Le Futur de la Génomique - Hybrid Turkeys Resources

Le Futur de la Génomique
Nous entrons dans une nouvelle ère en sélection animale. Beaucoup de progrès
génétiques sont attendus étant donné que la génomique offre beaucoup plus
que les technologies conventionnelles.
La sélection animale a un impact important sur l’amélioration de la production des animaux
d’élevage, mais nous entrons dans une nouvelle ère de sélection animale. La sélection
génomique a entraîné une révolution dans le monde de la sélection animale : elle a commencé
en vaches laitières mais a ensuite facilement trouvé sa place dans les autres espèces d’élevage.
On peut s’attendre à bien plus de progrès génétiques avec l’utilisation de la sélection
génomique pour les caractères mesurés en fin de vie ou difficiles à mesurer. Notamment pour
la dernière catégorie de caractères, la génomique peut offrir bien plus que les technologies
conventionnelles de sélection animale.
Progrès accélérés en génétique
Le taux de progrès en génétique est déterminé par 4 facteurs:
1) la précision des valeurs génétiques
2) La pression de sélection (de quelle taille est le groupe de candidats potentiels à la
sélection et combien sont sélectionnés)
3) la variabilité génétique du caractère
4) l’intervalle entre les générations (durée après laquelle on peut utiliser les animaux
sélectionnés en tant que parents).
La sélection génomique permet aux sélectionneurs de choisir des animaux avec beaucoup plus
de précision et à un âge plus jeune, c’est-à-dire qu’elle augmente la précision et diminue
l’intervalle entre générations, composants clé dans le taux de gain génétique qui peut être
atteint.
Marqueurs génétiques
La révolution suivante en sélection animale est basée sur le séquençage des génomes de
diverses espèces, la description ultérieure des marqueurs ADN (génétiques) et la technologie
pour cartographier ces marqueurs. Les valeurs de sélection génomique peuvent être estimées à
partir des informations générées par un large nombre de marqueurs génétiques. Avec un grand
nombre de marqueurs génétiques répandus dans tout le génome, il y en aura toujours un à
proximité du gène qui nous intéresse.
SNP
Avec le séquençage génomique (procédé de laboratoire qui détermine la séquence complète
d’ADN du génome d’un organisme) la bibliothèque complète des paires de bases d’un animal
est cartographiée. Les animaux ont des milliards de paires de bases. Une petite part (des
millions) peut être classifiée en tant que « polymorphismes d’un seul nucléotide » (SNP) ; une
situation où les bases nucléiques en un certain endroit du génome sont de types différents chez
certains individus d’une même espèce.
Valeurs de sélection génomique
De nos jours, nous connaissons le génome complet de beaucoup d’espèces, plus de 20 oiseaux
et mammifères, y compris l’être humain et des centaines de milliers de polymorphismes
nucléotidiques (SNP) sont désormais disponibles. Ces SNP peuvent être utilisés comme
marqueurs facilement identifiables pour les localisations sur le génome du porc. Il y a plusieurs
millions de SNP connus dans le génome des animaux. Ces SNP sont les bases de la sélection
génomique. A travers cette technologie, un grand nombre de SNP sont sélectionnés dans le
génome pour servir de source d’informations pour l’estimation de la valeur génétique.