ECOLE DOCTORALE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA SANTE

UMR 1071 Inserm/Université Clermont Auvergne M2iSH, USC INRA 2018 (Pr Nicolas BARNICH)
Directeur de thèse : Mathilde Bonnet (MCU, HDR)
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Effet des souches d’Escherichia coli pathogènes sur les défenses anti-oxydantes des entérocytes et
impact sur la carcinogenèse colique.
Le cancer colorectal (CCR) est une maladie multifactorielle où le microbiote intestinal semble jouer un rôle.
Une colonisation anormale de la muqueuse de patients CCR par des souches d’E. coli pathogènes porteurs
d’une genotoxine appelée colibactine (E. coli-pks) a été mise en évidence. Récemment nous avons montré
une interaction entre ces E. coli-pks et le système MMR de réparation de l’ADN, une des défenses antioxydantes de la cellule. Le but de ce travail est d’étudier les effets de l’infection chronique du colon par ces
souches E. coli-pks sur d’autres défenses anti-oxydantes des entérocytes et les conséquences sur la
carcinogenèse colique en utilisant des modèles animaux mais aussi des tumeurs de patients CCR de la
cohorte disponible au laboratoire. L’expression et l’activité d’enzymes anti-oxydantes du colon seront
corrélées aux dommages tissulaires. En complément, une approche d’expression des défenses antioxydantes sur cellules uniques sera effectuée grâce à l’utilisation du système qPCR Fluidigm C1+ Single
cell.
Ainsi ce projet permettra de déterminer si l’infection bactérienne est responsable d’une altération des
défenses anti-oxydantes et de l’induction d’une sous-population de cellules tumorales particulièrement
agressives. A terme ces travaux permettraient de développer de nouvelles stratégies thérapeutiques chez
les patients CCR porteurs de ce type de bactéries.
Gagnière J, et al. (2017). Interactions between microsatellite instability and human gut colonization by
Escherichia coli in colorectal cancer. Clin Sci (Lond).
Bonnet M et al. (2014) Colonization of the human gut by E. coli and colorectal cancer risk. Clin Cancer Res.