dépistage - Ministère de l`éducation nationale

éduSCOL
Chimie – biochimie – sciences du vivant
Classe terminale
Ressources pour le lycée technologique
Dépistage d’allèles mutés avec des enzymes de restriction
Fiche de présentation
Thème 4 du programme
Les systèmes vivants contiennent, échangent et utilisent de l’information génétique
Sous-thème
4.6. L’ADN est un objet des biotechnologies
Extrait du BOEN
Connaissances
Des recherches en thérapie génique explorent
des pistes pour soigner les maladies génétiques.
capacités
• Exploiter des ressources documentaires
Compétences transversales et attitudes
• Mobiliser ses connaissances
• Rechercher, extraire, organiser des informations utiles (le BO précise l'information utile)
• Formuler des hypothèses
• Raisonner, argumenter, démontrer
Mots clés de recherche : enzyme de restriction, maladie génétique, thérapie génique, biotechnologie,
dépistage génétique
Provenance : Académie de Lille
Adresse du site académique : www.ac-lille.fr
Ministère de l’éducation nationale (IGEN - DGESCO)
Dépistage d’allèles mutés avec des enzymes de restriction
http://eduscol.education.fr/CBSV
Janvier 2013
Introduction
On travaille dans l’exemple suivant sur le gène de la béta-globine et de son allèle à l’origine
de la drépanocytose.
L’activité se réalise avec Anagène ou Géniegen.
Les fichiers utilisés sont betacod.adn (allèle sauvage) et drepcod.adn (allèle muté récessif à
l’origine de la drépanocytose).
1-Principe des enzymes de restriction.
Ce sont des enzymes spécifiques de courtes séquences d’ADN, parfois palindromiques.
Leur action est de couper entre deux nucléotides. Les sites de coupures sont appelés « sites
de restriction »
2-Principe du dépistage d’un allèle muté.
L’apparition d’une mutation peut être à l’origine de l’apparition ou de la disparition d’un ou
plusieurs sites de restriction. En faisant migrer les fragments d’ADN obtenus après
intervention d‘une enzyme de restriction, par électrophorèse, il est possible de déterminer le
nombre de fragments et leur taille.
3-Recherche d’une enzyme de restriction permettant de dépister l’allèle muté du
gène de la bêta-globine.
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Avec Anagène ou Géniegen, ouvrir les deux séquences betacod et drepcod.adn,
présentes dans la banque de séquence.
Réaliser une comparaison simple pour localiser la mutation :
Sélectionner les deux séquences puis faire un « traitement enzymatique ». La
banque d’enzyme de restriction s’affiche :
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Dépistage d’allèles mutés avec des enzymes de restriction
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Sélectionner une représentation sous forme de graphique et de tableau. Choisir une
catégorie d’enzyme en fonction du nombre de bases du site de restriction,
sélectionner toutes les enzymes et les ajouter dans la fenêtre de sélection. Enfin,
valider.
Un tableau s’affiche indiquant le nombre de sites de restriction pour chacune des
enzymes au niveau des deux allèles :
Repérer la ou les enzymes où le nombre de site de restriction est différent (dans cet exemple : Mnl1).
S’il n’y en a pas, choisir une autre catégorie d’enzyme.
Une comparaison du site de restriction au niveau de la mutation permet de vérifier que le site
manquant est bien dû à la substitution du 20ème nucléotide :
Ministère de l’éducation nationale (IGEN - DGESCO)
Dépistage d’allèles mutés avec des enzymes de restriction
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