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Int-Ccl : L’immersion induit l’expression des gènes du locus Sub1, qui dans la lignée tolérante, cessent de s’exprimer
au bout d’une semaine et ne s’expriment plus au retour à l’air libre.
Hyp : Le gène Sub1A semble nécessaire et suffisant ( ?) à la résistance à l’immersion. Les modifications relevées
dans l’expression des deux autres gènes lorsque Sub1A est présent suggèrent en outre que Sub1A pourrait contrôler
(limiter) l’expression de Sub1B et Sub1C.
Critique : Chez Nipponbare, Sub1C n’est pas exprimé à 1R mais est de nouveau exprimé à 3R…
Question – transition : On peut alors se demander quels seraient les effets de l’insertion de Sub1A dans le génome
d’une variété de riz intolérante à l’immersion.
2 : Introduction d’un gène de résistance à l’immersion dans un cultivar intolérant
Obj – Pcp : Afin de tester les effets de l’insertion du gène Sub1A dans une plante sensible à l’immersion, on soumet
cette plante, ainsi qu’une plante tolérante, à une immersion de plusieurs jours puis on compare leur morphologie.
An : - Après 7 jours d’immersion suivis de 7 jours hors de l’eau, le cultivar M202(Sub1) présente des feuilles dressées,
son aspect semble normal ; le cultivar M202 présente en revanche des feuilles amollies (et moins vertes), de plus
grande taille que le cultivar M202(Sub1).
- Après 14 jours d’immersion suivis de 7 jours hors de l’eau, le cultivar M202(Sub1) présente là encore des feuilles
dressées ; le cultivar M202 a des feuilles rabougries, dont la longueur est encore plus grande (elles sont « étiolées »).
Int-Ccl : Plus l’immersion est prolongée, plus l’effet est délétère sur le cultivar M202 : son port est affecté. La
résistance à l’immersion du cultivar M202(Sub1) se manifeste par une moindre croissance et la conservation d’un port
dressé. Sub1A confère donc une tolérance à l’immersion.
3 : Tolérance à l’immersion chez le riz non flottant et expression des gènes SLR
3.A Niveau d’expression de SLR1 et SLRL1 chez M202 (sensible) et M202(Sub1) (résistant)
Obj – Pcp : Montrer le lien entre l’expression de Sub1A et l’expression de gènes codant des facteurs de transcription
inhibant la synthèse d’AG (hormone végétale stimulant la croissance) en comparant l’expression de ces gènes chez
des cultivars intolérants M202 et tolérants M202(Sub1) soumis à une immersion.
An : Le taux d’actine est constant, c’est le témoin de charge des différents puits.
Les deux facteurs de transcription sont produits dans les deux cultivars, avant
l’immersion mais cette expression est plus intense chez M202(Sub1), en
particulier à 14 j d’immersion pour SLR1.
Int-Ccl : L’expression de Sub1A entraîne celle de SLR1 et SLRL1, donc la
synthèse de facteurs de transcription inhibant des gènes impliqués dans la voie
de synthèse d’AG. Par conséquent, la croissance de la plante est limitée chez le
cultivar M202(Sub1) résistant à l’immersion.
3.B Effets de l’éthylène sur l’expression de Sub1A, SLR1, SLRL1 chez M202 et M202(Sub1)
Obj – Pcp : Comparer l’effet de l’éthylène, produit naturellement lors de l’immersion, sur l’expression de Sub1A, SLR1
et SLRL1 chez le cultivar intolérant et le cultivar tolérant à l’immersion.
An : - L’expression de Sub1A chez M202(Sub1) est stimulée
par l’éthylène (pas chez M202 qui ne le possède pas).
- SLR1 et SLRL1 s’expriment davantage chez M202(Sub1)
que chez M202 en présence d’éthylène.
- Chez M202, cette expression n’est pas modifiée en présence
d’éthylène.
Int-Ccl : L’éthylène n’agit pas directement sur l’expression de
SLR1 et SLRL1, il agit sur l’expression de Sub1A qui à son
tour stimule l’expression de SLR1 et SLRL1.
3.C Action combinée de acide gibbérellique, ACC (précurseur d’éthylène) et Sub1A sur la croissance
Obj – Pcp : Comparer l’action combinée de l’AG et de l’éthylène sur la
croissance des plants de riz possédant ou non le gène Sub1A.
An : - Dans toutes les conditions, l’accroissement de taille augmente avec la
concentration en acide gibbérellique.
- En l’absence d’ACC donc d’éthylène (action de l’AG seul), l’accroissement
de taille n’est pas significativement différent entre les deux cultivars
- En présence d’ACC donc d’éthylène, M202 a un accroissement supérieur
à M202(Sub1) (3,2 cm en 5 jours au lieu de 2,3 cm).