UNIVERSITE MOHAMMED V FACULTE DE MEDECINE ET DE PHARMACIE -RABATANNEE : 2011 THESE N°:100 LA QUALITE MICROBIOLOGIQUE DES EAUX DE BAIGNADE THESE Présentée et soutenue publiquement le :………… PAR Mr. EL ATTIFFI EL OUADRASSI ALI Né le 22/06/1987 à KSAR EL KEBIR Pour l'Obtention du Doctorat en Pharmacie MOTS CLES : Eaux de baignade, Pollution, Risques sanitaires. MEMBRES DE JURY Mr. A.GAOUZI Professeur de Pédiatrie Mr. M . ZOUHDI Professeur de Microbiologie Mme. S. EL HAMZAOUI Professeur de Microbiologie Mme. S.AOUFI Professeur agrégé de Parasitologie PRESIDENT RAPPORTEUR JUGES UNIVERSITE MOHAMMED V- SOUISSI FACULTE DE MEDECINE ET DE PHARMACIE - RABAT DOYENS HONORAIRES : 1962 – 1969 : Docteur Abdelmalek FARAJ 1969 – 1974 : Professeur Abdellatif BERBICH 1974 – 1981 : Professeur Bachir LAZRAK 1981 – 1989 : Professeur Taieb CHKILI 1989 – 1997 : Professeur Mohamed Tahar ALAOUI 1997 – 2003 : Professeur Abdelmajid BELMAHI ADMINISTRATION : Doyen : Professeur Najia HAJJAJ Vice Doyen chargé des Affaires Académiques et estudiantines Professeur Mohammed JIDDANE Vice Doyen chargé de la Recherche et de la Coopération Professeur Ali BENOMAR Vice Doyen chargé des Affaires Spécifiques à la Pharmacie Professeur Yahia CHERRAH Secrétaire Général : Mr. El Hassane AHALLAT Conservateur : Ahmed ZAHIDI PROFESSEURS : Février, Septembre, Décembre 1973 1. Pr. CHKILI Taieb Neuropsychiatrie Janvier et Décembre 1976 2. Pr. HASSAR Mohamed Pharmacologie Clinique Mars, Avril et Septembre 1980 3. Pr. EL KHAMLICHI Abdeslam 4. Pr. MESBAHI Redouane Neurochirurgie Cardiologie 5. Mai et Octobre 1981 6. Pr. BOUZOUBAA Abdelmajid 7. Pr. EL MANOUAR Mohamed 8. Pr. HAMANI Ahmed* 9. Pr. MAAZOUZI Ahmed Wajih 10. Pr. SBIHI Ahmed 11. Pr. TAOBANE Hamid* Cardiologie Traumatologie-Orthopédie Cardiologie Chirurgie Cardio-Vasculaire Anesthésie –Réanimation Chirurgie Thoracique 12. 13. 14. 15. 16. 17. Oto-Rhino-Laryngologie Chirurgie-Cardio-Vasculaire Anatomie Chirurgie Thoracique Physiologie Mai et Novembre 1982 Pr. ABROUQ Ali* Pr. BENOMAR M’hammed Pr. BENSOUDA Mohamed Pr. BENOSMAN Abdellatif Pr. LAHBABI ép. AMRANI Naïma Novembre 1983 18. Pr. ALAOUI TAHIRI Kébir* 19. Pr. BALAFREJ Amina 20. Pr. BELLAKHDAR Fouad 21. Pr. HAJJAJ ép. HASSOUNI Najia Pneumo-phtisiologie Pédiatrie Neurochirurgie Rhumatologie 22. Pr. SRAIRI Jamal-Eddine Cardiologie Décembre 1984 23. Pr. BOUCETTA Mohamed* 24. Pr. EL GUEDDARI Brahim El Khalil 25. Pr. MAAOUNI Abdelaziz 26. Pr. MAAZOUZI Ahmed Wajdi 27. Pr. NAJI M’Barek * 28. Pr. SETTAF Abdellatif Neurochirurgie Radiothérapie Médecine Interne Anesthésie -Réanimation Immuno-Hématologie Chirurgie Novembre et Décembre 1985 29. Pr. BENJELLOUN Halima 30. Pr. BENSAID Younes 31. Pr. EL ALAOUI Faris Moulay El Mostafa 32. Pr. IHRAI Hssain * 33. Pr. IRAQI Ghali 34. Pr. KZADRI Mohamed Cardiologie Pathologie Chirurgicale Neurologie Stomatologie et Chirurgie Maxillo-Faciale Pneumo-phtisiologie Oto-Rhino-laryngologie Janvier, Février et Décembre 1987 35. Pr. AJANA Ali 36. Pr. AMMAR Fanid 37. Pr. CHAHED OUAZZANI Houria ép.TAOBANE 38. Pr. EL FASSY FIHRI Mohamed Taoufiq 39. Pr. EL HAITEM Naïma 40. Pr. EL MANSOURI Abdellah* 41. Pr. EL YAACOUBI Moradh 42. Pr. ESSAID EL FEYDI Abdellah 43. Pr. LACHKAR Hassan 44. Pr. OHAYON Victor* 45. Pr. YAHYAOUI Mohamed Radiologie Pathologie Chirurgicale Gastro-Entérologie Pneumo-phtisiologie Cardiologie Chimie-Toxicologie Expertise Traumatologie Orthopédie Gastro-Entérologie Médecine Interne Médecine Interne Neurologie Décembre 1988 46. Pr. BENHAMAMOUCH Mohamed Najib 47. Pr. DAFIRI Rachida 48. Pr. FAIK Mohamed 49. Pr. HERMAS Mohamed 50. Pr. TOLOUNE Farida* Chirurgie Pédiatrique Radiologie Urologie Traumatologie Orthopédie Médecine Interne Décembre 1989 Janvier et Novembre 1990 51. Pr. ADNAOUI Mohamed 52. Pr. AOUNI Mohamed 53. Pr. BENAMEUR Mohamed* 54. Pr. BOUKILI MAKHOUKHI Abdelali 55. Pr. CHAD Bouziane 56. Pr. CHKOFF Rachid 57. Pr. KHARBACH Aîcha 58. Pr. MANSOURI Fatima 59. Pr. OUAZZANI Taïbi Mohamed Réda 60. Pr. SEDRATI Omar* 61. Pr. TAZI Saoud Anas Médecine Interne Médecine Interne Radiologie Cardiologie Pathologie Chirurgicale Urologie Gynécologie -Obstétrique Anatomie-Pathologique Neurologie Dermatologie Anesthésie Réanimation Février Avril Juillet et Décembre 1991 62. Pr. AL HAMANY Zaîtounia 63. Pr. ATMANI Mohamed* Anatomie-Pathologique Anesthésie Réanimation 64. 65. 66. 67. 68. 69. 70. 71. 72. 73. 74. 75. 76. 77. 78. 79. 80. 81. 82. Pr. AZZOUZI Abderrahim Pr. BAYAHIA Rabéa ép. HASSAM Pr. BELKOUCHI Abdelkader Pr. BENABDELLAH Chahrazad Pr. BENCHEKROUN BELABBES Abdellatif Pr. BENSOUDA Yahia Pr. BERRAHO Amina Pr. BEZZAD Rachid Pr. CHABRAOUI Layachi Pr. CHANA El Houssaine* Pr. CHERRAH Yahia Pr. CHOKAIRI Omar Pr. FAJRI Ahmed* Pr. JANATI Idrissi Mohamed* Pr. KHATTAB Mohamed Pr. NEJMI Maati Pr. OUAALINE Mohammed* Pr. SOULAYMANI Rachida ép.BENCHEIKH Pr. TAOUFIK Jamal Anesthésie Réanimation Néphrologie Chirurgie Générale Hématologie Chirurgie Générale Pharmacie galénique Ophtalmologie Gynécologie Obstétrique Biochimie et Chimie Ophtalmologie Pharmacologie Histologie Embryologie Psychiatrie Chirurgie Générale Pédiatrie Anesthésie-Réanimation Médecine Préventive, Santé Publique et Hygiène Pharmacologie Chimie thérapeutique Décembre 1992 83. Pr. AHALLAT Mohamed 84. Pr. BENOUDA Amina 85. Pr. BENSOUDA Adil 86. Pr. BOUJIDA Mohamed Najib 87. Pr. CHAHED OUAZZANI Laaziza 88. Pr. CHRAIBI Chafiq 89. Pr. DAOUDI Rajae 90. Pr. DEHAYNI Mohamed* 91. Pr. EL HADDOURY Mohamed 92. Pr. EL OUAHABI Abdessamad 93. Pr. FELLAT Rokaya 94. Pr. GHAFIR Driss* 95. Pr. JIDDANE Mohamed 96. Pr. OUAZZANI TAIBI Med Charaf Eddine 97. Pr. TAGHY Ahmed 98. Pr. ZOUHDI Mimoun Chirurgie Générale Microbiologie Anesthésie Réanimation Radiologie Gastro-Entérologie Gynécologie Obstétrique Ophtalmologie Gynécologie Obstétrique Anesthésie Réanimation Neurochirurgie Cardiologie Médecine Interne Anatomie Gynécologie Obstétrique Chirurgie Générale Microbiologie Mars 1994 99. Pr. AGNAOU Lahcen 100. Pr. AL BAROUDI Saad 101. Pr. BENCHERIFA Fatiha 102. Pr. BENJAAFAR Noureddine 103. Pr. BENJELLOUN Samir 104. Pr. BEN RAIS Nozha 105. Pr. CAOUI Malika 106. Pr. CHRAIBI Abdelmjid 107. Pr. EL AMRANI Sabah ép. AHALLAT 108. Pr. EL AOUAD Rajae 109. Pr. EL BARDOUNI Ahmed 110. Pr. EL HASSANI My Rachid 111. Pr. EL IDRISSI LAMGHARI Abdennaceur 112. Pr. EL KIRAT Abdelmajid* 113. Pr. ERROUGANI Abdelkader Ophtalmologie Chirurgie Générale Ophtalmologie Radiothérapie Chirurgie Générale Biophysique Biophysique Endocrinologie et Maladies Métaboliques Gynécologie Obstétrique Immunologie Traumato-Orthopédie Radiologie Médecine Interne Chirurgie Cardio- Vasculaire Chirurgie Générale 114. 115. 116. 117. 118. 119. 120. 121. 122. 123. 124. 125. Pr. ESSAKALI Malika Pr. ETTAYEBI Fouad Pr. HADRI Larbi* Pr. HASSAM Badredine Pr. IFRINE Lahssan Pr. JELTHI Ahmed Pr. MAHFOUD Mustapha Pr. MOUDENE Ahmed* Pr. OULBACHA Said Pr. RHRAB Brahim Pr. SENOUCI Karima Pr. SLAOUI Anas ép. BELKHADIR Immunologie Chirurgie Pédiatrique Médecine Interne Dermatologie Chirurgie Générale Anatomie Pathologique Traumatologie – Orthopédie Traumatologie- Orthopédie Chirurgie Générale Gynécologie –Obstétrique Dermatologie Chirurgie Cardio-Vasculaire Mars 1994 126. Pr. ABBAR Mohamed* 127. Pr. ABDELHAK M’barek 128. Pr. BELAIDI Halima 129. Pr. BRAHMI Rida Slimane 130. Pr. BENTAHILA Abdelali 131. Pr. BENYAHIA Mohammed Ali 132. Pr. BERRADA Mohamed Saleh 133. Pr. CHAMI Ilham 134. Pr. CHERKAOUI Lalla Ouafae 135. Pr. EL ABBADI Najia 136. Pr. HANINE Ahmed* 137. Pr. JALIL Abdelouahed 138. Pr. LAKHDAR Amina 139. Pr. MOUANE Nezha Urologie Chirurgie – Pédiatrique Neurologie Gynécologie Obstétrique Pédiatrie Gynécologie – Obstétrique Traumatologie – Orthopédie Radiologie Ophtalmologie Neurochirurgie Radiologie Chirurgie Générale Gynécologie Obstétrique Pédiatrie Mars 1995 140. Pr. ABOUQUAL Redouane 141. Pr. AMRAOUI Mohamed 142. Pr. BAIDADA Abdelaziz 143. Pr. BARGACH Samir 144. Pr. BEDDOUCHE Amoqrane* 145. Pr. BENAZZOUZ Mustapha 146. Pr. CHAARI Jilali* 147. Pr. DIMOU M’barek* 148. Pr. DRISSI KAMILI Mohammed Nordine* 149. Pr. EL MESNAOUI Abbes 150. Pr. ESSAKALI HOUSSYNI Leila 151. Pr. FERHATI Driss 152. Pr. HASSOUNI Fadil 153. Pr. HDA Abdelhamid* 154. Pr. IBEN ATTYA ANDALOUSSI Ahmed 155. Pr. IBRAHIMY Wafaa 156. Pr. MANSOURI Aziz 157. Pr. OUAZZANI CHAHDI Bahia 158. Pr. RZIN Abdelkader* 159. Pr. SEFIANI Abdelaziz 160. Pr. ZEGGWAGH Amine Ali Réanimation Médicale Chirurgie Générale Gynécologie Obstétrique Gynécologie Obstétrique Urologie Gastro-Entérologie Médecine Interne Anesthésie Réanimation Anesthésie Réanimation Chirurgie Générale Oto-Rhino-Laryngologie Gynécologie Obstétrique Médecine Préventive, Santé Publique et Hygiène Cardiologie Urologie Ophtalmologie Radiothérapie Ophtalmologie Stomatologie et Chirurgie Maxillo-faciale Génétique Réanimation Médicale Décembre 1996 161. Pr. AMIL Touriya* Radiologie 162. 163. 164. 165. 166. 167. 168. 169. 170. 171. 172. 173. 174. Pr. BELKACEM Rachid Pr. BELMAHI Amin Pr. BOULANOUAR Abdelkrim Pr. EL ALAMI EL FARICHA EL Hassan Pr. EL MELLOUKI Ouafae* Pr. GAOUZI Ahmed Pr. MAHFOUDI M’barek* Pr. MOHAMMADINE EL Hamid Pr. MOHAMMADI Mohamed Pr. MOULINE Soumaya Pr. OUADGHIRI Mohamed Pr. OUZEDDOUN Naima Pr. ZBIR EL Mehdi* Chirurgie Pédiatrie Chirurgie réparatrice et plastique Ophtalmologie Chirurgie Générale Parasitologie Pédiatrie Radiologie Chirurgie Générale Médecine Interne Pneumo-phtisiologie Traumatologie-Orthopédie Néphrologie Cardiologie Novembre 1997 175. Pr. ALAMI Mohamed Hassan 176. Pr. BEN AMAR Abdesselem 177. Pr. BEN SLIMANE Lounis 178. Pr. BIROUK Nazha 179. Pr. BOULAICH Mohamed 180. Pr. CHAOUIR Souad* 181. Pr. DERRAZ Said 182. Pr. ERREIMI Naima 183. Pr. FELLAT Nadia 184. Pr. GUEDDARI Fatima Zohra 185. Pr. HAIMEUR Charki* 186. Pr. KANOUNI NAWAL 187. Pr. KOUTANI Abdellatif 188. Pr. LAHLOU Mohamed Khalid 189. Pr. MAHRAOUI CHAFIQ 190. Pr. NAZI M’barek* 191. Pr. OUAHABI Hamid* 192. Pr. SAFI Lahcen* 193. Pr. TAOUFIQ Jallal 194. Pr. YOUSFI MALKI Mounia Gynécologie-Obstétrique Chirurgie Générale Urologie Neurologie O.RL. Radiologie Neurochirurgie Pédiatrie Cardiologie Radiologie Anesthésie Réanimation Physiologie Urologie Chirurgie Générale Pédiatrie Cardiologie Neurologie Anesthésie Réanimation Psychiatrie Gynécologie Obstétrique Novembre 1998 195. Pr. AFIFI RAJAA 196. Pr. AIT BENASSER MOULAY Ali* 197. Pr. ALOUANE Mohammed* 198. Pr. BENOMAR ALI 199. Pr. BOUGTAB Abdesslam 200. Pr. ER RIHANI Hassan 201. Pr. EZZAITOUNI Fatima 202. Pr. KABBAJ Najat 203. Pr. LAZRAK Khalid ( M) Gastro-Entérologie Pneumo-phtisiologie Oto-Rhino-Laryngologie Neurologie Chirurgie Générale Oncologie Médicale Néphrologie Radiologie Traumatologie Orthopédie Novembre 1998 204. Pr. BENKIRANE Majid* 205. Pr. KHATOURI ALI* 206. Pr. LABRAIMI Ahmed* Hématologie Cardiologie Anatomie Pathologique Janvier 2000 207. Pr. ABID Ahmed* Pneumophtisiologie 208. 209. 210. 211. 212. 213. 214. 215. 216. 217. 218. 219. 220. 221. 222. 223. 224. 225. 226. 227. 228. 229. 230. 231. 232. 233. 234. 235. 236. 237. 238. 239. 240. 241. 242. 243. 244. 245. 246. Pr. AIT OUMAR Hassan Pr. BENCHERIF My Zahid Pr. BENJELLOUN DAKHAMA Badr.Sououd Pr. BOURKADI Jamal-Eddine Pr. CHAOUI Zineb Pr. CHARIF CHEFCHAOUNI Al Montacer Pr. ECHARRAB El Mahjoub Pr. EL FTOUH Mustapha Pr. EL MOSTARCHID Brahim* Pr. EL OTMANYAzzedine Pr. GHANNAM Rachid Pr. HAMMANI Lahcen Pr. ISMAILI Mohamed Hatim Pr. ISMAILI Hassane* Pr. KRAMI Hayat Ennoufouss Pr. MAHMOUDI Abdelkrim* Pr. TACHINANTE Rajae Pr. TAZI MEZALEK Zoubida Novembre 2000 Pr. AIDI Saadia Pr. AIT OURHROUI Mohamed Pr. AJANA Fatima Zohra Pr. BENAMR Said Pr. BENCHEKROUN Nabiha Pr. CHERTI Mohammed Pr. ECH-CHERIF EL KETTANI Selma Pr. EL HASSANI Amine Pr. EL IDGHIRI Hassan Pr. EL KHADER Khalid Pr. EL MAGHRAOUI Abdellah* Pr. GHARBI Mohamed El Hassan Pr. HSSAIDA Rachid* Pr. LACHKAR Azzouz Pr. LAHLOU Abdou Pr. MAFTAH Mohamed* Pr. MAHASSINI Najat Pr. MDAGHRI ALAOUI Asmae Pr. NASSIH Mohamed* Pr. ROUIMI Abdelhadi Décembre 2001 247. Pr. ABABOU Adil 248. Pr. AOUAD Aicha 249. Pr. BALKHI Hicham* 250. Pr. BELMEKKI Mohammed 251. Pr. BENABDELJLIL Maria 252. Pr. BENAMAR Loubna 253. Pr. BENAMOR Jouda 254. Pr. BENELBARHDADI Imane 255. Pr. BENNANI Rajae 256. Pr. BENOUACHANE Thami 257. Pr. BENYOUSSEF Khalil 258. Pr. BERRADA Rachid 259. Pr. BEZZA Ahmed* Pédiatrie Ophtalmologie Pédiatrie Pneumo-phtisiologie Ophtalmologie Chirurgie Générale Chirurgie Générale Pneumo-phtisiologie Neurochirurgie Chirurgie Générale Cardiologie Radiologie Anesthésie-Réanimation Traumatologie Orthopédie Gastro-Entérologie Anesthésie-Réanimation Anesthésie-Réanimation Médecine Interne Neurologie Dermatologie Gastro-Entérologie Chirurgie Générale Ophtalmologie Cardiologie ²Anesthésie-Réanimation Pédiatrie Oto-Rhino-Laryngologie Urologie Rhumatologie Endocrinologie et Maladies Métaboliques Anesthésie-Réanimation Urologie Traumatologie Orthopédie Neurochirurgie Anatomie Pathologique Pédiatrie Stomatologie Et Chirurgie Maxillo-Faciale Neurologie Anesthésie-Réanimation Cardiologie Anesthésie-Réanimation Ophtalmologie Neurologie Néphrologie Pneumo-phtisiologie Gastro-Entérologie Cardiologie Pédiatrie Dermatologie Gynécologie Obstétrique Rhumatologie 260. 261. 262. 263. 264. 265. 266. 267. 268. 269. 270. 271. 272. 273. 274. 275. 276. 277. 278. 279. 280. 281. 282. 283. 284. 285. 286. 287. 288. 289. 290. 291. 292. Pr. BOUCHIKHI IDRISSI Med Larbi Pr. BOUHOUCH Rachida Pr. BOUMDIN El Hassane* Pr. CHAT Latifa Pr. CHELLAOUI Mounia Pr. DAALI Mustapha* Pr. DRISSI Sidi Mourad* Pr. EL HAJOUI Ghziel Samira Pr. EL HIJRI Ahmed Pr. EL MAAQILI Moulay Rachid Pr. EL MADHI Tarik Pr. EL MOUSSAIF Hamid Pr. EL OUNANI Mohamed Pr. EL QUESSAR Abdeljlil Pr. ETTAIR Said Pr. GAZZAZ Miloudi* Pr. GOURINDA Hassan Pr. HRORA Abdelmalek Pr. KABBAJ Saad Pr. KABIRI EL Hassane* Pr. LAMRANI Moulay Omar Pr. LEKEHAL Brahim Pr. MAHASSIN Fattouma* Pr. MEDARHRI Jalil Pr. MIKDAME Mohammed* Pr. MOHSINE Raouf Pr. NABIL Samira Pr. NOUINI Yassine Pr. OUALIM Zouhir* Pr. SABBAH Farid Pr. SEFIANI Yasser Pr. TAOUFIQ BENCHEKROUN Soumia Pr. TAZI MOUKHA Karim Décembre 2002 293. Pr. AL BOUZIDI Abderrahmane* 294. Pr. AMEUR Ahmed * 295. Pr. AMRI Rachida 296. Pr. AOURARH Aziz* 297. Pr. BAMOU Youssef * 298. Pr. BELMEJDOUB Ghizlene* 299. Pr. BENBOUAZZA Karima 300. Pr. BENZEKRI Laila 301. Pr. BENZZOUBEIR Nadia* 302. Pr. BERNOUSSI Zakiya 303. Pr. BICHRA Mohamed Zakariya 304. Pr. CHOHO Abdelkrim * 305. Pr. CHKIRATE Bouchra 306. Pr. EL ALAMI EL FELLOUS Sidi Zouhair 307. Pr. EL ALJ Haj Ahmed 308. Pr. EL BARNOUSSI Leila 309. Pr. EL HAOURI Mohamed * 310. Pr. EL MANSARI Omar* 311. Pr. ES-SADEL Abdelhamid Anatomie Cardiologie Radiologie Radiologie Radiologie Chirurgie Générale Radiologie Gynécologie Obstétrique Anesthésie-Réanimation Neuro-Chirurgie Chirurgie-Pédiatrique Ophtalmologie Chirurgie Générale Radiologie Pédiatrie Neuro-Chirurgie Chirurgie-Pédiatrique Chirurgie Générale Anesthésie-Réanimation Chirurgie Thoracique Traumatologie Orthopédie Chirurgie Vasculaire Périphérique Médecine Interne Chirurgie Générale Hématologie Clinique Chirurgie Générale Gynécologie Obstétrique Urologie Néphrologie Chirurgie Générale Chirurgie Vasculaire Périphérique Pédiatrie Urologie Anatomie Pathologique Urologie Cardiologie Gastro-Entérologie Biochimie-Chimie Endocrinologie et Maladies Métaboliques Rhumatologie Dermatologie Gastro-Entérologie Anatomie Pathologique Psychiatrie Chirurgie Générale Pédiatrie Chirurgie Pédiatrique Urologie Gynécologie Obstétrique Dermatologie Chirurgie Générale Chirurgie Générale 312. 313. 314. 315. 316. 317. 318. 319. 320. 321. 322. 323. 324. 325. 326. 327. 328. 329. 330. 331. 332. 333. Pr. FILALI ADIB Abdelhai Pr. HADDOUR Leila Pr. HAJJI Zakia Pr. IKEN Ali Pr. ISMAEL Farid Pr. JAAFAR Abdeloihab* Pr. KRIOULE Yamina Pr. LAGHMARI Mina Pr. MABROUK Hfid* Pr. MOUSSAOUI RAHALI Driss* Pr. MOUSTAGHFIR Abdelhamid* Pr. MOUSTAINE My Rachid Pr. NAITLHO Abdelhamid* Pr. OUJILAL Abdelilah Pr. RACHID Khalid * Pr. RAISS Mohamed Pr. RGUIBI IDRISSI Sidi Mustapha* Pr. RHOU Hakima Pr. SIAH Samir * Pr. THIMOU Amal Pr. ZENTAR Aziz* Pr. ZRARA Ibtisam* Gynécologie Obstétrique Cardiologie Ophtalmologie Urologie Traumatologie Orthopédie Traumatologie Orthopédie Pédiatrie Ophtalmologie Traumatologie Orthopédie Gynécologie Obstétrique Cardiologie Traumatologie Orthopédie Médecine Interne Oto-Rhino-Laryngologie Traumatologie Orthopédie Chirurgie Générale Pneumophtisiologie Néphrologie Anesthésie Réanimation Pédiatrie Chirurgie Générale Anatomie Pathologique PROFESSEURS AGREGES : Janvier 2004 334. Pr. ABDELLAH El Hassan 335. Pr. AMRANI Mariam 336. Pr. BENBOUZID Mohammed Anas 337. Pr. BENKIRANE Ahmed* 338. Pr. BENRAMDANE Larbi* 339. Pr. BOUGHALEM Mohamed* 340. Pr. BOULAADAS Malik 341. Pr. BOURAZZA Ahmed* 342. Pr. CHAGAR Belkacem* 343. Pr. CHERRADI Nadia 344. Pr. EL FENNI Jamal* 345. Pr. EL HANCHI ZAKI 346. Pr. EL KHORASSANI Mohamed 347. Pr. EL YOUNASSI Badreddine* 348. Pr. HACHI Hafid 349. Pr. JABOUIRIK Fatima 350. Pr. KARMANE Abdelouahed 351. Pr. KHABOUZE Samira 352. Pr. KHARMAZ Mohamed 353. Pr. LEZREK Mohammed* 354. Pr. MOUGHIL Said 355. Pr. NAOUMI Asmae* 356. Pr. SAADI Nozha 357. Pr. SASSENOU ISMAIL* 358. Pr. TARIB Abdelilah* 359. Pr. TIJAMI Fouad Ophtalmologie Anatomie Pathologique Oto-Rhino-Laryngologie Gastro-Entérologie Chimie Analytique Anesthésie Réanimation Stomatologie et Chirurgie Maxillo-faciale Neurologie Traumatologie Orthopédie Anatomie Pathologique Radiologie Gynécologie Obstétrique Pédiatrie Cardiologie Chirurgie Générale Pédiatrie Ophtalmologie Gynécologie Obstétrique Traumatologie Orthopédie Urologie Chirurgie Cardio-Vasculaire Ophtalmologie Gynécologie Obstétrique Gastro-Entérologie Pharmacie Clinique Chirurgie Générale 360. Pr. ZARZUR Jamila Cardiologie Janvier 2005 361. Pr. ABBASSI Abdellah 362. Pr. AL KANDRY Sif Eddine* 363. Pr. ALAOUI Ahmed Essaid 364. Pr. ALLALI Fadoua 365. Pr. AMAR Yamama 366. Pr. AMAZOUZI Abdellah 367. Pr. AZIZ Noureddine* 368. Pr. BAHIRI Rachid 369. Pr. BARKAT Amina 370. Pr. BENHALIMA Hanane 371. Pr. BENHARBIT Mohamed 372. Pr. BENYASS Aatif 373. Pr. BERNOUSSI Abdelghani 374. Pr. BOUKLATA Salwa 375. Pr. CHARIF CHEFCHAOUNI Mohamed 376. Pr. DOUDOUH Abderrahim* 377. Pr. EL HAMZAOUI Sakina 378. Pr. HAJJI Leila 379. Pr. HESSISSEN Leila 380. Pr. JIDAL Mohamed* 381. Pr. KARIM Abdelouahed 382. Pr. KENDOUSSI Mohamed* 383. Pr. LAAROUSSI Mohamed 384. Pr. LYAGOUBI Mohammed 385. Pr. NIAMANE Radouane* 386. Pr. RAGALA Abdelhak 387. Pr. SBIHI Souad 388. Pr. TNACHERI OUAZZANI Btissam 389. Pr. ZERAIDI Najia Chirurgie Réparatrice et Plastique Chirurgie Générale Microbiologie Rhumatologie Néphrologie Ophtalmologie Radiologie Rhumatologie Pédiatrie Stomatologie et Chirurgie Maxillo Faciale Ophtalmologie Cardiologie Ophtalmologie Radiologie Ophtalmologie Biophysique Microbiologie Cardiologie Pédiatrie Radiologie Ophtalmologie Cardiologie Chirurgie Cardio-vasculaire Parasitologie Rhumatologie Gynécologie Obstétrique Histo-Embryologie Cytogénétique Ophtalmologie Gynécologie Obstétrique AVRIL 2006 423. Pr. ACHEMLAL Lahsen* 424. Pr. AFIFI Yasser 425. Pr. AKJOUJ Said* 426. Pr. BELGNAOUI Fatima Zahra 427 Pr. BELMEKKI Abdelkader* 428. Pr. BENCHEIKH Razika 429 Pr. BIYI Abdelhamid* 430. Pr. BOUHAFS Mohamed El Amine 431. Pr. BOULAHYA Abdellatif* 432. Pr. CHEIKHAOUI Younes 433. Pr. CHENGUETI ANSARI Anas 434. Pr. DOGHMI Nawal 435. Pr. ESSAMRI Wafaa 436. Pr. FELLAT Ibtissam 437. Pr. FAROUDY Mamoun 438. Pr. GHADOUANE Mohammed* 439. Pr. HARMOUCHE Hicham 440. Pr. HANAFI Sidi Mohamed* 441 Pr. IDRISS LAHLOU Amine Rhumatologie Dermatologie Radiologie Dermatologie Hématologie O.R.L Biophysique Chirurgie - Pédiatrique Chirurgie Cardio – Vasculaire Chirurgie Cardio – Vasculaire Gynécologie Obstétrique Cardiologie Gastro-entérologie Cardiologie Anesthésie Réanimation Urologie Médecine Interne Anesthésie Réanimation Microbiologie 442. Pr. JROUNDI Laila 443. Pr. KARMOUNI Tariq 444. Pr. KILI Amina 445. Pr. KISRA Hassan 446. Pr. KISRA Mounir 447. Pr. KHARCHAFI Aziz* 448. Pr. LAATIRIS Abdelkader* 449. Pr. LMIMOUNI Badreddine* 450. Pr. MANSOURI Hamid* 451. Pr. NAZIH Naoual 452. Pr. OUANASS Abderrazzak 453. Pr. SAFI Soumaya* 454. Pr. SEKKAT Fatima Zahra 455. Pr. SEFIANI Sana 456. Pr. SOUALHI Mouna 457. Pr. TELLAL Saida* 458. Pr. ZAHRAOUI Rachida Radiologie Urologie Pédiatrie Psychiatrie Chirurgie – Pédiatrique Médecine Interne Pharmacie Galénique Parasitologie Radiothérapie O.R.L Psychiatrie Endocrinologie Psychiatrie Anatomie Pathologique Pneumo – Phtisiologie Biochimie Pneumo – Phtisiologie Octobre 2007 458. Pr. LARAQUI HOUSSEINI Leila 459. Pr. EL MOUSSAOUI Rachid 460. Pr. MOUSSAOUI Abdelmajid 461. Pr. LALAOUI SALIM Jaafar * 462. Pr. BAITE Abdelouahed * 463. Pr. TOUATI Zakia 464. Pr. OUZZIF Ez zohra * 465. Pr. BALOUCH Lhousaine * 466. Pr. SELKANE Chakir * 467. Pr. EL BEKKALI Youssef * 468. Pr. AIT HOUSSA Mahdi * 469. Pr. EL ABSI Mohamed 470. Pr. EHIRCHIOU Abdelkader * 471. Pr. ACHOUR Abdessamad * 472. Pr. TAJDINE Mohammed Tariq* 473. Pr. GHARIB Noureddine 474. Pr. TABERKANET Mustafa * 475. Pr. ISMAILI Nadia 476. Pr. MASRAR Azlarab 477. Pr. RABHI Monsef * 478. Pr. MRABET Mustapha * 479. Pr. SEKHSOKH Yessine * 480. Pr. SEFFAR Myriame 481. Pr. LOUZI Lhoussain * 482. Pr. MRANI Saad * 483. Pr. GANA Rachid 484. Pr. ICHOU Mohamed * 485. Pr. TACHFOUTI Samira 486. Pr. BOUTIMZINE Nourdine 487. Pr. MELLAL Zakaria 488. Pr. AMMAR Haddou * 489. Pr. AOUFI Sarra 490. Pr. TLIGUI Houssain 491. Pr. MOUTAJ Redouane * 492. Pr. ACHACHI Leila Anatomie pathologique Anesthésie réanimation Anesthésier réanimation Anesthésie réanimation Anesthésie réanimation Cardiologie Biochimie Biochimie Chirurgie cardio vasculaire Chirurgie cardio vasculaire Chirurgie cardio vasculaire Chirurgie générale Chirurgie générale Chirurgie générale Chirurgie générale Chirurgie plastique Chirurgie vasculaire périphérique Dermatologie Hématologie biologique Médecine interne Médecine préventive santé publique et hygiène Microbiologie Microbiologie Microbiologie Virologie Neuro chirurgie Oncologie médicale Ophtalmologie Ophtalmologie Ophtalmologie ORL Parasitologie Parasitologie Parasitologie Pneumo phtisiologie 493. Pr. MARC Karima 494. Pr. BENZIANE Hamid * 495. Pr. CHERKAOUI Naoual * 496. Pr. EL OMARI Fatima 497. Pr. MAHI Mohamed * 498. Pr. RADOUANE Bouchaib* 499. Pr. KEBDANI Tayeb 500. Pr. SIFAT Hassan * 501. Pr. HADADI Khalid * 502. Pr. ABIDI Khalid 503. Pr. MADANI Naoufel 504. Pr. TANANE Mansour * 505. Pr. AMHAJJI Larbi * Pneumo phtisiologie Pharmacie clinique Pharmacie galénique Psychiatrie Radiologie Radiologie Radiothérapie Radiothérapie Radiothérapie Réanimation médicale Réanimation médicale Traumatologie orthopédie Traumatologie orthopédie Mars 2009 Pr. BJIJOU Younes Pr. AZENDOUR Hicham * Pr. BELYAMANI Lahcen* Pr. BOUHSAIN Sanae * Pr. OUKERRAJ Latifa Pr. LAMSAOURI Jamal * Pr. MARMADE Lahcen Pr. AMAHZOUNE Brahim* Pr. AIT ALI Abdelmounaim * Pr. BOUNAIM Ahmed * Pr. EL MALKI Hadj Omar Pr. MSSROURI Rahal Pr. CHTATA Hassan Toufik * Pr. BOUI Mohammed * Pr. KABBAJ Nawal Pr. FATHI Khalid Pr. MESSAOUDI Nezha * Pr. CHAKOUR Mohammed * Pr. DOGHMI Kamal * Pr. ABOUZAHIR Ali * Pr. ENNIBI Khalid * Pr. EL OUENNASS Mostapha Pr. ZOUHAIR Said* Pr. L’kassimi Hachemi* Pr. AKHADDAR Ali * Pr. AIT BENHADDOU El hachmia Pr. AGADR Aomar * Pr. KARBOUBI Lamya Pr. MESKINI Toufik Pr. KABIRI Meryem Pr. RHORFI Ismail Abderrahmani * Pr. BASSOU Driss * Pr. ALLALI Nazik Pr. NASSAR Ittimade Pr. HASSIKOU Hasna * Pr. AMINE Bouchra Pr. BOUSSOUGA Mostapha * Pr. KADI Said * Anatomie Anesthésie Réanimation Anesthésie Réanimation Biochimie Cardiologie Chimie Thérapeutique Chirurgie Cardio-vasculaire Chirurgie Cardio-vasculaire Chirurgie Générale Chirurgie Générale Chirurgie Générale Chirurgie Générale Chirurgie Vasculaire Périphérique Dermatologie Gastro-entérologie Gynécologie obstétrique Hématologie biologique Hématologie biologique Hématologie clinique Médecine interne Médecine interne Microbiologie Microbiologie Microbiologie Neuro-chirurgie Neurologie Pédiatrie Pédiatrie Pédiatrie Pédiatrie Pneumo-phtisiologie Radiologie Radiologie Radiologie Rhumatologie Rhumatologie Traumatologie orthopédique Traumatologie orthopédique Octobre 2010 Pr. AMEZIANE Taoufiq* Pr. ERRABIH Ikram Pr. CHERRADI Ghizlan Pr. MOSADIK Ahlam Pr. ALILOU Mustapha Pr. KANOUNI Lamya Pr. EL KHARRAS Abdennasser* Pr. DARBI Abdellatif* Pr. EL HAFIDI Naima Pr. MALIH Mohamed* Pr. BOUSSIF Mohamed* Pr. EL MAZOUZ Samir Pr. DENDANE Mohammed Anouar Pr. EL SAYEGH Hachem Pr. MOUJAHID Mountassir* Pr. RAISSOUNI Zakaria* Pr. BOUAITY Brahim* Pr. LEZREK Mounir Pr. NAZIH Mouna* Pr. LAMALMI Najat Pr. ZOUAIDIA Fouad Pr. BELAGUID Abdelaziz Pr. DAMI Abdellah* Pr. CHADLI Mariama* ENSEIGNANTS SCIENTIFIQUES PROFESSEURS 1. Pr. ABOUDRAR Saadia 2. Pr. ALAMI OUHABI Naima 3. Pr. ALAOUI KATIM 4. Pr. ALAOUI SLIMANI Lalla Naïma 5. Pr. ANSAR M’hammed 6. Pr. BOUKLOUZE Abdelaziz 7. Pr. BOUHOUCHE Ahmed 8. Pr. BOURJOUANE Mohamed 9. Pr. CHAHED OUAZZANI Lalla Chadia 10. Pr. DAKKA Taoufiq 11. Pr. DRAOUI Mustapha 12. Pr. EL GUESSABI Lahcen 13. Pr. ETTAIB Abdelkader 14. Pr. FAOUZI Moulay El Abbes 15. Pr. HMAMOUCHI Mohamed 16. Pr. IBRAHIMI Azeddine 17. Pr. KABBAJ Ouafae 18. Pr. KHANFRI Jamal Eddine 19. Pr. REDHA Ahlam 20. Pr. OULAD BOUYAHYA IDRISSI Med 21. Pr. TOUATI Driss 22. Pr. ZAHIDI Ahmed 23. Pr. ZELLOU Amina * Enseignants Militaires Médecine interne Gastro entérologie Cardiologie Anesthésie Réanimation Anesthésie réanimation Radiothérapie Radiologie Radiologie Pédiatrie Pédiatrie Médecine aérotique Chirurgie plastique et réparatrice Chirurgie pédiatrique Urologie Chirurgie générale Traumatologie orthopédie ORL Ophtalmologie Hématologie Anatomie pathologique Anatomie pathologique Physiologie Biochimie chimie Microbiologie Physiologie Biochimie Pharmacologie Histologie-Embryologie Chimie Organique et Pharmacie Chimique Applications Pharmaceutiques Génétique Humaine Microbiologie Biochimie Physiologie Chimie Analytique Pharmacognosie Zootechnie Pharmacologie Chimie Organique Biochimie Biologie Biochimie Chimie Organique Pharmacognosie Pharmacologie Chimie Organique DEDICACES A LA MEMOIRE DE MA GRANDE MERE HALIMA KHLIFIA Ce travail est pour moi le fruit de tes prières. Que la terre de TOUBA te soit légère. A MES TRES CHERS PARENTS EL ATTIFFI EL OUADRASSI AHMED EL FAILALI NABILA Dont leurs mérites, leurs sacrifices, leurs qualités humaines m’ont permis de vivre ce jour : Les mots me manquent pour exprimer toute la reconnaissance, la fierté et le profond amour que je vous porte pour les sacrifices qu’ils ont consenti pour ma réussite, qu’ils trouvent ici le témoignage de mon attachement ma reconnaissance, gratitude et respect, que dieu leur préservent bonne santé et longue vie. Tous mes sentiments de reconnaissance pour vous. A MES SOEURS : CHEMSS ET YOUSSRA J’espère atteint le seuil de vos espérances. Que ce travail soit l’expression de ma profonde affection, je vous remercie pour le soutient moral et l’encouragement que vous m’avez accordés. Je vous souhaite tout le bonheur que vous méritez En leur souhaitant un brillant avenir. A MES GRANDS PARENTS A TOUTE LA FAMILLE EL ATTIFFI A TOUTE LA FAMILLE EL FILALI Que je ne pourrais nommer de peur d’en oublier mon attachement et mes affections les plus sincères A MES AMI(E) S A tout ceux qui ont su m’apporter aide et soutient aux moments propices, Je dédie ce travail, reconnaissant et remerciant chaleureusement. REMERCIEMENTS A NOTRE MAITRE ET PRESIDENT DE THESE Monsieur le professeur A.GAOUZI Professeur de Pédiatrie Malgré vos multiples occupations, vous avez spontanément accepté de présider ce jury de thèse. Votre courtoisie, votre modestie et votre sens des responsabilités font de vous un maître respecté et estimé par toute une génération d’étudiants. Veuillez trouvez ici l’expression de nos remerciements les plus sincères et de notre profonde reconnaissance. A NOTRE MAITRE ET RAPPORTEUR DE THESE Monsieur le professeur M.ZOUHDI Professeur de Microbiologie Vous nous avez confié ce travail et vous avez mis les moyens nécessaires pour sa réalisation. Votre disponibilité constante, votre amour du travail bien fait et votre abord facile forcent l’admiration et le respect. Puisse ce travail répondre à vos attentes et être le témoignage de notre profonde et vive gratitude. A NOTRE MAITRE ET JUGE DE THESE Madame le professeur S.AOUFI Professeur agrégé de Parasitologie La spontanéité avec laquelle vous avez accepté de juger ce travail nous réjouit. Plus qu’un honneur, c’est une joie pour nous, de vous compter parmi nos juges et de pouvoir profiter de vos compétences. Nous vous prions, cher Maître, d’accepter nos vifs remerciements et notre profonde gratitude. A NOTRE MAITRE ET JUGE DE THESE Madame le professeur S.EL HAMZAOUI Professeur de Microbiologie Vous nous faites un grand honneur en acceptant de nous consacrer de votre temps. Nous sommes sensibles à l’amabilité avec laquelle vous nous avez accueillie. C’est avec respect et sincérité que nous vous remercions. « En cette journée mondiale de l’eau, prenons la résolution d’en faire plus pour que tous les êtres humains disposent d’eau salubre. Et réaffirmons notre volonté de mieux gérer les ressources en eau de notre planète, qui sont la clef de notre survie et d’un développement durable au XXIe siècle » KOFI ANNAN. Journée mondiale de l’eau, 22 mars 2005 Table des matières INTRODUCTION .............................................................................................................................. 1 I.LE LITTORAL MAROCAIN ...................................................................................................... 4 I.1. Spécificités ....................................................................................................................................... 4 I.2. Pressions ................................................................................................................................................. 4 I.2.1. Urbanisation – littoralisation ........................................................................................ 4 I.2.2. La pression démographique sur le littoral ................................................................. 5 I.2.3. Industrialisation ............................................................................................................ 5 I.2.4. Tourisme ........................................................................................................................ 6 I.2.5. Agriculture ..................................................................................................................... 6 I.2.6. Transport maritime ........................................................................................................ 7 I.2.7. Surexploitation des ressources naturelles .................................................................. 7 II. LES POLLUTIONS MARITIMES ......................................................................................... 8 II.1.Pollution par les eaux usées domestiques........................................................................ 9 II.2. Pollution par les eaux usées industrielles ...................................................................... 11 II.3. La pollution par les eaux de ruissellement ..................................................................... 11 II.4. La pollution d’origine atmosphérique ............................................................................ 12 II.5. La pollution par les activités maritimes ......................................................................... 12 II.6. La pollution par les déchets solides ............................................................................... 13 II.7. La pollution radioactive ................................................................................................... 14 II.8. La pollution due aux activités estivales ......................................................................... 14 II.9. La pollution thermique ..................................................................................................... 14 II.10. La pollution microbiologique ....................................................................................... 15 II.10.1. Les sources de contamination ......................................................................... 15 II.10.2. Les bactéries ..................................................................................................... 17 II.10.3. Les virus ............................................................................................................ 17 II.10.4. Les protozoaires .............................................................................................. 18 II.10.5. Les helminthes .................................................................................................. 19 II.10.6. Les champignons .............................................................................................. 19 III. L’EVALUATION DE LA QUALITE MICROBIOLOGIQUE DES EAUX - LES GERMES INDICATEURS DE CONTAMINATION FECALE ...................................... 20 III.1.Définition des indicateurs bactériens de contamination fécale ................................. .23 III.1.1. Les coliformes totaux ........................................................................................ 23 III.1.2. Les coliformes fécaux ......................................................................................... 24 III.1.3. Les Entérocoques intestinaux ........................................................................... 24 III.1.4. Le rapport coliformes fécaux/streptocoques fécaux ...................................... 25 III.2.Autres indicateurs ............................................................................................................ 25 IV. LES METHODES DE DETECTION DES MICRO-ORGANISMES INDICATEURS ............................................................................................................................... 27 IV.1. La mise en culture .................................................................................................... 27 IV.2. La problématique des bactéries fécales non cultivables ..................................... 31 IV.3. Les méthodes moléculaires ..................................................................................... 34 IV.4. L’énumération des E. coli viables par hybridation in situ .................................. 36 IV.5. La mesure directe de l’activité β-D-glucuronidasique ........................................ 38 V. LES NORMES DE QUALITE MICROBIOLOGIQUE DES EAUX DE BAIGNADE ....................................................................................................................................... 41 VI. LA SURVIE DES BACTERIES DANS LE MILIEU MARIN ....................................... 45 VI.1. Les facteurs influençant la survie des microorganismes en milieu marin .......... 47 VI.1.1. Facteurs physico-chimiques ................................................................................... 47 VI.1.1.1. La dilution ............................................................................................................. 47 VI.1.1.2. L’adsorption .......................................................................................................... 48 VI.1.1.3. La sédimentation ................................................................................................... 48 VI.1.1.4. La lumière............................................................................................................... 48 VI.1.1.5. La température ..................................................................................................... 49 VI.1.1.6. Les variations de pH ............................................................................................ 49 VI.1.1.7. La salinité .............................................................................................................. 49 VI.1.2. Facteurs biologiques ................................................................................................ 50 VII. RISQUES SANITAIRES LIES A LA BAIGNADE DANS LES EAUX POLLUEES ....................................................................................................................................... 52 VII.1.Introduction ................................................................................................................ .52 VII.2. Historique ................................................................................................................... 52 VII.3. Les microorganismes impliqués et les pathologies observées ............................ 53 VII.3.1. Les bactéries ............................................................................................... 53 VII.3.2. Les virus ...................................................................................................... 55 VII.3.3. Les champignons ....................................................................................... 55 VII.3.4. Les protozoaires ......................................................................................... 56 VII.3.5. Micro-algues et cyanobactéries ................................................................ 56 VII.4. Les risques liés aux contaminants chimiques ....................................................... 57 VIII. LES EPIDEMIES LIEES AUX EAUX DE BAIGNADE ............................................ 59 VIII.1. E. coli O157 :H7 ........................................................................................................ 59 VIII.2. Autres ........................................................................................................................... 60 IX. LA SURVEILLANCE DE LA QUALITE DES EAUX DE BAIGNADE AU MAROC ............................................................................................................................................. 61 IX.1. Organisation des contrôles ......................................................................................... 61 IX.2. Les procédures d’exécution des programmes ......................................................... 62 IX.3. Qualité hygiénique des plages du Royaume : Saison 2009-2010.......................... 66 CONCLUSION ET RECOMMANDATIONS........................................................................... 68 RESUMES ANNEXES BIBLIOGRAPHIE INTRODUCTION 1 L'hydrosphère est le fondement de la vie et des équilibres écologiques, ses usages sont donc multiples, mais s'agissant de santé humaine, ils sont dominés par l'agriculture et l'aquaculture, l'industrie et l'artisanat, surtout, la fourniture collective ou individuelle d'eau potable, utilisable à des fins alimentaires (eau de boisson, cuisine) mais aussi domestiques et d'hygiène, et les loisirs aquatiques, dont la baignade. Notre civilisation moderne utilise de plus en plus le milieu aquatique pour les loisirs, les vacances et diverses activités nautiques et ludiques. Il existe diverses catégories de baignades, aménagées ou non, littorales (eau de mer) ou intérieures (eau douce: rivière, lac, étang) qui connaissent des problèmes spécifiques liés à la contamination par des eaux usées, plus ou moins épurées, ou des eaux de ruissellement qui véhiculent divers polluants. Si la baignade constitue une activité de loisirs qui permet détente et exercices physiques bénéfiques pour la santé, elle peut néanmoins présenter certains risques. Ceux-ci sont liés, soit à la qualité de l’eau, soit à des activités associées à la baignade et souvent à des comportements. Le Maroc dispose d’un vaste territoire maritime : le littoral méditerranéen et atlantique, qui est soumis à la pression démographique sans cesse croissante des agglomérations urbaines et à l’influence des différentes activités industrielles, portuaires et touristiques. Il reçoit, en plus, les apports des 2 bassins versants des rivières et des cours d’eau, ainsi qu'une grande partie des eaux usées urbaines et industrielles. L’objectif de ce mémoire est : de déterminer les différents types de pollutions qui peuvent influencer la qualité des eaux de baignade ; de définir les méthodes d’évaluation de la qualité microbiologique des eaux de baignade ; et d’étudier l’impact sanitaire de la qualité microbiologique des eaux de baignade. 3 I . LE LITTORAL MAROCAIN : I.1. Spécificités : Le Maroc est doté d'une frange littorale qui s’étend sur la façade atlantique de Cap Spartel à Lagouira (2 934 km) et sur la façade méditerranéenne de Cap Spartel à Saïdia (512 km). Cette zone côtière constitue un pôle d’attraction important pour les activités socio-économiques d’intérêt national, compte tenu de son poids démographique, économique et de sa fonction dans l’organisation de l’espace national(1). Ce littoral présente divers milieux physiques tels que les plages, les dunes, les rivages, les estuaires, les falaises, les lagunes, les vasières, etc.). C’est une zone complexe, vulnérable fortement convoitée. Il présente une flore et une faune originale. C’est aussi un espace de conflits, de convergence d’intérêts et d’acteurs entraînant une littoralisation pesante des côtes(2). I.2. Pressions : I.2.1. Urbanisation – littoralisation : L’urbanisation des côtes a été très marquante ces dernières décennies. Le taux d’urbanisation en 1971 était de 35 % et il est passé à 42,8 % puis à 51 % respectivement en 1982 et 1994 pour atteindre 55,1 % en 2004(2).L’urbanisation classique progresse le long de la côte et aboutit à des formes d’occupation linéaire. L’urbanisation touristique planifiée en pleine expansion avec la multiplication de projets immobiliers et touristiques se développe aux dépens des espaces vierges. 4 I.2.2. La pression démographique sur le littoral : La population marocaine recensée en 2004 est estimée à 29,9 millions d’habitants contre près de 26 millions en 1994(2). La population côtière représente 60 %. Cela traduit à l'évidence une dynamique démographique importante aboutissant à une occupation des zones côtières et à une littoralisation de la population et des activités induites. La densité moyenne de population au niveau du littoral atlantique est d’environ 162 hab./km² contre 90 hab./ km² au niveau de la méditerranée(2). A cette pression endogène s’ajoute celle du tourisme , si bien qu’en période de pointe (juillet-aout), le cumul des résidents (permanents et secondaire) et des touristes porte les densités littorales à des niveaux très élevés pouvant atteindre au niveau de certaines zones plus de 300 habitants par kilomètre carré. I.2.3. Industrialisation : La côte joue le rôle de pôle nerveux de l'économie nationale du fait de la concentration industrielle (80 % des effectifs permanents des industries), touristique (50 % de la capacité d'accueil) et commerciale (92 % du commerce extérieur)(3). Cette concentration exerce sur le littoral des pressions à travers notamment les rejets d’eaux résiduaires générées par ce secteur souvent déversés sans traitement préalable directement dans le milieu marin. 5 I.2.4. Tourisme : L'urbanisation touristique planifiée est en pleine expansion dans de nombreuses régions de la côte, notamment dans les régions de Tanger, Tétouan, AI Hoceima, Saidia, Rabat-Casablanca et Agadir réduisant le nombre d'espaces maritimes vierges qui risquent eux-mêmes de ne pas le rester longtemps. Dans bon nombre de ces régions, l'occupation revêt des formes illicites à cause d'un déséquilibre flagrant entre offre et demande d'espaces côtiers. On assiste ainsi à une “durcification” progressive du littoral par la construction de complexes hôteliers ou de résidences secondaires et la multiplication des infrastructures d'accompagnement (routes panoramiques, ports de plaisance, etc.). Outre l’énorme problème des rejets domestiques incontrôlés, ces équipements touristiques réduisent les possibilités d’échanges entre terre et mer, déséquilibrant ainsi l’écologie du littoral. I.2.5. Agriculture : Dans de nombreuses régions littorales du pays, et particulièrement à proximité des zones humides, les pratiques agricoles en matière d'utilisation d'engrais et de pesticides ont souvent un impact considérable sur la qualité des eaux du fait du drainage des oueds. Ces impacts sont flagrants prés de certains milieux comme le complexe lagunaire de Oualidia Sidi Moussa où la culture sous serre a considérablement affecté les eaux de la lagune, ou encore les lagunes de Moulay Bousselham ou de Khnifiss, où l'agriculture et le pastoralisme sont des activités importantes(3). 6 I.2.6. Transport maritime : Les eaux marocaines méditerranéennes et atlantiques connaissent une navigation maritime intense. Des centaines de bateaux longent quotidiennement nos côtes, notamment des pétroliers et des tankers qui constituent une menace permanente de la pollution marine. I.2.7. Surexploitation des ressources naturelles : Le littoral marocain souffre également d’un problème majeur qu’est la dégradation des dunes et l’érosion des plages, principalement à cause d’une demande sans cesse croissante en matériaux de construction, en particulier de sable pour le secteur du bâtiment. Cette demande, estimée à près de 13 millions de tonnes, et qui sera plus que le double en 2015(3), est en grande partie satisfaite par des prélèvements, souvent illicites et peu coûteux, au niveau des plages et des dunes littorales. En effet, de plus de 160 points de prélèvements recensés, quelques-uns seulement semblent officiellement autorisés. C’est un problème d’autant plus important qu’il concerne 11 des 16 régions administratives du pays et près d’une trentaine de communes. Il en résulte que de nombreuses plages s’appauvrissent en sable (baie de Tanger, Moulay Bousselham, Monica, Kariat Arekmane) et, selon certaines études (RDH 50, 2005), sur un échantillon de 47 plages analysées 7 ont complètement disparu et 19 sont soumises à une dégradation aiguë. 7 II. LES POLLUTIONS MARITIMES : La pollution marine est « L’introduction par l’Homme, directement ou indirectement, de substances ou d’énergies dans le milieu marin, estuaires compris, et qui a pour conséquence ou est susceptible d’engendrer des effets nuisibles tels qu’ils porteraient atteinte aux ressources vivantes et à la vie marine, mettraient la santé humaine en danger, gêneraient les activités marines, telles que la pêche et autre utilisation légitime de la mer »(4). Plateformes pétrolières 5% Déchets solides 5% Atmosphère 20% Rejets liquides industriels 10% Transport maritime 10% Agriculture 20% Eaux usées 30% Figure 1: Origine de la pollution marine(5). 8 II.1. Pollution par les eaux usées domestiques : L’évacuation directe dans le milieu marin des eaux usées brutes est à l’heure actuelle la plus importante source de pollution du littoral marocain. Les conséquences de ces rejets sur l’équilibre du milieu marin sont nombreuses, aussi bien sur le plan physico-chimique, chimique que biologique. Selon un nouveau rapport du Programme des Nations Unies pour l’environnement (PNUE), une marée montante d’eaux usées menace la santé et la richesse d’un nombre important d’océans et mers à travers le monde, tandis que des progrès sont notables en matière de pollution pétrolière et chimique. Dans de nombreux pays en développement, de 80 à 90 pour cent des eaux usées déversées sur les côtes sont des effluents bruts, c'est à dire des rejets qui n'ont pas été traités(6),ainsi que 60 % des eaux usées urbaines rejetées dans la mer méditerranéenne ne sont pas traitées préalablement(7). Les eaux usées domestiques (eaux-vannes et eaux ménagères) urbaines contiennent une multitude d’agents pathogènes excrétés par la voie intestinale ou urinaire et susceptibles de déclencher des maladies transmissibles. Ces agents peuvent être classés en quatre catégories principales : les bactéries, les virus, les parasites et les champignons. Parmi tous les microorganismes couramment rencontrés dans les eaux usées urbaines, il est important de distinguer leur origine, ainsi que les pathologies qu’ils sont susceptibles d’engendrer. En se basant sur ces deux critères, nous pouvons définir trois catégories de germes(8) : les germes d’origine tellurique non pathogènes et non infectieux, 9 entraînés par les eaux de ruissellement. Les germes d’origine fécale, humaine ou animale, le plus fréquemment non pathogènes, qui regroupent principalement des bactéries, et sont couramment utilisés comme germes témoins de contamination fécale. Les germes pathogènes parmi lesquels nous distinguons : certaines bactéries, les virus et les parasites. Pour tous ces microorganismes, l’eau représente un vecteur de choix pour atteindre leur cible. La transmission se fait préférentiellement par voie digestive (ingestion d’eau d’alimentation ou de baignade contaminée ou d’aliments souillés comme les coquillages), mais peut également se faire par voie cutanéo-muqueuse lors des activités de baignades. La résistance de ces micro-organismes à la salinité du milieu marin diffère suivant les espèces et varie de quelques dizaines de minutes pour les plus fragiles à plusieurs semaines pour les plus résistantes. Ainsi, parmi les espèces les plus résistantes, on peut citer les œufs des parasites intestinaux (Tænia, Ascaris, etc.), les spores de champignons microscopiques pathogènes (Candida, Trichophyton, etc.). Pour les espèces moyennement résistantes dans le milieu marin, il y a les bactéries pathogènes comme sérotypes de salmonelles, le vibrion cholérique, certains Pseudomonas (bacille pyocyanique), le staphylocoque doré et clostridium(9). Certains facteurs comme la température de l’eau de mer, la teneur en oxygène dissout et la teneur en matières organiques conditionnent la résistance de microorganismes pathogènes dans le milieu marin(10). 10 II.2. Pollution par les eaux usées industrielles : Généralement, les eaux usées industrielles sont riches en matières minérales et organiques non ou difficilement biodégradables, surtout les déchets de l’industrie. Ces eaux usées sont chargées de substances dérivées de pétrole et en premier lieu les essences, fuels, et les huiles utilisées dans divers moteurs à combustion. On trouve aussi les métaux lourds tel que le mercure (appareils électriques, produits pharmaceutiques), le cadmium (industrie métallurgique), l’argent, le chrome, le zinc, le cuivre, le plomb. À côté des métaux lourds, on a les métalloïdes (phosphore, arsenic, fluor et le chlore), les acides et les cyanures(11, 12), sans oublier les sels qui viennent des détergents et des engrais chimiques (nitrites, nitrates, orthophosphate). L’accumulation de ces substances a des impacts directs sur l’équilibre biologique du milieu marin à moyen ou à long terme et dont les conséquences sur la faune et la flore marines peuvent être très graves, surtout sur les ressources halieutiques(10). II.3. La pollution par les eaux de ruissellement : Les eaux de ruissellement contiennent surtout des matières en suspension d'origine végétale, des hydrocarbures, des polluants venant de l'atmosphère comme le gaz sulfureux, les composés du plomb, les gaz nitreux et carbonique, des détergents et tout polluant se trouvant accidentellement sur la chaussée(13). Ces eaux résultent du lessivage et de l’érosion des sols et basins versant par les eaux de précipitation. 11 II.4. La pollution d’origine atmosphérique : Les principales sources de la pollution atmosphérique sont les activités industrielles et la circulation automobile, cette pollution a un impact non négligeable sur l’équilibre de la faune et de la flore marines et par conséquent sur les ressources halieutiques. II.5. La pollution par les activités maritimes : La navigation maritime et les installations portuaires sont les principaux responsables de la pollution par les hydrocarbures(HC) aussi bien au voisinage des côtes qu’en haute mer. Cette pollution peut être soit accidentelle (accidents maritimes, marées noires, etc.) ou intentionnelle (dégazage des pétroliers en haute mer, nettoyage des cuves de navires). Il est à noter que pour le Maroc, les pollutions dues à des accidents en mer ne peuvent être considérées comme un risque hypothétique, mais comme un danger potentiel et quotidien compte tenu de l'intensité du trafic aussi bien le long des sites atlantiques que méditerranéens. A titre d'exemple, la Méditerranée, mer semi-fermée, représente 7 % de la surface mondiale des eaux, enregistre 17 % de la pollution globale des mers et se classe ainsi à la première place des mers du monde en terme de pollution (concentration moyenne de goudron dans les eaux de surface de la Méditerranée est de 5 mg/m² alors que la moyenne pour tous les océans pour ce paramètre est de 0.8 mg/m²)(1). 12 II.6. La pollution par les déchets solides : Ce sont d'abord tous les débris solides qui s'accumulent le long des laisses de hautes mers: bouteille, sacs et autres récipients en matière plastique, bois, débris de filets et de filins... Ces déchets proviennent de décharges, autorisées ou non, le long du littoral et des cours d'eau allant à la mer, des réseaux d'eau pluviale, des rejets directs d'émissaires sans dégrillage, de l'abandon débris sur la plage par les baigneurs et les casses croûteuses peu scrupuleuses, du déversement à partir de navire (commerce et plaisance)... Ces objets constituent surtout une nuisance visuelle qui déprécie l'attrait d'une plage. Flottant au large, ils peuvent constituer une entrave à la pêche et à la navigation. Elles peuvent être l'origine de pollution par hydrocarbures. Dans les laisses de hautes mers, les déchets les plus fréquents sont les matières plastiques. Voici quelques exemples de déchets et leur persistance : Tableau I : déchets en mer par types, par description et par persistance(14) Déchets Description Persistance Plastiques Fragments, bâches, sacs et récipients Indéfiniment Polystyrène Verres, emballages et balises Plus de 30 ans Caoutchouc Gants, bottes et pneus Plus de 50 ans Bois Bois Construction, palettes, fragments Plus de 10 ans Métaux Cannettes, barils d’essence, aérosols et Plus de 100 ans débris Verre Bouteilles, ampoules Environ 4000 ans Relatifs aux déchets Tampons, préservatifs, fèces Environ 30 ans sanitaires 13 II.7. La pollution radioactive : La pollution radioactive se trouve au niveau des rejets des centrales électronucléaires et des centres de traitement des déchets(5). Cette pollution peut être transportée par des organismes planctoniques ou par des poissons ayant concentré des éléments radioactifs. II.8. La pollution due aux activités estivales : Durant la période estivale, les plages constituent un pôle d’attraction important pour une population hétérogène. Les différentes études menées à cet effet, en particulier celles du Ministère de la Santé, du Ministère de l’Équipement et du Département de l’Environnement an Maroc, ont montré que les plages les plus polluées sont celles qui reçoivent une forte masse d’estivants(1). Les baigneurs peuvent transmettre au milieu marin les germes qu’ils hébergent au niveau de la peau et des muqueuses. II.9. La pollution thermique : Elle est plus rare sur les côtes que dans les rivières du fait du volume et du brassage des eaux. Certaines implantations industrielles, en particulier les centrales électriques, consomment de l'eau pour leur refroidissement qu'elles rejettent ensuite à une température supérieure. Une centrale de 1000 MW utilise 14 et rejette plusieurs dizaines de m³ d'eau par seconde dont la température se trouve élevée de 7 à 8 °C(5). Cette élévation de température entraîne : Une diminution de la teneur de l’eau en oxygène. Une diminution du pH due à la diminution de l’oxygène dissous. Une augmentation de la salinité en favorisant l’évaporation. Stimule la vitesse de multiplication des algues unicellulaires entraînant l'eutrophisation(5). II.10. La pollution microbiologique : II.10.1. Les sources de contamination : Les sources de pollution microbiologiques sont issues notamment de mauvais raccordements d'habitations au réseau d'assainissement, de débordements des réseaux d'eaux usées, de rejets de station d'épuration d'eaux résiduaires et du ruissellement sur les sols lors des pluies importantes. L'existence de dispositifs d'assainissement autonome défectueux dans certaines zones d'habitation, mais aussi la pollution diffuse apportée par les rejets mal maîtrisés des zones d'élevages, en particulier par temps de pluie, constitue des causes de pollution microbiologique. L'impact des rejets sur une zone de baignade dépend de divers facteurs : quantité de pollution rejetée, éloignement du point de rejet par rapport à la zone de baignade permettant une certaine auto-épuration des rejets, caractéristiques de la dispersion des rejets des courants marins, la charge microbienne des rejets, et de la survie des micro-organismes dans le milieu aquatique. 15 Les baignades constituent une source de pollution, celle-ci est étroitement liée à la densité des baigneurs et la capacité de renouvellement de l’eau. Au niveau du sable, la contamination est essentiellement directe, ainsi que cette contamination peut avoir comme origine l’eau de mer. Le degré de contamination microbiologique du sable est influencé par plusieurs facteurs tels que la concentration des polluants, la fréquence de nettoyage des plages, la capacité de dispersion par les vents, la survie des bactéries et leur concentration dans les éléments polluants. Figure 2 : 0rigines des sources potentielles de contamination fécale dans le milieu marin(15). 16 II.10.2. Les bactéries : Les bactéries sont des procaryotes de taille variable entre 0,1 et 10 µm. Elles possèdent tout le matériel cellulaire nécessaire à leur multiplication. Certaines d’entre elles peuvent être rencontrées sous forme de spores : ce phénomène de sporulation a lieu en réponse à un environnement qui leur est peu favorable. Le pouvoir pathogène d’une bactérie est soit spécifique (il engendre des pathologies spécifiques), soit opportuniste (il ne s’exprime que sur des individus affaiblis). L’ingestion est la voie de contamination majoritaire. L’annexe 1 répertorie différents exemples de bactéries retrouvées dans les eaux usées(16). Parmi ces bactéries, les plus connues sont les espèces du genre Salmonella qui sont presque toutes pathogènes (responsables de fièvres typhoïdes et paratyphoïdes ainsi que de gastroentérites) et les Escherichia coli dont certaines souches sont responsables de redoutables gastroentérites et diarrhées. II.10.3. Les virus : Les virus sont des organismes de très petite taille (10 à 350 nm). Ils ne sont constitués que d'une molécule d'ADN ou d'ARN, entourée d'une capside. Ne possédant ni noyau, ni capacité de synthèse, ce sont des parasites obligatoires d'une cellule vivante dont ils détournent, à leur profit, les systèmes enzymatiques, énergétiques et de synthèse. 17 L’infection d’un individu par un virus hydrique se produit dans la majorité des cas par l’ingestion, sauf pour le Coronavirus où elle peut aussi avoir lieu par inhalation. Les virus sont relativement spécifiques d'un hôte. Il existe des virus adaptés à chaque type d'hôtes (animaux, hommes, plantes, champignons, algues, bactéries). Les virus entériques transmis par ingestion sont, avec les virus respiratoires transmis par inhalation d'aérosols, les plus importants pour la santé humaine. L’annexe 1 recense la plupart des virus que l’on peut trouver dans les eaux usées ainsi que les symptômes de la maladie qui leur est associée(16). II.10.4. Les protozoaires : Les protozoaires sont des organismes unicellulaires eucaryotes, plus complexes et plus gros que les bactéries. Leur taille varie de quelques microns à quelques millimètres, mais la plupart des espèces ne dépassent pas quelques centaines de microns. La plupart des protozoaires pathogènes sont des organismes parasites et se développent aux dépens de leur hôte. Ils sont souvent rencontrés dans les eaux où ils se nourrissent de matière organique ou de bactéries. Certains protozoaires adoptent au cours de leur cycle de vie une forme de résistance, appelée kyste (en particulier, oocyte pour Cryptosporidium et kyste pour Giardia). L’annexe 1 reprend des exemples de protozoaires d’origine hydrique, dont les plus importants sont Cryptosporidium et Giardia(16). 18 II.10.5. Les helminthes : Il peut s’agir de vers plats (plathelminthes), ou ronds (némathelminthes), qui comprennent de nombreuses formes de parasites souvent à l’origine de maladies très graves. Ce sont pour la plupart, des vers intestinaux, rejetés avec les matières fécales animales ou humaines (souvent sous forme d’œufs très résistants). La contamination se fait par voie digestive lors de l’absorption d’eau contaminée par des œufs ou des larves, ou alors par voie transcutanée c’est à dire, par fixation puis pénétration de larves à travers la peau. Différents exemples d’helminthes sont repris en annexe 1(16). II.10.6. Les champignons : Ce sont des organismes privés de tout organe de locomotion, incapables d’effectuer la photosynthèse, et de ce fait, réduit à l’état de parasite ou à celui de saprophytes (organismes qui tirent leur nourriture de matières organiques en voie de décomposition). Les champignons recherchés dans l’eau se transmettent par voie cutanéomuqueuse, et sont à l’origine d’affections cutanées. Ce sont les moisissures et les levures (mycètes unicellulaires). Parmi les moisissures, nous pouvons citer comme espèces pathogènes : Allescheria boydii, Géotrichum candidum, Aspergillus fumigatus, Parmi les levures, nous pouvons citer Candida albicans, espèce très répandue, d’origine fécale, et responsables de diverses mycoses (infections cutanéomuqueuses buccales, vaginales et cutanées). 19 III. L’EVALUATION DE LA QUALITE MICROBIOLOGIQUE DES EAUX - LES GERMES INDICATEURS DE CONTAMINATION FECALE : Dans les milieux aquatiques, la détection de tous les pathogènes potentiels est très difficile et incertaine en raison de(17) : la très grande variété et diversité des micro-organismes pathogènes qui peuvent être présents dans l’eau (virus, bactéries, protozoaires…) ; la faible abondance de chaque espèce de pathogène (nécessité de concentrer de très grands volumes d’eau pour les détecter) ; l’inexistence de méthodes standardisées et rapides pour la détection de tous ces micro-organismes pathogènes. Même si des outils moléculaires pour détecter plusieurs pathogènes à la fois se développent progressivement, il est aujourd’hui impossible de fonder la surveillance en routine de la qualité microbiologique des eaux sur la recherche des pathogènes. L’évaluation de la qualité microbiologique des eaux est, par conséquent, basée sur le concept de germes dits « indicateurs de contamination ». Ces indicateurs ou bactéries indicatrices de contamination n’ont pas nécessairement par eux-mêmes un caractère pathogène, mais leur présence indique l’existence d’une contamination par des matières fécales. Leur concentration est une indication du niveau de risque de présence de microorganismes pathogènes. Un indicateur idéal est par définition une espèce ou un groupe de bactéries qui présente certaines caractéristiques. Celles-ci sont reprises dans le Tableau II. 20 Tableau II : Caractéristiques d’un indicateur idéal de contamination fécale(18) Propriété Pathogénicité Occurrence Survie Reproduction Inactivation Source Coût Caractéristique d’un indicateur Pas pathogène Présent en même temps que les pathogènes, absent en absence de de contamination fécale Taux de survie similaire à celui des pathogènes Ne se reproduit pas dans les eaux naturelles Inactivé par les différents traitements au même niveau que les pathogènes La seule source dans les eaux naturelles est la contamination fécale Méthodes de détection bon marché, rapides et faciles à mettre en œuvre Le choix d’un tel indicateur doit répondre à un certain nombre d’exigences ou de critères(19) : ils doivent toujours être présents lorsque les microorganismes pathogènes sont présents ; ils doivent apparaître en plus grand nombre que les agents pathogènes associés; ils doivent avoir le même comportement que les agents pathogènes dans l’environnement naturel et au cours des procédés de fabrication ; ils doivent être mis en évidence, dénombrés et identifiés à l’aide de techniques simples. Différents groupes de bactéries sont utilisés comme indicateurs de contamination fécale dans différents pays et sous différentes juridictions. Les coliformes totaux et fécaux ont été très longtemps les principaux indicateurs de contamination fécale mais aujourd’hui, Escherichia coli et les entérocoques 21 intestinaux sont reconnus comme plus appropriés(20, 21) et proposés pour remplacer les coliformes dans certaines normes de qualité microbiologique des eaux. Il est cependant important de comprendre les potentialités et les limitations de ces différents indicateurs. Quelques caractéristiques des indicateurs les plus couramment utilisés sont présentées ci-dessous : Coliformes totaux (CT). La pertinence de ce groupe comme indicateur est aujourd’hui fortement contestée du fait que toutes les espèces incluses dans les CT ne sont pas spécifiques de la flore intestinale des animaux à sang chaud. En effet, certaines espèces sont d’origine tellurique ou aquatique et sont capables de se développer dans l’environnement aquatique(22, 23). Coliformes fécaux (CF) (aussi appelés Coliformes Thermotolérants). Les CF constituent un sous-groupe des CT capables de se développer à 44 °C. Les CF sont considérés comme plus appropriés comme indicateurs de contamination fécale que les CT. Ce groupe est majoritairement constitué de Escherichia coli mais comprend aussi des Klebsiellas, des Enterobacter et des Citrobacter. Certains auteurs ont rapporté la présence de ces dernières espèces dans des eaux sans qu’aucune contamination fécale ne soit suspectée(24, 25), tel que , Havelaar(26) montre qu'en Finlande la majorité des coliformes thermotolérants détectés dans une eau provenaient d'eaux usées d'industries de bois et de papier. E. coli. De nombreuses études ont montré que cette espèce était généralement associée à une source fécale (20, 23, 24, 27-29). Aujourd’hui E.coli est considéré comme le meilleur indicateur d’une contamination récente du milieu aquatique par du matériel fécal humain ou d’animaux à sang chaud(20). Cependant, quelques études (30-32) 22 suggèrent qu’en milieux tropicaux certaines souches d’E. coli puissent faire partie de la flore autochtone des rivières ; cette espèce ne serait donc pas un indicateur idéal de contamination fécale en milieux tropicaux. Entérocoques intestinaux. Ce groupe est aussi considéré comme un bon indicateur spécifique de la contamination fécale. Plusieurs études ont montré que l’abondance des entérocoques intestinaux était mieux corrélée à l’apparition de maladies gastro-intestinales chez les baigneurs fréquentant des plages aux eaux contaminées que l’abondance des CT ou CF (33, 34).Le fait que les entérocoques intestinaux survivent plus longtemps dans le milieu naturel que les E. coli peut constituer un avantage de ce groupe si l’on cherche à identifier une contamination fécale ancienne (35, 36) III.1. Définition des indicateurs bactériens de contamination fécale : III.1.1. Les coliformes totaux : Ils sont définis comme l’ensemble des bactéries aérobies et anaérobies facultatives Gram négatif, non sporulantes, en forme de bâtonnet, qui sont capables de se multiplier en présence de sels biliaires ou d’autres agents de surface ayant des propriétés équivalentes et de fermenter le lactose avec production d’acide et de gaz en 48 heures à 35-37°C. Les principaux genres inclus dans le groupe sont : Citrobacter, Enterobacter, Escherichia, Klebsiella et Serratia (37). La presque totalité des espèces est non pathogène et ne représente pas de risque direct pour la santé (20, 38), à l’exception de certaines souches d'Escherichia coli (E. coli) ainsi que de rares bactéries pathogènes opportunistes. 23 III.1.2. Les coliformes fécaux : Les coliformes fécaux, ou coliformes thermotolérants, sont un sousgroupe des coliformes totaux capables de fermenter le lactose à une température de 44,5C°. L’espèce la plus fréquemment associée à ce groupe bactérien est l'Escherichia coli (E. coli) et, dans une moindre mesure, certaines espèces des genres Citrobacter, Enterobacter et Klebsiella (20, 39, 40). La bactérie E. coli représente toutefois 80 à 90 % des coliformes thermotolérants détectés(20, 41). III.1.3. Les Entérocoques intestinaux : Ils constituent un sous-groupe des Streptocoques fécaux ; ce sont des bactéries Gram positives, catalases négatives, en forme de cocci, commensaux du tube digestif. Les entérocoques appartiennent au groupe D de Lancefield, les plus fréquemment isolés sont Enterococcus faecalis et à un moindre degré Enterococcus faecium(42). Ils peuvent être définis comme des microorganismes capables de se développer entre 10 et 45 °C à pH 9,6 et dans 6.5% de NaCl , ou comme des microorganismes capables de se développer en aérobiose et d’hydrolyser le 4methylumbeliferyl β -D Glucoside en présence d’acétate de thallium, acide nalidixique et 2,3,5- triphenyltetrazolium chloride (TTC). 24 III.1.4. Le rapport coliformes fécaux/streptocoques fécaux : le rapport coliformes fécaux/entérocoques est un élément informatif de premier ordre pour déterminer la source de contamination(43) : Rapport CF/SF Source de contamination R>4 origine exclusivement humaine 4>R>2 origine mixte à prédominance humaine 2>R>1 origine incertaine 1>R>0.7 origine mixte à prédominance humaine 0.7>R origine principalement animale Ce rapport doit être, cependant, appliqué avec prudence, car il varie énormément avec la température de l’eau de mer, l’éloignement de la source de contamination et avec le temps d’immersion des contaminants. III.2. Autres indicateurs : Des études récentes ont mis en évidence le fait que l’abondance de bactéries indicatrices en général n’était pas bien corrélée à la présence de virus pathogènes (44-46) . Les bactériophages et plus particulièrement les coliphages ont été proposés comme des indicateurs spécifiques pour les virus entériques. Les bactériophages sont des virus qui infectent des bactéries ; ceux qui infectent en particulier E. coli et les autres coliformes sont appelés des coliphages. Trois groupes sont actuellement testés comme indicateurs: les coliphages somatiques, les coliphages anti-mâle à ARN ou phages F-RNA (qui se lient aux 25 pili sexuels des bactéries F+) et les phages infectant Bacteroides fragilis. Cette approche est en plein développement, mais des limitations pour l’usage des coliphages comme indicateurs subsistent: de nombreux paramètres influencent le devenir des coliphages dans les milieux naturels (densité des bactéries hôtes, et des phages eux-mêmes, température, pH, etc.) et peu d’informations pertinentes existent à ce sujet ; ils sont présents en nombre très variable et leur abondance n’a pas été démontrée comme ayant un rapport avec l’apparition d’infections ; finalement, les analyses sont encore très chères et nécessitent une étape de concentration(47). Clostridium perfringens a aussi été proposé. Cette bactérie anaérobie stricte ne se multiplie que dans le tractus intestinal d'animaux à sang chaud et ses spores résistent remarquablement aux conditions défavorables, beaucoup mieux que les virus entériques. Cependant, du fait de cette très forte résistance, Clostridium s'avère être un indicateur trop conservatif et se révèle non corrélé avec les virus entériques(48). Une collaboration internationale (Projet virobathe) vise à établir des normes pour l’énumération des virus dans les eaux à usage récréatif. Enfin, certains auteurs (22, 49) proposent une évaluation de la qualité microbiologique des eaux basée sur l’énumération simultanée de plusieurs indicateurs complémentaires. 26 IV. LES METHODES DE ORGANISMES INDICATEURS : DETECTION DES MICRO- IV.1. La mise en culture : Les méthodes traditionnelles pour l’énumération des bactéries fécales sont basées sur leur mise en culture. Bien que, ces dernières années, nombre de publications aient proposé des méthodes alternatives aux méthodes classiques de dénombrement des bactéries fécales dans les eaux de surface, ces dernières sont néanmoins encore utilisées de manière systématique pour le contrôle en routine de la qualité microbiologique des eaux et sont toujours les seules reprises dans les normes. Deux grands types de méthodes basées sur la mise en culture sont régulièrement utilisés : - La détermination du nombre le plus probable (NPP) : des dilutions décimales de l’échantillon sont inoculées dans une série de tubes contenant un milieu de culture liquide spécifique. La loi de Poisson permet de calculer le NPP sur base de la proportion de tubes positifs dans chaque dilution. - La méthode de filtration sur membrane (MF) : un volume défini de l’échantillon est filtré et la membrane est incubée sur un milieu gélosé spécifique. Différents milieux et conditions d’incubation (temps et température) peuvent être utilisés selon le type de bactéries fécales recherché(50) . Après incubation, on dénombre les colonies visibles à l’œil nu et l’on considère que chaque colonie résulte de la multiplication sur le milieu d’une cellule bactérienne. Le résultat s’exprime en UFC (unité formant colonie) par unité de volume. 27 Pour l’énumération des coliformes et des E.coli, les milieux spécifiques classiques utilisés pour la détermination du NPP ou des UFC possèdent du lactose et un indicateur pour identifier la production d’acide. Ils contiennent aussi des détergents et/ou des sels biliaires pour inhiber la croissance des Gram positifs et des levures. Le milieu liquide spécifique le plus utilisé en France pour l’énumération des coliformes dans l’eau est le bouillon lactosé au vert brillant. Les milieux gélosés spécifiques les plus utilisés pour l’énumération des coliformes sont: le milieu m-Endo et le milieu lactosé TTC-Tergitol. Pour augmenter la spécificité et diminuer le temps de réponse des méthodes basées sur la mise en culture, des propriétés enzymatiques des coliformes et des E. coli sont aujourd’hui exploitées. La détection de l’activité de la β-Dgalactosidase (une enzyme spécifique des coliformes) et celle de la β-Dglucuronidase (une enzyme spécifique des E. coli) sont utilisées pour mettre en évidence la présence de ces bactéries. Des substrats chromogéniques et fluorogéniques ont été incorporés dans les milieux de culture ; l’hydrolyse de ces substrats par les enzymes spécifiques donne lieu à des produits colorés ou fluorescents qui permettent une détection aisée de l’activité enzymatique ciblée(51). Quelques milieux de culture basés sur ces propriétés enzymatiques permettent la détection simultanée des coliformes et des E. coli. Un exemple d’un dénombrement sur gélose d’E. coli est présenté par la figure 3. Le substrat fluorogénique incorporé à la gélose fait apparaître les cellules d’E. coli en mauve. 28 Figure 3 : Photographie d’un dénombrement des E. coli sur un milieu de culture contenant un substrat chromogénique (milieu Chromocult Agar). Les colonies d’E. coli apparaissent colorées en mauve sur ce milieu(52). La connaissance des propriétés enzymatiques de ces bactéries a également permis de développer l’approche dite “defined substrate technique” (53) : Elle consiste à fournir comme seul substrat dans le milieu, un composé nécessitant l’activité enzymatique ciblée pour pouvoir être utilisé ; seul le groupe de bactéries ciblé peut donc croître. Une méthode normalisée (ISO 1899-1) et miniaturisée est aujourd’hui utilisée pour l’énumération des E. coli pour le contrôle de routine de la qualité microbiologique des eaux. Dans cette méthode 29 NPP miniaturisée, une microplaque de 96 puits contenant un substrat fluorogénique pouvant être hydrolysé par la β-D-glucuronidase est utilisé. Après incubation de la microplaque, 36 h à 44 °C, chaque puit est inoculé avec des dilutions décimales de l’échantillon d’eau. Les puits positifs sont énumérés sous illumination UV et le NPP est calculé (voir figure 4). Figure 4 : Photographie d’un dénombrement des E. coli par la technique microplaque. Les puits positifs (où il y a eu croissance des E. coli) apparaissent fluorescents sous illumination UV. Chaque rangée verticale de puits correspond à une dilution de l’échantillon (échantillon de plus en plus dilué de gauche à droite). Le nombre de puits fluorescents est compté pour chaque dilution de l’échantillon ce qui permet une estimation du NPP d’E. coli dans l’échantillon. 30 Les méthodes basées sur la mise en culture présentent deux inconvénients majeurs. Tout d’abord, le temps de réponse est relativement long (de 24 à 48 h pour la détermination du NPP). Elles ne permettent donc pas de détecter immédiatement les pollutions fécales en milieu naturel, ce qui constitue un handicap considérable quand une réponse rapide sur l’état de contamination d’une eau naturelle est souhaitée, par exemple aux prises d’eau des usines de production d’eau potable en rivière ou dans les zones de baignade fréquentées. D’autre part, ces méthodes peuvent sous-estimer le nombre de bactéries fécales présentes dans un échantillon d’eau, en ne prenant pas en compte celles qui ne sont plus capables de se diviser. IV.2. La problématique des bactéries fécales non cultivables : A l’origine de l’utilisation des méthodes basée sur la mise en culture, on considérait que la différence entre bactéries «mortes» et bactéries «vivantes » s’exprimait par la capacité de ces cellules à se multiplier ou pas dans ou sur des milieux et dans des conditions considérées optimums pour leur croissance. Aujourd’hui, on sait pertinemment que la frontière entre la vie et la mort d’une bactérie ne peut être définie par cet unique et simple concept. En effet, depuis le courant des années 1980, d’importants développements méthodologiques très variés ont permis de mettre en évidence l’existence d’une proportion importante de bactéries présentes dans les milieux aquatiques naturels qui n’étaient pas capables de se développer dans les milieux de culture (bactéries non cultivables) mais présentaient certaines caractéristiques qui 31 démontraient leur activité ou leur viabilité. Diverses méthodes sont utilisées pour évaluer l’activité ou la viabilité des bactéries(54) : mesure de l’intégrité cellulaire comme l’intégrité membranaire ou le potentiel de membrane, mesures d’activités métaboliques comme l’utilisation d’un substrat ou la synthèse de protéines, la détection d’une activité respiratoire ou d’une activité enzymatique ou encore la détection de synthèse d’ARNm ou d’ARNr. Les bactéries présentant certaines activités mais incapables de se multiplier en culture ont été intitulées « Bactéries Viables mais Non Cultivables », ou VBNC(55). Certains auteurs(56, 57) ont proposé l’utilisation du terme ANC (Actives Non Cultivables) comme plus approprié que le terme VNBC pour décrire ces bactéries vu que la « viabilité » dont on parle est souvent définie par la mesure de certaines propriétés cellulaires qui ne sont pas forcement en relation avec la capacité de ces cellules à se reproduire. Cet état VBNC ou ANC a été mis en évidence pour des bactéries autochtones du milieu aquatique mais aussi pour diverses bactéries entériques dans le milieu aquatique(55). L’habitat naturel des E. coli est l’intestin des animaux à sang chaud qui offre un environnement à température constante et élevée (37 °C) et des concentrations élevées en substrats organiques aisément assimilables comme les acides aminés et les sucres, tous facteurs favorables au développement bactérien. Une fois rejetées dans le milieu naturel, ces bactéries se trouvent confrontées à des conditions défavorables telles que la limitation en nutriments, le stress osmotique, de faibles températures et des variations de pH ainsi que face à de multiples prédateurs. Une partie de ces bactéries peuvent survivre à ces conditions défavorables en entrant dans l’état VBNC(58, 59). En effet, de nombreuses publications montrent qu’après leur introduction dans un milieu aquatique naturel, les bactéries fécales perdent assez rapidement leur 32 faculté de croître dans ou sur les milieux spécifiques utilisés pour leur dénombrement mais conservent beaucoup plus longtemps certaines activités métaboliques (59-61). Différentes études ont, par ailleurs, suggéré que ces bactéries actives mais non cultivables pouvaient conserver leur pathogénicité (62, 63). Si les bactéries entériques VBNC présentes dans les milieux aquatiques sont effectivement capables de « ressusciter » de ce stade « dormant » et de se reproduire le risque sanitaire serait alors systématiquement sous-estimé par les méthodes de dénombrement par mise en culture(64). Aujourd’hui, le concept de bactéries VBNC fait encore l’objet de débats passionnés sur la signification exacte de cet état(56, 59). Deux visions divergentes s’opposent(65, 66). La première présente l’état VBNC comme une stratégie de survie, et donc un processus actif qui conduit à une différenciation. Cette hypothèse veut que cet état soit réversible et que dans certaines conditions ces cellules « ressuscitent » et soient capables de se reproduire. L’autre vision présente cet état comme une étape irréversible conduisant vers la mort. Ces cellules seraient capables de maintenir certaines activités métaboliques ou respiratoires pendant un temps limité mais ne seraient pas capables de « ressusciter ». De nombreuses études ont tenté d’induire une « ressuscitation », celle-ci serait la meilleure mesure d’une réelle viabilité (67-69). Dans la plupart de ces études, la « ressuscitation » n’a été possible que sur les cultures qui sont restées dans l’état VBNC pour de courtes périodes de temps(65). D’autres auteurs contestent ces résultats en suggérant que la croissance observée était due à quelques cellules cultivables présentes en abondance inférieure à la limite de détection de la méthode d’énumération par mise en culture utilisée(70). 33 L’intérêt croissant pour le développement de nouvelles méthodes de dénombrement spécifiques capables de détecter les bactéries fécales dans l’état VBNC dans les eaux de surface découle tout naturellement de ce qui précède. IV.3. Les méthodes moléculaires : Les méthodes moléculaires de détection de bactéries fécales (pathogènes et indicateurs) ont été l’objet d’un important travail de recherche durant les dernières années. Les méthodes moléculaires présentent l’avantage d’être rapides, spécifiques ; elles ne nécessitent pas d’étape de mise en culture mais présentent l’inconvénient d’être chères et de nécessiter un personnel très qualifié. De plus, certaines ne font pas toujours la distinction entre les bactéries vivantes et mortes. La méthode moléculaire est basée sur l’extraction de l’ADN des microorganismes présents dans l’échantillon suivie de la multiplication, par la technique d’amplification génique, d’une séquence du génome ou ADN spécifique du micro-organisme recherché. Cette multiplication appelée PCR (pour Polymerase Chain Reaction en anglais), dont le principe est expliqué à la figure 4, permet de recopier en plusieurs centaines de millions d’exemplaires le fragment d’ADN. Il est alors possible de visualiser la présence d’un microorganisme présent en très faible nombre dans l’échantillon de départ. Des variantes de cette technique (PCR compétitive et PCR en temps réel) permettent aujourd’hui, sur la base du nombre de copies du gène après amplification, de dénombrer les micro-organismes dans l’échantillon. Ces méthodes sensibles présentent néanmoins l’inconvénient de ne pas permettre la distinction entre un micro-organisme vivant et un fragment en bon état de son ADN présent dans l’échantillon. 34 Figure 5 : Schéma du principe de l’amplification génique (PCR)(52). 35 IV.4. L’énumération des E. coli viables par hybridation in situ : L’hybridation in situ avec une sonde fluorescente (FISH - Fluorescent In Situ Hybridisation), consiste à marquer la cellule cible avec une sonde moléculaire spécifique du micro-organisme ciblé liée à un composé fluorescent. Cette sonde moléculaire est en fait l’homologue d’une séquence de bases spécifiques de l’ARN du microorganisme cible. Dans le cas du micro-organisme cible, la sonde moléculaire se lie par appariement à la séquence de base homologue de l’ARN de la cellule cible qui devient fluorescente et détectable en microscopie à épifluorescence. Dans le cas d’un micro-organisme non-cible, il n’y pas appariement et donc pas de marquage de la cellule. Récemment, cette procédure d’hybridation in situ appliquée aux E. coli a été couplée avec un test de viabilité pour ne détecter en microscopie que les cellules viables(71). Ce test consiste à incuber les bactéries dans un milieu riche en présence d’antibiotiques qui inhibent la division cellulaire ; à la suite de cette incubation, les cellules actives sont allongées, ce qui permet de les distinguer des inactives. Cette élongation des cellules actives s’accompagne d’un accroissement du contenu en ARN sans changer le nombre de bactéries. Ce couplage offre donc le double avantage de faciliter la détection des bactéries, après marquage par une sonde moléculaire fluorescente, et de permettre la seule énumération des cellules actives (cellules présentant une activité métabolique dans les conditions d’incubation en présence du milieu riche). Des exemples de dénombrement des E. coli par cette méthode sont présentés par la figure 6. 36 À l’inverse des méthodes basées sur la mise en culture, cette technique offre l’avantage de dénombrer l’ensemble des E. coli viables et non pas seulement les E. coli cultivables (capable de se multiplier sur les milieux de culture), mais elle présente l’inconvénient d’être relativement lourde à mettre en œuvre et de nécessiter un personnel formé aux techniques de biologie moléculaire et à la microscopie. Cette technique a permis de montrer que la proportion des E. coli viables mais non cultivables était plus importante dans les milieux peu contaminés par rapport aux milieux fortement contaminés(52). Ceci s’explique probablement par le fait que des conditions plus stressantes (stress nutritionnel, effet de la lumière), qui sont responsables de la plus grande fraction de bactéries viables mais non cultivables sont rencontrées dans les milieux les moins contaminés. Figure 6 : Hybridation in situ avec une sonde moléculaire des E. coli présents dans un échantillon d’eau usée traitée (10 ml filtrés) (I) et dans un échantillon d’eau (100 ml filtrés) (II). Sur les deux photos, la flèche « a » indique une cellule d’E. coli fluorescent en rouge(52). 37 IV.5. La mesure directe de l’activité β-D-glucuronidasique : La mesure de l’activité de la β-D-glucuronidase des E. coli sans passage par une étape de mise en culture des échantillons a été proposée comme alternative aux dénombrements par mise en culture dans les eaux côtières(72). La méthode consiste à filtrer un échantillon d’eau (en général 100 ml), à incuber le filtre dans un tampon à pH optimal (6.9) et à température optimale (44 °C) en présence du substrat fluorogène (4-méthylumbelliferyl-β-Dglucuronide (MUGlu) en concentration saturante et à mesurer l’apparition de la fluorescence au cours du temps(73). L’apparition de la fluorescence est due à la methylumbelliferone (MUF) résultant de l’hydrolyse du substrat MUGlu par la β-D-glucuronidase des E. coli et est proportionnelle à la quantité d’enzymes présentes dans l’échantillon qui est elle-même proportionnelle au nombre des E.coli dans l’échantillon. Ce protocole permet de mesurer l’activité GLU en moins d’une heure. Le résultat de la mesure exprimé en terme d’activité enzymatique est converti en abondance d’E. coli grâce à une calibration du type de celle présentée à la figure7. 38 Figure 7 : Relation linéaire en coordonnées logarithmiques, entre l’activité GLU et la concentration en E. coli cultivables (estimée par la méthode « microplaque »)(52). La mesure directe de l’activité GLU avec le type de protocole décrit ci-dessus a été appliquée avec succès à divers types d’échantillons : eaux de mer, eaux douces et eaux usées (73-75). Ces différents travaux ont tous montré une corrélation significative entre le Log de l’activité GLU et celui de l’abondance en coliformes fécaux dénombrés sur gélose. La rapidité, la simplicité du protocole expérimental et un coût équivalent à celui des méthodes de dénombrement sur gélose ont permis de proposer cette approche comme une méthode rapide pour évaluer la qualité microbiologique des eaux douces (76) et marines (77). 39 Tel que dans une étude montrant l’efficacité de cette analyse enzymatique, cinq cents échantillons provenant de différents sites côtiers (côte atlantique française) et d'eau douce ont été analysés par cette méthode, les résultats obtenus par la mesure de l'activité β D-glucuronidase sont conformes pour plus de 90 % des échantillons analysés à ceux estimés par la méthode standard (ISO 9308-3)(78). De plus, pour moins de 1 % d'échantillons, le niveau de qualité en E. coli peut être sous-estimé contrairement à la méthode de référence. Les inconvénients liés à cette méthode sont la nécessité d’une calibration par rapport à une méthode de mise en culture pour obtenir un résultat exprimé en concentration d’E. coli ainsi que la possible interférence, dans certaines conditions environnementales, de micro-organismes non ciblés (bactéries non E. coli possédant une activité glucuronidasique) et de la turbidité. 40 V. LES NORMES DE QUALITE MICROBIOLOGIQUE DES EAUX DE BAIGNADE : Pour un niveau de contamination microbiologique donné, le risque sanitaire dépend de l’usage qui est fait de l’eau. L’eau qui est directement consommée, qui est utilisée comme ressource dans une usine de production d’eau potable, qui sert pour l’hygiène, la baignade ou pour d’autres activités récréatives nautiques, ou encore qui est utilisée pour l’irrigation des cultures n’expose évidemment pas aux mêmes risques sanitaires. De ce fait, des normes différentes ont été établies pour chacun de ces usages. Les études épidémiologiques permettent de faire le lien entre l’exposition à un facteur donné et l’incidence d’infections dues à cette exposition. Elles donnent une estimation du risque en fonction d’un niveau d’exposition ou dose (dans le cas des maladies d’origine hydrique, une abondance d’indicateurs) et peuvent donc être utilisées pour définir des normes appropriées. Les études épidémiologiques qui conduisent à la définition de normes doivent être de la plus grande rigueur de façon à entraîner l’adhésion à ces normes. Néanmoins, ce type d’étude ne donne qu’une estimation statistique d’une relation risque/facteur contrairement à d’autres méthodes expérimentales, mais elles sont souvent pour diverses raisons (éthiques, logistiques, financières, etc.) les seules accessibles. Les limites méthodologiques des études épidémiologiques sont généralement atteintes lorsqu’il s’agit de mesurer de très faibles changements du risque, ce qui implique le traitement d’échantillons trop vastes pour être accessibles. 41 Des études épidémiologiques sont à l’origine des normes pour la réutilisation des eaux usées(79) et de la norme pour les eaux à usage récréatif(80) contrairement aux normes pour l’eau de boisson qui sont basées sur le principe de précaution (absence totale d’indicateurs de contamination fécale) (81). Pruss (82) présente une revue des études épidémiologiques disponibles concernant les eaux à usage récréatif. Sur 22 études identifiées seulement 7 concernaient les eaux douces (83-88). Cette revue met en évidence une forte corrélation entre l’abondance d’indicateurs et l’occurrence de maladies gastrointestinales et montre qu’E. coli est le meilleur indicateur de risque sanitaire pour les eaux douces. Pour un usage donné de l’eau, les normes n’ont aucune raison d’être identiques partout dans le monde. En effet, des facteurs locaux influencent le risque que constitue un niveau de contamination donné. Ce sont, entre autres : le background génétique et immunologique de la population, ce dernier étant lui-même corrélé à la prévalence d’infections diverses dans cette population et à l’écologie microbienne de la région considérée; le type de pathogènes présents et leur proportion par rapport aux indicateurs ; la différence de survie des microorganismes d’origine fécale dans des milieux aquatiques différents. Il faut noter qu’aujourd’hui le niveau des normes est en général établi partout dans le monde sur base d’études épidémiologiques conduites seulement en régions tempérées et dont les résultats ne sont probablement pas directement transposables à d’autres régions comme les régions tropicales ; il semble 42 aujourd’hui important de lancer des études épidémiologiques spécifiques à chaque région pour y garantir la pertinence des normes de qualité microbiologique. Parmi les normes microbiologiques des eaux de baignade, on distingue les normes proposées par l’OMS et le PNUE et la nouvelle directive Européenne 2006/7/CEE (voir tableaux ci-dessous). Tableau III : Les normes microbiologiques pour les eaux de baignade proposées par l’OMS et le PNUE en 1983(89). Nombre Paramètres Concentration par 100 ml à ne pas dépasser 50% 90% du temps minimum d'échantillons Coliformes Fécaux 100 1000 10 100 1000 10 Streptocoques Fécaux 43 Tableau IV : Les normes microbiologiques requises pour les eaux de baignade déterminée par la directive 2006/7/CEE. Paramètres Excellente qualité Bonne qualité Qualité suffisante Entérocoques intestinaux (CFU /100ml) 100* 200* 185** Escherichia Coli (CFU/100ml) 250* 500* 500** * : évaluation au 95ème percentile ** : évaluation au 90ème percentile Même si des critiques peuvent être émises sur la manière dont ces normes ont été établies et sur leur réelle signification sanitaire, personne ne peut nier l’utilité de leur caractère préventif. Une meilleure gestion du risque sanitaire associé à l’eau nécessite de poursuivre les études épidémiologiques afin de mieux appréhender la relation entre la présence des indicateurs et l’apparition de maladies mais nécessite aussi d’approfondir l’étude de l’écologie des germes indicateurs et pathogènes dans le milieu aquatique naturel. 44 VI. LA SURVIE DES BACTERIES DANS LE MILIEU MARIN : Le concept classique d’auto-épuration bactérienne par l’eau de mer a été longtemps retenu. Jusqu’aux années 70, il était admis que les bactéries pathogènes d’origine humaine étaient détruites en quelques heures dans l’eau de mer. La plupart des auteurs considèrent la température et la diminution d’intensité lumineuse comme seules responsables des décroissances bactériennes en milieu marin, mais certains n’excluent pas l’intervention d’autres facteurs défavorables tels que la salinité, les carences en éléments nutritifs, la sédimentation, l’antibiose entre les bactéries et certaines substances antibactériennes produites par les algues ou les bactéries marines. Par contre, la présence de matière organique, notamment dans les sédiments, favoriserait le processus de survie des E. coli et des salmonelles(90). Les résultats in vivo de ces expériences ont montré que les E. coli évoluaient rapidement en 1 à 4 jours vers un état non cultivable dans les milieux carencés en éléments nutritifs(90). E. coli subit des processus adaptatifs structuraux telle la diminution de sa taille, un changement de la composition de ses enveloppes, avec disparition de certaines protéines. Tout ceci s’accompagne d’une modification de l’activité enzymatique notamment de la β-galactosidase. Or, comme la numération des coliformes fécaux en milieu spécifique est fondée sur la dégradation du lactose, liée essentiellement à l’activité de cette galactosidase, cette méthode peut être remise en cause pour l’identification des E. coli en milieu marin. Par contre, ces formes dormantes garderaient leur pouvoir pathogène. Des résultats similaires ont été retrouvés avec Vibrio, Salmonella et Shigella(90). 45 Les bactéries et virus, hôtes habituels de l’intestin de l’homme et des animaux à sang chaud, qui arrivent dans le milieu marin, se retrouvent dans un milieu hostile peu propice à leur croissance. Incapables de se multiplier dans cet environnement, ces microorganismes vont y survivre plus ou moins longtemps en fonction des paramètres physiques, chimiques et biologiques du milieu (figure 8). Les microorganismes sont soit libres dans la masse d’eau, soit associés à des particules organiques ou minéraux. Suivant le poids de ces particules, les microorganismes vont être soumis à une dilution tout au long de l’estuaire ou à une sédimentation favorable à leur concentration. Ainsi, on estime que les sédiments sont plus contaminés que l’eau environnante et vont constituer un réservoir potentiel pour une recontamination ultérieure des eaux à la faveur de la remise en suspension des microorganismes lors des phénomènes naturels (crues, tempête) ou d’activités humaines (dragages). Le temps de survie des microorganismes est défini par le temps nécessaire à la disparition de 90% de la population initiale, exprimé par le T90. De quelques heures à quelques jours pour les bactéries, cette survie est prolongée, pour les virus, de plusieurs semaines à plusieurs mois. 46 Figure 8 : Les paramètres physiques, chimiques et biologiques influençant la survie des germes en milieu marin(15). VI.1. Les facteurs influençant la survie des microorganismes en milieu marin : VI.1.1. Facteurs physico-chimiques : VI.1.1.1. La dilution : Elle intervient immédiatement après le rejet. Elle est favorisée par le mélange des eaux : courants, turbulence et action des marées. On estime que 90 à 99% des bactéries d’égout sont détruites après 48 heures de suspension dans 47 l’eau de mer et que leur nombre décroit avec la distance beaucoup plus rapidement que l’on pourrait s’y attendre du fait de la simple dilution. VI.1.1.2. L’adsorption : C’est la fixation des polluants sur toutes les particules organiques ou minérales en suspension dans le milieu aquatique. C’est un phénomène bien connu par lequel les microbes s’accrochent à des corpuscules dont ils suivent le sort ; l’adsorption contribue donc à un isolement des germes et à une efficace dissociation de la charge polluante, car elle peut atteindre 90 à 95% des bactéries et des virus). VI.1.1.3. La sédimentation : Directe ou indirecte (après adsorption), elle détermine la disparition momentanée des microbes. Cette disparition peut être provisoire, car il peut y avoir remis en suspension des sédiments et des bactéries. Très efficace en eaux calmes, elle se trouve amoindrie par la turbulence du milieu. VI.1.1.4. La lumière : Certaines études ont montré que les coliformes fécaux dans l’eau de mer sont très sensibles à la lumière solaire(91). Ceci peut être expliqué par l’effet bactéricide de la fraction UV des radiations solaires sur la cellule, en induisant des dommages par libération des ions peroxyde qui agissent sur la cellule en la rendant perméable aux sels inorganiques, ce qui fait varier alors sa pression osmotique. 48 Une turbidité élevée de l’eau limite la pénétration des rayons UV dans l’eau et contribue également à réduire l’efficacité des rayons UV vis-à-vis des cellules microbiennes. VI.1.1.5. La température : Généralement les basses températures favorisent la survie des bactéries dans le milieu marin en limitant leurs dépenses énergétiques par diminution des activités métaboliques des bactéries(91). VI.1.1.6. Les variations de pH : Des travaux ont montré que la survie des coliformes fécaux(CF) a été influencée par le pH du milieu d’incubation. En effet, les pH basiques entraînent une nette diminution de la survie des CF(91). VI.1.1.7. La salinité : La salinité est aussi un facteur de stress très important que subissent les bactéries de pollution fécale en arrivant au milieu marin(92), où la bactérie doit rétablir l’équilibre osmotique entre le milieu extérieur et son cytoplasme. Ce rétablissement met en jeu des mécanismes complexes qui font appel à l’augmentation de la concentration de certains solutés (osmo-régulateurs) dans la bactérie. 49 Ainsi, les fortes variations de salinité d’un milieu à l’autre ont tendance à empêcher l’accoutumance des bactéries allochtones à leur nouveau milieu, ce qui conduit à la décroissance de leur nombre. Des auteurs(93) ont souligné également que la présence de particules organiques permet aux microorganismes de lutter plus efficacement contre le stress salin. VI.1.2. Facteurs biologiques : Compétition interspécifique: la présence des microorganismes autochtones, plus aptes à se multiplier dans leur milieu naturel, implique la décroissance des bactéries allochtones. Prédation : On peut citer les : -Bactéries prédatrices : comme les Bdellovibrio (groupe de bactéries de petite taille qui se fixent sur d’autres bactéries pour les « dévorer » ; ce sont des vibrions très mobiles qui n’attaquent que les bactéries Gram négatives); et les Myxobactéries (germes à Gram négatif ayant pour singularité d’hydrolyser les molécules insolubles, de lyser les cellules bactériennes et de les utiliser comme substrat). -Les bactériophages : extrêmement répondus dans la nature ; ils parasitent et détruisent bactéries et Cyanophycées. Ils peuvent détruire une population bactérienne entière ou seulement une partie de celle-ci, s’intégrer dans le chromosome pour établir la lysogénie. -Les prédateurs microphages : Ce sont tous les organismes qui se nourrissent de microbes. Ils sont représentés par les amibes, les flagellés, les ciliés ou des êtres plus évolués tels que les mollusques filtrants qui absorbent une grande quantité 50 de bactéries et de virus avec leur nourriture. Il faut souligner que pour ces deux derniers, les germes absorbés ne sont pas nécessairement détruits. L’oligotrophie : peut être liée à l’absence de substances nutritives ou à la non biodisponibilité de la matière organique. 51 VII. RISQUES SANITAIRES LIES A LA BAIGNADE DANS LES EAUX POLLUEES : VII.1. Introduction : La baignade dans les eaux naturelles peut entraîner un contact plus ou moins intense avec des germes pathogènes qui peuvent être présents dans l’eau en plus ou moins grande quantité. Les pathologies associées à ces germes concernent la sphère O.R.L., l’appareil digestif, les yeux et la peau, et une grande variété d’agents pathogènes présents dans les eaux naturelles sont responsables de ces diverses maladies dont les plus fréquentes sont répertoriées dans l’annexe 2. Le risque encouru par le baigneur dépend de plusieurs facteurs : du niveau de contamination de l’eau, de l’état de santé du baigneur, des modalités de la baignade (durée, immersion de la tête…). La transmission des microorganismes peut se faire par voie féco-orale (ingestion d’eau) ou par contact avec la peau et les muqueuses(94). VII.2. Historique : Jusqu’en 1975 environ, les risques sanitaires liés à la baignade ont été ignorés. À partir des années 1980, plusieurs personnes s’intéressent à ces risques, notamment Cabelli et Foulon aux États-Unis. Les études réalisées révèlent une convergence certaine entre les pathologies observées (diarrhées, vomissements, nausées,…) et l’existence d’une pollution 52 fécale marquée. Lors de différentes études, il s’avère que les baigneurs présentent plus de troubles gastro-intestinaux que les non-baigneurs, tout comme les baigneurs des zones soumises à des pollutions fécales comparés à ceux des zones saines. Les travaux de Foulon (1983) ont mis en évidence l’apparition de troubles dermatologiques et d’affections O.R.L. attribués à la baignade et plus précisément aux conditions de baignade (avec immersion ou non de la tête par les baigneurs). Toutefois, l’ingestion d’eau apparaît comme le mode principal d’agression et l’on suppose qu’un baigneur ingère de 75 à 100 ml d’eau lorsqu’il nage la tête sous l’eau(95). Prüss(96) a réalisé une synthèse bibliographique épidémiologique. Il ressort de cette synthèse que la mauvaise qualité microbiologique des eaux de baignade est souvent corrélée à l’apparition de pathologies plus ou moins graves chez l’homme. VII.3. Les microorganismes impliqués et les pathologies observées : Les micro-organismes pathogènes les plus fréquemment rencontrés dans les eaux douces et salées sont repris dans l’annexe 2, ainsi que les pathologies dont ils sont responsables. VII.3.1. Les bactéries : Les bactéries pathogènes incluent des espèces d’origine fécale humaine ou animale, qui appartiennent aux genres Shigella (S. sonnei et flexneri), Salmonella, Campylobacter (C. jejuni et C. coli), Yersinia (Y. enterocolitica), Escherichia (E. coli pathogènes) et Vibrio (V. cholerae)(52). 53 D’autres bactéries pathogènes comme les Legionellas (L. pneumophila) et certaines espèces du genre Vibrio ne sont pas des bactéries d’origine entérique mais des pathogènes dont l’habitat naturel est l’environnement et plus particulièrement les systèmes aquatiques. Les bactéries pathogènes opportunistes peuvent être d’origine fécale. Elles appartiennent à une grande diversité de genres comme les genres Pseudomonas, Aeromonas, Klebsiella, Flavobacterium, Enterobacter,Citrobacter, Serratia, Acinetobacter, Proteus, Providencia et Mycobacterium, et Nocardia. Ces pathogènes opportunistes affectent essentiellement des sujets sensibles comme les enfants, les personnes âgées ou les immunodéprimés. Les entérobactéries pathogènes induisent essentiellement des gastro-entérites qui se déclarent dans les quarante-huit heures qui suivent la baignade(97). Dermatites, infections des yeux et de la sphère ORL font aussi partie des risques sanitaires liés à la présence de ces bactéries dans les eaux de baignade. La fièvre typhoïde est causée par Salmonella typhi, maladie infectieuse aiguë et contagieuse, elle est la première maladie pour laquelle une augmentation d’occurrence a été observée chez les baigneurs(98). Les Salmonella paratyphi A, B et C sont également à l'origine de fièvres entériques. Staphylococcus aureus est à l’origine d’infections cutanées. Les enfants (moins de 16 ans) sont les plus touchés par ces troubles de santé. Leptospira interrogans responsable de la leptospirose, portée par certains animaux infectés (rats, bétail, chiens,…), qui la rejettent dans leurs urines, est présent dans les eaux douces et les berges boueuses. La leptospirose, maladie d’origine animale, transmissible à l’homme, se transmet essentiellement par voie indirecte, lors de baignades en eau douce. Les leptospires pénètrent dans 54 l'organisme par l'intermédiaire de plaies, de lésions cutanées ou par les muqueuses. La contamination par voie digestive (absorption d'aliments souillés par les urines d'animaux malades) est exceptionnelle. VII.3.2. Les virus : Les virus pathogènes d’origine fécale (virus de l’hépatite A, entérovirus, rotavirus, calicivirus astrovirus, norovirus) sont souvent à l’origine de maladies transmises par les eaux polluées. Le virus de Norwalk et les virus Norwalk-like sont à l’orgine de gastro-entérites ayant une période d’incubation de 15 à 48 heures, alors que celles engendrées par des rotavirus se déclarent principalement au bout de 2 à 4 jours. Les adénovirus peuvent, eux, induire des gastro-entérites ayant des périodes d’incubation pouvant aller jusqu’à deux semaines(97).Virus Norwalk et Norwalk-like sont principalement responsables d’épidémies de gastro-entérites chez les adultes alors que les rotavirus et astrovirus sont à l’origine d’épidémies chez les enfants. Entérovirus et adénovirus sont aussi responsables de problèmes respiratoires. Ces pathologies observées à la suite d’une baignade, ont été classées dans la catégorie « Acute Febrile Respiratory Illness » .Fièvre, maux de tête et de gorge, douleurs dans le corps, fatigue, anorexie et toux comptent parmi ces troubles respiratoires. VII.3.3. Les champignons : Les champignons sont présents dans les eaux de mer. Penicillium spp., Aspergillus spp. et Alternaria spp sont les champignons filamenteux le plus souvent retrouvés dans les eaux de baignade. Candida spp. est, quant à elle, la 55 levure la plus communément dosée dans les eaux de mer. Ces levures et champignons sont à l’origine d’infections oculaires, respiratoires, de la sphère ORL, de la peau et de dérangements gastriques. 7.3.4. Les protozoaires : Des protozoaires tels que Giardia (sous forme kystique) et que les oocytes de Crytosporidium survivent dans l’eau de mer. Les oocytes de Toxoplasma gondii est, lui, infectieux s’il est sous forme sporulée. Ces formes sporulées ont une durée de vie de quelques mois dans l’eau de mer. Les pathologies induites par ces parasites sont principalement des gastroentérites. Les diarrhées parasitiques ont des périodes d’incubation variant entre sept et dix jours(97). 7.3.5. Micro-algues et cyanobactéries : De nombreuses espèces toxiques de dinoflagellés, de diatomées, de nanoflagellés et de cyanobactéries (algues de couleur bleu-vert) présentes dans le milieu marin provoquent des pathologies humaines. La toxicité de ces microsalgues pour l’homme tient aux toxines qu’elles libèrent. Le principal danger vient de ce qu’elles s’accumulent dans les fruits de mer et les poissons qui sont ensuite consommés par l’homme, chez qui elles provoquent des intoxications. La « dermatite du baigneur » (ou « des nageurs ») est un eczéma de contact sévère qui se manifeste après immersion dans de l’eau de mer où se trouvent des efflorescences de certaines espèces de cyanobactéries. Elle provoque des démangeaisons et des brûlures dans les minutes ou dans les heures qui suivent la baignade. Des composés toxiques 56 comme l’aplysiatoxine, la débromoaplysiatoxine et la lyngbyatoxine A ont été isolés dans les cyanobactéries marines. Ils sont très inflammatoires et contribuent dans une large mesure aux tumeurs de la peau(99). Nodularia spumigena a été la première cyanobactérie reconnue comme mortelle chez l’animal. Elle produit une hépatotoxine, la nodularine, qui provoque d’importantes hémorragies du foie chez les mammifères et altère la structure de cet organe. L’inhalation d’embruns chargés de fragments de dinoflagellés ou de toxines (brévétoxines) libérés dans l’écume par des micros-algues lysées peut être dangereuse pour l’homme. Les signes et symptômes sont une irritation sévère de la conjonctive et des muqueuses (en particulier celles du nez) suivie d’une toux persistante, d’éternuements et de picotements des lèvres. VII.4. Les risques liés aux contaminants chimiques : Il arrive que des contaminants chimiques naturels ou anthropiques pénètrent dans les eaux de surface ou se déposent sur les plages. L’exposition est un facteur crucial à prendre en compte pour déterminer le risque d’intoxication par les produits chimiques présents dans les eaux de baignade. Le type d’activités de loisir pratiquées est donc important. L’exposition se fait par contact direct avec la peau, les yeux et les muqueuses, par inhalation ou par ingestion(99). La fréquence, l’ampleur et la probabilité de l’exposition sont des critères déterminants pour évaluer le risque lié à un contaminant donné. Par exemple, le chrome rejeté par les tanneries peut provoquer des irritations importantes et peut engendrer des cancers de la peau. 57 Le mercure, contenu dans les détergents, peut donner des allergies et des complications neurologiques quand il est avalé. Plusieurs autres métaux lourds tels que l’argent, le cuivre, le plomb et le cadmium peuvent avoir des conséquences très nuisibles. 58 VIII. LES EPIDEMIES LIEES AUX EAUX DE BAIGNADE : VIII.1. E. coli O157 :H7 : À l’échelle mondiale, la plupart des épidémies liées à l’ingestion d’eau contaminée par des E. coli sont associées à des baignades dans des eaux de surface naturelles (en rivière, lac, ou étang) ou dans des piscines ou des pataugeoires(100, 101). Ces épidémies étaient dues à des souches E. coli O157:H7 , mais aussi à des souches E. coli non-O157. La plupart du temps, ces épidémies étaient associées à une forte contamination microbiologique des eaux ou à un traitement (chloration) insuffisant des eaux de piscine et de pataugeoire(102). La première flambée d’E. coli 0157: H7 associée à l'eau de loisirs est survenue à l'été 1991. L'épidémie a concerné 21 cas d’E. coli 0157: H7, tous associés à la baignade dans le lac Bleu près de Portland, Oregon(103). Quatre autres foyers d’E. coli 0157: H7 ont été épidémiologiquement liés à la baignade dans les lacs d'eau douce (103). En août 1999, 36 patients ont élaboré E. coli 0157: H7. La plupart avaient des antécédents de la natation dans le lac Battle Ground, situé à Battle Ground Lake State Park dans le comité de Clark, à Washington (28 nageurs et nageuses de 8 contacts, 35 selles-culture ont confirmé, une sérologie confirmée). Entre 1997 et 2000, la plupart des épidémies liées à l’ingestion accidentelle d’eau de baignade survenues aux États-Unis étaient dues à des E. coli pathogènes(102). En 2001, quatre cas d’E. coli O157:H7 ont été déclarés à la Direction de santé publique de Montréal-Centre. Il s’agissait de quatre jeunes garçons, âgés entre 3 et 7 ans. Suite aux enquêtes épidémiologiques, l’eau de baignade à une plage 59 publique de la région de Montréal pouvait être le facteur d’exposition commun à tous les cas(104). VIII.2. Autres : La shigellose : en 1994, une épidémie de shigellose à Shigella sonnei de 59 cas liée à des baignades dans un lac de l’Ain dans la région de RHÔNE-ALPES en France s’est produite(105). La schistosomiase : en 1996, 54 cas de dermatite cercarienne dues au shistosoma sp. sont survenus dans la région du Québec, dont 52 cas élaborés lors de baignade dans des lacs, et 2 cas produits lors de baignade dans une plage publique(106). La cryptosporidiose : En 1988, 60 cas de cryptosporidiose furent rapportés dans le comté de Los Angeles(USA). Tous les individus infectés étaient nageurs et leur seul lien était l’utilisation d’une piscine contaminée par C.parvum(107). Entre 1983 et 2005, 149 épidémies de cryptosporidiose se sont enregistrées en Angleterre et Pays de Galles dont 43 sont dus au contamination de piscines(108). 60 IX. LA SURVEILLANCE DE LA QUALITE DES EAUX DE BAIGNADE AU MAROC : IX.1. Organisation des contrôles : La surveillance de la qualité des eaux de baignade est organisée conjointement par le Ministère de l’Équipement et des Transports (MET) et le Secrétariat d’État chargé de l’Eau et de l’Environnement (SEEE), selon les normes marocaines et internationales (OMS et PNUE). Sa mise en œuvre est réalisée par : le Laboratoire National de L’Environnement relevant du Secrétariat d’État chargé de l’Eau et de l’Environnement ; le Laboratoire Public d’Essais et d’Études (LPEE) par l’intermédiaire de l’unité mobile du Centre d’Études et de Recherche de l’Environnement et de la Pollution (CEREP) pour le compte du Ministère de l’Équipement et des Transports. En 2010, 129 plages (35 au niveau de la Méditerranée et 94 au niveau de l’Atlantique) réparties sur 23 wilayas et provinces ont fait l’objet de surveillance de la qualité microbiologique(2). Le nombre de plages objet du Programme national de surveillance évolue depuis plusieurs années. Il est passé de 50 en 1999 à 129 plages en 2010 comme le montre la figure 9. 61 140 129 114 120 100 100 79 80 60 79 79 79 86 92 93 50 40 20 0 Figure 9 : Evolution du nombre des plages au Maroc IX.2. Les procédures d’exécution des programmes : Les eaux de baignade des plages couvertes par le programme font l’objet de contrôle entre les mois, mai et septembre, avec une campagne de référence au mois de février. La fréquence des prélèvements est bimensuelle durant la saison balnéaire. Les sites de surveillance sont choisis en fonction de l’importance de leur fréquentation, de la nature des lieux (Relief, forme du rivage…) et des risques particuliers de pollution (rejet d’eaux usées…). 62 L’évaluation de la qualité des eaux porte sur la recherche des paramètres microbiologiques [coliformes fécaux (Escherichia coli) et streptocoques fécaux (entérocoques)] conformément à la norme nationale NM 03.7.200, aux normes internationales et directives de l’OMS/PNUE, applicables à la surveillance sanitaire des eaux de baignade. L’évaluation des résultats relatifs à la qualité des eaux de baignade est basée sur un traitement statistique des résultats issus des analyses microbiologiques. Cette évaluation conduit à une classification de la qualité des eaux selon la grille de la norme marocaine. Cette grille de qualité dresse les fourchettes de valeurs limites (guides et impératives) à prendre en considération (cf. tableau ci-dessous) : Tableau V : les nombres guides et les nombres impératifs selon la norme marocaine. Paramètres microbiologiques Valeurs guides (VG) par 100 ml valeurs impératives (VI) par 100 ml Coliformes fécaux 100 2000 Streptocoques fécaux 100 400 63 Pour le classement des eaux de baignade, quatre catégories (ou classes) sont distinguées, à savoir : Catégorie A : Eaux de bonne qualité pour la baignade Au moins 80 % des résultats en E.coli ou en coliformes fécaux sont inférieurs ou égaux au nombre guide (100/100 ml). Au moins 95 % des résultats en E.coli ou en coliformes fécaux sont inférieurs ou égaux au nombre impératif (2000/100ml). Au moins 90 % des résultats en streptocoques fécaux sont inférieurs ou égaux au nombre guide (100/100ml). Catégorie B : Eaux de qualité moyenne pour la baignade L’eau est de qualité moyenne lorsque le nombre impératif fixé par la directive pour les E.coli ou coliformes fécaux est respecté dans au moins 95 % des prélèvements (2000/100 ml), les conditions relatives aux nombres guides n’étant pas, en tout ou en partie vérifiées. Les eaux classées en catégorie 7 Les eaux classées en catégorie A ou B sont conformes à la norme 64 Catégorie C : Eaux momentanément polluées L’eau des points de surveillance pour lesquels la fréquence de dépassement du nombre impératif pour E.coli ou coliformes fécaux est comprise entre 5 % et 33,3 % est considérée comme pouvant être momentanément polluée. Cette pollution peut faire l’objet de mesures immédiates ou à moyen terme, permettant d’améliorer définitivement la qualité de l’eau. Il est important de noter que si moins de 20 prélèvements sont effectués pendant toute la saison sur un point, un seul dépassement du nombre impératif en E.coli ou coliformes fécaux, suffit pour entraîner le classement de la plage en catégorie C. Catégorie D : Eaux de mauvaise qualité Lorsque, pour le paramètre E.coli ou coliformes fécaux, les conditions relatives aux nombres impératifs sont dépassées au moins une fois sur trois, l’eau de baignade concernée est considérée comme de mauvaise qualité. Toutes les zones classées en catégorie D durant deux années de suite doivent être interdites à la baignade, sauf si des améliorations significatives apparaissent. Les eaux classées en catégorie C ou D ne sont pas conformes à la norme 65 IX.3. Qualité hygiénique des plages du Royaume : Saison 2009-2010 333 stations de prélèvements ont fait l’objet d’un nombre suffisant de prélèvements pour le classement et ont permis de déclarer 322 stations (soit 96,7 %) de qualité microbiologique conforme aux exigences réglementaires pour la baignade. La quasi-totalité des 11 stations (soit 3,3 %) déclarées non conformes pour la baignade de la saison 2009-2010 subit l’influence des rejets d’eaux usées ou connaît une forte concentration de baigneurs, conjuguées à l’insuffisance des infrastructures d’hygiène(2). 3,30% 96,50% Non conformes C et D Conformes A et B Figure 10 : Qualité hygiénique des plages au Maroc 2009-2010 66 80 70 60 50 Catégorie A 40 Catégorie B 30 Catégorie C 20 Catégorie D 10 0 Figure11 : Evolution de la qualité hygiénique des plages au Maroc 67 CONCLUSION ET RECOMMANDATIONS 68 Au terme de cette recherche, nous avons constaté que les sources de pollution des eaux de baignade sont nombreuses, dont les rejets des eaux usées (domestiques et industrielles) constituent la source la plus importante de la pollution des eaux de mer dans le monde, surtout dans les pays en développement. L’influence de ces pollutions se manifeste au niveau de la qualité microbiologique des eaux plus qu’au niveau de la qualité physicochimique. Ainsi que l’altération de la qualité microbiologique des eaux de baignade peut entrainer des risques non négligeables sur la santé humaine, ces risques se représentent principalement sous forme de gastro-entérites, dermatites, et infections des yeux et de la sphère O.R.L . Pour l’évaluation de la qualité de ces eaux, on utilise des germes indicateurs qui montrent l’existence d’une contamination par les matières fécales, dont E.coli reste le meilleur indicateur d’une contamination récente de l’eau par le matériel fécal, même que des études récentes proposent d’autres indicateurs comme les coliphages. L’évolution de la biologie moléculaire a permis d’apporter de nouvelles méthodes de détection de germes indicateurs qui sont plus spécifiques et rapides, mais ces méthodes sont chères. La qualité des eaux de baignade et globalement l’hygiène des plages s’est nettement améliorée au cours des cinq dernières années sur le littoral marocain, 69 certaines zones présentent encore une vulnérabilité due aux rejets directs et aux apports telluriques en particulier en temps de pluies. Une dynamique de refonte de la réglementation régissant la qualité des eaux de baignade est actuellement en marche en Europe, le Maroc suit également et progressivement cette dynamique. Afin de hausser davantage le niveau de gestion de la qualité des eaux de baignade et être proactif devant une éventuelle déviation de la qualité, il convient de mettre en place ce qui suit : • élaboration de profils de vulnérabilité des eaux de baignade (détermination des divers flux, hiérarchisation selon le degré d’impact, voies de transfert, fréquence d’apparition) ; • maîtrise des risques sanitaires en cas de dysfonctionnement de systèmes d’assainissement, fortes précipitations… en vue de prédire le rayon d’impact, sa durée et son moment d’apparition ; • activer la mise en place des stations d'épuration des eaux usées et des dispositifs d'assainissement nécessaires et adéquats, aussi bien pour les rejets solides que pour les rejets liquides, au niveau des villes côtières ; • mettre en place et appliquer les dispositifs législatifs et réglementaires nécessaires pour préserver le littoral, notamment par l'activation de la promulgation de la loi sur la protection du littoral, les normes de rejets liquides, etc. ; • veiller au respect des dispositions des textes réglementaires régissant le littoral, notamment celles relatives aux carrières et aux études d'impact sur l'environnement ; • créer une institution nationale chargée de l'aménagement des zones côtières ; 70 • doter les littoraux de schémas directeurs d'aménagement ; et les plages de plans d'aménagements d'infrastructures de loisirs, d'hygiène et de sécurité ; • renforcer le contrôle de l'exploitation illicite et anarchique du sable des dunes côtières ; • doter les ports en moyens de dépollution nécessaires ; • renforcer les plages en moyens matériels et humains pour la sécurité, l'hygiène et le nettoyage des plages ; • poursuivre les actions de sensibilisation de la population sur la qualité et la propreté des plages ; • utiliser les différents moyens de communication pour informer la population sur la qualité des plages ; • améliorer le cadre d'investissement sur le littoral en procédant à la mise en place des infrastructures de base et en améliorant la cadre de vie dans la zone littorale. Enfin, il faudrait arriver un jour à mettre en place un organisme autonome et efficace doté de moyens technique, financier et institutionnel capables de faire respecter la nature. 71 RESUMES Résumé Titre : LA QUALITE MICROBIOLOGIQUE DES EAUX DE BAIGNADE Auteur : EL ATTIFFI EL OUADRASSI ALI Mots clés : Eaux de baignade, Pollution, Risques sanitaires Les eaux de baignade constituent une part importante des loisirs actifs au monde. La qualité hygiénique de ces eaux est d’une importance capitale. Le risque sanitaire lié à la pollution des eaux de baignade est avant tous microbiologique. La transmission des microorganismes peut se faire par ingestion d’eau ou par contact direct avec la peau et les muqueuses. Principalement amenés par les rejets des eaux usées, les bactéries et les virus d’origine fécale sont les principaux microorganismes qui altèrent la qualité sanitaire des eaux de baignade. Le contrôle des eaux de baignade repose essentiellement sur la détection et l’énumération de bactéries indicatrices de risque fécale (les coliformes thérmotolérants, E. coli, entérocoques), et de certaines bactéries pathogènes (salmonelles). Ce contrôle est réalisé selon des méthodes classiques d’énumération après mise en culture sur milieu spécifique, et des méthodes enzymatiques pour E. coli .Par ailleurs, les progrès récents de la biologie moléculaire ont développé des techniques pour rechercher divers types de bactéries et virus tel que les entérovirus. Les eaux de baignade sont généralement classées en quatre catégories, dont les catégories A et B sont conformes, et les catégories C et D ne sont pas conformes à la norme. Summary Title: MICROBIOLOGICAL QUALITY OF BATHING WATER Author: EL ATTIFFI OUADRASSI ALI Keywords: Bathing Water, Pollution, Health Hazards Bathing waters are an important part in active leisure in the world. The hygienic quality of these waters is of paramount importance. The health risk associated with pollution of bathing water is above all microbiological. The transmission of microorganisms can be achieved by ingestion of water or by direct contact with skin and mucous membranes. Mainly brought about by discharges of sewage, bacteria and viruses of fecal origin are the main microorganisms that affect the sanitary quality of bathing water. Monitoring of bathing water is mainly based on the detection and enumeration of fecal indicator bacteria risk (thermotolerant coliforms, E. coli, enterococci), and certain pathogenic bacteria (Salmonella). This control is performed according to standard methods of enumeration after culturing in specific medium, and enzymatic methods for E. coli. In addition, recent advances in molecular biology have developed techniques to search for various types of bacteria and viruses such as enteroviruses. Bathing waters are usually classified into four categories, including Category A and B are consistent, and categories C and D are not compliant. ملخص العىوان :انجودة انًَكشوبَونوجَت نًَبه انسببحت الكاحب :انعطَفٌ انودساسٌ عهٌ الكلماث الزئيسيت :يَبه انسببحت ،انخهود ,انًخبطش انصحَت يَبه االسخحًبو حشكم جضءا هبيب فٌ أولبث انفشاغ و األنشطت فٌ انعبنى .نوعَت هزه انًَبه انصحَت حشكم أهًَت لصوى. انًخبطش انصحَت انًشحبطت بخهود يَبه انسببحت هٌ لبم كم شٌء يَكشوبَونوجَت .وًٍكن ححمَك انخمبل انًَكشوببث عن طشٍك انفى ين انًبء أو عن طشٍك االحصبل انًببشش يع انجهذ واألغشَت انًخبطَت. جهبج أسبسب ين لبم عن حصشٍف يَبه انصشف انصحٌ ،انبكخَشٍب وانفَشوسبث ين اصم بشاصً هٌ انكبئنبث انذلَمت انشئَسَت انخٌ حؤرش عهي نوعَت يَبه انسببحت. وحسخنذ أسبسب يشالبت يَبه انسببحت عهي انكشف وحعذاد بكخَشٍب انبشاص يؤششة (انمونونَبث انًخحًهت نهحشاسة ،كوالً ،انًعوٍت) ،وانبكخَشٍب انًسببت نأليشاض (انسبنًونَال)ٍ .خى حنفَز هزه انشلببت وفمب نهطشق انكالسَكَت و انعذ بعذ صسع فٌ وسط يعَن ،وانطشق األنضًٍَت نهمونونَت . إضبفت ,انخطوساث انحذٍزت فٌ يجبل انبَونوجَب انجضٍئَت وضعج حمنَبث يخمذيت نهبحذ عن يخخهف أنواع انبكخَشٍب وانفَشوسبث يزم انفَشوسبث انًعوٍت. وعبدة يب حصنف يَبه انسببحت فٌ أسبع فئبث ،بًب فٌ رنك انفئت Aو Bيخنبسمت ،وفئبث Cو D نَسج يخوافمت. ANNEXES Annexe 1(16) : Liste de quelques pathogènes des eaux usées et leurs symptômes Bactéries Enterococcus faecalis Salmonella Shigella Enterobacter Yersinia enterocolitica Legionella Escherichia Coli (certaines souches) Campylobacter jejuni Staphylococcus Pseudomonas aeruginosa Virus Entérovirus : -Coxsackievirus A et B -Echovirus -Poliovirus Virus de Norwalk Virus de l’hépatite A Virus de l’hépatite E Rotavirus Reovirus Caicivirus Coronavirus Adénovirus Protozoaires Giardia lamblia Cryptosporidium parvum Toxoplasma Microsporidium la résistance à presque tous les antibiotiques Gastro-entérites, autres infections Typhoïde, gastro-entérites et septicémie Diarrhées Cystites, pleurésies, méningites Diarrhée Pneumonie, autres maladies respiratoires Diarrhée Gastro-entérites , diarrhées (l’infection entérique bactérienne la plus répandue en Amérique du Nord) Affections cutanées et sous cutanées Infections ORL, septicémies Méningite, conjonctivite, péricardite, myocardite, diarrhée, encéphalite Méningite, conjonctivite, péricardite, myocardite, diarrhée, encéphalite Paralysie, méningite, fièvres violente gastro-entérite qui dure de 24 à 48 heures hépatite A Hépatite E Gastro-entérites Maladie respiratoire, entérite Diarrhée Gastro-entérites Infections respiratoires, infections conjonctivales Douleurs abdominales, diarrhée (la giardiase est maintenant l’infection humaine entérique non bactérienne ayant la plus forte incidence) Diarrhées accompagnées de douleurs abdominales, de vomissement et de fièvre Toxoplasmose Diarrhée Helminthes Taenia Ascaris Diarrhée, douleur musculaire Troubles digestifs Annexe 2 : Principaux groupes et genres d’agents pathogènes responsables de maladies d’origine hydrique(17). Groupes de micro-organismes Virus Bactéries Protozoaires Pathogènes Pathologies Méningite, paralysie, fièvres, Entérovirus (polio, écho, coxsackie myocardie, problèmes respiratoires et diarrhée Hépatite A et E Infections hépatiques Norovirus Diarrhée / gastro-entérite Sapporovirus Diarrhée / gastro-entérite Rotavirus Diarrhée / gastro-entérite Astrovirus Diarrhée Diarrhée, infections oculaires et Adenovirus problèmes respiratoires Reovirus Problèmes respiratoires et entériques Salmonella Fièvre typhoïde et diarrhée Shigelia Diarrhée Diarrhée (cause première des Campylobacter intoxications alimentaires) Yersinia enterolitica Diarrhée Escherichia coli O157 :H7 et certaines Diarrhée risque de complications autres souches (urémie hémolytique) chez les enfants Legionella pneumophila Pneumonie et autres infections Respiratoires Naegleria Méningo-encéphalite Entomoeba histolytica Dysenterie amibienne Giardia lamblia Diarrhée chronique Cryptosporidium parvum Diarrhée sévère, mortelle chez les individus immunodéprimés Cyclospora Diarrhée Microsporidies incluant Entercytozoan Diarrhées chroniques, affaiblissement, spp., Encephalitozoan spp., Septata problèmes pulmonaires, oculaires, spp., Pleistophora spp., Nosema spp musculaires et rénaux Microcystis Cyanobact éries Anabaena Aphanizomenon Dinophysis Phytoplancton toxique Helminthes Alexandrium Ascaris lumbricoides Diarrhée par ingestion des toxines produites par ces organismes (la toxine microcystine est impliquée dans des Pathologies neurologiques liées à l’ingestion de neurotoxines Pathologies neurologiques liées à l’ingestion de neurotoxines Intoxications diarrhéiques Pathologies neurologiques liées à l’ingestion de neurotoxines Ascariasis BIBLIOGRAPHIE 1. 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Serment de Galien Je jure en présence des maîtres de cette faculté : - D’honorer ceux qui m’ont instruit dans les préceptes de mon art et de leur témoigner ma reconnaisse en restant fidèle à leur renseignement. - D’exercer ma profession avec conscience, dans l’intérêt de la santé public, sans jamais oublier ma responsabilité et mes devoirs envers le malade et sa dignité humain. - D’être fidèle dans l’exercice de la pharmacie à la législation en vigueur, aux règles de l’honneur, de la probité et du désintéressement. - De ne dévoiler à personne les secrets qui m’auraient été confiés ou dont j’aurais eu connaissance dans l’exercice de ma profession, de ne jamais consentir à utiliser mes connaissances et mon état pour corrompre les mœurs et favoriser les actes criminels. - Que les hommes m’accordent leur estime si je suis fidèle à mes promesses, que je sois méprisé de mes confrères si je manquais à mes engagements. - أن أراقب هللا فً مهنتً أن أبجل أساتذتً الذٌن تعلمت على أٌدٌهم مبادئ مهنتً وأعترف لهم بالجمٌل وأبقى دوما وفٌا لتعالٌمهم. أن أزاول مهنتً بوازع من ضمٌري لما فٌه صالح الصحة العمومٌة ،وأن ال أقصر أبدا فً مسؤولٌتً وواجباتً تجاه المرٌض وكرامته اإلنسانٌة. أن ألتزم أثناء ممارستً للصٌدلة بالقوانٌن المعمول بها وبأدب السلوك والشرف ،وكذا باالستقامة والترفع. أن ال أفشً األسرار التً قد تعهد إلى أو التً قد أطلع علٌها أثناء القٌام بمهامً ،وأن ال أوافق على استعمال معلوماتً إلفساد األخالق أو تشجٌع األعمال اإلجرامٌة. ألحضى بتقدٌر الناس إن أنا تقٌدت بعهودي ،أو أحتقر من طرف زمالئً إن أنا لم أف بالتزاماتً. شهٌد" "وهللا على ما أقول جامعة محمد الخامس كلية الطب والصيدلة بالرباط أطروحة رقم 100 : سىـت 20114 الجودة الميكروبيولوجية لمياه السباحة أطزوحت قذمج وووقشج عالويت يوم ........................4 مه طزف السيد :العطيفي الودراسي علي المشداد في 1321/00/22بالقصز الكبيز. لـنـيـل شـهـادة الـدكـتـوراه فــي الصيدلة الكلماث األساسيت :مياه السباحة – التلوث – المخاطر الصحية. ححج إشزاف اللجىت المكووت مه األساحذة السيذ 4أحمذ كاوسي أسخبر فٌ طب األطفبل السيذ 4ميمون سهذي أسخبر فٌ عهى األحَبء انذلَمت السيذة 4سكيىت الحمشاوي أسخبرة فٌ عهى األحَبء انذلَمت السيذة 4سارة عوفي أسخبرة يبشصة فٌ عهى انطفَهَبث رئيس مشزف أعضاء