Ecole Doctorale Chimie et Sciences du Vivant

Master Sciences du Vivant - UFR de Biologie
Sujet de stage de Master 2 Recherche
Année 2009/2010
Laboratoire : Institut de Biologie Structurale Directeur : Eva Pebay-Peyroula
Intitulé de l'équipe : Laboratoire de RMN Responsable : Bernhard Brutscher
Nom et qualité du responsable du stage : Jean-Pierre Simorre HDR oui non
Catherine Bougault
Adresse : 41 rue Jules Horowitz – 38027 Grenoble Cedex 1
Tél : [phone] (ou 96-33) email :[email protected] ([email protected])
Spécialité MASTER :
Biologie Cellulaire et Intégrative Biochimie, Biologie Structurale
Biodiversité - Ecologie – Environnement
Titre du sujet : Interactions protéine/peptidoglycane corrélées aux mécanismes bactériens
de résistance aux antibiotiques
Objectifs recherchés (3 lignes max) :
Compréhension des interactions peptidoglycane – protéines pour développer de nouveaux antibiotiques
Résumé (10 lignes max) :
Si l’introduction des antibiotiques dans les pratiques médicales a considérablement réduit le taux de
mortalité causé par les maladies infectieuses, les bactéries pathogènes ont développé des mécanismes de
résistance de plus en plus complexes et efficaces à l’encontre des composés antibactériens usuellement
utilisés. Sans équivalent chez les organismes eucaryotes, le peptidoglycane de la paroi bactérienne, ainsi
que les systèmes enzymatiques liés à sa biosynthèse et à la morphogenèse de la cellule, constituent une
cible idéale pour le développement de nouveaux antibiotiques.
Nous proposons d’étudier, à la fois par RMN solide et liquide, l’interaction entre de nouvelles protéines
potentiellement impliquées dans les phénomènes de biosynthèse/recyclage du peptidoglycane (ou dans la
division bactérienne) avec des fragments ou des sacculi entiers formant la paroi bactérienne. Ces études
seront menées en collaboration avec différents partenaires français et européens.
Approches & matériel utilisés (3 lignes max) :
Production d’échantillons protéiques et de peptidoglycane incluant des marquages isotopiques; étude des
interactions par RMN liquide et solide
Publications pertinentes de l'équipe (3 max) :
1) Boudet J., Chouquet A., Chahboune A., Giustini C., Joris B., Simorre J.-P., Bougault C. (2007) 1H, 13C, 15N
resonance assignments of YajG, an Escherichia coli protein of unknown structure and function. J. Biomol NMR
Assign, 1, 89-91.
2) Kern T., Hediger S., Müller P., Giustini C., Joris B., Bougault C., Vollmer W., Simorre J.-P. (2008) Toward the
characterization of peptidoglycan structure and protein-peptidoglycan interactions by solid-state NMR spectroscopy. J.
Am. Chem. Soc. 130,5618-5619.
Domaines de compétences souhaités (quelques mots clés) :
Pour BCI indiquez aussi la sous-spécialité (Biologie Végétale, Développement et Différenciation, Immunologie, Neurosciences,
Physiologie, Microbiologie)
Biologie structurale, Biochimie et biologie moléculaire