Tumeurs solides

Contacts
Département de Biopathologie
Secteur d’Anatomopathologie
Dr Michèle CHEVALLIER Secrétariat
Dr Françoise GERARD Tél. : [phone] / 22
Dr Monique NEYRA Fax : [phone]
Secteur de Cytogénétique Moléculaire
Dr Benoît QUILICHINI Secrétariat
Dr Francine MUGNERET Tél. : [phone] / 10 07
Fax : [phone] / 10 08
Secteur d’Oncologie Moléculaire
Dr Martine BECKER Secrétariat
Saïd EL MOUATASSIM, PhD Tél. : [phone] / 10 07
Fax : [phone]
Biomnis
www.biomnis.com
19 av. Tony Garnier - 69007 LYON - Tél. : [phone]
78 av. de Verdun 94200 IVRY-SUR-SEINE - Tél : [phone]
Prise en charge génétique
des
tumeurs
solides
DS5-JANVIER 2015
Conditions de prélèvement et délai
Cytogénétique moléculaire
Hybridation in situ en fluorescence (FISH)
Nous faire parvenir :
un bloc de tissu tumoral inclus en paraffine (fixateur : Formol
ou AFA – pas de Bouin) – les coupes tissulaires seront réalisées
au laboratoire biomnis et le bloc tumoral sera retourné après
analyse.
OU
5 coupes (4 à 5 μm) réalisées par vos soins à partir du bloc
inclus en paraffine.
5 coupes (4 à 5 μm) réalisées par vos soins à partir du tissu
congelé.
Joindre impérativement le compte rendu histologique.
Délai : 1 semaine.
Prix : B500 par sonde.
Biologie moléculaire
Nous faire parvenir :
un bloc de tissu tumoral inclus en paraffine (fixateur : Formol
ou AFA – pas de Bouin) – les coupes tissulaires seront réalisées
au laboratoire biomnis et le bloc tumoral sera retourné après
analyse.
OU
5 coupes (10 μm) réalisées par vos soins à partir du bloc inclus
en paraffine.
5 coupes (10 μm) réalisées par vos soins à partir du tissu congelé.
Joindre impérativement le compte rendu histologique.
Délai : 10 jours.
Prix : BHN - nous consulter.
*NOTE
Pour l’analyse PCA3, se référer à la plaquette
“PCA3” pour les conditions de prélèvement.
Pour l’analyse Septine 9 : un tube EDTA
(sang périphérique). Acheminement maximum 24h.
Pour les analyses BCR-ABL qualitatif,JAK2 et MPL : un
tube EDTA (sang périphérique).
Pour l’analyse BCR-ABL quantitatif : un tube PAXgene
(sang périphérique).
Pour l’analyse BRCA1 et BRCA2 : tests en projet (2015)
Le point sur...

Amplification HER2
Mutations BRCA1 et 2*
Réarrangement IgH@
t(11 ;14) IgH@-CCND1
t(14 ;18) IgH@-BCL2
Réarrangement C MYC
Réarrangement MALT
Réarrangement BCL6
Réarrangement ALK
Amplification N-MYC
Délétion 1p36
Détermination de la ploïdie
FISH Biologie Moléculaire À VENIR :
GLIOME : - Délétion combinée 1p36/19q13
GLIOBLASTOME : - Détermination de la ploïdie
(chromosomes 7 et 10)
- Amplification EGFR
- Méthylation MGMT
MÉNINGIOME : - Délétion 1p36
- Détermination de la ploïdie
(chromosomes 14 et 22)
- Délétion p16
MÉDULLOBLASTOME : Amplification N-MYC et C-MYC
Expression PCA3*
Détermination de la ploïdie
(chromosomes 7, 17 et Y)
Détermination de la ploïdie
(chromosomes 3, 7 et 17)
SARCOME D’EWING ET PPNET : réarrangement EWS
LIPOSARCOME BIEN DIFFÉRENCIÉ ET DÉDIFFÉRENCIÉ :
amplification MDM2
LIPOSARCOME MYXOÏDE : réarrangement CHOP – réarrangement FUS
SYNOVIALOSARCOME : réarrangement SYT
RHABDOMYOSARCOME ALVÉOLAIRE : réarrangement FKHR
TUMEUR MYOFIBROBLASTIQUE INFLAMMATOIRE :
réarrangement ALK
SMP : BCR-ABL
Mutations NRAS
Mutations KRAS
SMP : BCR-ABL qualitatif et quantitatif*
JAK2 V617F*
JAK2 exon12*
MPL*
Mutations BRAF
Instabilité des microsatellites (MSI)
Septine 9*
Méthylation MLH1
Mutations BRAF
Amplification HER2
Mélanome
Cancer de la prostate
Cancer du rein
Cancer de l’ovaire
Cancer de la vessie
Réarrangement ALK
Mutations EGFR
Mutations KRAS
Tumeur
cérébrale
Cancer du poumon
non à petites
celules
Lymphome
Cancer du sein
invasif
Cancer de
l’estomac
GIST Tumeur
GastroIntestinale
Cancer
colo-rectal
Neuroblastome
Biopsie ostéo-
medullaire
Mutations C-KIT
Mutations PDGFRα
Analyse pangénomique des tumeurs solides par SNP Array (se référer
à la plaquette SNP Array disponible sur notre site : www.biomnis.com)
Tumeurs des
tissus mous
Mutations BRCA1 et 2*