2 par 2aa
• Ces mutations touchent toutes les espèces d’entérobactéries
mais K.pneumoniae est la plus fréquemment touchée.
• Sous la pression de sélection par les Céphalo3
• La mise en évidence au laboratoire par le phénomène de synergie entre
l’acide clavulanique et les Céphalo3.(bouchon de champagne)
• plus de 100 mutations décrites
Ceftazidime
Toutes les entérobactéries
E. coli, P. mirabilis,
Enterobacter, Serratia,
Morganella…
Entérocoques
Anaérobies
P. aeruginosa
Céphalosporinase déréprimée
Enterobacter, Serratia, Morganella
P. aeruginosa, Acinetobacter
BLSE
Céfépime, Cefpirome: intérêt sur céphalosporinase déréprimée
Toutes les entérobactéries
E. coli, P. mirabilis,
Entérocoques
Anaérobies
Enterobacter, Serratia,
Morganella…
P. aeruginosa
BLSE
Efflux : P. aeruginosa
Imipénème, Méropénème
S. maltophilia
Spectre large
Entérobactéries
P. aeruginosa
Acinetobacter
Anaérobies
E. faecalis
Staphylocoques
Imperméabilité
P. aeruginosa (porine D2)
Carbapénémases
P. aeruginosa
Entérobactéries, Acinetobacter
Modification PLP
SARM, E. faecium
Carbapénémases
Rares mais quelques cas rapportés
hydrolyse carbapénèmes et autres β-lactamines sauf aztreonam
difficulté de mise en évidence : CMI peuvent être peu élevèes
Carbapénémases sont décrites dans le monde entier (Asie du Sud-Est )
plusieurs types
Evolution comme pour les autres β-lactamases : mutation 1 ou 2 aa différents
Souvent associé à une résistance aux aminosides
Origine ? environnement
Avenir ?
Vancomycine, Teicoplanine
GramSpectre étroit
Staphylocoques
Entérocoques
Corynebactéries
Modification cible
Entérocoques
phénotypes Van A, B, C…
Staphylocoques
Résistance aux glycopeptides/ Phénotypes Van A, B, C...
Résistance des Entérocoques
aux glycopeptides 1987
rare en France
Passage au SAMR : ?
Possible in vitro
15 ans après : souches isolées en clinique, 2 cas en 2002
aux USA Pensylvanie et Michigan, non clonales, de type VanA
Inquiétude en 2003 : avenir?
(Lancet Infect. Dis. Fev2003, P. Courvalin)
S.aureus / Résistance - Sensibilité diminuée aux glycopeptides
1997 : souche japonaise R à vancomycine avec échec thérapeutique
VRSA, GRSA
VISA, GISA : CMI 8mg/l - Hétéro-VISA
distribution mondiale : 1ère souche en France 1998
attention aux souches : GentaR
et chez malades sous glycopeptides au long cours
2 types de résistance :
- homogène CMI Vanco 8mg/l, Teico 16 mg/l
modification de la paroi : épaississement,
PLP2a et précurseurs du peptidoglycane augmentés
- hétérogène CMI Vanco 3 à 8 mg/l, analyse de la population
1 cellule/106 exprime la résistance, non stable
difficile à mettre en évidence au laboratoire
Aminosides
Streptocoques
Entérocoques
Anaérobies
Spectre large
Bacilles gramStaphylocoques
Inactivation enzmatique
Inactivation enzymatique
enzymes modificatrices des aminosides
APH
ANT
AAC
APH : phosphotransférase
ANT : nucléotidyltransférase
AAC : acétyltransférase
Fluoroquinolones
Pefloxacine, Ofloxacine, Ciprofloxacine
Spectre large
Bacilles gramStaphylocoques
Bactéries intracellulaires
Legionella,
Chlamydia
Streptocoques
Entérocoques
Anaérobies
Modification de cible
Résistance croisée
chromosomique
par mutations
Résistance aux quinolones des Entérobactéries
les différents phénotypes
NA a. nalidixique
PEF pefloxacine
CIP ciprofloxacine
Sauvage
NA, PEF, OFX, CIP : S
NA : R
PEF, OFX, CIP : S
NA, PEF,OFX CIP : R
Attention à la sélection
NA, PEF, OFX: R
Posologie adaptée
CIP : S
Résistance aux quinolones de P. aeruginosa
les différents phénotypes
Sauvage
PEF, OFX, CIP : S
PEF pefloxacine
CIP ciprofloxacine
PEF, OFX, CIP : S
PEF,OFX CIP : R
PEF, OFX: R
CIP : S
Attention à la sélection
Posologie adaptée
Linezolide
Linezolide : nouvelle classe d ’antibiotiques
Oxazolidinone
Spectre : Activité sur les cocci Gram +
CMI 90 sur S. aureus Méthi S et Méthi R : 1mg/l
Concentrations critiques : 2 -4 mg/l
Cible d ’action : première phase de la synthèse des protéines
rares souches R
AMM : infections pulmonaires et tissus mous
attention : risque hématologique si traitement > 15 jours
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