biochimie partie ii

B
Bi io oc ch hi im mi ie e
P
Pa ar rt ti ie e I II I

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CHAPITRE 1: BIOLOGIE MOLÉCULAIRE ................................................................... - 4 -
1.1. CYCLE DE LA REPLICATION ET REPARATION : .............................................................. - 4 -
1.1.1. MISMATCH REPAIR :........................................................................................................ - 4 -
1.1.2. REPARATION DE LESION INDUITE PAR LES UV : ............................................................ - 5 -
1.1.3. BASE EXCISION REPAIR : .................................................................................................. - 5 -
1.1.4. REPARATION DE LESION SUR LES 2 BRINS : .................................................................... - 5 -
1.2. LE GENE : ......................................................................................................................... - 5 -
1.2.1. REGULATION DE LA TRANSCRIPTION : ........................................................................... - 6 -
1.2.2. MATURATION ARN PRIMAIRE : ..................................................................................... - 7 -
1.2.3. TRADUCTION : ................................................................................................................ - 7 -
1.2.4. MUTATIONS : .................................................................................................................. - 8 -
1.3. TRANSMISSION SIGNAUX : ............................................................................................... - 9 -
1.3.1. VOIES DE TRANSMISSION D’INFORMATION CHIMIQUE : ................................................. - 9 -
1.3.2. RECEPTEURS ENDOCRINES ET PARACRINES : ............................................................... - 10 -
1.4. BIOCHIMIE DU CANCER : ............................................................................................... - 13 -
1.4.1. ACTIVITE CONSTITUTIVE DE LA VOIE DE SIGNALISATION : .......................................... - 13 -
1.4.2. INSENSIBILITE AU FREIN : ............................................................................................. - 13 -
1.4.3. PERTE DE L’APOPTOSE : ............................................................................................... - 14 -
1.4.4. ANGIOGENESE : ............................................................................................................ - 14 -
1.4.5. POTENTIEL DE REPLICATION ILLIMITE : ....................................................................... - 14 -
CHAPITRE 2: GLOBULE ROUGE : ................................................................................ - 16 -
2.1. GENERALITES : .............................................................................................................. - 16 -
2.1.1. SANG : .......................................................................................................................... - 16 -
2.1.2. GLOBULE ROUGE : ........................................................................................................ - 16 -
2.2. HB: .................................................................................................................................. - 16 -
2.2.1. TYPES D’HB : ................................................................................................................ - 16 -
2.2.2. GENETIQUE DES GLOBINES : ......................................................................................... - 16 -
2.2.3. TRANSPORT O2 : .......................................................................................................... - 17 -
2.2.4. TRANSITION ALLOSTERIQUE : ...................................................................................... - 17 -
2.2.5. MYOGLOBINE : ............................................................................................................. - 17 -
2.2.6. CONTROLE ALLOSTERIQUE DU TRANSPORT D’O2 : ...................................................... - 18 -
2.2.7. HB FŒTALE : ................................................................................................................. - 19 -
2.2.8. PATHOLOGIES : HB ANORMALE : ................................................................................. - 19 -
2.3. METABOLISME DU FER : ................................................................................................ - 20 -
2.3.1. REPARTITION : .............................................................................................................. - 20 -
2.3.2. ABSORPTION :............................................................................................................... - 21 -
2.3.3. TRANSPORT : ................................................................................................................ - 21 -
2.3.4. STOCKAGE : .................................................................................................................. - 21 -
2.3.5. SYSTEME RETICULO-ENDOTHELIAL : ........................................................................... - 22 -
2.3.6. REGULATION UTILISATION CELLULAIRE : .................................................................... - 22 -
2.3.7. REGULATION UTILISATION ORGANISME :..................................................................... - 23 -
2.3.8. EXCRETION : ................................................................................................................. - 23 -
2.3.9. PATHOLOGIES : ............................................................................................................. - 23 -

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2.4. METABOLISME DE L’HEME : ......................................................................................... - 24 -
2.4.1. SYNTHESE HEME .......................................................................................................... - 24 -
2.4.2. PATHOLOGIES : ............................................................................................................. - 25 -
2.4.3. CATABOLISME DE L’HEME : ......................................................................................... - 25 -
2.4.4. BILIRUBINE ................................................................................................................... - 25 -
CHAPITRE 3: COAGULATION : .................................................................................... - 29 -
3.1. FORMATION DU CLOU PLAQUETTAIRE : ...................................................................... - 29 -
3.1.1. ADHESION : .................................................................................................................. - 29 -
3.1.2. ACTIVATION PLAQUETTE : ........................................................................................... - 29 -
3.2. COAGULATION : ............................................................................................................. - 29 -
3.2.1. FACTEURS DE COAGULATION : ..................................................................................... - 30 -
3.2.2. VOIE EXTRINSÈQUE : .................................................................................................... - 30 -
3.2.3. VOIE INTRINSEQUE: ...................................................................................................... - 30 -
3.2.4. DOMAINE GLA :............................................................................................................ - 31 -
3.3. TRANSFORMATION FIBRINOGENE EN FIBRINE : .......................................................... - 31 -
3.4. CONTROLE COAGULATION : ......................................................................................... - 32 -
3.5. FIBRINOLYSE : ............................................................................................................... - 32 -
3.6. ANTICOAGULANTS : ....................................................................................................... - 33 -
3.7. PATHOLOGIE :................................................................................................................ - 33 -
3.7.1. CIVD (COAGULATION INTRAVEINEUSE DISSEMINEE) : .............................................. - 33 -
3.7.2. AUTRES : ...................................................................................................................... - 33 -
CHAPITRE 4: PROTEINES PLASMATIQUES : ........................................................... - 34 -
4.1. GENERALITES : .............................................................................................................. - 34 -
4.1.1. ALBUMINE : .................................................................................................................. - 34 -
4.1.2. Α1-ANTITRYPSINE : ...................................................................................................... - 34 -
4.1.3. RENOUVELLEMENT DES PROTEINES PLASMATIQUES : ................................................. - 35 -
4.2. LIPOPROTEINES PLASMATIQUES .................................................................................. - 35 -
4.2.1. COMPOSITION : ............................................................................................................. - 35 -
4.2.2. CHYLOMICRONS : ......................................................................................................... - 35 -
4.2.3. VLDL (« VERY LOW DENSITY LIPOPROTEIN »): ............................................................ - 36 -
4.2.4. LDL : ............................................................................................................................ - 37 -
4.2.5. HDL : ........................................................................................................................... - 38 -
4.2.6. PATHOLOGIES : ............................................................................................................. - 38 -

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Chapitre 1: Biologie moléculaire
ADN : 2 hélices anti-parallèles et complémentaire (A-T, C-G), toujours sous forme de
chromatine dans les cellules eucaryotes (entourées autours du nucléosome)
NB : ARN  ADN par transcription inverse (virus)
1.1. Cycle de la réplication et réparation :
Mécanisme semi-conservatif
1.1.1. mismatch repair :
Certaines pathologies sont dues à des erreurs de réplication (« mismatch »), pour les
éviter, on a des mécanismes de réparation (« mismatch repair »)
1. Si mauvais appariement  reconnaissance du bon brin grâce aux méthylations
(se font un peu après la réplication)
2. réparation :
a. clivage par une endonucléase
b. excision mauvaise base
c. correction par la polymérase
d. liaison des brins par ligase

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- Pathologies: certains types de cancer (cancer du colon non-polypeux,…), <
déficience d’une enzyme du mismatch repair
1.1.2. Réparation de lésion induite par les UV :
- UV  dimère de thymine (après la réplication)  mauvais appariement des bases
complémentaire (A).
- Correction : par excinucléase  excise puis remplace les T. Après, une ligase
relie les brins
- Pathologies : xérodermie pigmentée (< déficience excinucléase)
1.1.3. Base excision repair :
Certaines bases peuvent s’altérer spontanément ou après exposition à des agents
chimiques (déamination C  U)  réparation par base excision repair
1.1.4. Réparation de lésion sur les 2 brins :
- Lésion souvent par clivage  réparation en soudant les 2 brins
- Pathologies : certains cancers et immunodéficience
1.2. Le gène :