Table des matières

Bulletin de la veille épidémiologique internationale de l’ONMNE – mois de décembre 2012-
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Table des matières
GRIPPE ............................................................................................................................................. 5
DÉRIVE ANTIGÉNIQUE DU VIRUS DE LA GRIPPE AVIAIRE HUMAINE EN ÉGYPTE ..................................... 5
GRIPPE AVIAIRE A (H7N7) HAUTEMENT PATHOGÈNE, EN 2003 AUX PAYS-BAS : PROPAGATION À
MÉDIATION ÉOLIENNE. ................................................................................................................... 5
GRIPPE (H3N2): UN CHANGEMENT DANS L’AFFINITÉ POUR LE RÉCEPTEUR .......................................... 7
GRIPPE: EUROPE ............................................................................................................................ 9
GRIPPE AH1N1 PDM 2009 DANS LES TERRITOIRES PALESTINIENS ...................................................... 11
CAS HUMAINS DE GRIPPE AVIAIRE, (H5N1): NOMBRE DE CAS EN 2012 .............................................. 12
GRIPPE AUX USA, DÉBUT PRÉCOCE ............................................................................................... 14
NOUVEAU CORONAVIRUS ................................................................................................................ 16
NOUVEAU CORONAVIRUS EN EST-MÉDITERRANÉE : PROPOSITIONS POUR UN PROGRAMME DE
RECHERCHE, « INTERNATIONAL SEVERE ACUTE RESPIRATORY AND EMERGING INFECTION
CONSORTIUM » (ISARIC) ............................................................................................................... 16
NOUVEAU CORONAVIRUS EST-MÉDITERRANÉE : CARACTÉRISATION DU RÉCEPTEUR ........................... 21
NOUVEAU CORONAVIRUS - EST-MÉDITERRANÉE - OMS, VOIES DE TRANSMISSION, JORDANIE ............. 23
NOUVEAU CORONAVIRUS - MÉDITERRANÉE ORIENTALE: COMMENTAIRES ........................................ 27
DIAGNOSTIC DU NOUVEAU CORONAVIRUS ..................................................................................... 29
CAPACITÉS DES LABORATOIRES POUR LA DÉTECTION MOLÉCULAIRE ET LA CONFIRMATION DU
NOUVEAU CORONAVIRUS EN EUROPE, NOVEMBRE 2012 ............................................................. 29
Les analyses de confirmation en laboratoire des infections par le nouveaux coronavirus humain (hCoV-
CEM) ....................................................................................................................................... 30
FIÈVRE JAUNE ................................................................................................................................. 31
FIÈVRE JAUNE EN RÉPUBLIQUE DU CONGO (OUEST) (MANIEMA) – MISE À JOUR OMS AU 12/12/2012 .. 31
FIÈVRE JAUNE AU DARFOUR (SOUDAN) ......................................................................................... 33
LES RESTRICTIONS CHINOISES .................................................................................................... 33

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LES CARTES DE VACCINATION AU DARFOUR ................................................................................ 33
LES MINEURS DU DARFOUR ....................................................................................................... 35
DARFOUR- OUEST ..................................................................................................................... 35
NOUVEAUX CAS ....................................................................................................................... 36
L’ASSISTANCE ET LE SOUTIEN DE LA MINUAD .............................................................................. 38
L’ÉPIDÉMIE DE FIÈVRE JAUNE TUE 164 PERSONNES AU DARFOUR .................................................. 39
SITUATION DE LA FIÈVRE JAUNE DANS LES DIFFÉRENTS ÉTATS DU DARFOUR .................................. 40
FIÈVRE JAUNE AU DARFOUR : BULLETIN OMS AU 6 DÉCEMBRE 2012 .............................................. 41
LA FIÈVRE JAUNE SE PROPAGE AU DARFOUR: PLUS DE FONDS SONT NÉCESSAIRES POUR DES VACCINS
SUPPLÉMENTAIRES ................................................................................................................... 42
UNE GRAVE ÉPIDÉMIE DE FIÈVRE JAUNE AU DARFOUR À L’OUEST DU SOUDAN............................... 43
SOUDAN: LA PIRE ÉPIDÉMIE DE FIÈVRE JAUNE EN AFRIQUE DEPUIS 1990 (1) ................................... 44
SOUDAN: LA PIRE ÉPIDÉMIE DE FIÈVRE JAUNE EN AFRIQUE DEPUIS 1990 (2) ................................... 45
CAMPAGNE DE VACCINATION CONTRE LA FIÈVRE JAUNE AU DARFOUR .......................................... 46
DEUX NOUVEAUX CAS DE FIÈVRE JAUNE, PROVENANT DU DARFOUR NORD, AU DARFOUR CENTRAL 48
LA LIGUE ARABE S'ENGAGE À FOURNIR LES VACCINS CONTRE LA FIÈVRE JAUNE .............................. 48
FIÈVRE JAUNE AU DARFOUR NORD ............................................................................................. 49
FIÈVRE JAUNE AU DARFOUR AU 18/12/2012 ............................................................................... 50
FIÈVRE JAUNE DARFOUR CENTRAL, DARFOUR SUD ....................................................................... 51
LETTRE PROMED : FIÈVRE JAUNE AU SOUDAN, INQUIÉTUDES EN CHINE ? ...................................... 52
FIÈVRE JAUNE AU DARFOUR NORD ............................................................................................. 53
FIÈVRE JAUNE AU DARFOUR CENTRAL, DARFOUR OUEST ET DARFOUR SUD .................................... 55
POLIOMYÉLITE ................................................................................................................................ 56
CIRCULATION DU POLIOVIRUS VACCIN DÉRIVÉ TYPE 2 AU PAKISTAN ET EN AFGHANISTAN, .................. 56
Pakistan: Une épidémie de polio (cVDPV2) au Baloutchistan tire la sonnette d'alarme ..................... 56

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Une nouvelle souche du virus polio (cVDPV2) venant du Pakistan frappe l’Afghanistan .................... 59
NOROVIRUS .................................................................................................................................... 60
DÉCÈS PAR NOROVIRUS À OSAKA AU JAPON .................................................................................. 60
DÉCÈS NOSOCOMIAUX PAR NOROVIRUS AU JAPON (MIYAZAKI) ...................................................... 62
UNE ÉPIDÉMIE DE NOROVIRUS TUE 6 PERSONNES AU JAPON .......................................................... 62
CAS ET DÉCÈS NOSOCOMIAUX PAR INFECTIONS À NOROVIRUS À KANAGAWA & GUNMA AU JAPON .... 63
ACTIVITÉ ACCRUE DU NOROVIRUS AU ROYAUME-UNI (ANGLETERRE, PAYS DE GALLES) ..................... 64
CHOLÉRA ........................................................................................................................................ 67
CHOLÉRA, NOUVELLE SOUCHE EN GUINÉE ..................................................................................... 67
CHOLÉRA AU SUD DE LA RÉPUBLIQUE DÉMOCRATIQUE DU CONGO .................................................. 67
TUBERCULOSE................................................................................................................................. 68
TUBERCULOSE À L’OUEST DU SÉNÉGAL ......................................................................................... 68
TUBERCULOSE AU MAROC ............................................................................................................ 70
TUBERCULOSE À LUANDA EN ANGOLA ........................................................................................... 71
LA LEISHMANIOSE ET LA TUBERCULOSE AUGMENTENT EN SYRIE ...................................................... 72
COMMENTAIRES ...................................................................................................................... 73
DIVERS ........................................................................................................................................... 74
DENGUE À MADÈRE AU PORTUGAL ............................................................................................... 74
MALADIES RESPIRATOIRES NON DIAGNOSTIQUÉES - BRÉSIL: (PARA) DEMANDE D’INFORMATION ......... 76
PNEUMONIES INFANTILES À UDAYAPUR AU NEPAL ......................................................................... 79
AUGMENTATION DE L’INCIDENCE DES GONOCOCCIES DANS LE MAINE, USA ...................................... 81
MÉNINGITE - MAROC (CÔTE ATLANTIQUE) ..................................................................................... 83
INFECTION FONGIQUE, MÉDICAMENT CONTAMINÉ - USA ............................................................... 85
150 CAS SUSPECTS DE CHIKUNGUNYA DÉTECTÉS À LIBREVILLE, GABON ............................................. 86

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AUGMENTATION DE L'INCIDENCE DE LA FIÈVRE HÉMORRAGIQUE AVEC SYNDROME RÉNAL DANS LA
RÉGION DE SARATOV EN RUSSIE .................................................................................................... 87
TRACHOME - SOUDAN .................................................................................................................. 88
MALADIE NON DIAGNOSTIQUÉE AU NORD DARFOUR AU SOUDAN.................................................... 90
TRYPANOSOMIASE AFRICAINE CHEZ UN SUÉDOIS APRÈS UN SAFARI EN TANZANIE ............................. 91
MÉNINGITE À MÉNINGOCOQUE, EXPOSITION DANS UN AVION, RÉGION MÉTROPOLITAINE DE SANTIAGO
AU CHILI ..................................................................................................................................... 93
LA PESTE BUBONIQUE TUE TOUJOURS À MADAGASCAR ................................................................... 95
L’ARN VIRAL DU SCHMALLENBERG VIRUS DÉTECTE DANS DU SPERME BOVIN ..................................... 96
COQUELUCHE AU ROYAUME-UNI .................................................................................................. 97
DEUX MILLIONS DE PERSONNES SOUFFRANT DE SCHISTOSOMIASE (BILHARZIOSE) AU SOUDAN (NORD
KORDOFAN) ................................................................................................................................ 98

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GRIPPE
DÉRIVE ANTIGÉNIQUE DU VIRUS DE LA GRIPPE AVIAIRE HUMAINE EN ÉGYPTE
Date: Fri 14 Déc. 2012
Source: CIDRAP News [edited]
<http://wwwnc.cdc.gov/eid/article/19/1/12-1080_article.htm>
L'analyse démontre une dérive antigénique des virus H5N1 en Égypte
L'analyse des souches du virus de la grippe aviaire H5N1 isolées chez des patients égyptiens entre 2007 et
2011 a retrouvé peu de preuves de réassortiment, mais une dérive antigénique importante, selon un
rapport publié hier dans "Emerging Infectious Diseases" [voir commentaire ci-dessous]. Des enquêteurs des
États-Unis et égyptiens ont séquencé les génomes complets de 59 isolats du virus grippal A/H5N1 et 13
gènes de l'hémagglutinine (HA) ont été séquencés directement à partir d’échantillons cliniques de 72
patients.
"Nous avons mis en évidence des preuves de réassortiments minimes et aucune introductions étrangères »,
écrivent-ils. « Les gènes hémagglutinine du virus, ont constitué, dès 2011 un groupe monophylétique au
sein du clade 2.2.1 qui a également inclut les virus humains de 2009 et 2010 et les virus contemporains de
la volaille, ce résultat est cohérent avec une transmission zoonotique ».
Alors qu’ils n’ont trouvé que peu d’évidences de réassortiment, ils ont, par contre, observé une «Dérive
antigénique importante" quand ils ont effectué des tests d'inhibition HA, en utilisant des antisérums de
furet et ont comparé les résultats contre une gamme de virus H5N1. L'Égypte a confirmé 158 cas humains
de H5N1 au cours de la période de l'étude.
Commentaire ProMED-mail
Le rapport précédent résume la publication suivante: Younan M, Poh MK, Elassal E, Davis T, Rivailler P,
Balish AL, et al. Microevolution of highly pathogenic avian influenza A(H5N1) viruses isolated from humans,
Egypt, 2007-2011. Emerg Infect Dis [Internet]. 2013 Jan [date cited].
<http://dx.doi.org/10.3201/eid1901.121080>.
GRIPPE AVIAIRE A (H7N7) HAUTEMENT PATHOGÈNE, EN 2003 AUX PAYS-BAS :
PROPAGATION À MÉDIATION ÉOLIENNE.
Date: Thu 13 Déc. 2012
Source: Journal of Infectious Diseases 2012, Advance Access; published
10 Dec 2012 [summarised, edited]