Fiche d`UE – 3V667 INTERACTIONS DURABLES

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Fiche d’U.E. – 3V667
INTERACTIONS DURABLES, ECOLOGIE ET EVOLUTION :
DU MUTUALISME AU PARASITISME
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•!Responsables!de!l’U.E.!:!!
!Fabienne!AUDEBERT!([email protected])!
!Magali!ZBINDEN!([e-mail])!
!Clothilde!BIARD!(clothilde.bia[email protected])!
!
•!Nature!de!l’U.E!:!!
!Complémentaire!
!
•!Semestre!où!l’enseignement!est!proposé!:!!
! S6!
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•!Nombre!d’ECTS!:!!
! 3!ECTS!
!
•!Nombre!d’heures!de!cours!:!!
!14!heures!de!cours!
!
•!Nombre!d’heures!de!TD!:!!
!4!heures!de!TD!!
!
•!Nombre!d’heures!de!TP!:!!
! 12!heures!!
!
•!Modalités!des!contrôles!des!connaissances!(CDC)!:!!
Examen!de!cours!/50!;!examen!réparti!(CR!TP)!/20!;!travail!personnel!(dossier!et!oral)!/30!
!
•!Capacité!d'accueil!:!!
!75!étudiant(e)s!(3!groupes)!
!
!
Cet!enseignement!présente!les!interactions!durables!dans!le!monde!du!vivant.!Ces!associations!
dynamiques!(hôtes/symbiontes!ou!parasites)!y!sont!étudiées!à!l’échelle!du!gène,!de!l’espèce!et!
des! communautés! d’espèces,! dans! un! contexte! écologique! et! évolutif.! L’UE! met! en! avant! les!
approches! interdisciplinaires! et! intégratives! et! les! mécanismes! d’adaptation! à! la! variabilité!
environnementale.!
SDV
Sciences de la Vie

a) Objectifs,de,l'Unité,d'Enseignement,:,,
Tous! les! organismes! sont! impliqués! dans! des! interactions! durables! avec! d'autres! espèces,! sous! des!
formes! variées,! allant! du! mutualisme! obligatoire! au! parasitisme.! Ces! associations! obéissent! à! des!
règles! fondamentales! communes! et! jouent! un! rôle! décisif! dans! le! fonctionnement! et! l'évolution! du!
vivant,! du! génome! à! l'écosystème! (reproduction,! survie,! nutrition,! comportement,! immunité,!
coévolution! et! cospéciation,! structure! des! génomes,! transferts! de! gènes,!...).! Le! fonctionnement! des!
relations! "organisme_organisme"! au! sens! large! est! abordé! de! l'échelle! des! communautés! jusqu'aux!
aspects!moléculaires,!illustrant!les!grands!processus!et!concepts!de!l'écologie!et!de!l'évolution.!
!
b) Thèmes,abordés,:,,
Cours!:!
•! Définitions!:! interaction! (nature! de! l’interaction,! gradient! des! types! d’interactions! jusqu’aux!
interactions! durables),! symbiose! au! sens! large! (distinction! entre! les! terminologies! francophone! et!
anglophone),!phorésie,!mutualisme,!commensalisme,!parasitisme,!ecto_!et!endosymbioses.!!
•!Etude!des!différentes!étapes!du!cycle!d’interaction!:!
_!Reconnaissance! entre! partenaires,! mise! en! place,! transmission! horizontale! et! verticale,!
séparation!des!partenaires!
_!Fonctionnement,! notions! de! bénéfice! et! coût,! manipulation! des! partenaires,! modalités! des!
modes!de!vie!symbiotique!et!parasitaire!
_!Evolution!de!la!virulence,!évolution!de!la!résistance,!coévolution!et!cospéciation,!conséquences!
évolutives,! importance! écologique! des! interactions! durables! (théorie! endosymbiotique,!
épidémiologie,…)!
TP/TD!:!!
•!TD!épidémiologie.!
•! TP1!:! Découverte! des! interactions.! But! du! TP!:! établir! la! démarche! scientifique! pour! étudier! une!
interaction! durable.! Etude! de! différents!exemples! pris! en! milieux! marin! et! terrestre! (anémone! de!
mer! et! zooxanthelles,! hydre! et! zoochlorelles,! lichen! et! mycorhizes,! symbioses! chimiosynthétiques,!
bernard!l’ermite,!pucerons!et!bactéries,!termites!et!flagellés,!xylophagie!en!milieu!terrestre!et!marin,!
bactéries!luminescentes,!taenia,!douve,!ascaris).!Discussion!sur!les!partenaires,!coûts!et!bénéfices.!!
•! TP2!:! Interactions! positives!:! exemple! des! symbioses! chimiotrophes!:! la! symbiose! comme! facteur!
d’adaptation! à! un! «!milieu! extrême!»,! adaptation! de! l’hôte! à! l’utilisation! de! composés! toxiques!
alimentant!ses!symbiontes.!
•!TP3!:! Un! organisme! est! un! écosystème!:! exemple! du! pigeon! et! l’omniprésence! des! symbiontes! et!
des! parasites.! Trouver! et! identifier! les! partenaires.! Calcul! des! descripteurs! pour! caractériser!
l’infection!:!abondance,!prévalence,!effet!sexe,!spécificité!de!localisation,!répartition,!migration.!
•! TP4!:! La! manipulation! parasitaire!:! exemple! des! gammares! et! acanthocéphales,! altération! du!
comportement!lié!au!parasitisme.!
•!TP5!:!Les!virus!comme!vecteur!de!transfert!latéral!de!gènes!entre!microalgues!marines!(approche!
bioinformatique).!
!
c) Connaissances,et,compétences,attendues,:,
Connaissance! sur! les! modalités! d’une! interaction! durable! (positive! ou! négative).! Conséquences!
évolutives! et! aspects! écologiques.! Identification! des! symbiontes! et! parasites.! Mise! en! place! d’une!
démarche!scientifique!par!les!TP!et!le!travail!personnel.!!
,
d) Evaluations,des,connaissances,:,
Examen!de!cours!/50!;!examen!réparti!(CR!TP)!/20!;!travail!personnel!(dossier!et!oral)!/30!
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e) Particularités,pédagogiques,:,,
Part! importante! de! travaux! pratiques! qui! présentent! une! démarche! expérimentale! et! font! appel! à!
l’esprit!critique!des! étudiants,!en!développant!leur! autonomie.!Un!travail!de!recherche!personnel!en!
petits! groupes! (3! à! 4! étudiant(e)s)! sera! réalisé! sur! un! cas! d’interaction! durable,! suivi! d’une!
présentation!devant!les!autres!étudiant(e)s!et!d’une!discussion.!
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