Sujet de stage de Master 2 Recherche Année 2013/2014

Sujet de stage de Master 2 Recherche
Année 2013/2014
Laboratoire : Institut de Biologie Structurale
Intitulé de l'équipe : Equipe Pathogénie Bactérienne
Directeur : E. Pebay-Peyroula
Responsable : A. Dessen
Nom et qualité du responsable du stage : Viviana Job
Adresse : 41 Rue Jules Horowitz
Tél :0438789590
email : [email protected]
HDR oui ☐
non x
Spécialité MASTER :
☐ Biodiversité - Ecologie – Environnement
x Biochimie, Biologie Structurale
☐ Immunology, Microbiology, Infectiology
☐ Neurosciences and Neurobiology
☐ Physiology Epigenetics Development
Titre du sujet : Caractérisation structurale du système de sécrétion de type VI de
Pseudomonas aeruginosa
Objectifs recherchés (3 lignes max) :
Ce projet vise la compréhension biochimique et structurale de deux protéines
essentielles pour le système de sécrétion de type IV de Pseudomonas aeruginosa,
TagQ et TagR.
Résumé (10 lignes max) :
Pseudomonas aeruginosa est un pathogène majeur pour l’homme, agent causal
d’infections pulmonaires majeures, et particulièrement dangereux pour des patients
atteints de la mucoviscidose. Le système de sécrétion de type VI (T6SS) est un système
macromoléculaire récemment découvert chez ce pathogène, impliqué dans la sécrétion
de différentes toxines dans les cellules humaines. Notre équipe vise l’étude de protéines
spécifiques de ce système, en particulier les protéines TagQ et TagR, qu'on suppose
forment un complexe essentiel pour la fonction du T6SS de P. aeruginosa. Les protéines
seules seront d'abord purifiées et caractérisées biochimiquement et ensuite on
cherchera a confirmer la formation d'un complexe. Un fera également des études par
cristallographie aux rayons X des deux protéines et du complexe. Ces études pourront
aider au développement de nouveaux antibiotiques qui bloquent la virulence de P.
aeruginosa due a ce système.
Approches & matériel utilisés (3 lignes max) :
Biologie moléculaire, expression et purification de protéines recombinantes en E.coli, biochimie des
protéines et du complexe, cristallogenese. Des expériences in vivo sur Pseudomonas pourront être
réalisées en collaboration avec l'iRTSV de Grenoble.
Publications pertinentes de l'équipe (3 max) :
Gendrin C, Contreras-Martel C, Bouillot S, Elsen S, Lemaire D, Skoufias DA, Huber P, Attree I,
Dessen, A (2012) Structural basis of cytotoxicity mediated by the type III secretion toxin
ExoU from Pseudomonas aeruginosa. PLoS Pathog. e1002637.
Izoré, T., Perdu, C., Job, V., Attree, I., Faudry, E., and Dessen, A. (2011) Structural
characterization and membrane localization of ExsB from the type III secretion system
(T3SS) of Pseudomonas aeruginosa. J. Mol. Biol. 413, 236-246.
Izoré, T., Job, V., and Dessen, A. (2011) Biogenesis, regulation, and targeting of the type III
secretion system. Structure 19, 603-612.
Domaines de compétences souhaités (quelques mots clés) :
Microbiologie: transformation et mise en culture de bactéries,
Biochimie: purification de proteines