prelevements microbiologiques
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PRELEVEMENTS MICROBIOLOGIQUES 1. Préparation du prélèvement Le préleveur muni des documents nécessaires au prélèvement appelle le patient et vérifie les renseignements administratifs obligatoires : Nom, Prénom, date de naissance.. Il rassure et informe le patient sur le déroulement et les conditions du prélèvement. Le préleveur doit obligatoirement s'identifier, et noter la date et l'heure du prélèvement. Il s'assure de la conformité des conditions de prélèvement en application des recommandations du présent Manuel de Prélèvement : - Respect des préconisations : Liste des préconisations selon le type de prélèvement - Respect des conditions particulières : Liste des analyses nécessitant des conditions particulières Il s'enquiert de l'existence d'une éventuelle thérapeutique et sollicite, si nécessaire, des informations cliniques complémentaires : Liste des analyses nécessitant des renseignements particuliers Il note ces informations sur la fiche de transmission qui accompagne les échantillons prélevés. 2. Hygiène et sécurité Tout prélèvement doit être considéré comme potentiellement à risque infectieux. Le port de gants à usage unique est obligatoire pour effectuer le prélèvement. Avant chaque prélèvement, le préleveur se lave les mains à l'eau et au savon ou les passe à la solution hydroalcoolique. Les règles d'élimination des déchets et la conduite à tenir en cas d'incident de prélèvement doivent être connues. 3. Déroulement du prélèvement Le préleveur installe le patient et s'assure de la présence et de la conformité du matériel utilisé. Le laboratoire peut fournir tout type de matériel nécessaire et indispensable au recueil d'un échantillon de qualité, conformément aux recommandations, en fonction des analyses à réaliser et du type de prélèvement à effectuer. 4. PRELEVEMENTS URINAIRES : Voir les préconisations pour les différents types de recueil 5. PRELEVEMENTS GENITAUX : 5.1 : Prélèvement vaginal ou cervico-vaginal Analyse myco-bactériologique et parasitologique La patiente devra éviter toute toilette intime, tout traitement local (crème, gels, savons…) ainsi que tout rapport sexuel dans les 24 heures précédant l’examen. Il est conseillé d'éviter le prélèvement pendant la période menstruelle car la flore est modifiée (sauf avis contraire du prescripteur). Le prélèvement doit être réalisé avant ou à distance de tout traitement antibiotique (> 15 jours pour les chlamydia, > 5 jours pour les germes banaux ). Le préleveur doit s’assurer des conditions physiologiques du sujet. Après avoir installer la patiente en position gynécologique, mise en place d’un spéculum à usage unique, prélever à l'aide d'écouvillons stériles, en fonction du tableau suivant : • Bactériologie « classique » Lames (examen direct et colorations) Mycoplasme Chlamydia Site de prélèvement Culs de sac et col Culs de sac Endocol Endocol Nombre d’écouvillons 1 avec milieu de transport 1 1 avec milieu de transport 1* *Ecouvillon spécifique selon la technique d’analyse (PCR) avec milieu de transport spécial. En présence d'une vulvite chez la fillette, rechercher le présence d'Oxyures par un scotchtest : Cliquer pour voir les préconisations 5.2 : Frottis cervical pour examen anatomo-pathologique - Après l'installation de la patiente en position gynécologique et l'interrogatoire à la recherche de renseignements cliniques, - Mettre en place le spéculum pour dégager le col utérin. Si besoin, enlever l'excédent de mucosités au niveau cervical. - Prélever avec la brosse « Servex-brush » par 4 à 5 mouvements de rotation au niveau du canal endo-cervical. - Etalement par badigeonnage de chaque face de la brosse sur une lame d'examen puis fixation immédiate par le fixateur cytologique. - Placer les lames dans un porte lames pour transmettre le prélèvement au Service d'AnatomoPathologie. 5.3 : Prélèvement pour recherche d'HPV oncogènes - Mettre en place le spéculum pour dégager le col utérin. Si besoin, enlever l'excédent de mucosités au niveau cervical. - Prélever avec la brosse par 4 à 5 mouvements de rotation au niveau du canal endo-cervical. - Décharger la brosse par 3 mouvements de rotation de la brosse contre les parois du milieu de transport ( Abbott cervicollect, M4RT ou STM Qiagen)ou dans un milieu de conservation pour cytologie en milieu liquide. NB : Recherche possible sur les milieux de conservation pour la cytologie suivants : ThinPrep ( Hologic), Surepath (Tripath), Cytoscreen (SeroA), EasyFix ( Labonord) et CMDH 5generic Vision). - Pour que la recherche d' HPV oncogènes soit remboursée il faut que la prescription possède l'indication ASC–US, toutes autres indications ne seront pas remboursées. 5.4 : Prélèvement pour test de Hühner (sur RDV au laboratoire) – Le prélèvement est effectué entre J-4 et J-1, avant le pic ovulatoire, et entre 9 et 18 à 24 heures après le rapport sexuel (abstinence de 3 à 5 jours). - Après l'installation de la patiente dans la salle de prélèvements et l'interrogatoire à la recherche de renseignements cliniques, mettre en place le spéculum pour dégager le col utérin. - Introduire l'extrémité de l'aspiglaire dans le col utérin et tirer le mandrin à soi afin d'aspirer la glaire endocervicale (prélever toute la glaire: si besoin utiliser un deuxième aspiglaire). - De même prélever un aspiglaire dans un cul de sac (vérification qu'un rapport a bien eu lieu). - Remplir les données cliniques et renseignements nécessaires sur la feuille de transmission. - Faire acheminer l’échantillon le plus rapidement possible au service de spermiologie. 5.5 : Prélèvement urétral - Le ou la patient(e) ne doit pas uriner dans les deux heures précédant le prélèvement, de préférence le matin - Introduire de quelques mm, pour chaque recherche, un écouvillon fin dans l’urètre (en écartant les grandes lèvres chez la femme) et effectuer 3 ou 4 rotations pour recueillir le maximum de cellules et les sécrétions. - Si il existe un écoulement, récupérer la sérosité sur un écouvillon identifié. - Prélever 2 écouvillons au niveau du méat (un pour état frais et coloration, un pour la mise en culture) pour une bactériologie « classique ». - Pour la recherche de chlamydia : 1 écouvillon spécifique PCR avec milieu de transport spécial. - Pour la recherche de mycoplasmes : 1 écouvillon supplémentaire avec milieu de transport. 6. AUTRES PRELEVEMENTS Nature du prélèvement Selles Mode de prélèvement Coproculture Parasitologie Voir préconisations patients Sperme Spermoculture (sur RDV) et/ou Voir préconisations patients spermogramme Scotch-Test Oeufs d’Oxyures Voir préconisations patients Ongles, cheveux, squames Recherche de dermatophytes Recherche de germes pathogènes Sécretions bronchopulmonaires et crachats et/ou de BK Recherche particulière sur prescription explicite Échantillon de selles recueilli dans le flacon stérile fourni par le laboratoire. Pour les bébés et nouveau-nés, apporter la couche bien fermée au laboratoire dans un sac plastique. -Après 3 jours d’abstinence -Se laver les mains -Uriner -Par masturbation, après une désinfection locale.(dans le service de spermiologie au Val, à domicile pour St Sulpice) -Recueil de la totalité de l’éjaculat. -Au lever, avant toute toilette locale et avant l'émission des premières selles -Appliquer le scotch sur les plis de la marge anale en appuyant quelques secondes. -Retirer l’adhésif et l’étaler sur les lames support Matériels -Pot à coproculture stérile, remis le plus vite possible après l’émission, à température ambiante (dans l'heure en cas de selles diarrhéiques ou de recherche anguillules) -Prélèvement effectué sur place au Val. - Prélèvement apporté dans le service de spermiologie immédiatement (en moins de 30 min à St Sulpice), à 37°c. -Étui de 2 lames + scotch (non opaque) apporté au laboratoire, à température ambiante. - Prélever de préférence à la périphérie des lésions des squames à l’aide d’un vaccinostyle ou d’une curette - En cas de teigne,arracher les cheveux susceptibles d’être atteints - Pour les ongles, couper avec la pince à ongles ou aux ciseaux toute la partie de l’ongle atteinte (morceaux très fins), gratter à la limite de la zone saine avec un vaccinostyle ou une curette - En cas de lésion suintante, écouvillonner le pus et gratter le plancher de la lésion - Boites de Pétri stériles - Vaccinostyle ou curette de Brocq - Ecouvillons - Coupe-ongles ou ciseaux. - Pinces - recueil de crachats dans un flacon stérile type ECBU ou selles - Flacon stérile transmis rapidement au laboratoire - le matin, au réveil, après brossage des dents et rinçage de la bouche, après un effort de toux - Recours à la kinésithérapie si nécessaire (jeunes enfants ou personnes âgées) - Eviter au maximum de recueillir de - Lavage broncho-alvéolaire ou la salive aspiration bronchique en milieu spécialisé - Prélèvements 3 jours consécutifs si BK Nature du prélèvement Lésions cutanées, plaie, escarre, pus profond etc Gorge Amygdales Pharynx Mode de prélèvement Recherche de germes pathogènes Recherche de germes pathogènes et germes spécifiques sur prescription explicite - Prendre les précautions d’asepsie pour éviter de contaminer le prélèvement par les bactéries se trouvant normalement sur la peau. - Passer les écouvillons sur toute leur surface au niveau de la zone à prélever (zone inflammatoire profonde) ; si elle est sèche, tremper préalablement l'écouvillon dans du sérum physiologique stérile. - Placer un écouvillon dans le milieu de transport - Ecouvillonnage fin des sécrétions au niveau des 2 narines Oreilles - Ecouvillonner le conduit auditif externe, sous éclairage direct, après avoir nettoyé le conduit avec un écouvillon imbibé d'eau stérile sauf si l'écoulement purulent est abondant Matériel divers : cathéter, redons, mèches, stérilets, drains, lames ... Si abcès fermé : prélèvement à la seringue stérile ou bien rompre la barrière cutanée et écouvillonner le pus Si lésions ou abcès ouvert : 2 à 3 écouvillons - Prélever au niveau des zones inflammatoires ou nécrotiques, à la périphérie des fausses membranes, sur les amygdales - Éviter de toucher la langue, la luette - Si recherche de Coqueluche (PCR), faire un écouvillonage nasopharyngé des 2 narines avec un écouvillon fin supplémentaire, dans 1 écouvillon pour lames et un écouvillon en milieu de transport un milieu de transport spécifique pour la culture bactériologique (fourni par le laboratoire) Nez Œil Matériels Recherche de germes pathogènes - Avant toute toilette faciale, sans maquillage - Écouvillonnage fin, doux, sous palpébral, ainsi que des culs de sac conjonctivaux (de l'angle externe de l'œil jusqu'à l'angle interne) - Liquide de lentilles dans un flacon stérile type ECBU 1 écouvillon pour lames et un écouvillon en milieu de transport pour la culture bactériologique. Si demande explicite, prélever un écouvillon spécial pour Chlamydia (milieu de transport des prélèvements génitaux) Recherche de germes pathogènes - Transmettre le matériel suspect dans un flacon stérile type ECBU - si l'ablation n'est pas possible, prélever autour des point d'insertion Flacon stérile et/ou 1écouvillon avec milieu de transport pour la culture et 1 écouvillon pour lames Nature du prélèvement Liquides de Ponctions : Ascite, Articulaire, LCR... Génital, ORL, cutané ... Mode de prélèvement Recherche de germes pathogènes Germes spécifiques sur prescription explicite Recherche d'Herpes - Ponctions réalisées par le médecin - Désinfection cutanée - Prélèvements à la seringue - Transmission rapide de l'échantillon au laboratoire (flacon stérile ou seringue sans aiguille) - Flacon stérile type ECBU - Flacon d'hémocultures - Tube hépariné (bouchon vert) - Prélèvement au niveau de la lésion bulleuse si possible pour récupérer les sérosités. - Si non, au niveau de l'ulcération. - Décharger l'écouvillon dans les puits d'une lame d'immunofluorescence (éventuellement humidifiés avec du sérum physiologique) - Si la prescription précise une recherche par PCR ou Culture, décharger l'écouvillon dans le milieu de transport spécifique. Transmission des lames d'IF au laboratoire spécialisé. Transmission du milieu de transport au laboratoire spécialisé pour une recherche par PCR ou Culture Grattage des lésions Recherche de Ouvrir les sillons cutanés Gale (sarcoptes interdigitaux avec un vaccinostyle et gratter le fond pour récupérer les scabéi) sarcoptes Peau Cils / Sourcils Recherche de Demodex Matériels Arracher cils et sourcils à la pince à épiler ou prélèvement complet d'un comédon Observation entre lame et lamelle dans une goutte de potasse ou de noir chlorazole ou de sérum physiologique. Observation entre lame et lamelle dans une goutte de potasse ou de noir chlorazole ou de sérum phy. 7. HEMOCULTURES : Voir le protocole spécifique (prélèvement sanguin)
