Fiche d`U.E. – 3V667 INTERACTIONS DURABLES, ECOLOGIE ET

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Fiche d’U.E. – 3V667
INTERACTIONS DURABLES, ECOLOGIE ET EVOLUTION :
DU MUTUALISME AU PARASITISME
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•!Responsables!de!l’U.E.!:!!
!Fabienne!AUDEBERT!([email protected])!
!Magali!ZBINDEN!([e-mail])!
!Clothilde!BIARD!(clothilde.bi[email protected])!
!
•!Nature!de!l’U.E!:!!
!Complémentaire!
!
•!Semestre!où!l’enseignement!est!proposé!:!!
! S6!
!
•!Nombre!d’ECTS!:!!
! 3!ECTS!
!
•!Nombre!d’heures!de!cours!:!!
!14!heures!de!cours!(dont!2!heures!à!suivre!en!ligne)!
!
•!Nombre!d’heures!de!TD/TP!:!!
!16!heures!:!4!TP/TD!de!3!heures!et!2!TD!de!2!heures!
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•!Modalités!des!contrôles!des!connaissances!(CDC)!:!!
Examen!de!cours!/60!;!examen!réparti!de!TP!(CR!des!4!TP)!/40!!
!
•!Capacité!d'accueil!:!!
!75!étudiantWeWs!(3!groupes)!
!
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Cet!enseignement!présente!les!interactions!durables!dans!le!monde!du!vivant.!Ces!associations!
dynamiques!(hôtes/symbiontes!ou!parasites)!y!sont!étudiées!à!l’échelle!du!gène,!de!l’espèce!et!
des! communautés! d’espèces,! dans! un! contexte! écologique! et! évolutif.! L’UE! met! en! avant! les!
approches! interdisciplinaires! et! intégratives! et! les! mécanismes! d’adaptation! à! la! variabilité!
environnementale.!
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SDV
Sciences de la Vie

a) Objectifs,de,l'Unité,d'Enseignement,:,,
Tous! les! organismes! sont! impliqués! dans! des! interactions! durables! avec! d'autres! espèces,! sous! des!
formes! variées! allant! du! mutualisme! obligatoire! au! parasitisme.! Ces! associations! obéissent! à! des!
règles! fondamentales! communes! et! jouent! un! rôle! décisif! dans! le! fonctionnement! et! l'évolution! du!
vivant,! du! génome! à! l'écosystème! (reproduction,! survie,! nutrition,! comportement,! immunité,!
coévolution! et! coWspéciation,! structure! des! génomes,! transferts! de! gènes,...).! Le! fonctionnement! des!
relations! "organismeWorganisme"! au! sens! large! est! abordé! de! l'échelle! des! communautés! jusqu'aux!
aspects!moléculaires,!illustrant!les!grands!processus!et!concepts!de!l'écologie!et!de!l'évolution.!
!
b) Thèmes,abordés,:,,
Cours!:!
•! Définitions!:! interaction! (nature! de! l’interaction,! gradient! des! types! d’interactions! jusqu’aux!
interactions! durables),! symbiose! au! sens! large! (distinction! entre! les! terminologies! francophone! et!
anglophone),!phorésie,!mutualisme,!commensalisme,!parasitisme,!ectoW!et!endosymbioses.!!
•!Etude!des!différentes!étapes!du!cycle!d’interaction.!
•!Reconnaissance!entre!partenaires,!mise!en!place,!transmission!horizontale!et!verticale,!séparation!
des!partenaires!
•!Fonctionnement,!notions!de! bénéfice!et!coût,!manipulation!des! partenaires,!modalités!des!modes!
de!vie!symbiotique!et!parasitaire!
•! Evolution! de! la! virulence,! évolution! de! la! résistance,!coévolution! et! cospéciation,! conséquences!
évolutives,! importance! écologique! des! interactions! durables! (théorie! endosymbiotique,!
épidémiologie,…)!
TP/TD!:!!
•!TD!1!:!Les!virus!comme!vecteur!de!transfert!latéral!de!gènes!entre!microalgues!marines!(approche!
bioinformatique).!(2h)!
•!TD!2!:!Epidémiologie!(2h).!
*!TP1!(3h)!:! Découverte! des! interactions.! But! du! TP!:! établir! la! démarche! scientifique! pour! étudier!
une!interaction!durable.!Etude!de!différents!exemples!pris!en!milieux!marin!et!terrestre!(Symbiose!
marine!:!anémone!de!mer!et!zooxanthelles,!Symbiose!terrestre:!lichen!et!mycorhizes,!,!xylophagie!en!
milieu!terrestre:!termites!et!flagellés,!Parasitisme!:!cycle!du!taenia).!Discussion!sur!les!partenaires,!
coûts!et!bénéfices.!!
•! TP2!(3h)!:! Interactions! positives!:! exemples! des! symbioses! marines! et! terrestres! avec! différents!
échanges! (service,! nutritionnel,! protection,! fitness,! ..):! Symbioses! chimiotrophes! (Riftia& pachyptila,!
Bathymodiolus!sp.,! Rimicaris& exoculata),! Symbiose! fixatrice! d’azote! (Rhizobium!et! légumineuses),!
Bactéries!bioluminescentes!(Euprymna&scolopes!et!Vibrio&fisheri),!Pucerons!et!leurs!symbiontes.!
•!TP3!(3h)!:!La!manipulation!parasitaire!:!exemple!des!gammares! et!acanthocéphales,!altération!du!
comportement!lié!au!parasitisme.!
•!TP4!(3h)!:!Un!organisme!est!un!écosystème!:!exemple!du!pigeon!et!l’omniprésence!des!symbiontes!
et! des! parasites! (étude! du! plumage,! sang! et! fécès).! Calcul! des! descripteurs! pour! caractériser!
l’infection!:!abondance,!prévalence,!effet!sexe,!spécificité!de!localisation,!répartition,!migration.!
!
c) Connaissances,et,compétences,attendues,:,
Connaissances! sur! les! modalités! d’une! interaction! durable! (positive! ou! négative).! Conséquences!
évolutives! et! aspects! écologiques.! Identification! des! symbiontes! et! parasites.! Mise! en! place! d’une!
démarche!scientifique!par!les!TP.!!
,
d) Evaluations,des,connaissances,:,
Examen!de!cours!/60!;!examen!réparti!de!TP!(CR!TP)!/40!!
!
e) Particularités,pédagogiques,:,,
Part! importante! de! travaux! pratiques! qui! présentent! une! démarche! expérimentale! et! font! appel! à!
l’esprit!critique!des!étudiantWeWs,!en!développant!leur!autonomie.!
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