GrassLandscape

ERA-NET+ (FP7) – FACCE-JPI 2014 programme ‘Climate Smart Agriculture’
Bridging landscape genomics and quantitative
genetics for a regional adaptation of European
grasslands to climate change
GrassLandscape
INRA, IBERS, IPK, EPHE, ILVO
The GrassLandscape Consortium
 INRA
UR P3F, Centre Poitou-Charentes, Lusignan, France
JP Sampoux, P Barre, I Litrico, D Combes, A Escobar-Guitterez
UMR Ecologie et Ecophysiologie Forestières, Nancy, France
V Badeau
 IBERS
IBERS - Aberystwyth University, Wales, UK
M Hegarty , I Thomas
 IPK
Genebank Department, Satellite Collections North, Malchow-Poel, Germany
K Dehmer, E Willner, A Roschanski
 EPHE
EPHE – CEFE, Montpellier, France
S Manel
 ILVO
Plant Sciences Unit, Growth and development, Melle, Belgium
I Roldan-Ruiz, T Ruttink, H Muylde
Génomique du paysage et adaptation au changement climatique
 Distribution environnementale de la diversité génétique adaptative naturelle
Modèles d’association
Diversité génomique X variations environnementales
Modèles de distribution environnementale de la
diversité adaptative
Distribution spatiale des allèles adaptatifs
Spatial distribution of an SNP involved in
fowering earliness in Arabidopsis Thaliana
(Banta et al., 2012)
Ces modèles de distribution peuvent être utilisés pour l’adaptation au changement climatique
→ Où trouver des ressources génétiques pour les futures conditions climatiques
→ Programmes de migration assistée de la diversité
→ Marqueurs génomiques pour sélectionner pour les futures conditions climatiques
GrassLandscape: génomique du paysage appliquée la diversité naturelle
du ray-grass anglais
Genebank set = 500 accessions des CRG européens sélectionnées fin 2014
Phénotypage au champ
2015-2017
Plateforme de phénotypage
Mai – juin 2015
 Analyses des données phénotypiques (2016-2017)
→ Associations diversité phénotypique × diversité SNP
→ Associations diversité phénotypique × environnement
Polymorphisme de séquence
janvier – avril 2016
Données environnementales
 Génomique du paysage (2016-2017)
→ Signature de la selection
→ Associations diversité SNP × environnement
GrassLandscape: génomique du paysage appliquée la diversité naturelle
du ray-grass anglais
→ In situ set: Nouvelles prospections de populations naturelles de ray-grass anglais
Lamayou, Aveyron, France
Idsegahuizum, The Netherlands
França, North Portugal
Breitnau, BadenWürt, Germany
Collecte dans 55 sites en Europe (printemps – été 2015)
GrassLandscape: génomique du paysage appliquée la diversité naturelle
du ray-grass anglais
In situ set = 50 populations
Phénotypage champ (plantes espacées)
2015 - 2017
Polymorphisme de séquence janv – avr 2016
 Analyses des données phénotypiques (2016-2017)
→ Associations diversité phénotypique × diversité SNP
→ Associations diversité phénotypique × environnement
Données environnementales
 Génomique du paysage (2016-2017)
→ Signature de la selection
→ Associations diversité SNP × environnement
Adaptation régionale du ray-grass anglais au changement climatique
Stratégie pour la restauration de prairies permanentes dégradées par le
changement climatique
Adaptation régionale du ray-grass anglais au changement climatique
Introgression des adaptations climatiques dans les variétés à haute valeur
agronomique des prairies temporaires