VETAGRO SUP CAMPUS VETERINAIRE DE LYON Année 2013 - Thèse n° Le virus Schmallenberg : conditions d’émergence et de dissémination ; épidémiologie de la maladie induite par ce nouveau virus ; conséquences cliniques, lésionnelles et moyens de lutte. THESE Présentée à l’UNIVERSITE CLAUDE-BERNARD - LYON I (Médecine - Pharmacie) et soutenue publiquement le 8 novembre 2013 pour obtenir le grade de Docteur Vétérinaire par DEFFONTAINES Martin Né le 25 décembre 1987 à Semur en Auxois 2 4 VETAGRO SUP CAMPUS VETERINAIRE DE LYON Année 2013 - Thèse n° Le virus Schmallenberg : conditions d’émergence et de dissémination ; épidémiologie de la maladie induite par ce nouveau virus ; conséquences cliniques, lésionnelles et moyens de lutte. THESE Présentée à l’UNIVERSITE CLAUDE-BERNARD - LYON I (Médecine - Pharmacie) et soutenue publiquement le 8 novembre 2013 pour obtenir le grade de Docteur Vétérinaire par DEFFONTAINES Martin Né le 25 décembre 1987 à Semur en Auxois 1 2 3 4 Remerciements A Monsieur le Professeur Berland, De la Faculté de Médecine de Lyon, Qui nous fait l’honneur d’accepter la présidence de ce jury de thèse Hommages respectueux. A Monsieur le Professeur Pépin De VetAgro Sup, Campus Vétérinaire de Lyon Pour avoir encadré ce travail avec une grande disponibilité. Pour sa motivation, son soutien et ses nombreux conseils. Toute ma gratitude et mon respect. A Monsieur le Professeur Guérin De VetAgro Sup, Campus Vétérinaire de Lyon Pour sa motivation, son soutien, et pour avoir accepté de juger ce travail. Profonds et sincères remerciements. 5 6 Sommaire Remerciements..................................................................................................... 5 Table des illustrations ....................................................................................... 13 Liste des annexes ............................................................................................... 17 Liste des sigles et abréviations utilisés............................................................. 18 Introduction ....................................................................................................... 21 1. Le virus Schmallenberg : généralités .......................................................... 23 1.1. Historique des évènements qui ont conduit à la découverte du virus..................... 23 1.2. Le virus......................................................................................................................... 23 1.2.1. Analyse métagénomique........................................................................................ 23 1.2.1.1. Principe ........................................................................................................... 23 1.2.1.2. Résultats .......................................................................................................... 24 1.2.1.3. Conclusions d’Hoffman................................................................................... 24 1.2.2. Le SBV, un Bunyavirus du genre Orthobunyavirus ........................................... 25 1.2.2.1. Relations phylogéniques.................................................................................. 26 1.2.2.2. Morphologie et composition du SBV............................................................... 27 1.2.2.3. Propriétés ........................................................................................................ 28 1.2.2.3.1. Propriétés physico-chimiques .................................................................. 28 1.2.2.3.2. Propriétés antigéniques............................................................................. 28 1.2.2.3.3. Echappement à la réponse immunitaire ................................................... 29 1.2.2.4. Effet cytopathique............................................................................................ 29 1.2.2.5. Cycle de réplication ........................................................................................ 29 1.2.3. Le SBV, un arbovirus............................................................................................ 30 1.2.3.1. Définition et conséquences.............................................................................. 30 1.2.3.2. Identification du vecteur.................................................................................. 31 1.2.4. Pathogénie ............................................................................................................. 31 1.3. Le vecteur : un moucheron du genre Culicoïdes ...................................................... 31 1.3.1. Généralités ............................................................................................................. 31 1.3.1.1. Présentation .................................................................................................... 31 1.3.1.2. Répartition géographique ............................................................................... 32 1.3.1.3. Description ...................................................................................................... 32 1.3.2. Biologie et écologie du vecteur ............................................................................. 32 1.3.2.1. Biologie des Culicoïdes ................................................................................... 32 1.3.2.2. Milieux de vie .................................................................................................. 34 7 1.3.2.3. Facteurs influançant la biologie des Culicoïdes............................................. 34 1.3.2.3.1. Influence de la température ...................................................................... 34 1.3.2.3.2. Survie hivernale du vecteur...................................................................... 35 1.3.3. Du moucheron « sain » au moucheron vecteur : conditions à réunir ................ 35 1.3.4. Activité vectorielle en France................................................................................ 36 1.3.4.1. Activité des Culicoïdes en 2011 ...................................................................... 36 1.3.4.2. Activité des Culicoïdes en 2012 ...................................................................... 37 1.3.5. Du moucheron vecteur à la dissémination de la maladie : facteurs favorisants 37 1.4. Epidémiologie de la maladie induite par ce nouveau virus ..................................... 38 1.4.1. Les espèces concernées ......................................................................................... 38 1.4.1.1. Espèces sensibles............................................................................................. 38 1.4.1.2. Espèces réceptives........................................................................................... 38 1.4.1.3. Et l’homme ? ................................................................................................... 39 1.4.2. Dissémination ........................................................................................................ 39 1.4.2.1. Les matières virulentes.................................................................................... 39 1.4.2.2. Modes de transmission du virus ...................................................................... 40 1.4.3. Données épidémiologiques sur le SBV ................................................................. 41 1.4.3.1. L’expansion de la maladie en Europe à son émergence ................................. 41 1.4.3.1.1. Les faits marquants................................................................................... 41 1.4.3.1.2. Progression spatiale et temporelle de la maladie ..................................... 44 1.4.3.2. Bilan de la saison 2011/2012 .......................................................................... 45 1.4.3.2.1. En Europe ................................................................................................. 46 1.4.3.2.2. En France.................................................................................................. 51 1.4.3.3. Bilan de la saison 2012/2013 .......................................................................... 58 1.4.3.3.1. En Europe ................................................................................................. 58 1.4.3.3.2. En France.................................................................................................. 61 1.4.3.4. Conclusion : de l’émergence à août 2013....................................................... 63 1.4.4. Morbidité et mortalité............................................................................................ 64 1.5. Emergence et dissémination du SBV : bilan ............................................................. 65 2. Particularités immunologiques, cliniques et histo-pathologiques de l’infection des ruminants par le SBV .............................................................. 67 2.1. Immunologie ................................................................................................................ 67 2.1.1. Rappel : réponse immunitaire innée et réponse immunitaire acquise................ 67 2.1.2. Réponse immunitaire innée .................................................................................. 67 2.1.2.1. Les acteurs de l’immunité innée...................................................................... 67 2.1.2.1.1. Les cytokines............................................................................................ 67 2.1.2.1.2. Les cellules effectrices ............................................................................. 71 2.1.2.1.3. Le système du complément ...................................................................... 71 2.1.2.1.4. L’hyperthermie......................................................................................... 71 8 2.1.2.2. Caractéristiques de la réponse immunitaire innée face aux Bunyavirus et au SBV ............................................................................................................................... 71 2.1.2.3. Modes d’echappements des Bunyavrius et du SBV à la réponse immunitaire innée ............................................................................................................................. 73 2.1.2.3.1. Induction limitée de la réponse INF de type 1 ......................................... 73 2.1.2.3.2. Echappement du virus à la réponse INF de type 1 ................................... 73 2.1.3. Réponse immunitaire spécifique........................................................................... 74 2.1.3.1. Les acteurs de la réponse immunitaire spécifique .......................................... 74 2.1.3.1.1. Les lymphocytes B ................................................................................... 74 2.1.3.1.2. Les lymphocytes T ................................................................................... 74 2.1.3.2. Les deux types de réponse immunitaire spécifique ......................................... 74 2.1.3.3. Réponse immunitaire à médiation humorale face aux bunyavirus et au SBV 75 2.1.3.4. Réponse immunitaire à médiation cellulaire face aux bunyavirus et au SBV 75 2.1.4. Maturité immunitaire du jeune vis à vis du SBV ................................................. 76 2.1.4.1. Rappel : système immunitaire du fœtus........................................................... 76 2.1.4.2. Production fœtale d’INF de type 1 .................................................................. 76 2.1.4.3. Immunité humorale fœtale............................................................................... 76 2.1.4.4. Immunité colostrale......................................................................................... 77 2.1.5. SBV et immunité : bilan........................................................................................ 78 2.2. Expression clinique du SBV ....................................................................................... 78 2.2.1. La forme inapparente............................................................................................ 78 2.2.2. La forme aigüe....................................................................................................... 78 2.2.2.1. Résultats issus de la reproduction expérimentale de la maladie .................... 79 2.2.2.2. Résultats issus d’une enquête terrain.............................................................. 79 2.2.2.2.1. Résultats au niveau du troupeau (Collin, 2012) ....................................... 79 2.2.2.2.2. Résultats au niveau individuel.................................................................. 80 2.2.2.3. SBV aigu : conclusion ..................................................................................... 82 2.2.3. La forme congénitale............................................................................................. 82 2.2.3.1. Description des signes cliniques de la forme congénitale .............................. 82 2.2.3.1.1. Malformations congénitales ..................................................................... 82 2.2.3.1.2. Autres signes cliniques............................................................................. 84 2.2.3.2. Fréquences relatives des différents signes cliniques de la forme congénitale 84 2.2.3.2.1. Bovins....................................................................................................... 85 2.2.3.2.2. Petits ruminants............................................................................................ 88 2.2.3.2.3. Bilan : comparaison bovin/ovin ............................................................... 91 2.2.3.3. SBV congénital : bilan..................................................................................... 92 2.2.4. Expressions cliniques du SBV : résumé............................................................... 94 2.3. Diagnostic différentiel ................................................................................................. 94 2.3.1. Diagnostic différentiel chez les adultes ................................................................ 94 2.3.1.1. Affections à prendre en compte ....................................................................... 94 2.3.1.2. Critères cliniques pour l’exclusion des principales affections ....................... 96 2.3.2. Diagnostic différentiel chez le nouveau-né infecté in utero ................................ 99 2.3.2.1. Affections à prendre en compte ....................................................................... 99 9 2.3.2.1. Critères cliniques pour l’exclusion des principales affections ....................... 99 2.4. Diagnostic de laboratoire.......................................................................................... 101 2.4.1. Examen lésionnel ................................................................................................ 101 2.4.1.1. Rappel : le système nerveux central .............................................................. 101 2.4.1.2. Au niveau macroscopique ............................................................................. 101 2.4.1.3. Au niveau histologique .................................................................................. 103 2.4.1.3.1. Lésions du système nerveux................................................................... 104 2.4.1.3.2. Lésions musculo-squelettiques............................................................... 110 2.4.1.4. Examen lésionnel : bilan ............................................................................... 110 2.4.2. Tests diagnostiques.............................................................................................. 112 2.4.2.1. Test directs .................................................................................................... 112 2.4.2.1.1. RT-PCR en temps réel............................................................................ 112 2.4.2.1.2. Isolement viral........................................................................................ 113 2.4.2.2. Tests indirects................................................................................................ 113 2.4.2.2.1. Séroneutralisation................................................................................... 114 2.4.2.2.2. Immunofluorescence indirecte ............................................................... 114 2.4.2.2.3. ELISA..................................................................................................... 114 2.4.2.3. Conclusions sur les tests de laboratoire ....................................................... 114 2.4.2.4. Démarche diagnostique................................................................................. 115 3. L’émergence du SBV : moyens de lutte, conséquences et perspectives . 117 3.1. Moyens de lutte contre le SBV ................................................................................. 117 3.1.1. Vaccination.......................................................................................................... 117 3.1.2. Adaptation de la gestion de la reproduction....................................................... 118 3.1.3. Lutte contre le vecteur......................................................................................... 118 3.1.3.1. La lutte écologique ........................................................................................ 118 3.1.3.2. La lutte mécanique ........................................................................................ 119 3.1.3.3. La lutte chimique........................................................................................... 119 3.2. Conséquences liées à l’émergence du SBV.............................................................. 123 3.2.1. La gestion publique de la maladie de Schmallenberg........................................ 123 3.2.1.1. La gestion de l’épizootie de FCO en Europe ................................................ 123 3.2.1.2. La gestion de l’épizootie de la maladie de Schmallenberg aux niveaux européen et international ........................................................................................... 126 3.2.1.3. La gestion de l’épizootie de la maladie de Schmallenberg au niveau français .................................................................................................................................... 128 3.2.2. Conséquences économiques de la maladie......................................................... 130 3.2.2.1. Pertes économiques directes ......................................................................... 130 3.2.2.1.1. Résultats économiques dans les exploitations touchées par le SBV congénital et facteurs de variations ........................................................................ 130 3.2.2.1.2. Indemnisation des éleveurs .................................................................... 131 3.2.2.1.3. Prise en charge des analyses................................................................... 131 3.2.2.2. Pertes économiques indirectes ...................................................................... 132 10 3.2.2.2.1. A l’échelle internationale ....................................................................... 132 3.2.2.2.2. A l’échelle de l’exploitation................................................................... 133 3.3. Perspectives................................................................................................................ 133 3.3.1. Evolution attendue de la maladie de Schmallenberg......................................... 133 3.3.1.1. A l’echelle d’un troupeau .............................................................................. 133 3.3.1.2. A l’échelle européenne .................................................................................. 134 3.3.2. Adaptation de la gestion de l’épizootie ............................................................... 136 3.3.2.1. L’exemple de la maladie d’Akabane en Australie (Kirkland, 2012)............. 136 3.3.2.2. Enseignements pour la gestion de la maladie de Schmallenberg en Europe 137 3.3.3. Emergence de nouvelles maladies ...................................................................... 137 Conclusion........................................................................................................ 139 Bibliographie.................................................................................................... 141 Annexes............................................................................................................. 157 11 12 Table des illustrations Figures Figure 1 : Relations phylogéniques entre le SBV et les autres Orthobunyavirus des sérogroupes Simbu, Bunyamwera et California (Hoffmann, 2012)......................................... 25 Figure 2 : Structure du SBV (photos du FLI)........................................................................... 28 Figure 3 : Schéma du mode de réplication des Bunyavirus au sein de la cellule hôte (Whitehouse, 2004) .................................................................................................................. 30 Figure 4 : Comparaison entre la taille d’un Culicoïdes (Culicoïdes scoticus, Downes et Kettle, 1952) (à gauche) et d’un moustique (Culex spp) (à droite), toutes deux femelles (Zimmer, 2008a)....................................................................................................................................... 32 Figure 5 : Cycle de vie des moucherons du genre Culicoïdes (Purse, 2005) ........................... 33 Figure 6 : Mode de dissémination du SBV par l’intermédiaire d’un moucheron vecteur (Zientara, 2013) ........................................................................................................................ 41 Figure 7 : Evolution de la distribution des foyers confirmés de SBV en Europe, de septembre 2011 à avril 2012. Pour les mois de mars et avril 2012, deux régions d’Espagne étaient concernées, mais sans confirmation par PCR (EFSA, 2012a) ................................................. 45 Figure 8 : Répartition, par espèce, des régions concernées par au moins un cas confirmé de SBV (mai 2012) (EFSA, 2012b) .............................................................................................. 48 Figure 9 : Evolution de la distribution des foyers confirmés de SBV en Europe de septembre 2011 à octobre 2012, toutes espèces confondues (EFSA, 2012b) ........................................... 48 Figure 10 : Evolution du nombre de foyers de SBV confirmés, par espèce, en Europe, par semaine de septembre 2011 à novembre 2012 (EFSA, 2012b) ............................................... 50 Figure 11 : Carte représentant la prévalence cheptel du « SBV congénital » bovin au 31 août 2012 (Dominguez, 2013).......................................................................................................... 51 Figure 12 : Evolution du nombre de Foyers de SBV congénital bovin, par semaine (Dominguez, 2013)................................................................................................................... 52 Figure 13 : Evolution mensuelle du ratio « nombre de foyers bovins rapporté au nombre moyen de vêlages » (Dominguez, 2013) .................................................................................. 53 Figure 14 : Détermination des périodes possibles de contamination des mères par le SBV ... 53 Figure 15 : Répartition des foyers de SBV congénital chez les petits ruminants au 31 mai 2012 ( Dominguez, 2012b)....................................................................................................... 54 Figure 16 : Carte représentant la prévalence cheptel du SBV congénital chez les ovins au 31 mai 2012 (Dominguez, 2012b)................................................................................................. 55 Figure 17 : Carte reptésentant la répartition géographique des élevages caprins ayant fait l’objet d’une suspicion clinique de SBV congénital (Dominguez, 2012b).............................. 55 Figure 18 : Evolution du nombre de Foyers de SBV congénital ovin, par semaine (Dominguez, 2012b)................................................................................................................. 56 Figure 19 : Evolution mensuelle du ratio « nombre de foyers ovins rapporté au nombre estimé d’agnelages » (Dominguez, 2012b) ......................................................................................... 57 13 Figure 20 : Evolution du nombre de foyers de SBV congénital caprin, par semaine (Dominguez, 2012b)................................................................................................................. 57 Figure 21 : Progression géographique de la maladie de Schmallenberg en Europe entre septembre 2011 et avril 2013 (EFSA, 2013)............................................................................ 59 Figure 22 : Evolution du nombre de foyers confirmés de SBV, toutes espèces confondues, en Europe, entre fin 2011 et avril 2013 (EFSA, 2013) ................................................................. 59 Figure 23 : Evolution du nombre de foyers confirmés (foyers congénitaux et foyers aigus) par espèce en Europe entre août 2012 et avril 2013 (EFSA, 2013) ............................................... 60 Figure 24 : Répartition des foyers confirmés de SBV congénital en France entre novembre 2012 et août 2013, par espèce (Plateforme ESA, 2013a)......................................................... 62 Figure 25 : Evolution du nombre de foyers confirmés (foyers congénitaux et foyers aigus) par espèce en France sur la saison 2012/2013 (Plateforme ESA, 2013a) ...................................... 62 Figure 26 : Synthèse et mode d’action des INF de types 1 (Deffontaines).............................. 68 Figure 27 : Induction de la synthèse d’INF de type 1 dans une cellule infectée (Deffontaines) .................................................................................................................................................. 69 Figure 28 : Signalisation et mécanismes effecteurs de la réponse INF de type 1 chez les cellules voisines d’une cellule infectée (Deffontaines)............................................................ 70 Figure 29 : Synthèse et mode d’action des INF de type 2 (Deffontaines) ............................... 70 Figure 30 : Brachygnathie inférieure chez un agneau atteint de SBV congénital (Deffontaines, octobre 2013, Côte d’Or) ......................................................................................................... 83 Figure 31 : Arthrogrypose et léger torticolis chez un agneau atteint de SBV congénital (Deffontaines, octobre 2013, Côte d’Or) ................................................................................. 83 Figure 32 : Arthrogrypose et torticolis chez un veau atteint de SBV congénital (Deffontaines, décembre 2013, Côte d’Or) ...................................................................................................... 84 Figure 33 : Répartition de la proportion de femelles à problème pouvant être rapporté au SBV au sein des cheptels enquêtés (489 élevages) (Plateforme ESA, 2012a) ................................. 85 Figure 34 : Répartition de la proportion de femelles ayant mis bas à terme des veaux présentant des troubles (490 élevages) (Plateforme ESA, 2012a) ........................................... 86 Figure 35 : Répartition de la proportion de femelles à problème pouvant être rapportées au SBV au sein des lots concernés par les troubles (560 élevages) (Plateforme ESA, 2012b) .... 88 Figure 36 : Répartition de la proportion de femelles ayant mis bas à terme des agneaux présentant des troubles (559 élevages) (Plateforme ESA, 2012b) ........................................... 89 Figure 37 : Répartition des événements concernant les femelles gestantes au sein d’un cheptel touché par le SBV congénital................................................................................................... 91 Figure 38 : Répartition des événements concernant les nouveaux nés au sein d’un cheptel touché par le SBV congénital................................................................................................... 92 Figure 39 : Conséquences hypothétiques d’une infection in utero par le virus Schmallenberg chez les bovins et les petits ruminants (Martinelle, 2012) ....................................................... 93 Figure 40 : Chronologie d’apparition des signes cliniques lors d’une infection aiguë par le SBV et par un autre agent infectieux (Deffontaines) ............................................................... 96 Figure 41 : Vue latérale de l’encéphale de bovin (Budras, 2003).......................................... 101 14 Figure 42 : Hypoplasie du cervelet chez un veau infecté par le SBV (Herder, 2012) ........... 102 Figure 43 : Porencéphalie chez un veau infecté par le SBV (Herder, 2012) ......................... 103 Figure 44 : Infiltration lymphohistiocytaire perivasculaire modérée dans un cerveau d’agneau infecté par le SBV (barre d’échelle : 20 µm) (Herder, 2013)................................................. 104 Figure 45 : infiltration lymphohistiocytaire multifocale de la moelle épinière d’un agneau infecté par le SBV (barre d’échelle : 1 000 µm) (Herder, 2013)............................................ 105 Figure 46 : Moelle épinière cervicale d’un veau infecté par le SBV. Micromyélie avec réduction importante de la substance grise. (La flèche montre des neurones et l’astérisque une fibrose importante au niveau du sillon ventral) (Herder, 2012) ............................................. 107 Figure 47 : Distribution des cas d’encéphalites avec présence ou non d’antigènes viraux chez des nouveaux nés présentant des malformations (Herder, 2013)........................................... 109 Figure 48 : Fibres musculaires d’un agneau infecté par le SBV. Fibres musculaires normales (astérisque). La plupart des fibres présentent une myofibrille hypoplasique (Herder, 2012) 110 Figure 49 : Conséquences lésionelles d’une infection par le SBV (Deffontaines) ................ 111 Tableaux Tableau 1 : Les différents genres de la famille des Bunyavirus............................................... 25 Tableau 2 : Caractéristiques des virus ayant une forte homologie avec le SBV...................... 27 Tableau 3 : Présentation des habitats larvaires des espèces du genre Culicoides (Diptera : Ceratopogonidae) vectrices du SBV (Augot, 2012)................................................................ 34 Tableau 4 : Espèces réceptives au virus Akabane et aux autres virus du sérogroupe Simbu .. 38 Tableau 5 : Période de gestation susceptible d’entraîner des malformations congénitales lors de l’infection des mères par le SBV......................................................................................... 40 Tableau 6 : Faits marquants concernant la progression du SBV à travers l’Europe entre décembre 2011 et mai 2012. .................................................................................................... 42 Tableau 7 : Nombre de suspicions et foyers confirmés de SBV par pays, sur la période allant du 1er août 2011 au 30 octobre 2012 (EFSA, 2012b).............................................................. 46 Tableau 8 : Prévalence « cheptel » du SBV clinique dans les trois pays les plus touchés....... 47 Tableau 9 : Nombre de suspicions et de foyers confirmés de SBV par espèces sensibles, sur la période allant du 1er août 2011 au 30 octobre 2012 (EFSA, 2012b)........................................ 47 Tableau 10 : Nombre de foyers confirmés de SBV par pays au 30 avril 2013 (EFSA, 2013) 58 Tableau 11 : Comparaison du nombre de foyers ovins confirmés lors de la saison 2011/2012 et de la saison 2012/2013 (EFSA, 2012b ; EFSA, 2013)......................................................... 61 Tableau 12 : Comparaison du nombre de foyers de SBV confirmés ovins et bovins en France entre janvier 2012 et avril 2013................................................................................................ 63 Tableau 13 : Caractéristiques de la réponse immunitaire lors de l’infection d’un organisme animal par un virus ................................................................................................................... 67 Tableau 14 : Caractéristiques de la réponse immunitaire spécifique à médiation humorale et de la réponse immunitaire spécifique à médiation cellulaire. .................................................. 75 15 Tableau 15 : Fréquences d’observation des signes cliniques lors de SBV aigu chez les bovins (Collin, 2012) ........................................................................................................................... 81 Tableau 16 : Malformations congénitales visibles à la naissance causées par le virus Schmallenberg (Garigliany, 2012a). ........................................................................................ 83 Tableau 17 : Répartition des cheptels en fonction de la fréquence d’observation des différentes anomalies sur les veaux atteints de SBV congénital (Plateforme ESA, 2012a) .... 87 Tableau 18 : Répartition des cheptels en fonction de la fréquence d’observation des différentes anomalies sur les agneaux atteints de SBV congénital (Plateforme ESA, 2012b) 90 Tableau 19 : Liste non exaustive des affections à prendre en compte dans le diagnostic différentiel du SBV aigu chez les ruminants............................................................................ 95 Tableau 20 : Diagnostic différentiel clinique de la forme du SBV aiguë chez les bovins....... 97 Tableau 21 : Diagnostic différentiel clinique de la forme du SBV aiguë chez les ovins......... 98 Tableau 22 : Liste non exaustive des affections à prendre en compte dans le diagnostic différentiel du SBV congénital chez les ruminants .................................................................. 99 Tableau 23 : Comparaison entre les signes cliniques du SBV congénital et les signes cliniques des maladies les plus fréquentes considérées dans le diagnostic différentiel......................... 100 Tableau 24 : Distribution des lésions dégénératives entre les zones du SNC concernées par une inflammation uniquement et les zones concernées par des malformations associées ou non à une inflammation................................................................................................................. 106 Tableau 25 : Evolution des lésions au niveau du cerveau chez des souris infectées par le SBV (Varela, 2013)......................................................................................................................... 108 Tableau 26 : Prélèvements et analyses à réaliser en fonction du contexte............................. 116 Tableau 27 : Pyréthrinoïdes de synthèse disponibles sur le marché pour les bovins et les ovins : indications principales du RCP .................................................................................. 121 Tableau 28 : Nombre de foyers de FCO (ovins et bovins) déclarés par la France entre 2006 et 2011 (Bricq, 2008) ................................................................................................................. 124 Tableau 29 : Evolution des modalité de renseignements des cas de SBV congénital en France ................................................................................................................................................ 129 Tableau 30 : Restrictions d’importations liées au SBV en 2012 (ProMed-mail, 2012a)....... 132 Tableau 31 : Circulation du SBV chez des agnelles apparteneant à un troupeau immunisé contre ce virus (Claine, 2013) ................................................................................................ 134 Tableau 32 : Diagnostic clinique de la FCO (Elbers, 2008) .................................................. 161 Tableau 33 : Signes observés sur les animaux en fonction de la localisation des lésions (Du Terrail, 2008).......................................................................................................................... 165 Tableau 34 : conséquences cliniques des maladies transmises par les tiques chez les ruminants ................................................................................................................................................ 170 Tableau 35 : Anomalies rencontrées chez le veau lors de BVD congénital et chez l’agneau lors de border disease congénital (Smith, 2009) .................................................................... 172 Tableau 36 : Effets de l’infection in-utero du fœtus bovin par le virus de la FCO en fonction du stade de gestation (Belbis, 2009)....................................................................................... 173 16 Liste des annexes Annexe 1 : Relations phylogéniques entre le SBV et les autres Orthobunyavirus du sérogroupe Simbu (Goller, 2012)............................................................................................. 157 Annexe 2 : Répartitions mensuelles des mises bas en France chez les bovins et les ovins ..... 158 Annexe 3 : Répartition des foyers de FCO en Europe, 2008 (Bricq, 2008)............................. 159 Annexe 4 : Affections à prendre en compte dans le diagnostic différentiel du SBV aigu chez les ruminants ............................................................................................................................ 160 Annexe 5 : Affections à prendre en compte dans le diagnostic différentiel du SBV congénital chez les ruminants .................................................................................................................... 171 Annexe 6: Critères applicables à l’inscription des maladies, des infections et des infestations listées par l’OIE (OIE, 2013b) ................................................................................................. 177 17 Liste des sigles et abréviations utilisés ADN : Acide DésoxyriboNucléique ADNc : Acide DésoxyriboNucléique complémentaire AFSSA : Agence Française de Sécurité Sanitaire des Aliments AHS : Arthrogryposis-Hydranencephaly Syndrom AINOV : Aino Virus AKAV: Akabane Virus AMM : Autorisation de Mise sur le Marché Anap : Anaplasmose Anses : Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail ARN : Acide RiboNucléique Bab : Babésiose BATV : Batai Virus BDV : Border Disease Virus BfR : Bundesinstitut für Risikobewertung BHK : Baby Hamster Kidney BoH : Bovine Herpesvirus BTV : Bluetongue Virus BUNV : Bunyamwera Virus BVD : Bovine Virus Diarrhea CD : Cluster of Differenciation CMH : Complexe Majeur d’Histocompatibilité CP : Cytopathogène CSSA : Caisse de Solidarité Santé Animale Da : Dalton DEFRA : Département pour l’environnement, l’alimentation et les affaires rurales DGAL : Direction Générale de l’Alimentation DOUV: Douglas Virus DUGV : Dugbe Virus ECDC : European Center for Disease Prevention and Control EDTA : Ethylenediaminetetraacetic Acid EFSA : European Food Safty Autority EHD : Epizootic Hemorragic Disease ELISA : Enzyme-Linked Immunosorbent Assay ESA : Epidémiosurveillance en Santé Animale FA : Fièvre Aphteuse FC : Fièvre Charbonneuse FCO : Fièvre Catarrhale Ovine FLI : Friedrich Loeffler Institut GDS : Groupement de Défense Sanitaire HTNV : Hantaan Virus IBR : Rhinotrachéite Infectieuse Bovine IL : Interleukines INF : Interféron IPI : Infecté Permanent Immunotolérant IRF : Interferon Regulatory Factor JAK : Janus Kinase 18 KO : Knock-Out L : Large LACV : La Crosse Virus LB : Lymphocyte B LBE : Leucose Bovine Enzootique LT : Lymphocyte T M : Medium MD : Mucosal Disease NAMP : National Arbovirus Monitoring Program NCP : Non Cytopathogène ND : Non Déterminé NK : Natural Killer NUTS : Nomenclature d’Unités Territoriales Statistiques OAS : Oligoadenylate Synthétase OIE : Organisation Mondiale de la Santé Animale OROV : Oropouche virus PCR : Polymerase Chain Reaction PEAV : Peaton Virus PK : Protéine Kinase PPR : Peste des Petits Ruminants qRT-PCR : Quantitative Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction RCP : Résumé des Caractéristiques du Produit RIVM : Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu RT-PCR : Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction RVFV : Rift Valley Fever Virus S : Small SABOV : Sabo Virus Salm : Salmonellose SANV : Sango Virus SATV : Sathuperi Virus SBV : Schmallenberg Virus SHAV : Shamonda Virus SHUV : Shuni Virus SIMV : Simbu Virus SNC : Système Nerveux Central SNGTV : Société Nationale des Groupements Techniques Vétérinaires STAT : Signal Transducer and Activator of Transcription TAHV : Tahyna Virus TLRs : Toll-Like Receptors TNF : Tumor Necrosis Factor UE : Union Européenne UFP : Unités Formant Plaques UNCEIA : Union National des Coopératives d’Elevage et d’Insémination Animale WD : Winter Dysentery 19 20 Introduction Au cours des dix dernières années, le continent européen a vu l’émergence de plusieurs maladies virales infectieuses à transmission vectorielle. Il s’agit d’arboviroses : la transmission du virus se fait par l’intermédiaire d’arthropodes hématophages. Ces maladies ont un impact sanitaire variable, tant sur la santé animale que sur la santé humaine. Ainsi, en 2006, la fièvre catarrhale a émergé aux Pays-Bas, entraînant des pertes importantes dans les troupeaux ovins et bovins européens et français (plus de 50 000 foyers ovins et bovins en France entre 2006 et 2009 (Bricq, 2008). D’autres maladies, comme le Chikungunya apparu en Italie en 2007, la fièvre du Nil occidental observée en Grèce et en Roumanie en 2010 ou encore la dengue découverte en France et Croatie 2010, présentent un risque pour la santé humaine de part leur caractère zoonotique (Lindgren, 2012). Elles sont ainsi responsables de plusieurs milliers de morts dans le monde chaque année. L’Europe apparaît alors comme un potentiel point chaud pour l’émergence et la réémergence de maladies infectieuses. En 2011, un nouveau virus fait son apparition, d’abord en Allemagne et aux Pays-Bas avant de s’étendre à toute l’Europe occidentale : le virus Schmallenberg (SBV). Ce virus touche essentiellement les ovins et les bovins et dans une moindre mesure les caprins. La forme aiguë de la maladie est à l’origine de signes cliniques non spécifiques chez les adultes regroupés sous le terme de syndrome fébrile. La forme congénitale de la maladie est à l’origine de malformations chez les nouveaux nés. Ces malformations sont regroupées sous le terme de syndrome arthrogrypose-hydranencéphalie. Depuis la découverte de ce virus, de nombreuses études ont été menées, et le sont encore aujourd’hui, afin d’apporter des connaissances sur la biologie du SBV. L’objectif de ce travail est de synthétiser les résultats des travaux publiés avant septembre 2013, date de clôture de ce travail, afin de proposer une vue détaillée des caractéristiques de cette nouvelle maladie. Ce travail présente un intérêt particulier du fait des enjeux sanitaires liés à l’émergence de ce virus, comme les autres maladies émergentes de ce début de siècle le laissent à penser. Après une présentation des données générales, de l’historique de cette nouvelle maladie à son épidémiologie, les particularités immunologiques, cliniques et histo-pathologiques induites par le SBV seront abordées. Enfin, une analyse des conséquences de ce nouveau virus sera proposée afin d’en dégager des enseignements et des perspectives pour les années à venir. 21 22 1. Le virus Schmallenberg : généralités 1.1. Historique des évènements qui ont conduit à la découverte du virus Pendant l’été 2011, les éleveurs et les vétérinaires de la Rhénanie, du Nord-Westphalie et des Pays-Bas ont rapporté une nouvelle maladie survenant dans les élevages de bovins laitiers. Aux Pays-Bas, 80 élevages étaient concernés à ce moment là. Les symptômes observés corespondaient à un syndrome fébrile non spécifique ne durant que quelques jours. Dans tous les cas, la guérison est survenue rapidement. Toujours aux Pays-Bas, une première hypothèse de botulisme chronique a été écartée. Par la suite, les services de Santé Animale ont réalisé plusieurs tests diagnostiques sans toutefois identifier un agent pathogène responsable (Brugère-Picoux, 2012). En Allemagne, les analyses menées à l’Institut Friedrich Loeffler1 (FLI) ont permis d’écarter les virus de la fièvre catarrhale ovine, de la maladie hémorragique épizootique, de la fièvre aphteuse, de la diarrhée virale bovine, de la rhinotrachéite infectieuse bovine ainsi que ceux responsables de la fièvre de la Vallée du Rift et de la fièvre éphémère bovine, comme agents étiologiques de cette maladie. La maladie a été signalée pour la première fois le 15 novembre 2011 (ProMed-mail, 15 novembre 2011). Au cours du mois de novembre 2011, en Allemagne, dans une ferme près de la ville de Schmallenberg, des prélèvements de sang ont été réalisés sur trois vaches laitières adultes présentant les symptômes de cette nouvelle maladie. A partir de ces trois échantillons de sang, le FLI est parvenu à identifier l’agent causal par l’intermédiaire d’une analyse métagénomique. Il s’agissait d’un virus ayant des séquences génomiques présentant une homologie avec le genre Orthobunyavirus de la famille des Bunyaviridae (Brugère-Picoux, 2012 ; Hoffmann, 2012). 1.2. Le virus 1.2.1. Analyse métagénomique 1.2.1.1. Principe Le but d’une analyse métagénomique est d’identifier l’ensemble des microorganismes présents dans un échantillon (d’eau ou de sang par exemple). Pour cela, l’ensemble du matériel génétique de cet échantillon est amplifié, puis il est confronté aux bases de données dépositaires des séquences génomiques spécifiques de tous les organismes et microorganismes identifiés. Si ce type d’analyse ne permet pas toujours d’identifier clairement l’ensemble des espèces présentes dans l’échantillon analysé, il permet 1 Organisme fédéral allemand spécialisé dans la recherche en santé animale. 23 au moins de préciser le type de microorganismes (virus, bactérie, levure, etc), leur famille voire leur genre. Ainsi, lors de la recherche d’un agent pathogène nouveau, l’analyse métagénomique permet aussi d’identifier des séquences spécifiques, indispensables pour la mise au point de nouveaux protocoles à des fins diagnostiques. Dans le cas du SBV, le premier échantillon analysé était un mélange de sang obtenu sur trois vaches laitières ayant présenté des signes cliniques suspects en octobre 2011. Le sang d’une vache non malade dans une ferme voisine a également été prélevé, constituant ainsi un échantillon témoin. Pour l’analyse métagénomique, quatre bibliothèques génomiques ont été réalisées, correspondant à l’ADN et à l’ARN de chaque échantillon, le pool de sang des trois vaches malades d’une part et le sang de la vache saine d’autre part. Chacune des quatre bibliothèques obtenues à partir des deux échantillons a été séquencée (technologie Roche 454) puis confrontée aux bases de données existantes (Hoffmann, 2012). 1.2.1.2. Résultats Des séquences génomiques spécifiques aux Orthobunyavirus n’ont été retrouvées que dans la bibliothèque d’ARN obtenue à partir de l’échantillon de sang des trois vaches malades. Ces séquences sont incluses dans trois segments d’ARN de tailles différentes : le segment S (Small) composé de 830 nucléotides, le M (Medium) de 4415 nucléotides et le L (Large) de 6865 nucléotides (Hoffmann, 2012). Afin d’identifier plus précisément cet Orthobunyavirus, ces trois segments ont été comparés aux séquences d’ARN de la base de données utilisée. Ainsi, les trois segments présentent des homologies avec des souches virales japonaises du sérogroupe Simbu. Le segment S présente 97% d’homologie avec le virus Shamonda, le segment M, 71% avec le virus Aino et le segment L, 69% avec le virus Akabane (Hoffmann, 2012). Ces trois virus sont connus pour leur tératogénicité chez les ruminants. A cause du manque d’informations concernant les segments M et L du virus Shamonda, seul le segment S a été utilisé pour les analyses phylogéniques. Les résultats de l’arbre phylogénique montrent que le segment S est distinct mais proche de celui des virus Shamonda du sérogroupe Simbu (Hoffmann, 2012). 1.2.1.3. Conclusions d’Hoffman La figure 1 représente les relations phylogéniques entre le SBV et les Orthobunyavirus des sérogroupes Simbu, Bunyamwera et California. Pour établir cet arbre, Hoffmann a utilisé le gène de la nucléocapside (702 nucléotides) localisé sur le segment d’ARN S. 24 Figure 1 : Relations phylogéniques entre le SBV et les autres Orthobunyavirus des sérogroupes Simbu, Bunyamwera et California (Hoffmann, 2012) D’après Hoffman, le SBV est un virus Shamonda-like du genre Orthobunyavirus ; l’homologie inconstante entre les différents segments de différents orthobunyavirus proviendrait du manque d’informations concernant les segments M et L du virus Shamonda. Cela n’implique pas forcément que le SBV est un réassortant. Remarque : La métagénomie est une nouvelle technologie qui s’est révélée très utile dans la détection précoce de ce nouveau pathogène chez les animaux de production. En effet, le SBV a été découvert lors des manifestations cliniques aigues chez les adultes et bien avant que les premiers cas de nouveaux nés malformés soient rapportés. De ce fait, les outils de diagnostic ont pu être mis au point rapidement afin de suivre la progression de la forme congénitale du SBV mais aussi afin d’évaluer la séroprévalence dans les différents troupeaux. 1.2.2. Le SBV, un Bunyavirus du genre Orthobunyavirus Les Bunyavirus Les Bunyavirus sont répartis en 5 genres (Elliott, 2009). Tableau 1 : Les différents genres de la famille des Bunyavirus Famille Bunyavirus (Bunyaviridae) Genre Tospovirus Orthobunyavirus Phlebovirus Nairovirus Hantavirus Quelques exemples Virus de plantes Virus de la Cache Valley, virus Akabane, virus Shamonda, virus Aino Virus de la fièvre de la vallée du Rift Virus Nairobi Virus Hantaan, virus Séoul, virus Amur 25 Les Orthobunyavirus Le genre Orthobunyavirus comporte plus de 170 virus d’inportance variable aussi bien en médecine humaine qu’en médecine vétérinaire. Il comprend actuellement 18 sérogroupes dont le sérogroupe Simbu. Ces sérogroupes sont efféctués à partir des résultats de tests de fixation du complément sur la protéine de la nucléocapside virale. A ce jour, le sérogroupe Simbu est composé de 25 virus divisés en 7 « espèces » : Akabane virus, Manzanilla virus, Oropouche virus, Sathuperi virus, Shamonda virus, Shuni virus et Simbu virus. Ces “espèces” sont déterminées par des tests de « neutralisation » croisée et des tests « d’hémagglutinationinhibition » croisée (Yanase, 2012). Répartition géographique Les Orthobunyavirus sont largement répartis en Asie, en Afrique et en Océanie (Hoffmann, 2012). Aucun des virus du sérogroupe Simbu n’avait auparavant été détecté en Europe. Cependant, un virus du même genre mais d’un sérogroupe différent (virus Batai) a déjà été isolé en 2009 en Allemagne (Sud-Ouest) chez des moustiques (Löst, 2011). 1.2.2.1. Relations phylogéniques L’hypothèse que le SBV soit un réassortant entre un segment d’ARN M dérivant d’un virus Sathuperi et les segments L et S d’un virus Shamonda (Yanase, 2012) a été évoquée suite aux travaux de Yanase et coll. Cependant, les résultats des traveaux de Goller et coll. sur la phylogénie et les réactions de neutralisation croisée du SBV vis-à-vis de 9 autres virus du sérogroupe Simbu montrent que le SBV n’est probablement pas un réassortant et qu’il est à classer, dans le sérogroupe Simbu, dans le groupe des virus Sathuperi (Goller, 2012). A la lecture des différents arbres phylogéniques établis par Goller (annexe 1) et Hoffman (figure 1) certains virus ayant une forte homologie avec le SBV sont présentés dans le tableau ci-dessous. Ils sont répertoriés en fonction de leurs origines géographiques et de leurs conséquences cliniques chez les ruminants. La distribution géographique est établie à partir d’isolements viraux positifs chez des arthropodes vecteurs et les hôtes vertébrés après une infection naturelle. 26 Tableau 2 : Caractéristiques des virus ayant une forte homologie avec le SBV Virus du sérogroupe Simbu Akabane Aino Shamonda Sathuperi Année du premier isolement 1959 (Japon) 1964 (Japon) 1965 (Nigéria) 1957 Australie, Japon, Taïwan, Israël, Corée, Turquie, Kenya, Afrique du sud, Malaisie, Inde Australie, est et sud-est de l’Asie Nigéria, Japon Inde, Nigéria, Japon Hôte principal Bovin Bovin Bovin Bovin Conséquences cliniques Syndrome arthogrypose hydranencéphalie Malformations congénitales, avortement, mortinatalité Asymptomatique Asymptomatique % d’homologie avec le SBV d’après Hoffman (Hoffmann, 2012) 69% pour le segment L 71% pour le segment M 97% pour le segment S Distribution géographique % d’homologie avec le SBV d’après Goller (Goller, 2012) 92,9 % pour le segment L 82,1 % pour le segment M De même que d’autre virus du sérogroupe Simbu, comme les virus Tinaroo, Simbu, Sabo, Sango, Shnuni et le virus de la Cache Valley qui sont également connus pour induire des anomalies congénitales, le SBV est un virus à action tératogène. 1.2.2.2. Morphologie et composition du SBV Les Bunyavirus sont des virus enveloppés et de petite taille. La particule virale mesure entre 100 et 120 nm. Le génome de ces virus est composé d’un ARN simple brin, de polarité négative. Cet ARN est constitué de 3 segments génomiques, L, M et S (pour Large, Medium et Small). Ces dénominations corespondent a leur longueur relative en nucléotides. Les trois segments d’ARN adoptent une configuration circulaire en association avec la protéine N de la nucléocapside. Le génome du SBV code pour quatre protéines structurales et deux protéines non structurales (Elliot, 2012). • • Le segment L code pour la polymérase L (une ARN polymérase ARN dépendante). Le segment M code pour les deux glycoprotéines de surface qui sont GN et GC ainsi que, chez les Orthobunyavirus, Tospovirus et Phlebovirus, pour une protéine NSm, impliquée dans la morphogénèse virale. 27 • Enfin, le segment S code pour la nucléoprotéine N. Pour la plupart des espèces des genres Orthobunyavirus, Tospovirus et Phlebovirus, il code également pour la protéine NSs, qui intervient dans la modulation de la réponse antivirale des cellules infectées (Pépin, 2012). Figure 2 : Structure du SBV (photos du FLI) Remarque : La présence d’un génome tri-segmenté rend possible l’émergence de virus réassortants, conséquence d’un échange de segments entre deux virus infectant un même hôte ou un même vecteur. Ainsi, cette possibilité a, un temps, été évoquée pour expliquer l’émergence du virus Schmallenberg (Yanase, 2012 ; Pépin, 2012). 1.2.2.3. Propriétés 1.2.2.3.1. Propriétés physico-chimiques Par extrapolation des résultats obtenus avec les Orthobunyavirus du sérogroupe California, le pouvoir infectieux du SBV serait fortement réduit par chauffage à 50-60°C pendant au moins 30 minutes. Il serait sensible aux désinfectants communs tels l’eau de javel à 1%, le glutaraldéhyde à 2%, l’éthanol à 70% et le formaldéhyde. Sa survie dans le milieu extérieur, en dehors du vecteur ou d’un hôte, serait très limitée dans le temps (OIE, 2013a). 1.2.2.3.2. Propriétés antigéniques Les glycoprotéines GC et GN, sont présentes à la surface de chaque particule virale. Ces protéines ont pour conséquence d’induire la production d’anticorps neutralisants chez l’individu hôte. Notons que, parmi les trois segments, le segment d’ARN M est celui qui présente le plus de variabilité chez les Orthobunyavirus. Cela suggère que ce segment a subi une forte pression de la part de l’immunité des différents hôtes de ces virus au cours du temps (Elliott R. B., 2011). 28 Remarque : Les réarrangements génétiques à l’origine des réassortants ont un impact important sur l’antigénicité, la virulence et le pouvoir pathogène des virus segmentés. Ils sont à l’origine de l’évolution des différents genres au sein des familles virales (Yanase, 2012). Par exemple, le virus influenza responsable de la grippe A (H1N1), qui a entraîné la mort de plus de 15 000 personnes à travers le monde en 2010, est un réassortant entre des virus influenza d’origines porcine, aviaire et humaine (Centers for Disease Control and Prevention, 2010). 1.2.2.3.3. Echappement à la réponse immunitaire Chez l’homme et l’animal, les Bunyavirus ont développé des stratégies efficaces d’évitement, notamment de la réponse immunitaire innée. Les différentes stratégies reposent sur l’action de la protéine NSs. Cette dernière, synthétisée à partir du segment S, est capable d’inhiber les réponses antivirales de l’hôte infecté, en particulier celles induites par le système interféron (Bouloy, 2001 ; Elliott, 2009). 1.2.2.4. Effet cytopathique La culture du SBV sur des cellules de différentes espèces animales et de l’espèce humaine a permis de montrer que le virus peut se multiplier dans des lignées cellulaires de mouton, de bovin, d’humain, de chien, de hamster et d’insectes (cellules KC). Quarante-huit heures après l’infection, le titre viral est de 106 unités formant plaques par millilitre2 entraînant un effet cytopathique sur toutes ces cellules. Le SBV semble se repliquer le plus efficacement sur la lignée ovine. En effet, 72 heures après l’inoculation, des plages de lyse aux contours bien nets de 3mm sont observées (Varela, 2013). 1.2.2.5. Cycle de réplication L’interaction entre les glycoprotéines de surface des particules virales et les récepteurs cellulaires permet aux Bunyavirus de pénétrer dans la cellule hôte par endocytose. Après la décapsidation et la libération de l’ARN viral dans le cytoplasme de la cellule hôte, ont lieu la réplication et la synthèse des protéines du virion puis la reconstitution de nouvelles particules virales au niveau de l’appareil de Golgi et du réticulum endoplasmique. Chaque segment génomique est associé à la polymérase et ils sont empaquetés par la nucléocapside pour former le complexe ribonucléoprotéique. Puis, suite à la fusion de la membrane de l’appareil de Golgi avec la membrane cellulaire, les nouvelles particules virales se forment par bourgeonnement (Walter, 2011). 2 Chez les lignées receptives au virus, la présence de ce dernier conduit à la destruction des cellules et à l’apparition de plaques ou de zones claires. Le nombre de particules virales est supposé correspondre au nombre de plaques observées. Le dénombrement est exprimé en unités formant plaques par millilitre (UFP/mL). 29 Figure 3 : Schéma du mode de réplication des Bunyavirus au sein de la cellule hôte (Whitehouse, 2004) 1.2.3. Le SBV, un arbovirus 1.2.3.1. Définition et conséquences Le terme arbovirus désigne les virus se multipliant à la fois chez les vertébrés et chez des arthropodes suceurs de sang. Suite à un repas sanguin, le virus se multiplie dans le tube digestif de l’insecte puis gagne les glandes salivaires où la multiplication virale se poursuit. L’insecte, qui ne souffre aucunement de l’infection virale, transmet alors le virus aux vertébrés lors de ses futurs repas sanguins. Ce type d’insecte est qualifié de vecteur biologique. Tous les Bunyavirus, à l’exception des Hantavirus (Walter, 2011), sont transmis par des arthropodes et sont donc des arbovirus. C’est notamment le cas de tous les membres du sérogroupe Simbu. Par exemple, le virus Akabane a été isolé chez des moucherons piqueurs du genre Culicoïdes spp et chez des moustiques des genres Anopheles, Culex et Ochlerotatus (Kurogi, 1987 ; Bryant, 2005). Le virus Aino est quant à lui transmis à la fois par des moustiques du genre Culex spp et des moucherons du genre Culicoïdes (Doherty, 1979 ; Kim, 2005). Lors de la découverte du SBV, son appartenance au sérogroupe Simbu a légitimement laisser penser que ce virus était un arbovirus, ce qui a été démontré très rapidement par la suite. 30 1.2.3.2. Identification du vecteur L’hypothèse d’un rôle central des arthropodes du genre Culicoïdes dans la transmission du SBV a été étayée par plusieurs études rétrospectives. Le virus SBV a été identifié chez des moucherons du genre Culicoïdes piégés au Danemark en octobre 2011 (Rasmussen, 2012). A cette époque, aucun cas de foyer animal n’avait été notifié au Danemark. En Belgique, l’ARN du SBV a été détecté dans un pool de C. obsoletus capturés début septembre 2011 et dans un pool de C. dewulfi capturés début octobre 2011. En Italie, le virus a également été identifié sur six pools de Culicoïdes du complexe obsoletus piégés entre septembre et novembre 2011 (Domignez, 2012). Ainsi, le virus ne serait pas contagieux d’un animal à un autre mais serait transmis par un moucheron du genre Culicoïdes, à savoir le même genre que le moucheron vecteur du virus de la FCO. 1.2.4. Pathogénie L’infection de l’hôte réceptif se fait à la suite de l’injection de salive contenant du SBV, lors de la piqûre d’un moucheron infestant. Dans un premier temps, le virus va se répliquer à proximité du point d’inoculation, puis dans les noeuds lymphatiques drainant la zone correspondante. Ensuite, le virus va se disséminer dans l’organisme jusqu’aux organes cibles : c’est la phase de virémie qui dure de 2 à 5 jours pour le SBV (Hoffmann, 2012). Les cellules cibles du SBV sont les cellules nerveuses du système nerveux du fœtus et les cellules musculaires. L’infection entraîne une réponse immunitaire innée basée sur la production d’interférons (IFN) de type 1 et une réponse immunitaire adaptative basée sur la production d’anticorps. Cependant, la protéine virale NSs du SBV inhibe la production d’IFN de type 1 (Wernike, 2012). De plus, pour la plupart des Bunyavirus, cette protéine induit l’apoptose de la cellule hôte lorsque la formation des nouvelles particules virales est achevée (Walter, 2011). La pathogénie du SBV repose donc sur sa capacité à échapper à la réponse immunitaire de l’individu infecté et pourrait également reposer sur sa capacité à induire l’apoptose des cellules infectées. Remarque : La phase de virémie observée lors de l’inoculation expérimentale du SBV dure de 2 à 5 jours (Hoffmann, 2012). Cependant, une étude de terrain récente laisse supposer que cette phase de virémie, dans les conditions naturelles, pourait être supérieure à 15 jours (Claine, 2013). 1.3. Le vecteur : un moucheron du genre Culicoïdes 1.3.1. Généralités 1.3.1.1. Présentation Les Culicoïdes sont les plus petits diptères hématophages. Ils mesurent de 1 à 3 mm de long. Le genre Culicoïdes fait partie de la sous-famille des Ceratopogoninae, comportant 60 genres 31 répartis en 4 sous-familles. Il existe plus de 1400 espèces de Culicoïdes, dont 87 ont été signalées en France métropolitaine et en Corse (Augot, 2012). 1.3.1.2. Répartition géographique Le genre Culicoïdes est présent globalement dans le monde entier, sur une zone allant d’une latitude de 40° Nord jusqu’à 35° Sud, comprenant l’Afrique, le Proche et Moyen-Orient, l’Asie, l’Australie, l’Amérique du Sud et l’Europe. 1.3.1.3. Description Les Culicoïdes ont une morphologie classique de la famille des Cératopogonidés : ils présentent un corps élancé, avec des ailes velues recouvrant le corps au repos, et des antennes longues et filiformes, globuleuses à la base, constituées de 12 à 16 articles agencés comme des grains de chapelet. Les Culicoïdes s’identifient facilement grâce à des motifs alaires noirs et blancs constitués de pigments compris dans la membrane de l’aile. De plus, l’aile est parcourue d’une nervure médiane pédiculée et d’une nervure transverse. Les mâles et les femelles sont différenciés par l’étude attentive des antennes et des pièces buccales (Perie, 2005). Figure 4 : Comparaison entre la taille d’un Culicoïdes (Culicoïdes scoticus, Downes et Kettle, 1952) (à gauche) et d’un moustique (Culex spp) (à droite), toutes deux femelles (Zimmer, 2008a) 1.3.2. Biologie et écologie du vecteur 1.3.2.1. Biologie des Culicoïdes Les Culicoïdes se nourrissent en majorité de nectar et seules les femelles (dans un grand nombre d’espèces) sont hématophages. Chez 90% des espèces, le repas sanguin précédant la ponte est obligatoire. Il est réalisé environ deux jours avant la ponte. 32 La majorité des espèces de Culicoïdes étant de nature crépusculaire ou nocturne, ils piquent rarement en plein jour et en plein soleil, mais plutôt, à l’ombre, à l’aube, ou le soir au coucher du soleil. Durant la journée, ils sont au repos ; ils fréquentent alors la face inférieure des feuilles ou des herbes situées en zone ombragée. Chaque ponte est précédée d’un repas sanguin 2 jours avant environ. Une seule ponte peut représenter entre 10 et 674 œufs en fonction des facteurs liés à l’espèce et aux conditions de vie. Les œufs, pondus au sol en milieu généralement humide, éclosent 2 à 8 jours après la ponte (sauf exception dans les pays nordiques). Le développement larvaire dure entre 2 semaines et 1 mois selon les conditions climatiques. Les insectes se transforment alors en nymphes, puis en adultes au bout de 2 à 10 jours. En général, la durée de vie des adultes est courte (10 à 20 jours), mais ils peuvent vivre pendant des périodes plus longues (entre 1,5 et 3 mois) surtout en cas de températures basses, et peuvent ainsi prendre de multiples repas sanguins (Walzer, 2009). Figure 5 : Cycle de vie des moucherons du genre Culicoïdes (Purse, 2005) Les Culicoïdes adultes s’éloignent tout au plus de quelques centaines de mètres de l’endroit où les imagos ont vu le jour : leur dispersion active est donc très limitée (Mellor, 2000). Leur dispersion passive par les vents chauds et humides de basse altitude (< 2000 m), soufflant à vitesse moyenne (10 à 40 km/h), est cependant nettement plus importante puisqu’elle peut atteindre plusieurs centaines de kilomètres (Braverman, 1996). Cette dispersion passive peut ainsi propager ces insectes vers de nouvelles régions et entraîner l’apparition ou la dispersion de certaines épizooties comme celles constatées ces dernières années, telle que la FCO ou le SBV. 33 La densité des populations de Culicoïdes adultes varie avec les saisons. Certaines espèces sont présentes au cours de toute l’année tandis que d’autres ne sont présentes que peu de temps. Les espèces C. obsoletus et C. scoticus sont des espèces précoces ayant une longue période de vie; elles apparaissent mi-avril pour disparaître début novembre tandis que C. impunctatus se rencontre par exemple que de mai à septembre (Service, 1971). De façon générale, deux générations sont observées chaque année : une de printemps et une d’été, de moindre importance (Rieb, 1982). 1.3.2.2. Milieux de vie Les espèces incriminées dans la transmission du virus Schmallenberg sont associées à des biotopes humides et riches en matières organiques. Ainsi, C. dewulfi est une espèce exclusive des bouses de vache. C. obsoletus, qui fait partie des espèces dont les adultes récoltés par piégeage sont les plus abondants, est vraissemblablement ubiquiste. Plusieurs études vont dans ce sens : ainsi, C. obsoletus a été retrouvé dans les litières de forêt en Europe (Jamnback, 1963 ; Conte, 2007), mais aussi dans des trous d'arbres, des tas de fumier, du mélange paille et fèces ou du crottin, ou encore dans du compost de jardin (Augot, 2012). Récemment, des larves de C. obsoletus (et dans une moindre mesure de C. scoticus) ont été trouvées dans des résidus d'ensilage de maïs (Zimmer, 2008b), mais aussi à l’intérieur d’étables en Belgique (Zimmer, 2010). Enfin, dans les Ardennes, un nombre important de larves de C. obsoletus a été trouvé dans de vieux fumiers (litières) en décomposition avancée se transformant en un compost terreux près du sol, contre les murs, à l’intérieur comme à l’extérieur des bâtiments d’élevage, ainsi qu’au pied des fumières déposées dans les pâtures (Ninio, 2011). Tableau 3 : Présentation des habitats larvaires des espèces du genre Culicoides (Diptera : Ceratopogonidae) vectrices du SBV (Augot, 2012) Espèce C. obsoletus C. dewulfi Gîtes larvaires Mélange bouse et fumier ± transformé en terreau, trou d’arbre, ensilage de maïs, résidus de grains et plantes en décomposition Bouses de vaches (desséchées en surface), crottin de cheval, résidus de grains et plantes en décomposition 1.3.2.3. Facteurs influançant la biologie des Culicoïdes 1.3.2.3.1. Influence de la température La survie, l’activité et la dispersion des Culicoïdes sont fortement influencées par les facteurs météorologiques telles que la température, l’humidité, le vent, etc. La température est sans doute l’élément jouant le rôle le plus important sur le comportement et la survie de ces moucherons. En effet, leur activité est significative entre 13°C et 35°C (Braverman, 1996), même si ces limites varient en fonction des espèces. Pour C. obsoletus par exemple, des vols sont constatés à des températures minimales situées entre 6°C et 12°C dans des étables au cours de l’hiver 2006-2007 (Losson, 2007). Au contraire, des températures basses inhibent l’activité des adultes et le développement larvaire. 34 La hausse des températures entraîne une augmentation du nombre de repas sanguins, de la fréquence de ponte et de la taille de la population. Mais au-dessus d’une certaine température seuil, spécifique à chaque espèce, l’effet s’inverse. Ceci est à mettre en relation avec l’importance de l’humidité pour le développement et la survie des Culicoïdes (Murray, 1991). En effet, les larves sont particulièrement sensibles à la dessiccation, qui les tue rapidement. La sécheresse est également défavorable aux adultes, qui se réfugient alors dans la végétation ; par temps lourd et orageux, ils reprennent leur activité. La pluie ne leur est pas non plus favorable, puisqu’elle empêche leur vol. Ces éléments justifient le fait que pour les régions tempérées, ces vecteurs sont surtout abondants au printemps et vers la fin de l’été et le début de l’automne. 1.3.2.3.2. Survie hivernale du vecteur Les piégeages de Culicoïdes réalisés en hiver montrent que le nombre de vecteurs à cette période est très faible. En cas de températures relativement clémentes, dans les régions tempérées, les larves de nombreuses espèces peuvent passer l'hiver et rester au stade larvaire pendant 7 mois. Lorsque la moyenne mensuelle des températures maximales quotidiennes est supérieure à 12,5 °C en hiver, la zone peut être considérée comme favorable à la survie de Culicoides imicola. Si cette moyenne n’est atteinte qu’au cours de sept mois dans l’année, il est possible que des Culicoides survivent mais la probabilité est beaucoup moins élevée (Perie, 2005). Dans le cas de la FCO, qui est aussi un virus transmis par un moucheron du même genre, la réémergence du virus au printemps 2007 implique un transhivernage du virus (Zimmer, 2010 ; Losson, 2007). 1.3.3. Du moucheron « sain » au moucheron vecteur : conditions à réunir Dans un premier temps, pour permettre la transmission de la maladie, le vecteur doit être en mesure de réunir certaines conditions qui déterminent sa compétence (Walzer, 2009). La compétence vectorielle fait référence à la possibilité pour un vecteur, à l’echelle individuelle, de pouvoir être infécté par le virus, de pouvoir le multiplier et de pouvoir le transmettre. Dans un deuxième temps, la population de vecteurs doit avoir la possibilité de disséminer l’agent pathogène : c’est la capacité vectorielle. La capacité vectorielle est un paramètre plutôt écologique. Elle se calcule avec les éléments suivants : la survie du vecteur, le nombre de repas sanguins moyen que la population de vecteurs effectue sur un individu hôte par jour, la période d’incubation virale propre au vecteur et la compétence du vecteur. Tous ces paramètres sont sujets aux variations de l’environnement. Pour pouvoir transmettre un virus, un moucheron du genre Culicoïdes doit donc être compétent et capable. Ainsi, un vecteur « compétent » peut avoir une faible capacité véctorielle due à un faible nombre de repas sanguins ou à une survie dans l’environnement 35 trop faible. A l’inverse, un vecteur peu «compétent » peut avoir une capacité vectorielle plus importante que celle supposée. La démonstration en laboratoire de la compétence d’un vecteur n’est donc pas suffisante pour conclure sur la capacité véctorielle de ce ce dernier, et ne permet pas de dire qu’il est à l’origine de l’expansion de la maladie (Mullens, 2004 ; Wittmann, 2002). L’identification du SBV chez des moucherons du genre Culicoïdes ainsi que la probable réplication du virus chez ces moucherons (Rasmussen, 2012) montrent la compétence de ce vecteur dans le cadre de la maladie de Schmallenberg. La capacité vectorielle de ces moucherons est, quant à elle, démontrée par l’expansion de la maladie entre fin 2011 et l’été 2013. 1.3.4. Activité vectorielle en France 1.3.4.1. Activité des Culicoïdes en 2011 En 2011, 3670 collectes ont été réalisées. Au total, 1 968 610 Culicoides ont été capturés, appartenant à au moins 72 espèces (contre 67 espèces en 2010). Concernant ces populations, l’année 2011 a été marquée en France par (Balenghien, 2012) : • une reprise précoce de l’activité. La reprise de l’activité3 des populations de Culicoides a été officiellement déclarée le 17 janvier (contre le 11 mars en 2009 et le 25 mars en 2010) ; • une population importante au printemps. Les populations de Culicoïdes ont présenté des abondances médianes4 bien plus élevées qu’en 2009 ou 2010, avec en mars une abondance médiane 6 à 8 fois plus élevée qu’en 2009 et 2010. La tendance se confirme en avril avec une abondance médiane 3 à 6 fois plus élevée qu’en 2009 et 2010 ; • un maintien de la population à l’automne. Les abondances médianes présentées à l’automne 2011 sont très élevées (3 à 7 fois plus par rapport à 2009 ou 2010) et sont équivalentes à ce qui est observé habituellement en été ; • une survie pendant l’hiver 2011-2012. L’activité des populations de Culicoïdes s’est maintenue pendant l’ensemble du mois de décembre sur la façade atlantique, ce qui a conduit la France à ne pas déclarer de fin de période d’activité en 2011. Des piégeages en janvier 2012 mettent en évidence une activité continue des populations jusqu’aux grands froids de février 2012. L’activité importante des populations de Culicoïdes en France en 2011 est à mettre en relation avec une année où la température n’est jamais été suffisamment basse pour inhiber l’activité des moucherons. En effet, les températures moyennes de l’automne 2011 sont restées 3 Au sens réglementaire, la période d’activité des Culicoïdes correspond à une capture de plus de cinq femelles par piège et par nuit. 4 L’abondance est le nombre maximal de femelles recensées sur un site, par piège et par nuit, pendant le mois considéré. L’abondance médiane est calculée à partir de l’ensemble des 166 sites suivis en France. 36 supérieures aux normales saisonnières, jusqu’à +4 °C en octobre et décembre, et jusqu’à +10°C en novembre. De plus, l’absence de grand froid a permis une survie hivernale du vecteur (Balenghien, 2012). 1.3.4.2. Activité des Culicoïdes en 2012 L’activité des différentes populations de Culicoïdes enregistrée en France sur l’année 2012 est moins importante que celle enregistrée en 2011. L’année 2012 est caractérisée par (Cirad, 2013) : • un maintien des populations vectorielles pendant le mois de janvier ; • une population de Culicoïdes moins nombreuse au printemps 2012 qu’au printemps 2013. Sur l’année 2012, 783 921 moucherons ont été capturés alors que 1 968 610 Culicoïdes avaient été capturés en 2011 ; • une fin d’activité des moucherons en décembre 2012 ; • une absence de populations de Culicoïdes pendant toute l’année dans certaines régions (notamment de l’est du pays), alors que toutes les régions de France étaient concernées en 2011 ; • une activité majoritairement enregistrée dans les régions de l’ouest. 1.3.5. Du moucheron vecteur à la dissémination de la maladie : facteurs favorisants Actuellement, il est admis que la transmission du SBV est principalement vectorielle, les vecteurs compétents étant des moucherons du genre Culicoïdes. La capacité de la population vectorielle à transmettre le virus est d’autant plus importante que (Hateley, 2009) : • la fréquence des repas des moucherons est élevée ; • le cycle de reproduction des virus est rapide ; • la réplication virale dans le moucheron est rapide ; • le nombre de moucherons compétents dans la population vectorielle est élevé ; • le nombre d’espèces de moucherons vecteurs impliquées dans la transmission du virus est grand. Ainsi, la capacité d’une population vectorielle dépend surtout de la température. Le climat en est donc l’élément déterminant. Cette capacité est maximale pour des températures comprises entre 10 et 30°C. Les conditions climatiques de l’année 2011 ont été favorables aux populations de Culicoïdes et donc à la dissémination du SBV sur le territoire français alors que les conditions climatiques de 2012 l’ont moins été, en particulier pour une dissémination dans l’est du pays. 37 1.4. Epidémiologie de la maladie induite par ce nouveau virus 1.4.1. Les espèces concernées 1.4.1.1. Espèces sensibles Le virus Schmallenberg a été isolé principalement chez des bovins, des ovins et des caprins (OIE, 2013a). Entre fin 2011 et mai 2013, 5 636 foyers bovins ont été officiellement confirmés en Europe, contre 2 931 foyers ovins et 136 foyers caprins. 1.4.1.2. Espèces réceptives Une espèce réceptive est une espèce capable de multiplier le SBV sans qu’aucun signe clinique ne soit mis en évidence. Ces espèces sont alors des réservoirs épidémiologiques du virus. La réceptivité au SBV des espèces suivantes a été démontrée soit par identification directe du SBV soit par séroconversion : • Bison • Alpaga • Buffle • Chevreuil • Cerf • Mouflon • Chien Le chien est la seule espèce non ruminante à présenter à ce jour une réceptivité au SBV (Wensman, 2013). Pour toutes ces espèces, aucun signe clinique n’a été rapporté, que ce soit chez les adultes ou chez les nouveaux nés (Linden, 2012). La sensibilité de ces espèces reste donc à démontrer. Il est à noter que de nombreuses espèces sauvages et domestiques sont réceptives aux autres virus du sérogroupe Simbu. Le tableau suivant récapitule les espèces réceptives pour le virus Akabane et pour d’autres virus du sérogroupe Simbu (Garigliany, 2012a). Tableau 4 : Espèces réceptives au virus Akabane et aux autres virus du sérogroupe Simbu Virus Akabane • • • • • 38 Cheval Cervidés (cerf, chevreuil, daim, etc.) Buffle Chameau Porc Autres virus du sérogroupe Simbu • • • • • • • • Zébre Eléphant Gnou Impala Grand Koudou Rhinocéros Phacochère Sanglier 1.4.1.3. Et l’homme ? Quelques rappels : Dans la famille des Bunyavirus, il y a plus de 330 virus, dont 174 font partie des Orthobunyavirus. Il y a 60 Bunyavirus pathogènes pour l’homme dont 30 présents parmi les Orthobunyvirus. Parmis ces derniers, il y a le Tahyna virus (TAHV), La Crosse virus (LACV) et le Batai virus (BATV). Au sein du sérogroupe Simbu, il y a aussi des virus zoonotiques comme l’Oropouche virus (OROV) (Weidmann, 2003). Les virus dont le SBV est le plus proche, c’est-à dire Shamonda, Aino et Akabane, ne sont pas pathogènes pour l’homme. Ceci, ajouté au fait qu’aucune manifestation inhabituelle chez l’homme n’a été détectée depuis l’été 2011 dans les régions atteintes, a conduit l’Institut Néerlandais pour la Santé Publique et l’Environnement (RIVM) et le Centre Européen pour la Prévention et le Contrôle des Maladies (ECDC basé à Stochkolm) à estimer, en décembre 2011, que bien que son potentiel zoonotique ne puisse être complètement exclu, il parait peu probable que le virus Schmallenberg constitue un danger pour l’homme (Braks, 2012 ; Control, 2011). De son côté, l’Institut Fédéral allemand pour l’évaluation des Risques (BfR) estime que le virus SBV n’est pas transmissible à l’homme par contact direct, par la viande ou par le lait (Bundesinstitut für Risikobewertung, 2012). En avril 2012 l'Institut Robert Koch publie le résultat d’une enquête sérologique SBV au sein de populations humaines exposées en Allemagne. Aucun cas d’infection ou de maladie associée au virus SBV n’a été rapporté chez l’homme depuis la première identification de ce virus (Dominguez, 2012a). De plus, une analyse sérologique sur une soixantaine d’éleveurs n’a pas permis de mettre en évidence des anticorps anti-SBV (Ducomble, 2012). Une autre enquête sérologique conduite aux Pays-Bas auprès de 301 personnes ayant pu être exposées au virus SBV n’a pas permis de mettre en évidence d’anticorps anti-SBV (Reusken, 2012). 1.4.2. Dissémination 1.4.2.1. Les matières virulentes Le SBV a été isolé dans les tissus encéphaliques des fœtus infectés in utero. Il est ainsi retrouvé dans le cerveau et la moelle épinière et plus particulièrement dans les corps des neurones de la matière grise où il se réplique (Bilk, 2012 ; Varela, 2013). Le SBV semble régulièrement retrouvé par PCR dans les organes et le sang des fœtus infectés, les liquides amniotiques, le placenta, le méconium et le cordon ombilical (Bilk, 2012). Chez les animaux vivants infectés par le SBV, le virus peut également être isolé dans le sang. Il semble que le SBV ne soit pas réparti de façon homogène à l’intérieur de chaque tissu (Garigliany, 2012a). Il est important de noter que lors de mises bas ou d’avortements de nouveaux-nés inféctés, il y a libération d’une quantité importante de virus dans le milieu extérieur. Cependant, cela ne représente pas une menace directe pour les opérateurs ou pour les autres animaux puisque le SBV ne semble pas directement contagieux (Bilk, 2012). 39 1.4.2.2. Modes de transmission du virus Transmission horizontale La transmission horizontale, par contact direct ou indirect, semble peu probable. En effet, l’infection expérimentale de 2 bovins par voie orale n’a pas entraîné de virémie transitoire détectable par PCR. De plus, le contact entre 3 bovins témoins et des bovins infectés expérimentalement a révélé une absence de SBV dans le lot témoin (PCR négative), alors que le SBV était bien présent dans le lot infecté (PCR positive) (Wernike, 2013). Enfin, la survie dans le milieu extérieur du SBV est très limitée dans le temps. Ces arguments ne sont donc ni en faveur d’une transmission horizontale directe ni en faveur d’une transmission horizontale indirecte. Transmission verticale Le SBV est détecté sur des fœtus malformés, nés avant terme ou pas, de veaux, d’agneaux et de chevreaux (Garigliany, 2012a). Les malformations associées au SBV sont semblables à celles observées lors d’infections par le virus Akabane ou le virus Aino. Les malformations induites par les virus du sérogroupe Simbu sont regroupées dans ce qui est appelé le syndrome arthrogrypose / hydranencéphalie (AHS) (Varela, 2013). De ce fait, les données sur la transmission verticale des virus Akabane et Aino sont utilisés comme modèle pour le virus Schmallenberg et extrapolées à ce virus. L’infection expérimentale de brebis par le virus Akabane a entraîné la naissance d’agneaux malformés. Si l’infection a lieu avant la gestation, cette gestation se passe normalement. Les malformations congénitales sont observées sur les fœtus quand l’infection des mères a lieu pendant une période sensible de la gestation (Parsonson, 1977). Cette période se situe entre le 28ème et le 50ème jour de gestation pour les ovins, entre le 30ème et le 50ème jour de gestation chez les caprins et entre le 62ème et le 173ème jour de gestation chez les bovins. La période de gestation sensible au SBV, pour les différentes espèces réceptives, n’est pas encore complétement déterminée. Les différents auteurs s’appuient donc sur ce qui est établi pour le virus Akabane. Tableau 5 : Période de gestation susceptible d’entraîner des malformations congénitales lors de l’infection des mères par le SBV Espèces sensibles au SBV Période de gestation critique hypothétique Bovins Ovins Caprins Entre 62 et 173 jours Entre 28 et 50 jours Entre 30 et 50 jours Transmission vénérienne Malgré une période virémique très courte, l’ARN du SBV a pu être détecté dans des lots de semences provenant de taureaux infectés par le SBV (ProMed-mail, 2012b ; ProMed-mail, 2012c) De plus, l’inoculation expérimentale a démontré la présence de virus de Schmallenberg infectieux dans certains échantillons de semences de bovins positifs à la PCR (ProMed-mail, 2013). 40 Ces résultats montrent que la semence de taureaux infectés naturellement par le SBV peut être infectieuse. Cela suggère également que le SBV et le Virus Akabane auraient des comportements différents en terme d’excrétion. En effet, le sperme de taureaux infectés expérimentalement par le virus Akabane n’est pas infectieux (Parsonson, 1981). Le transfert embryonnaire peut être une pratique présentant des risques de transmission du SBV. Cependant, en réalisant une PCR sur la femelle donneuse, le risque de transmission est négligeable. Transmission vectorielle La transmission vectorielle par l’intermédiaire des moucherons du genre Culicoïdes est la voie majeure de contamination des ruminants. Elle présente une certaine cyclicité qui dépend des conditions météorologiques. Ce mode de transmission est à l’origine de la dissémination du virus à travers l’Europe, de même que le transport d’animaux virémiques transitoires. Figure 6 : Mode de dissémination du SBV par l’intermédiaire d’un moucheron vecteur (Zientara, 2013) 1.4.3. Données épidémiologiques sur le SBV 1.4.3.1. L’expansion de la maladie en Europe à son émergence Les données présentées concernent la période allant de septembre 2011 à mai 2012. 1.4.3.1.1. Les faits marquants Le tableau 6 suivant résume les évènements marquant concernant l’évolution des cas de SBV à travers l’Europe entre décembre 2011 et mai 2012. Il relate également l’orientation prise par chaque pays pour la gestion de cette nouvelle maladie. 41 Tableau 6 : Faits marquants concernant la progression du SBV à travers l’Europe entre décembre 2011 et mai 2012. Date Pays Espèces Evènements 29 novembre 2011 Allemagne Bovin Première identification Schmallenberg (FLI, 2011). 16 décembre 2011 Pays-Bas Ovin Identification du SBV sur des prélèvements de cerveaux d’agneaux malformés (Dominguez, 2012a). du virus France Diffusion d’une note d’information sur le SBV par l’Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (Anses) et la Direction générale de l’alimentation (DGAL) (Calavas, 2011). Royaume-Uni Incitation à la vigilance des éleveurs par le Département pour l’environnement, l’alimentation et les affaires rurales (DEFRA). La déclaration des cas d’avortement ou de malformation chez des ruminants est obligatoire (Dominguez, 2012a). Pays-Bas La déclaration de tout cas de ruminant (bovin, ovin, caprin) nouveau-né malformé est rendue obligatoire (Dominguez, 2012a). 22 décembre 2011 Belgique Ovin identification du SBV sur des agneaux d’un même élevage de la province d’Anvers (frontalière avec les Pays Bas) (van der Berg, 2011). 27 décembre 2011 Pays-Bas Ovin 85 suspicions ont été rapportées et le SBV a été identifié chez 13 agneaux (Dominguez, 2012a). 3 janvier 2012 Pays-Bas Caprin Détection pour la première fois du SBV chez une chèvre. 20 décembre 2011 4 janvier 2012 42 France Activation de la surveillance des cas de malformations chez les ruminants (DGAL, 2012). Date 5 janvier 2012 Pays Espèces Pays-Bas Notification de la "maladie Schmallenberg" pour la première fois à l'OIE. Ce rapport est émis par les Pays-Bas qui notifient 39 foyers de maladie Schmallenberg, survenus entre le 19 décembre 2011 et le 03 janvier 2012 (Notification OIE, 2012a). Royaume-Uni Ovin Confirmation de quatre premiers foyers ovins d’infection par le SBV. L'identification du SBV fait l'objet d'une notification immédiate à l'OIE (Notification OIE, 2012b). Pays-Bas Bovin Isolement du virus dans l’espèce bovine pour la première fois. Mise en évidence du virus sur l’encéphale d’un avorton de six mois. Allemagne Bison Identification de la maladie chez un bison (fœtus et sa mère) (Dominguez, 2012a). Ovin Confirmation des deux premiers cas d’infection par le SBV, sur des ovins nouveau-nés malformés (Dominguez, 2012a). Caprin Confirmation du premier cas d’infection par le SBV chez un chevreau malformé (notification immédiate à l’OIE) (Notification OIE, 2012c). 23 janvier 2012 24 janvier 2012 25 janvier 2012 16 février 2012 Evènements France Italie Luxembourg Confirmation du premier cas d’infection par le SBV chez un petit ruminant (notification immédiate à l’OIE) (Notification OIE, 2012d). 12 mars 2012 Espagne Ovin Confirmation du premier foyer après l’identification du SBV chez un agneau malformé (notification immédiate à l’OIE) (Notification OIE, 2012e). 30 mai 2012 Danemark Bovin Confirmation des premiers (Dominguez, 2012a). 17 février 2012 cas bovins 43 1.4.3.1.2. Progression spatiale et temporelle de la maladie Les données de cette partie corespondent à la période allant de septembre 2011 à mars 2012. Les cartes suivantes représentent les régions d’Europe (NUTS5) où au moins un foyer de SBV a été confirmé entre septembre 2011 et mars 2012. Une expansion marquée des cas cliniques de SBV est observée entre novembre 2011 et février 2012. A partir du mois de mars 2012, la progression du SBV clinique ralentit mais cela ne signifie pas forcément que le nombre de cas se stabilise. 5 Septembre 2011 Novembre 2011 Décembre 2011 Janvier 2012 NUTS : Nomenclature d’unités territoriales statistiques. Ces unités territoriales sont définies uniquement pour des besoins statistiques et ne constituent pas forcément des unités administratives officielles, mais souvent des groupements de ces unités administratives, en fonction de la population résidente moyenne dans le pays concerné. 44 Février 2012 Mars 2012 Avril 2012 Figure 7 : Evolution de la distribution des foyers confirmés de SBV en Europe, de septembre 2011 à avril 2012. Pour les mois de mars et avril 2012, deux régions d’Espagne étaient concernées, mais sans confirmation par PCR (EFSA, 2012a) 1.4.3.2. Bilan de la saison 2011/2012 Le SBV clinique correspond aux cas où les animaux présentent des symptômes visibles. Il se divise en deux types, le SBV aigü et le SBV congénital. Une suspicion clinique d’infection aigüe par le SBV se définit comme un ovin, un caprin ou un bovin présentant des signes généraux inconstants, tels la fièvre, la diarrhée, l’abattement ou la diminution de production. Cela concernent principalement les adultes (Hoffmann, 2012). Un foyer de SBV aigu est défini comme une exploitation où une ou plusieurs suspicions cliniques d’infection aiguë par le virus SBV ont été confirmées par des analyses virologiques. 45 Une suspicion clinique d’infection congénitale par le SBV est définie comme un agneau, un veau ou un chevreau, fœtus ou nouveau-né, présentant une ou plusieurs malformations ou des troubles neurologiques. Un foyer de SBV congénital est défini comme une exploitation où une ou plusieurs suspicions cliniques d’infection congénitale par le virus SBV ont été confirmées par des analyses virologiques (qRT-PCR). 1.4.3.2.1. En Europe Dans un premier temps, les pays d’Europe concernés par des foyers de SBV seront identifiés. Dans un second temps, la progression et la répartition géographique des foyers de SBV entre septembre 2011 et octobre 2012 sera étudiée. Pays d’Europe concernés par des foyers de SBV En mai 2012, 3745 foyers de SBV sont confirmés dans 8 pays d’Europe : la Belgique, la France, l’Allemagne, le Luxembourg, les Pays-Bas, l’Italie, l’Espagne et le Royaume-Uni. Pendant l’été 2012, des foyers confirmés de SBV sont rapportés dans des pays nouvellement touchés. Cela concerne l’Autriche, le Danemark, la Suède, l’Irlande, la Finlande, la Pologne et la Suisse. En France, en Allemagne et au Royaume-Uni, des régions jusque-là épargnées commencent à observer des cas de SBV clinique. Ainsi, en octobre 2012, 15 pays d’Europe sont concernés par des foyers de SBV. A noter qu’à cette date, la Norvège n’a pas encore enregistré de foyers de SBV mais que le SBV a été isolé chez des moucherons capturés dans le sud du pays. La France apparaît comme le pays présentant le plus grand nombre de foyers. Cependant, ce chiffre est à mettre en relation avec le nombre d’exploitations du territoire. Tableau 7 : Nombre de suspicions et foyers confirmés de SBV par pays, sur la période allant du 1er août 2011 au 30 octobre 2012 (EFSA, 2012b) Pays France Allemagne Pays-Bas Royaume-Uni Suisse Belgique Luxembourg Espagne Italie Pologne Danemark Finlande Suède Irlande Norvège Total 46 Nombre de suspicions Nombre de foyers confirmés de SBV 5 585 3 196 1 502 1 502 1 690 351 499 310 301 301 231 231 47 28 17 5 9 4 2 2 42 1 12 1 57 1 56 0 9 0 10 059 5 933 La prévalence « cheptel » du SBV congénital est alors calculée. Elle correspond au pourcentage d’exploitations agricoles où il y a eu au moins un cas de SBV congénital. Tableau 8 : Prévalence « cheptel » du SBV clinique dans les trois pays les plus touchés Pays France Pays-Bas Allemagne Nombre d'exploitations (Eurostat, données de 2010) 309 370 50 440 216 100 Prévalence cheptel 1,03 % 0,70 % 0,70 % La France est donc bien le pays le plus touché par le SBV en octobre 2012, devant les PaysBas puis l’Allemagne. Répartition des cas par espèce Les bovins apparaissent comme l’espèce présentant le plus grand nombre de cas, devant les ovins et les caprins. Tableau 9 : Nombre de suspicions et de foyers confirmés de SBV par espèces sensibles, sur la période allant du 1er août 2011 au 30 octobre 2012 (EFSA, 2012b) Espèce Nombre de suspicions Nombre de foyers confirmés de SBV Bovin Ovin Caprin Total 6 429 (64%) 3 422 (34%) 208 (2%) 10 059 (100%) 3 562 (60%) 2 278 (38,5%) 93 (1,5%) 5 933 (100%) Distribution des foyers par espèce en Europe en mai 2012 La figure suivante représente pour chaque espèce de ruminant domestique les régions où il y a eu au moins un cas confirmé de SBV, entre l’apparition de la maladie en septembre 2011 et mai 2012. Bovins Ovins 47 Caprins Figure 8 : Répartition, par espèce, des régions concernées par au moins un cas confirmé de SBV (mai 2012) (EFSA, 2012b) Pour chacune des espèces, les régions concernées par au moins un cas de SBV clinique sont uniformément réparties au sein de la zone européenne nord-ouest. Cependant, les régions concernées par les cas cliniques ovins occupent quasiment toute cette zone, de même que pour les bovins (même s’il semble que pour ces derniers le nombre de régions concernées soit moins important), tandis que les régions concernées par au moins un cas de SBV caprin clinique sont beaucoup moins nombreuses. Ceci est à mettre en relation avec un nombre de cas cliniques caprins restreint. En tenant compte de toutes les espèces, sur la période allant de septembre 2011 à octobre 2012, il apparaît que les foyers de SBV restent relativement circonscrits dans la zone européenne nord–ouest. Figure 9 : Evolution de la distribution des foyers confirmés de SBV en Europe de septembre 2011 à octobre 2012, toutes espèces confondues (EFSA, 2012b) 48 La dynamique d’expansion des foyers de SBV s’est fortement ralentie après mai 2012 (et même dès mars 2012 d’après la figure 7), puisque le nombre de régions nouvellement touchées par des foyers de SBV sur les six premiers mois de l’épidémie (de septembre 2011 à mars 2012, figure 7) est bien plus important que celui concernant les 6 derniers mois (de mai 2012 à octobre 2012, figure 9). Evolution du nombre de foyers de SBV en Europe de septembre 2011 à octobre 2012 Le nombre de cas de foyers confirmés de SBV par semaine pour la période étudiée a été reporté, par espèce et par pays, sur les graphiques de la figure 10 (page 50). Les premiers foyers datent de septembre 2011. Le nombre total de foyers atteint un pic fin février, début mars (semaine 9). Une nouvelle augmentation conduit à un second pic, moins conséquent que le premier, en mai 2012 (semaine 19). Ensuite, des foyers de SBV continuent à apparaître, moins nombreux mais affectant des nouveaux pays. Remarque : Après la semaine 11, les informations concernant la Belgique ne sont plus fournies, mais des cas de SBV sont encore observés dans le pays. L’analyse par espèce montre que les ovins contribuent majoritairement à l’augmentation observée à partir de la mi janvier (semaine 3) jusqu’au pic de début-mars (semaine 9), comme indiqué sur la figure 10. Après la mi mai (semaine 19), très peu de foyers ovins sont déclarés. Cette diminution est probablement due à la fin de la saison des mises bas des ovins dans la plupart des pays. Concernant l’espèce bovine, les premiers foyers apparaissent progressivement début février (semaine 5). Le pic est observé en mai (semaine 19) mais de nouveaux foyers sont déclarés tout au long de l’été jusqu’en octobre 2012. A partir du mois d’août, la plupart des nouveaux foyers rapportés correspondent à des cas de SBV aigu observé chez des adultes en Suisse. Pendant cette période, des cas de SBV aigu sont également observés au Royaume-Uni. Les bovins participent donc majoritairement au second pic et au maintien du nombre de foyers de SBV observés sur le graphique général. L’évolution des foyers caprins semble avoir la même tendance que celle des foyers ovins. Les premières observations datent de fin décembre 2011 (semaine 52), le pic est atteint fin février (semaine 8) et très peu de cas sont rapportés après la mi-mai (semaine 19). Par ailleurs, les graphiques présentés permettent de préciser la chronologie des événements observée sur les cartes des figures précedentes : dans un premier temps, les foyers de SBV concernent majoritairement les Pays-Bas ; les foyers allemands et français, dans des proportions équivalentes, sont ensuite à l’origine de la forte augmentation puis des deux pics observés ; enfin, la Suisse commence à déclarer des foyers à partir de fin juillet (semaine 30). 49 Figure 10 : Evolution du nombre de foyers de SBV confirmés, par espèce, en Europe, par semaine de septembre 2011 à novembre 2012 (EFSA, 2012b) 50 1.4.3.2.2. En France Les bovins Un bilan de la surveillance de l’infection congénitale par le SBV chez les bovins a été réalisé sur la période janvier-août 2012 (Dominguez, 2013). Au total au 31 août 2012, 3 639 élevages bovins avaient fait l’objet d’une « suspicion clinique de SBV congénital ». L’infection par le virus SBV a été biologiquement confirmée pour 2 018 élevages de bovins et un élevage de bisons. Ces 2 019 élevages sont comptabilisés comme des « foyers bovins ». o Répartition géographique du SBV congénital bovin, en France La prévalence cheptel du SBV congénital bovin est estimée à 0,92 %6 en août 2012, à la fin de la campagne de surveillance du SBV en France. L’étude de ce taux par département permet de montrer que le virus a diffusé dans la plus grande partie du territoire, plus ou moins intensément. Seuls le Sud et la région parisienne, régions où le nombre d’exploitations agricoles bovines est limité, apparaissent peu atteints. La prévalence cheptel du SBV congénital est globalement plus élevée dans la moitié nord du territoire, et plus particulièrement dans le quart nord-est. Cela correspond, d’après la figure 7, aux premiers départements touchés par des cas de SBV congénital. Prévalence cheptel Figure 11 : Carte représentant la prévalence cheptel du « SBV congénital » bovin au 31 août 2012 (Dominguez, 2013) 6 Calculé à partir des données Eurostat 2007 : 219 920 exploitations agricoles bovines en France. 51 o Evolution du nombre de foyers de SBV congénital bovin de janvier 2012 à août 2012 La répartition, par semaine, des premières « suspicions cliniques de SBV congénital » dans les foyers bovins et dans les élevages ayant fait l’objet d’une suspicion non confirmée est présentée dans la figure 12. Les premières naissances de veaux atteints de SBV congénital identifiées dans le cadre de la surveillance ont eu lieu au tout début du mois de janvier 2012 (semaine 1). L’incidence du SBV congénital chez les bovins a ensuite augmenté progressivement jusqu’en mai. Le pic épizootique a été atteint mi-mai (semaine 19 : 155 foyers confirmés). L’incidence du « SBV congénital » a diminué après ce pic, bien que la décroissance apparente soit lente. D’après les auteurs de l’étude, la décroissance est en partie masquée par l’inclusion de cas d’infection aiguë par le SBV. Il est à noter que le taux de confirmation des suspicions de SBV congénital chez les bovins a augmenté à partir de mi-avril (taux de confirmation des suspicions : 33 % en moyenne avant mi-avril ; 67 % en moyenne après mi-avril). Ceci est très vraisemblablement lié au recours au diagnostic sérologique à partir de mi-avril, en lien avec la première mise à disposition d’un kit de diagnostic Elisa. Figure 12 : Evolution du nombre de Foyers de SBV congénital bovin, par semaine (Dominguez, 2013) La dynamique d’apparition des foyers bovins, figure 13, a culminé en mai, avec 1,2 vêlages de veaux atteints de SBV congénital pour 1 000 vêlages sur l’ensemble du mois, puis a diminué jusqu’en août. Le ratio « nombre de foyers bovins rapporté au nombre moyen de vêlages au cours de la période de surveillance» reflète globalement l’intensité de la dynamique d’apparition des foyers de SBV congénital. L’évolution mensuelle du ratio « nombre de foyers bovins rapporté au nombre moyen de vêlages » est cohérente avec l’évolution du nombre de foyers confirmés (figure 12). Remarque : l’annexe 2 montre la répartition mensuelle des vêlages en France sur une année. 52 Figure 13 : Evolution mensuelle du ratio « nombre de foyers bovins rapporté au nombre moyen de vêlages » (Dominguez, 2013) La période de gestation, chez les bovins, pendant laquelle le virus peut passer la barrière placentaire et entraîner des malformations fœtales se situe entre 62 et 173 jours de gestation (tableau 5). La figure suivante présente les mois possibles d’infection des mères par le SBV à partir des mois au cours desquels des veaux malformés infectés par le virus sont nés. Mois de Possible période de contamination des mères déclaration d’un foyer de 2011 2012 SBV congénital juin juil aoû sept oct nov déc janv fév mars avr mai juin Décembre 2011 Janvier 2012 Février Mars Avril Mai Juin Juillet Août Figure 14 : Détermination des périodes possibles de contamination des mères par le SBV D’après la figure 13, la dynamique d’apparition des foyers de SBV bovin est importante pour les mois d’avril, de mai, de juin et de juillet. Cela correspondrait à une circulation maximale du virus entre les mois d’octobre 2011 et janvier 2012 (figure 14). Pour appuyer cette hypothèse, il est rappelé que les conditions climatiques de 2011 ont permis une activité vectorielle importante en octobre et novembre 2011 et une activité vectorielle non négligeable en décembre 2011 et janvier 2012. 53 Les petits ruminants Le bilan de la surveillance de l’infection congénitale par le virus Schmallenberg chez les petits ruminants a été réalisé sur la période janvier – mai 2012 (Dominguez, 2012b). Au total, au 31 mai 2012, 1 893 élevages de petits ruminants ont fait l’objet d’une suspicion clinique de SBV congénital. L’infection par le SBV a été biologiquement confirmée pour 1 145 élevages. Ainsi, 1 129 foyers ovins et 17 foyers caprins (un élevage mixte ovin et caprin, atteint chez les deux espèces, comptant pour un foyer ovin et un foyer caprin) ont été comptabilisés. o Répartition géographique du SBV congénital des petits ruminants, en France Près de 50 % des foyers de SBV congénital chez les petits ruminants sont concentrés dans quatre départements du centre-ouest (Charente (16), Indre (36), Vienne (86), Haute-Vienne (87)) et près de 20 % sont situés dans quatre départements du nord-est (Haute-Marne (52), Meurthe-et-Moselle (54), Moselle (57), Vosges (88)). Figure 15 : Répartition des foyers de SBV congénital chez les petits ruminants au 31 mai 2012 ( Dominguez, 2012b) o Répartition géographique du SBV congénital ovin, en France En moyenne, dans les départements atteints, des cas de SBV congénital ont été confirmés dans 4 % des structures détentrices d’ovins. Dans les départements les plus touchés, des cas de SBV congénital ont été confirmés dans environ 10 % des structures détentrices d’ovins. Ainsi, dans le nord-est, la Haute-Marne (52), la Meurthe-et-Moselle (54) et la Moselle (57) ont été fortement impactées (respectivement 11 %, 12 % et 11 % des structures atteintes) et dans la zone centre-ouest, l’Indre (36) et la Vienne (86) ont été largement atteintes (respectivement 11 % et 17 % des structures atteintes). 54 Figure 16 : Carte représentant la prévalence cheptel du SBV congénital chez les ovins au 31 mai 2012 (Dominguez, 2012b) o Répartition géographique du SBV congénital caprin, en France Neuf des 17 foyers caprins de SBV congénital (soit 53%) sont situés dans le centre-ouest de la France. Figure 17 : Carte reptésentant la répartition géographique des élevages caprins ayant fait l’objet d’une suspicion clinique de SBV congénital (Dominguez, 2012b) 55 o Evolution du nombre de foyers de SBV congénital ovin de janvier 2012 à mai 2012 Les premiers agneaux atteints de SBV congénital identifiés dans le cadre de la surveillance sont nés au cours de la première semaine de janvier 2012. L’incidence du SBV congénital augmente ensuite fortement, en particulier à la fin du mois de février (semaine 8 : 218 foyers confirmés), et culmine début mars (semaine 9 : 242 foyers confirmés), ce qui correspond à une circulation virale intense pendant l’automne 2011. L’incidence du SBV congénital a rapidement diminué après ce pic. Les dernières mises-bas d’agneaux atteints de SBV congénital identifiées dans le cadre de la surveillance ont eu lieu respectivement, les 2 et 3 mai dans le Puy-de-Dôme (63) et dans le Maine-et-Loire (49). Ces foyers correspondraient à une contamination au cours du mois de janvier 2012, possiblement en lien avec une activité résiduelle des vecteurs dans ces zones. Figure 18 : Evolution du nombre de Foyers de SBV congénital ovin, par semaine (Dominguez, 2012b) De même que pour les bovins, le ratio « nombre de foyers ovins rapporté au nombre estimé d’agnelages » reflète l’intensité de la dynamique d’apparition des foyers de SBV congénital. L’intensité d’apparition des foyers ovins a ainsi été maximale en février, importante en mars et bien plus faible les autres mois (figure 19). Cela confirmerait une circulation maximale du virus pendant les mois d’octobre, de novembre et de décembre 2011, en conformité avec les observations réalisées sur les bovins. Enfin, les faibles ratios du mois d’avril et surtout du mois de mai supposeraient une faible circulation du virus entre décembre 2011 et février 2012. La très faible activité vectorielle enregistrée à cette époque vient appuyer cette hypothèse, mais cela est à relativiser du fait que le nombre d’agnelages en France diminue fortement après le mois d’avril (voir l’annexe 2 sur la répartition mensuelle des agnelages en France au cours de l’année). 56 Figure 19 : Evolution mensuelle du ratio « nombre de foyers ovins rapporté au nombre estimé d’agnelages » (Dominguez, 2012b) o Evolution du nombre de foyers de SBV congénital caprin de janvier à mai 2012 : En ce qui concerne les caprins, les foyers (et les suspicions) de SBV congénital apparaissent plus groupés dans le temps que pour les ovins (figure 20). Les premiers chevreaux atteints de SBV congénital sont nés début février. Comme pour les ovins, l’incidence du SBV congénital a culminé les semaines 8 et 9 (fin février et début mars). Le dernier foyer caprin identifié correspond à une mise bas ayant eu lieu le 21 mars dans les Pyrénées Atlantiques. Comme pour les autres espèces, il semblerait que la circulation maximale du virus ait eu lieu pendant les mois d’octobre et de novembre 2011. Figure 20 : Evolution du nombre de foyers de SBV congénital caprin, par semaine (Dominguez, 2012b) 57 1.4.3.3. Bilan de la saison 2012/2013 Les données décrites ci-dessus (saison 2011/2012) correspondent à la « première vague » de circulation du virus, de son émergence à l’été 2011 à janvier 2012. La « deuxième vague » correspond quant à elle à une circulation continue du virus depuis la reprise d’activité du vecteur au printemps 2012 jusqu’à l’été 2013 (saison 2012/2013). 1.4.3.3.1. En Europe Pays d’Europe concernés par des foyers de SBV Le SBV a continué sa progression pendant l’hiver 2012 et le printemps 2013 pour atteindre notamment l’Ecosse, la Norvège, la Suède, la Finlande, l’Estonie, la Lettonie, la Hongrie, la Slovénie et la Croatie. En mai 2013, 8 730 foyers de SBV ont été confirmés depuis l’émergence de la maladie en 2011. Ces foyers ont été rapportés par 22 pays d’Europe. Tableau 10 : Nombre de foyers confirmés de SBV par pays au 30 avril 2013 (EFSA, 2013) Nombre de foyers confirmés de SBV Pays Du 1er août 2011 au 30 octobre 2012 France Allemagne Pays-Bas Royaume-Uni Suisse Belgique Luxembourg Espagne Italie Pologne Danemark Finlande Suède Autriche Irlande Slovénie République tchèque Estonie Croatie Hongrie Lettonie Norvège Total 3 196 1 502 351 310 301 231 28 5 4 2 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 933 58 Du 1er novembre 2012 au 30 avril 2013 1 361 592 0 136 128 367 0 0 82 3 1 17 50 86 78 26 19 5 3 1 1 1 2 957 Du 1er août 2011 au 30 avril 2013 4 557 2 094 351 446 429 598 28 5 86 5 2 18 51 86 78 26 19 5 3 1 1 1 8 890 La carte suivante indique la période de déclaration du premier foyer de SBV confirmé par région. Cette carte permet de voir la progression géographique de la maladie de Schmallenberg en Europe, entre septembre 2011 et avril 2013. Figure 21 : Progression géographique de la maladie de Schmallenberg en Europe entre septembre 2011 et avril 2013 (EFSA, 2013) Les données du tableau 10 et de la figure 21 montrent que le SBV a continué son expansion géographique en 2013 pour atteindre les pays voisins de ceux déjà concerné par le virus en 2012. De plus, ces chiffres montrent que le virus a également continué de circuler dans les pays déjà atteints en 2012. Evolution du nombre de foyers de SBV en Europe de l’émergence du SBV à avril 2013 La figure suivante montre l’évolution du nombre de foyers confirmés de SBV en Europe. Elle prend en compte les cas de foyers aigus et les cas de foyers congénitaux. Figure 22 : Evolution du nombre de foyers confirmés de SBV, toutes espèces confondues, en Europe, entre fin 2011 et avril 2013 (EFSA, 2013) 59 Cette figure montre que le nombre de foyers total de SBV en Europe est moins important pendant l’hiver 2012/2013 que pendant celui de 2011/2012. Cette diminution du nombre de foyers reste à confirmer pour le reste de l’année 2013. Des foyers de SBV ont été confirmés sans interruption entre janvier 2011 et avril 2013. De plus, les cas de foyers aigus ont été rapportés à partir du printemps 2012. Avant cette période, les foyers étaient majoritairement des foyers de SBV congénital. Enfin, des foyers de SBV aigu ont été déclarés en continu par l’Allemagne entre septembre 2012 et avril 2013. Ainsi, ces observations montrent une circulation virale en continu même lors de l’hiver 2012/2013. La figure 23 correspond à la répartition des foyers confirmés de SBV en Europe par espèce. Remarque : Ces résultats ne prennent pas en compte le nombre de foyers dont la confirmation a été faite uniquement par sérologie. Cela peut expliquer la différence entre les chiffres de la figure 22 ceux de la figure 23. Figure 23 : Evolution du nombre de foyers confirmés (foyers congénitaux et foyers aigus) par espèce en Europe entre août 2012 et avril 2013 (EFSA, 2013) Les foyers bovins ont participé majoritairement à cette deuxième vague, devant les foyers ovins puis les foyers caprins. Il est à noter, que contrairement à la première vague, le nombre de foyers a augmenté plus précocément fin 2012. De plus, le premier pic observé lors de la saison 2011/2012 correspondait uniquement à des foyers ovins alors que dans ce cas, il y avait autant de foyers ovins que de foyers bovins en novembre (avant que le nombre de foyers bovins soit largement majoritaire). Estimation du nombre de foyers ovins confirmés pour la saison 2012/2013 Les chiffres, toutes espèces confondues, de l’année 2013 seront publiés par l’Efsa en décembre 2013, ce qui permettera alors de conclure sur une diminution ou non du nombre de foyers de SBV en 2012/2013 par rapport à 2011/2012. Cependant, le faible nombre de foyers ovins enregistrés en Europe entre mai et août 2012 (seulement 27 cas enregistrés) laisse à penser que peu de nouveaux cas de foyers ovins seront confirmés sur cette période en 2013. Ainsi, il est probable que le nombre de foyers ovins sur la saison complète 2012/2013 reste faible par rapport à la saison 2011/2012. 60 Cette hypothèse est appuyée par les données suivantes : les cinq pays qui ont déclaré le plus de foyers confirmés de SBV ovins en 2012 sont les mêmes qu’en 2013. Cependant, dans chacun de ces cinq pays, le nombre de foyers déclarés pour la saison 2012/2013 est plus faible que lors de la période correspondante en 2011/2012. Tableau 11 : Comparaison du nombre de foyers ovins confirmés lors de la saison 2011/2012 et de la saison 2012/2013 (EFSA, 2012b ; EFSA, 2013) Nombre de foyers de SBV ovins confirmés Pays Du 1er août 2011 au15 mai 2012 Du 1er août 2012 au 30 avril 2013 Total : Du 1er août 2011 au 30 avril 2013 France 1 122 187 1 330 Allemagne 634 98 732 Royaume-Uni 221 104 327 Belgique 155 108 14 0 169 108 Total pour les cinq pays les plus touchés 2 240 403 2 466 Total en Europe 2 251 657 2 935 Pays-Bas D’après ces résultats, le SBV semble affecter le troupeau ovin européen de manière moins forte en 2012/2013. Cela serait à mettre en relation soit avec une diminution de la circulation virale, soit avec une moindre sensibilité des troupeaux ayant déjà été affectés l’année précédente, soit avec une combinaison des deux facteurs. La non déclaration des cas peut également en être une des causes. Conclusion Les différents résultats de la saison 2012/2013 mettent en évidence une circulation du SBV en Europe dans les pays précédemment atteints comme dans des pays qui n’avaient pas encore été touchés. De plus, l’observation de cas de SBV aigu en Allemagne entre septembre 2012 et avril 2013 ainsi que l’apparition de foyers congénitaux de SBV sans interruption entre janvier 2011 et avril 2013 sont des arguments en faveur d’une circulation virale continue, même lors de la période hivernale 2012/2013. Cependant, d’après le nombre de foyers confirmés de SBV, l’impact de la maladie semble se réduire par rapport à l’année précédente. 1.4.3.3.2. En France L’étude de l’évolution de la maladie de Schmallenberg en France a été réalisée sur la période allant de novembre 2012 à août 2013, correspondant à la saison 2012/2013 dans sa totalité. Sur cette période, 1 785 foyers de SBV congénital ont été confirmés. Ces foyers sont répartis dans 77 départements. 61 Figure 24 : Répartition des foyers confirmés de SBV congénital en France entre novembre 2012 et août 2013, par espèce (Plateforme ESA, 2013a) D’après la figure 24, les foyers de SBV congénital étaient majoritairement situés dans le grand ouest, le sud ouest et le sud du Massif Central, c’est-à-dire dans des régions qui avaient été épargnées lors de l’année précédente. Cela semblerait confirmer une bonne immunisation des troupeaux lors de l’année précédente. Cette hypothèse est tempérée par le fait que le nord du Massif Central était une zone fortement atteinte en 2012/2013 alors qu’elle l’était déjà en 2011/2012. Parmis les 1 785 foyers de SBV congénital, il y a eu 266 foyers ovins, 32 foyers caprins et 1 487 foyers bovins. Figure 25 : Evolution du nombre de foyers confirmés (foyers congénitaux et foyers aigus) par espèce en France sur la saison 2012/2013 (Plateforme ESA, 2013a) 62 Au niveau français, les observations sont semblables à celles faites au niveau européen. Ainsi, la comparaison de la saison 2012/2013 avec la saison 2011/2012 montre : • • • un nombre de foyers moins important (1 785 contre 3 165 pour la saison 2011/2012), une déclaration des foyers plus précoce, une plus forte proportion de foyers bovins par rapport aux foyers ovins. Cela s’explique par le fait que la France est le pays européen le plus touché par la maladie de Schmallenberg. Par ailleurs, la diminution du nombre de foyers bovins en France sur la saison 2012/2013 est beaucoup moins importante que pour les foyers ovins : Tableau 12 : Comparaison du nombre de foyers de SBV confirmés ovins et bovins en France entre janvier 2012 et avril 2013 De janvier 2012 à août 2012 De novembre 2012 à août 2013 Total : De janvier 2012 à août 2013 Nombre de foyers bovins confirmés 2 019 1 487 3 506 Nombre de foyers ovins confirmés 1 122 187 1 330 1.4.3.4. Conclusion : de l’émergence à août 2013 La vague de foyers de SBV observée au cours de la saison 2011/2012 correspond à l’émergence du virus. Celui-ci a, à l’automne 2011, infecté toutes les femelles gestantes réceptives. Du fait d’une période à risque et d’une durée de gestation différentes entre les bovins et les petite ruminants, les cas de SBV congénital sont apparus en deux vagues : hiver 2011/2012 pour les ovins et printemps 2012 pour les bovins. Les résultats de la saison 2012/2013 sont la conséquence d’une circulation virale continue à partir du printemps 2012 (voire depuis la fin de l’hiver 2011/2012) avec la déclaration, en continu, de foyers aigus et de foyers congénitaux. Cette deuxième vague de foyers observée au cours de la saison 2012/2013 est moins conséquente que la première, mais la diminution du nombre de foyers reste à confirmer avec les résultats à venir fin 2013. L’analyse des courbes par espèce ne montre pas de décalage important entre les pics de déclaration de foyers de SBV ovins et bovins, contrairement à l’année précédente. Ainsi, il semble que la deuxième vague observée au cours de l’hiver 2012/2013 ne corresponde pas au pic d’activité du vecteur. Cette deuxième vague serait plutôt à mettre en relation avec le nombre de mises bas important pour les deux espèces à cette période de l’année (annexe 2). 63 1.4.4. Morbidité et mortalité La morbidité est définie comme étant le nombre d’individus infectés par le SBV au sein d’une population donnée. L’incidence ou la prévalence sont deux façons d’exprimer la morbidité d’une maladie. L’incidence ne prend en compte que le nombre de nouveaux cas par unité de temps alors que la prévalence correspond à une proportion de cas sur une période donnée. Prévalence cheptel du SBV congénital La prévalence cheptel du SBV congénital a déjà été abordée plus haut. Pour rappel, au niveau européen, entre décembre et octobre 2012, 0,24 % des cheptels bovins, ovins et caprins ont déclaré des cas de SBV congénital. En France, 1,03 % des cheptels sont concernés entre janvier 2012 et août 2012. Cette proportion passe à 0,54 % entre novembre 2012 et août 2013. Cependant, estimer la prévalence par la détection de cas de malformations conduit à sousestimer la proportion d’élevages infectés. En effet, dans certains cheptels, le virus peut avoir circulé sans infecter les fœtus. Par exemple, c’est le cas des élevages où il n’y avait pas de femelles gestantes au moment du passage du virus. C’est également le cas des élevages où la gestation des femelles était trop avancée au moment du passage viral, ce qui n’a pas autorisé la transmission verticale du virus. Seule une étude de séroprévalence permet d’avoir une estimation fiable de l’exposition au SBV. Séroprévalence du SBV o Comparaison par espèce Les différentes études montrent qu’au sein d’un cheptel (Elbers, 2012 ; Méroc, 2013a ; Méroc, 2013b), soit la séroprévalence est élevée (de 70 % à 100 %), soit elle est au contraire faible. Ainsi, en Belgique, la séroprévalence chez les bovins est de 86,3 % en mars 20127 (Méroc, 2013). Aux Pays-Bas, elle est de 72,5 % en février 2012 (Elbers, 2012). La séroprévalence du cheptel ovin belge est du même ordre que celle du cheptel bovin, avec une valeur de 84.31 % (Méroc, 2013a). En France, des résultats de séroneutralisation dans 3 élevages « cas » font état d’une séropositivité des animaux variable, allant de 7,5% dans un élevage du centre-ouest à 100% dans un élevage du nord-est. o Comparaison par classe d’âge Il ne semble pas y avoir de différence significative de séroprévalence entre les différentes classes d’âges (Elbers, 2012). Cependant, une étude réalisée sur des échantillons de sang collectés entre le 2 janvier et le 7 mars 2012, en Belgique, a montré une différence significative entre les différentes classes 7 En Belgique, au bilan du mois d’octobre 2012, 0,73 % des cheptels (bovins, ovins et caprins tous confondus) sont concernés par du SBV congénital. Aux Pays-Bas, c’est 0,70 % des cheptels qui sont concernés. 64 d’âges chez les bovins. Ainsi, la séroprévalence des bovins âgés de 6 à 12 mois était de 64,9 %, celle des 12 à 24 mois de 86,79 % et celle des plus de 24 mois est de 94,4 % (Méroc, 2013). Ces observations pourraient provenir du fait que les animaux jeunes restent plus souvent à l’intérieur et que, de ce fait, ils sont moins exposés au moucheron. Une étude sérologique réalisée sur des ovins en Belgique suggère que, dans un troupeau immunologiquement naïf envers le SBV, le risque d’infection pour le fœtus est de 28% (Garigliany, 2012b). Ce résultat est très proche de celui obtenu pour le virus Akabane, pour lequel le risque est de 30% (Charles, 1994). 1.5. Emergence et dissémination du SBV : bilan L’émergence d’un nouveau virus L’épidémie de SBV correspond à l’émergence d’un nouveau virus. Ce virus a commencé à circuler au cours de l’été 2011. Les arguments en faveur d’un nouveau virus sont : • l’identification d’un agent infectieux viral non connu avant novembre 2011 ; • l’absence de manifestations cliniques de la forme aigüe de la maladie de Schmallenberg avant l’été 2011 ; • l’absence de manifestations cliniques de la forme congénitale de la maladie de Schmallenberg avant décembre 2011 ; • la séronégativité d’échantillons sanguins prélevés avant le printemps 2011 chez les bovins, opposé, un an plus tard, à la séropositivité de plus de 70 % d’entre eux (Garigliany, 2012b). Cette observation est valable également pour les ovins et les ruminants sauvages. La dissémination La dissémination du SBV est très rapide au début de l’épidémie en 2011. Le BTV-8 (virus responsable de la FCO) est un virus qui présente des similitudes avec le SBV. En effet, ils ont un mode de transmission vectoriel semblable et ils sévissent, avec quelques années de décalage, dans la même région d’Europe (annexe 3). Cependant, le SBV se propage bien plus rapidement que le BTV-8 ne l’avait fait en 2007, malgré une phase de virémie causée par le BTV-8 de l’ordre de quelques semaines, contre quelques jours pour le SBV (Garigliany, 2012a). Cela suggère des différences dans les évènements qui ont permis l’émergence et la dissémination de ces deux virus, ainsi que dans leurs biologies. Aux Pays-Bas, la prévalence supérieure à l’est du pays plaide en faveur d’une arrivée du virus par l’est (Elbers, 2012). En France, il semblerait qu’une circulation virale importante ait eu lieu entre octobre et décembre 2011. Le virus a continué à circuler après décembre 2011, dans des proportions moins importantes. 65 66 2. Particularités immunologiques, cliniques et histopathologiques de l’infection des ruminants par le SBV 2.1. Immunologie 2.1.1. Rappel : réponse immunitaire innée et réponse immunitaire acquise Le système immunitaire d’un organisme animal distingue le soi du non-soi et élimine ou neutralise les substances étrangères qui peuvent s’y introduire, en particulier les agents infectieux. Cette fonction est assurée par un ensemble de mécanismes qui constituent l’immunité. Deux types sont schématiquement distingués : l’immunité innée ou naturelle et l’immunité acquise. Le tableau suivant résume les caractéristiques des réponses immunitaire innée et acquise lors de l’infection d’un organisme animal par un virus. Tableau 13 : Caractéristiques de la réponse immunitaire lors de l’infection d’un organisme animal par un virus Caractéristiques de la réponse immunitaire innée • non spécifique d’un agent infectieux • rapide : dans les heures voire les minutes après l’infection virale • repose sur la production de cytokines, l’activation de cellules sentinelles et de cellules NK (pour Natural Killer) • apoptose des cellules infectées • intervention du systéme du complément • hyperthermie Caractéristiques de la réponse immunitaire acquise • spécifique à un agent infectieux • plus « subtile » que l’immunité innée et plus lente à se mettre en place • repose sur l’activité des lymphocytes B, T CD4+ et T CD8+ • reconnaissance directe du virus via les anticorps • reconnaissance des antigènes viraux via le CMH 1 (LT CD8+) et/ou le CMH 2 (LT CD4+) 2.1.2. Réponse immunitaire innée 2.1.2.1. Les acteurs de l’immunité innée 2.1.2.1.1. Les cytokines 2.1.2.1.1.1. Définitions-rappels Les cytokines sont des petites molécules (8 à 50 kDa) solubles qui interviennent dans la communication cellulaire. Ells sont synthétisées par les cellules du système immunitaire, comme les lymphocytes T, mais également par d’autres cellules. Leurs actions, via des 67 récepteurs spécifiques, peuvent être autocrine (sur la cellule productrice), paracrine (sur des cellules proches) ou endocrine (sur des cellules distantes). Parmi les cytokines, il y a notamment les interférons (INF), les interleukines (IL), les chimiokines et le facteur de nécrose tumorale (TNF). Les interférons jouent un rôle majeur dans la réponse immunitaire innée. Ils peuvent être de type 1 (alpha, béta, omega, delta, tau ou epsilon) ou de type 2 (INF-gamma). Il existe également des INFs de type 3 (INF-lambda) qui ont un rôle similaire aux INFs de type 1. 2.1.2.1.1.2. Rôle des cytokines En réponse à l’infection par un virus, les cellules infectées produisent des interférons de type 1 (INF alpha et bêta). L’interféron de type 2 (INF gamma) est produit, quant à lui, par les LT CD4+ après reconnaissance des antigènes viraux et par les cellules NK. La production d’INF de type 2 un phénomène plus tardif que la production d’INF de type 1. Interférons de type 1 La production d’interférons de type 1 active, dans les cellules voisines, l’expression de gènes codant pour des protéines qui peuvent, de manière directe ou indirecte, inhiber la multiplication du virus. Trois phases peuvent être distinguées lors de la production d’interférons de type 1 par les cellules : l’induction, la signalisation et les mécanismes effecteurs. Figure 26 : Synthèse et mode d’action des INF de types 1 (Deffontaines) 68 o L’induction La phase d’induction se déroule à l’intérieur de la cellule infectée. Il existe des récepteurs intracytoplasmiques sensibles à l’ARN viral (dans le cas d’un virus ARN comme le SBV). Les deux principaux sont RIG-I et MDA5 (regroupés sous le terme de RIG-Like receptors, RLRs). Dans une moindre mesure, la protéine kinase PKR joue également ce rôle. La liaison entre les RLRs et l’ARN viral induit une cascade d’activation de différents facteurs qui va finalement aboutir à la phosphorylation d’un facteur de transcription : le IRF-3, qui fait partie de la famille des facteurs de régulation des interférons (INF regulatory factor, IRF). L’activation du facteur IRF-3 lui permet de pénétrer dans le noyau où il initialise la transcription des gènes codant pour l’INF-bêta. D’autres facteurs de transcription des gènes codant pour les interférons, tels IRF-7 ou AP-1, sont activés par la réplication virale. L’activation des IRFs se fait également par l’intermédiaire de recepteurs situés à la surface des endosomes : les toll-like receptors (TLRs), et plus particulièrement les TLR-3 et TLR7/8/9 (Elliott, 2009). Figure 27 : Induction de la synthèse d’INF de type 1 dans une cellule infectée (Deffontaines) o La signalisation Après une migration plus ou moins longue dans le milieu extracellulaire, les interférons de types alpha et bêta pénètrent dans les cellules cibles. Ils se lient et activent un récepteur cytoplasmique commum d’interférons de type 1. Ce dernier est présent chez toutes les cellules. La liaison des INF-alpha/bêta active la voie de communication dite JAK-STAT. Les protéines STAT (signal transducer and activator of transcription) sont des facteurs de transcription cytoplasmiques latents qui sont phosphorylés par des protéines kinases de la famille Janus (JAK). Une fois activés, STAT-1 et STAT-2 recrutent un troisième facteur, IRF-9, et vont activer les promoteurs des gènes codant pour des protéines aux propriétés antivirales (Elliott, 2009). Finalement, l’ensemble des protéines induites par les INF comprend des enzymes, des facteurs de transcription, des glycoprotéines de surface, des cytokines, des chémokines et un grand nombre de facteurs aux propriétés encore inconnues. 69 o Les mécanismes effecteurs Il y a trois principales protéines qui possèdent une activité antivirale directe : • La 2’5’ OAS (oligoadenylate synthétase) ; • La protéine Mx, qui bloquent la traduction de certains ARNm viraux ; • Une protèine kinase, la PK-P1 qui entaîne la phosphorylation de IIF alpha, ce qui permet de bloquer la traduction des ARNm viraux. Figure 28 : Signalisation et mécanismes effecteurs de la réponse INF de type 1 chez les cellules voisines d’une cellule infectée (Deffontaines) Interférons de type 2 La production d’interférons de type 2 permet le recrutement des macrophages et des lymphocytes T cytotoxiques. Cela augmente ainsi la destruction des particules virales et des cellules infectées. Figure 29 : Synthèse et mode d’action des INF de type 2 (Deffontaines) 70 2.1.2.1.2. Les cellules effectrices Les cellules effectrices de l’immunité innée sont les cellules sentinelles et les cellules NK. Parmi les cellules sentinelles, il y a les cellules dentritiques et les macrophages. Ces cellules sont attirées vers le site d’infection par un chimiotactisme déclenché par la réaction inflammatoire, et notamment par la production d’INF de type 2. Ces cellules ont une capacité de phagocytose, ce qui permet d’éliminer les particules virales et les cellules infectées. Les cellules NK reconnaissent et lysent les cellules infectées. Elles sont activées par l’INF gamma et, suite à leur activation, elles synthétisent également des INF gamma, ce qui va amplifier la destruction des cellules infectées. 2.1.2.1.3. Le système du complément Le système du complément est un groupe de protéines du sérum. Certaines sont directement impliquées dans les mécanismes d’élimination des agents pathogènes, les autres régulent finement l’activité des premières afin d’éviter les réactions auto-immunes. Le complément peut être activé directement par les cellules inféctées par le virus ; il s’agit alors de la voie d’activation alterne du complément. La voie d’activation classique fait intervenir le complexe anticorps-antigène ; cela fait partie de l’immunité acquise. Ce système stimule l’opsonisation et permet le recrutement des lymphocytes B et des macrophages. Il entraîne également la destruction des cellules infectées et des virus à enveloppe par l’intermédiaire du complexe d’attaque membranaire. Ce complexe est en réalité un pore qui se forme dans la membrane plasmique, à l’origine d’une entrée d’eau ou d’ions avec pour conséquence la lyse de la cellule cible. 2.1.2.1.4. L’hyperthermie L’hyperthermie n’est pas un composant du système immunitaire proprement dit, mais c’est une défense primaire de l’organisme. En effet, quand la température augmente, la multiplication virale diminue. La plupart des virus ne se multiplient pas (ou mal) à 40°C. Cela est du aux anomalies de réplication de l’ARN polymérase virale, qui entraîne des modifications au niveau de la structure des protéines virales. Ces protéines se dénaturent plus rapidement que d’autres lorsque la température augmente. 2.1.2.2. Caractéristiques de la réponse immunitaire innée face aux Bunyavirus et au SBV Les cellules NK semblent jouer un rôle mineur dans la protection contre ces virus puisque les cellules infectées sont rapidement détruites, par le virus lui-même, lors de la libération de nouvelles particules virales (Pavlovic, 2000). 71 Les INF de type 1 semblent, par contre, jouer un rôle majeur dans la protection naturelle contre les Bunyavirus. En effet, expérimentalement, la croissance de plusieurs d’entre eux est inhibée par les INFs. Ainsi, des souris rendues « knock-out » (KO) pour les gènes de récepteurs d’INF de type 1 sont très sensibles à l’infection par le virus Bunyamwera (BUNV), le virus de La Crosse (LACV), le nairovirus Dugbe (DUGV), le virus Hantaan (HTNV) et le virus résponsable de la fièvre de la vallée du Rift (RVFV) (Elliott, 2009). C’est également ce qui a été montré chez ces mêmes souris IFNAR-/- pour le SBV (Wernike, 2012). Pour les virus à ARN, les structures qui activent le plus efficacement la réponse IFN sont les ARN viraux double brin et les extrémités 5’ triphosphate présentes sur le génome viral. Cependant, les cellules infectées par les bunyavirus contiennent une trop faible quantité d’ARN double brin. Cette voie n’est donc pas une bonne voie d’activation de la réponse INF pour les virus de la famille du SBV. Parmi les bunyavirus certains genres possédent des extrémités 5’ triphosphatées alors que d’autres possèdent des extrémités 5’ monophophatées. Ainsi, les orthobunyavirus et les phlébovirus possèdent des extrémités 5’ triphosphatées. Les génomes du RVFV et du LACV se révèlent alors de solides déclencheurs de l’induction de la réponse INF (activation de RIGI). Au contraire, les hantavirus et nairovirus possédent des extrémité 5’ monophophatées et se révèlent de mauvais déclencheurs de l’induction de la réponse INF. Ainsi, l’extrémité 5’ triphosphate que possèdent certains bunyavirus comme les orthobunyavirus, permet une meilleure induction de la réponse IFN (en activant la RIG-I et la PKR) que celle permise par l’extrémité 5’monophosphate des nairo- et hantavirus (Elliott, 2009). Parmi les protéines effectrices de cette protection, il n’y a pas d’étude sur le SBV. D’après des études réalisées sur l’orthobunyavirus LACV, le phlebovirus RVFV, et plusieurs hantavirus, les protéines Mx pourraient être un des facteurs principaux de la réponse INF de type 1 contre les Bunyavirus. Ainsi, l’introduction de gènes codant pour certaines protéines Mx chez des moustiques a permis d’inhiber la réplication du LACV. Ces protéines peuvent inhiber la première transcription aussi bien que la réplication du génome des bunyavirus. Une interaction entre la protéine humaine MxA et la protéine virale N a été démontrée pour le LACV, le BUNV et le RVFV. Cela conforte l’idée que la formation d’un polymère entre les protéines Mx et la protéine N ou RNPs affecterait la fonction de la polymérase virale (Elliott, 2009). Des études ont montré que, in vivo, la PKR avait une action délétère sur l’orthobunyavirus BUNV alors que la 2-5 OAS n’avait aucun effet. Le phlebovirus RVFV n’est sensible à la PKR, in vivo et in vitro, qu’en l’absence de la protéine virale Ns. Le nairovirus DUGV est combattu par le système INF même si , in vivo, ni les protéines Mx ni la PKR ne jouent un rôle. Cela montre qu’en plus des protéines Mx et PKR, il existe d’autres effecteurs antibunyavirus dans le système INF (Elliott, 2009). Parce que le systéme des interférons est un systéme très efficace pour lutter contre l’infection virale, les virus pathogènes évoluent de façon à contourner ou à inactiver le système des IFN. Ainsi certains virus comme les bunyavirus produisent des particules antagonistes des IFN qui 72 interfèrent avec la phase d’induction, de signalisation, d’activation des protéines effectrices ou une combinaison des trois (Elliott, 2009). 2.1.2.3. Modes d’echappements des Bunyavrius et du SBV à la réponse immunitaire innée 2.1.2.3.1. Induction limitée de la réponse INF de type 1 La virulence du phlebovirus PTV chez le hamster dépend de la capacité des différentes souches virales à diminuer la réponse IFN. De plus, chez l’homme, les hantavirus pathogènes suppriment la phase d’induction ou de communication de la réponse IFN plus efficacement que les hantavirus non pathogènes. Enfin, chez les patients infectés par les hantavirus, le niveau d’activité des différents acteurs de la réponse INF n’augmente pas au cours de la maladie (Elliott, 2009). Ainsi, ces différentes études semblent montrer que la réponse de type INF après infection par un bunyavirus n’est pas aussi forte que ce à quoi il était possible de s’attendre. Par quel mécanisme les bunyavirus empêchent-ils une réponse INF « normale » suite à l’infection ? 2.1.2.3.2. Echappement du virus à la réponse INF de type 1 La segmentation naturelle du génome des orthobunyavirus implique qu’il y a trois extrémités 5’triphosphate par particule virale qui activent la RIG-I. Pour contrebalancer le fait qu’ils sont de bons inducteurs naturels de la réponse INF, ces virus expriment un facteur antagoniste de l’induction de la réponse IFN. Cet antagoniste très actif est la protéine NSs. En effet, une étude sur des souris montre que la protéine NSs du SBV joue ce rôle et que lorsque le gène de la protéine NSs ne s’exprime pas, le virus est moins virulent (Varela, 2013). La concentration en IFN est moins importante dans les cellules où le gène NSs s’exprime normalement que dans celles où il ne peut pas s’exprimer. Ce manque d’INF ne permet pas une bonne protection de la cellule alors que dans l’autre cas, la protection est assurée. Ainsi, malgré des différences de séquence, de taille et de mode d’expression, la protéine NSs agit en bloquant l’ARN polymérase II. La conséquence est une diminution importante de toutes les transcriptions chez la cellule hôte (Elliott, 2009). La recherche d’ARNm-INF-bêta dans les cellules infectées par du SBV délété pour le gène NSs indique que la transcription des gènes INF-bêta a bien lieu. Ce n’est pas le cas pour les cellules infectées par une particule virale de SBV pouvant exprimer la protéine NSs. Cela suggère que la protéine NSs du SBV interfère avec la transcription des gènes des INF bêta lors de l’infection. La protéine NSs jouerait donc un rôle de modulateur, direct ou indirect, sur la réponse INF suite à l’infection par le SBV (Varela, 2013). 73 2.1.3. Réponse immunitaire spécifique 2.1.3.1. Les acteurs de la réponse immunitaire spécifique 2.1.3.1.1. Les lymphocytes B Les lymphocytes B sont des cellules sanguines qui possèdent de nombreux récepteurs membranaires. Ces récepteurs sont des immunoglobines qui se lient spécifiquement aux antigènes, et notamment aux antigènes viraux. A la suite de la reconnaissance d’un antigène viral par ses récepteurs, le lymphocyte B va être activé et va proliférer. Parmi les lymphocytes B issus de l’expansion clonale, certains vont se différencier en lymphocytes B mémoire et d’autre en plasmocytes. Ces plasmocytes produisent des anticorps spécifiques de l’antigène reconnu au départ. Toutes les étapes sont régulées par des interleukines. 2.1.3.1.2. Les lymphocytes T Les cellules sentinelles, les macrophages et les cellules dendritiques phagocytent les particules virales. Ensuite, un antigène de cet agresseur va être présenté à la surface de ces cellules. Cet antigène est lié à un récepteur : le CMH de classe 2. Remarque : Toutes les cellules d’un organisme exprime un récepteur membranaire commun : le CMH1. Il est unique pour chaque individu. Par contre, seules les cellules présentatrices d’antigènes expriment un récepteur membranaire de type CMH2. Les lymphocytes T CD4+ Les lymphocytes T CD4+ circulent dans le sang et reconnaissent les cellules qui présentent un antigène viral au niveau d’un récepteur CMH2. La reconnaissance se fait grâce à une liaison spécifique entre le CMH2 et le récepteur lymphocytaire CD4+. Suite à cette reconnaissance, le lymphocyte T4 est activé. Il va se multiplier et libérer des INF gamma ainsi que d’autres cytokines, entraînant soit l’activation des lymphocytes T cytotoxiques CD8+ et des macrophages soit l’activation des plasmocytes. Les lymphocytes T4 sont donc les « organisateurs » de l’immunité acquise. Les lymphocytes cytotoxiques (LT CD8+) Les lymphocytes T cytotoxiques CD8+ circulent dans le sang et reconnaissent les cellules infectées qui présentent un antigène viral au niveau du CMH1. Cette reconnaisance se fait grâce à une liaison spécifique entre le CMH1 et le récepteur membranaire lymphocytaire CD8+. Par différents mécanismes, elle entraîne la mort de la cellule infectée. 2.1.3.2. Les deux types de réponse immunitaire spécifique Les acteurs de l’immunité spécifique sont à l’origine de deux types de réponse. D’un côté, il y a la réponse à médiation humorale basée sur la production d’anticorps. De l’autre, il y a la réponse à médiation cellulaire basée sur l’action des LTc. 74 Tableau 14 : Caractéristiques de la réponse immunitaire spécifique à médiation humorale et de la réponse immunitaire spécifique à médiation cellulaire. Réponse à médiation humorale • • • • Réponse à médiation cellulaire • Reconnaisance du complexe antigèneCMH2 par les lymphocytes T CD4 Activation des cellules effectrices par les LT CD4 (production INF de type 2) • Production d’anticorps par les plasmocytes Reconnaisance du complexe antigèneCMH1 par les lymphocytes T CD8 • Efficace contre les agents pathogènes présents dans le sang ou les autres liquides Lyse des cellules inféctées par les lymphocytes T cytotoxiques, les macrophages et les cellules NK • Efficace contre les agents pathogènes intracellulaires • Mémoire immunitaire Mémoire immunitaire. 2.1.3.3. Réponse immunitaire à médiation humorale face aux bunyavirus et au SBV L’infection expérimentale par le SBV de trois bovins a entrainé la production d’anticorps. Leur détection, par séroneutralisation, a été possible dès 18 jours avec des titres très élevés audelà de 40 jours (Hoffmann, 2012). Une étude portant sur l’inoculation du virus Akabane sur des brebis gestantes montre que les anticorps neutralisants sont présents dès cinq jours après l’inoculation. Autour de la mise bas, la concentration en anticorps diminue ponctuellement. Aucune différence au niveau de la réponse anticorps n’est observée entre les brebis donnant naissance à des agneaux mal-formés et les brebis donnant naissance à des agneaux « normaux ». Le stade de gestation au moment de l’infection n’influence pas non plus cette réponse (Parsonson, 1977). Les anticorps produits suite à l’infection par le virus Akabane préviennent l’infection transplacentaire (World Organisation for Animal Health, 2008). Ainsi, si l’animal infecté est capable de supporter les conséquences de l’infection, le système immunitaire spécifique est capable de produire des anticorps neutralisants spécifiques. Ils sont efficaces contre le cirulation virale sanguine et ils protègent contre les infections à venir (Charles, 1994 ; Weber, 2002). 2.1.3.4. Réponse immunitaire à médiation cellulaire face aux bunyavirus et au SBV Les lymphocytes T cytotoxiques semblent jouer un rôle mineur dans la protection contre ces virus. En effet, comme pour les cellules NK, ils interviennent dans la lyse des cellules infectées. Or, le cycle de réplication virale entraîne, au moment de la sortie des nouvelles particules virales par bourgeonnement, l’apoptose de la cellule infectée. Les cellules cibles des lympocytes T cytotoxiques sont rapidement détruites par le virus lui-même, lors de la libération de nouvelles particules virales (Pavlovic, 2000). 75 2.1.4. Maturité immunitaire du jeune vis à vis du SBV La sensibilité aux bunyavirus dépend de l’âge aussi bien chez l’homme, chez l’animal de rente que chez l’animal de laboratoire (Elliott, 2009). 2.1.4.1. Rappel : système immunitaire du fœtus Chez les ruminants, le type de placentation empêche le passage des cellules de l’immunité et des anticorps de la mère vers le fœtus. C’est pourquoi toute réponse immunitaire du fœtus dépend du niveau de développement et de maturation du système immunitaire fœtal. La réponse immunitaire chez un fœtus de ruminant infecté par le SBV, ou par un autre agent pathogène, dépend donc du stade de gestation au moment de l’infection. Chez les bovins, le développement du système immunitaire commence au 41ème jour de gestation et se poursuit jusqu’au 175ème jour. Chez les ovins, il commence à se developper à partir du 19ème jour et se termine vers le 115ème jour de gestation. Au cours de cette période, le système immunitaire devient de plus en plus compétent dans la lutte contre les infections. Ainsi, il commence à lutter efficacement à partir de 90 jours de gestations chez les bovins et de 65 à 70 jours chez les petits ruminants (Steukers, 2012 ; Parsonson , 1977 ; Parsonson., 1981). Ainsi, dès que le système immunitaire du fœtus est suffisamment developpé pour pouvoir identifier les antigènes du SBV, cela va entraîner une réponse de type inflammatoire qui donnera lieu à des encéphalites par exemple. Une infection du fœtus plus précoce pourrait entraîner une immunotolérance, comme c’est le cas pour le BVD, et l’absence d’inflammation (Bréard, 2013). 2.1.4.2. Production fœtale d’INF de type 1 Comme vu précédemment, la résistance naturelle de l’hôte au SBV se fait par l’intermédiaire du systéme interféron de type 1. Or, chez les jeunes animaux et plus particulièrement chez le fœtus, ce système de défense n’est pas encore mature. Ceci expliquerait la très forte sensibilité des fœtus, dont le système immunitaire ne peut encore produire une réponse interféron de type 1 « mature » (Elliott, 2009). 2.1.4.3. Immunité humorale fœtale Une étude sérologique menée sur des vaches séropositives pour le SBV et sur leurs produits a montré que sur 471 produits sans signes cliniques de SBV congénital, 116 (24,6%) étaient séropositifs pour le SBV avant la prise colostrale. Ainsi, l’infection d’une femelle en gestation entraîne souvent une transmission du virus au fœtus (après 30 jours de gestation) mais cela n’entraîne pas nécessairement des avortements, des malformations congénitales ou des troubles nerveux. Un produit en bonne santé peut naître lorsque l’infection du fœtus se fait quand son système immunitaire est capable de produire des anticorps neutralisants (Garigliany, 2012b). D’après certaines auteurs, le fœtus bovin pourrait produire des anticorps contre le SBV à partir de 150 jours de gestation mais cette date reste à démontrer (Garigliany, 2012b). Par 76 contre, le fœtus bovin peut produire des anticorps décelables contre les rotavirus dès 73 jours, contre les parvovirus dès 93 jours et contre le virus parainfluenza de type 3 à 120 jours (Tizard, 2004). Le fœtus ovin produit des anticorps contre le virus Akabane à partir de 50 jours de gestation (Tizard, 2004). 2.1.4.4. Immunité colostrale La persistance des anticorps d’origine maternelle chez le veau a été étudiée pour le virus Akabane. Les anticorps persistent pendant une période de 3,7 à 4,8 mois. La quantité et la qualité du colostrum, la durée et la précocité de la prise colostrale, et l’absorption des anticorps à travers la barrière intestinale sont les principaux facteurs influençant la durée de vie des anticorps d’origine colostrale chez le nouveau-né. Dans cette étude, la concentration du colostrum en anticorps varie avec l’exposition des mères au virus, plus ou moins importante suivant les zones géographiques, et le type de bovin, laitier ou allaitant. Les anticorps persistent plus longtemps chez les veaux allaitants que chez les veaux laitiers. Ceci serait dû à une meilleure qualité des colostrums de vaches allaitantes mais aussi au fait que les veaux allaitants sont laissés avec leur mère, augmentant ainsi la qualité du transfert de l’immunité passive (Tsutsui, 2009). Remarque : Au-delà de 36 heures, les anticorps présents dans le lait ne sont plus absorbés au niveau de l’intestin. Cependant, dans le cas des veaux allaitants, chaque buvée au cours des 36 premières heures va apporter des anticorps, alors que ce ne sera pas le cas pour les veaux laitiers puisque ces derniers sont souvent nourris avec du lait en poudre reconstitué. Sensibilité du fœtus bovin au SBV Réponse immunitaire 0 30 j 90 j Immunotolérance ? Pas de passage transplacentaire du virus 150 j 175 j 280 j Production d’anticorps Protection colostrale (jusqu’à 4 mois) Figure 30 : Schéma bilan, évolution de la sensibilité fœtale à l’infection par le SBV et défenses immunitaires (Deffontaines) 77 2.1.5. SBV et immunité : bilan Points à retenir • • • • • • Importance du système INF de type 1 Importance quantitative des lymphocytes T Importance quantitative moindre des lymphocytes B et des macrophages (Herder, 2013) Production d’anticorps neutralisants prévenant l’infection transplacentaire Diminution de la sensibilité du fœtus au SBV au fur et à mesure de la gestation 2.2. Expression clinique du SBV La maladie de Schmallenberg se manifeste cliniquement sous trois formes. La forme inapparente et la forme aigüe concernent majoritairement les adultes alors que la forme congénitale se manifeste chez les nouveaux-nés. Remarque : L’appellation SBV signifie littéralement Schmallenberg virus, mais, par souci de simplification, l’expression « SBV aigu » sera utilisée pour désigner la forme aigüe de l’infection par le SBV. Il en sera de même pour la forme congénitale. 2.2.1. La forme inapparente La maladie se manifeste chez les bovins et les petits ruminants adultes sous une forme inapparente dans la plupart des cas. En effet, d’après les enquêtes sérologiques, la proportion d’animaux séropositifs est beaucoup plus importante que la proportion d’animaux ayant contracté un SBV aigu (Elbers, 2012). 2.2.2. La forme aiguë Le SBV aigu est une forme qui reste malgré tout bénigne et transitoire dans la plupart des cas. Il se caractérise par un syndrôme fébrile et des signes cliniques non spécifiques. Les premières descriptions de signes cliniques d’atteinte par le SBV chez le bovin adulte rapportent une hyperthermie (> 40°C) transitoire, une chute de production laitière significative (jusqu’à 50 %), une diarrhée sévère et parfois des avortements (International Society for Infectious Diseases, 2011). En temps normal, la barrière hémato-méningée ne permet pas, chez les adultes, le passage du SBV dans le SNC, expliquant ainsi l’absence de troubles nerveux rapportés lors d’infections aigües par le SBV (Varela, 2013). A noter cependant que, concernant le virus Akabane, quelques cas isolés d’encéphalomyélites ont tout de même été rapportés chez les bovins (Kono, 2008). 78 2.2.2.1. Résultats issus de la reproduction expérimentale de la maladie Trois veaux d’environ 9 mois ont été infectés par voie intraveineuse et/ou sous-cutanée. La virémie détectée par qRT-PCR s’est étendue de 2 à 5 jours après l’infection, avec une virémie maximale au jour 4. Les résultats montrent donc une virémie de courte durée. Par ailleurs, un seul animal a développé une hyperthermie (40,5°C) et un seul autre une diarrhée muqueuse persistant plusieurs jours. Enfin, le sérum testé a permis de mettre en évidence la présence d’anticorps par séroneutralisation à partir du 21ème jour (Hoffmann, 2012). L’inoculation expérimentale de SBV chez des ovins conduit aux mêmes observations que chez les bovins, à savoir, une virémie courte (3 à 5 jours) et des symptômes peu marqués voire absents. De plus, dans certains cas, la détection du génome viral dans les nodules lymphatiques est possible jusqu’à 44 jours après l’inoculation. Enfin, les anticorps sont détectables dans le sérum à partir du 14ème jour (Wernike, 2013a). Remarque : Une étude portant sur l’infection naturelle chez les ovins a montré que, contrairement a ce qui est observé lors d’une inoculation expérimentale de SBV, chaque animal est porteur du virus pendant 10 à 15 jours (Claine, 2013). Cependant, dans les conditions naturelles, un même animal peut être piqué plusieurs fois par un Culicoïdes. Chaque piqûre peut entraîner une inoculation de SBV. Or, la réponse humorale n’est détectable par séroneutralisation que 2 à 4 semaines après le premier contact avec le virus. Ainsi, dans les conditions naturelles, il peut y avoir plusieurs inoculations de virus et la virémie pourrait être observée jusqu'à ce que la production d’anticorps anti-SBV empêche la circulation virale dans l’organisme. 2.2.2.2. Résultats issus d’une enquête terrain Une enquête réalisée en France visant à décrire cliniquement l’infection aigüe par le virus SBV chez les bovins a recruté 14 troupeaux dans lesquels le virus a circulé formellement pendant l’épisode clinique (RT-PCR ou séroconversion) (Collin, 2012). Ces troupeaux étaient situés dans des zones où le virus avait peu circulé pendant la saison d’activité vectorielle des Culicoïdes en 2011, et qui ont déclaré la maladie entre fin mai 2012 et mi octobre 2012, avec une majorité de cas en juillet 2012. 2.2.2.2.1. Résultats au niveau du troupeau (Collin, 2012) Durée de l’épisode clinique dans le troupeau La durée de l’épisode clinique dans le troupeau varie de 7 à 30 jours. Les cheptels qui ont un nombre assez faible d’animaux touchés cliniquement sont également ceux qui ont une durée globale d’épisode plus faible. Taux d’animaux atteints cliniquement dans le troupeau Le taux d’atteinte clinique varie de 8 à 30% des vaches en production et s’élève à 20% en moyenne. 79 Dans l’un des cheptels, le taux d’atteinte a été de 97 % ; il s’agissait d’un cheptel pour lequel une pathologie intercurrente a été suspectée. SBV et protection immunitaire Dans trois élevages, il a été mentionné l’apparition concommitante ou secondaire de maladies intercurrentes (mammites notamment mais aussi maladies respiratoires). Si une baisse d’immunité est plausible, il ne faut pas la relier nécessairement au SBV, mais considérer le problème de résistance globale du troupeau dans son ensemble. En effet, le SBV pourrait s’exprimer plus intensément dans les troupeaux immunodéprimés. SBV et reproduction o Avortements en fin de gestation (dernier tiers) Dans quatre élevages, des avortements en fin de gestation ont été signalés lors du passage viral dans l’élevage, sans analyse spécifique SBV chez les animaux concernés. Concernant les avortements dans le dernier tiers de gestation, l’état actuel des investigations ne permet pas de conclure quant à une implication du SBV aigu. Une étude comparant les déclarations d’avortement par les éleveurs bovin au deuxième semestre 2010 et au deuxième semestre 2011 (du 1er juillet au 31 décembre) permet de constater que le SBV ne semble pas avoir été à l’origine d’une augmentation significative des avortements de fin de gestation en élevage bovin au cours du 2ème semestre 2011. Malgré la forte sous-déclaration des avortements bovins en France, il est probable que si le SBV aigu avait entraîné une augmentation des avortements en élevage, une proportion plus importante d’éleveurs aurait déclaré des avortements (Bronner, 2012). o Mortalités embryonnaires Dans quatre élevages faisant l’objet d’un suivi de reproduction, il a été remarqué des défauts de gestation sur des animaux en début de gestation au moment du passage viral (de l’ordre de 75% des animaux du lot considéré). Dans un autre élevage, après avoir découvert une séropositivité suite à des signes cliniques évocateurs (hyperthermie, diarrhée, chute de production de 20 vaches sur 70 en production), de nombreuses mortalités embryonnaires tardives ont été confirmées (8 vaches en début de gestation retrouvées vides à l’échographie suivante). Les résultats concernant ces mortalités embryonnaires ne permettent pas d’en définir la cause (hyperthermie ou effet direct du virus sur le fœtus ou ses annexes). 2.2.2.2.2. Résultats au niveau individuel Au total, 103 animaux ont été décrits individuellement. Les résultats sont présentés dans le tableau suivant : 80 Tableau 15 : Fréquences d’observation des signes cliniques lors de SBV aigu chez les bovins (Collin, 2012) Pourcentage d’animaux concernés (par rapport aux 103 animaux décrits individuellement) Durée moyenne des symptômes (en jours) Signes cliniques relevés Caractéristiques des signes cliniques relevés Hyperthermie De 39.5°C à 42°C 100% 4, ( min = 1 jour, max = 6 jours) Anorexie 46% 5, (min = 1 jour, max = 11 jours) Signes généraux Baisse de production Signes digestifs Abattement 57% 7, (max = 15 jours) Absence de rumination 20% Intense (baisse supérieure à 50%) 67% Modérée (baisse comprise entre 25 et 50%) 35% Diarrhée profuse 23% 3 Diarrhée hémorragique 4% 3 Remarques À mettre en relation avec l’hyperthermie À mettre en relation avec l’anorexie et l’hyperthermie À mettre en relation avec l’anorexie et l’hyperthermie 7 Peut précéder l’hyperthermie de 12 à 24 heures Le signe majeur est l’hyperthermie importante (39.5°C à 42°C), associée à une baisse de production modérée à intense qui rétrocède totalement en une semaine environ. Les signes généraux associés (anorexie, abattement, non-rumination) sont inconstants. Ils rétrocèdent globalement au bout de cinq jours. Les signes digestifs (diarrhée aiguë profuse, voire hémorragique mimant la dysenterie hivernale) sont présents chez 27% des animaux. Toutefois, dans l’un des cheptels, des signes digestifs ont été observés sur 80% des animaux malades. A noter également qu’un impact a été observé sur des animaux qui ne présentaient pas de signes cliniques visibles, en particulier dans des exploitations en traite robotisée. En effet, chez ces animaux, le robot de traite révèle tout de même une hyperthermie et/ou une baisse de production. Cela amène à penser que sans un examen clinique approfondi, avec notamment 81 une bonne prise de commémoratifs et d’anamnèse ainsi qu’une prise de température, le nombre de cas de SBV aigu a très sûrement été sous-estimé. 2.2.2.3. SBV aigu : conclusion Points à retenir concernant le SBV aigu un tableau clinique non spécifique : o hyperthermie (>40°C) o dégradation de l’état général o anorexie o diarrhée o baisse de production o avortements ? o troubles de la reproduction ? une guérison rapide : o quelques jours à l’echelle individuelle (2-3 jours) o quelques semaines à l’echelle du troupepaau (2-3 semaines) La rareté, l’inconstance et le caractère non spécifique des troubles susceptibles d’être liés à une infection aiguë par le virus SBV chez les ruminants expliquent que ce virus ait pu diffuser de façon non détectée avant l’apparition de formes congénitales. 2.2.3. La forme congénitale Les virus tératogènes sont peu nombreux mais certains virus du sérogroupe Simbu sont connus pour leurs effets tératogènes sur les ruminants. C’est le cas, par exemple, des virus Akabane, Aino et Paeton. Ces virus passent la barrière placentaire des ruminants et se répliquent dans le fœtus. Cela peut entraîner des avortements et des malformations congénitales (Charles, 1994 ; Tsuda, 2004). La forme congénitale du SBV affecte les bovins, les ovins et les caprins. Elle touche aussi bien les mâles que les femelles. Cela se traduit soit par des nouveaux-nés malformés soit par des nouveaux-nés bien formés mais présentant des troubles divers (Garigliany, 2012a). 2.2.3.1. Description des signes cliniques de la forme congénitale 2.2.3.1.1. Malformations congénitales Expérimentalement, l’infection de brebis gestantes par le virus Akabane a entraîné la naissance d’agneaux avec le même type de déformations (Parsonson, 1977). Les malformations macroscopiques observées sur le terrain pour les virus Akabane et Schmallenberg sont semblables. Elles sont regroupées sous le terme de syndrome arthrogrypose-hydranencéphalie (tableau 16). 82 Tableau 16 : Malformations congénitales visibles à la naissance causées par le virus Schmallenberg (Garigliany, 2012a) Organe touché Colonne vertébrale Malformation Torticolis Raideur du cou. La tête est souvent basculée sur le dos de l’animal. Scoliose Déviation de la colonne vertébrale Membres Arthrogrypose Muscles Hypoplasie musculaire Crâne Mâchoire Définition Raideur des membres associée à des atteintes neurologiques avec raccourcissement des tendons Sous développement musculaire Hydrocéphalie Accumulation excessive de liquide céphalo-rachidien à l’intérieur des cavités du cerveau. Cela se traduit fréquemment par une augmentation de la taille du crâne. Brachygnatisme Différence de longueur entre la mâchoire inférieure et la mâchoire supérieure. La mâchoire inférieure est généralement plus courte. Figure 31 : Brachygnathie inférieure chez un agneau atteint de SBV congénital (Deffontaines, octobre 2013, Côte d’Or) Figure 32 : Arthrogrypose et léger torticolis chez un agneau atteint de SBV congénital (Deffontaines, octobre 2013, Côte d’Or) 83 Figure 33 : Arthrogrypose et torticolis chez un veau atteint de SBV congénital (Deffontaines, décembre 2013, Côte d’Or) Très fréquemment, la mise bas est dystocique. L’extraction forcée n’est pas toujours possible même en brisant les articulations. Les solutions sont alors l’embryotomie ou la césarienne. 2.2.3.1.2. Autres signes cliniques Un certain nombre d’animaux naissent vivants sans malformations visibles, mais présentent des troubles du comportement. Ainsi, des troubles moteurs peuvent être observés, comme de l’incapacité à se tenir debout, de la paralysie flasque, des mouvements exagérés, de l’ataxie et des difficultés à téter. Des troubles d’ordre psychique, comme des nouveaux-nés tristes ou qui présentent des vocalises anormales, son également observés. Enfin, des toubles d’ordre sensoriel sont aussi observés tels la cécité et des troubles d’ordre neurovégétatifs tels une production anormalement élevée de larmes (Garigliany, 2012b). Enfin, certains veaux ayant à la naissance un habitus normal meurent dans la semaine qui a suivi la naissance (parfois dès 12 heures après la naissance), sans raisons apparentes. Ces veaux peuvent présenter des signes neurologiques (opisthotonos), sans autre signe clinique. Un syndrome de dépérissement inéluctable est ce qui représente le mieux l’évolution clinique de ces veaux. Seul un veau présentant ce syndrome a fait l’objet d’une RT-PCR sur prélèvement sanguin et a révélé la présence du SBV. Il serait important de clarifier si ce type de cas est attribuable à une infection néonatale ou à une infection congénitale (Garigliany, 2012a ; Plateforme ESA, 2012a). 2.2.3.2. Fréquences relatives des différents signes cliniques de la forme congénitale Les résultats présentés dans cette partie sont ceux de deux enquêtes descriptives réalisées dans des élevages atteints par le virus de Schmallenberg8. La première concerne les bovins (Plateforme ESA, 2012a) et la seconde les petits ruminants (Plateforme ESA, 2012b). 8 Dans chacun des élevages enquêtés, au moins un cas de SBV congénital a été confirmé par des analyses de laboratoire. Tous les cas ne sont donc pas des cas confirmés. 84 Il est à noter que ces deux enquêtes ont été réalisées entre janvier et août 2012. Les résultats correspondent donc aux conséquences de la circulation du SBV dans des troupeaux non immunisés contre ce virus. 2.2.3.2.1. Bovins L’enquête descriptive concernant les bovins a été menée entre février et août 2012. Elle concernait 510 élevages, soit un cheptel global de 37 504 bovins. Les données se rapportent à 16 017 vaches ayant vêlé et 16 175 veaux nés sur la période d’enquête. Concernant les femelles o Répartition des femelles à problème Une femelle à problème a été définie comme une femelle ayant mis bas un ou plusieurs produit(s) présentant des troubles pouvant être rapportés au SBV. En moyenne, 6 % des femelles ayant mis bas sont des femelles à problème (écart-type 19%). Cette proportion reste relativement faible. En effet, dans 89% des cheptels concernés, la proportion de vaches à problème est inférieure à 30%. Ce ratio se situe à moins de 5% dans un tiers des cheptels bovins concernés (34%). Figure 34 : Répartition de la proportion de femelles à problème pouvant être rapporté au SBV au sein des cheptels enquêtés (489 élevages) (Plateforme ESA, 2012a) 85 o Mise-bas avant terme Parmi les vaches ayant vêlé, 2 % ont mis bas avant terme (écart-type : 15%). Concernant ces avortements, pour en moyenne 61% des femelles ayant mis bas avant terme, le ou les avorton(s) ne présent(en)t aucune malformation. Cependant, une grande variabilité entre les élevages est observée (écart-type 48%). o Mise-bas à terme Les mises-bas à terme à problème sont définies comme des naissances d’un ou plusieurs veaux présentant des malformations, des troubles, ou morts. Cela concerne, en moyenne, 4% des femelles (écart-type 13%). La figure 32 représente la répartition de la proportion de mise bas à terme à problème. Dans une majorité de cheptels (57%), moins de 5% des femelles ont mis bas à terme des veaux présentant des troubles. Figure 35 : Répartition de la proportion de femelles ayant mis bas à terme des veaux présentant des troubles (490 élevages) (Plateforme ESA, 2012a) o Autres éléments remarquables En moyenne, 5% des femelles à problème pouvant être rapportées au SBV sont mortes dans les 15 jours suivant la mise bas, des suites d’une mise bas à problème susceptible d’être liée au SBV (écart type : 21%). Cela est du probablement aux manipulations obstétricales réalisées durant les mises-bas dystociques. Par ailleurs, parmi les femelles à problème pouvant être rapportées au SBV, en moyenne, 6% des femelles ont mis bas deux produits ou plus dont l’un d’entre eux est parfaitement normal et au moins un autre est mort ou présente des troubles du comportement ou des malformations (écart-type : 23%). 86 Concernant les produits (veaux) o Répartition des veaux à problème En moyenne, sur l’ensemble des veaux nés vivants ou morts, normaux ou non, 7% de produits à problème pouvant être rapportés au SBV sont observés (écart-type : 19%). En moyenne, sur la totalité des naissances, 5% des produits naissent morts (avortons ou morts-nés) ou meurent très rapidement (dans les 12h) après la naissance dans les cheptels atteints (écart-type 17%). Parmi ces produits mort-nés ou mourant rapidement, 55% en moyenne présentent des malformations, mais les chiffres restent variables d’un élevage à l’autre (écart-type : 39%). Parmi la totalité des naissances, en moyenne 2% des veaux naissent vivants avec des troubles du comportement ou des malformations et sont encore vivants au bout de 12 heures (écarttype 9%). Dans un quart des cas, la viabilité estimée de ces animaux reste assez faible. o Description globale des malformations et troubles observés sur les veaux Le tableau ci-dessous montre les fréquences d’observation des anomalies sur les veaux atteints de SBV congénital. Tableau 17 : Répartition des cheptels en fonction de la fréquence d’observation des différentes anomalies sur les veaux atteints de SBV congénital (Plateforme ESA, 2012a) Anomalie Nombre de cheptels Fréquence d’observation de l’anomalie parmi les veaux à problème du cheptel > 50 % 20-50 % 10-20% < 10 % Non observé Troubles nerveux 410 7% 2% 1% 3% 87 % Veaux putréfiés ou gangrenés avec arrachement des membres à la traction 388 5% 3% 1% 6% 85 % Anomalie de la colonne vertébrale 447 25% 4% 0% 11 % 60 % Anomalie du port de la tête 459 34 % 5% 2% 11 % 48 % Déformation - blocage des articulations 468 52 % 7% 3% 18 % 21 % Allongement des membres 441 18 % 2% 2% 8% 70 % Les anomalies de fréquences les plus élevées sont, par ordre décroissant : 1. déformation ou blocage des articulations, 2. anomalie du port de la tête, 3. anomalie de la colonne vertébrale. 87 2.2.3.2.2. Petits ruminants L’enquête descriptive concernant les ovins a été réalisée entre février et juin 2012. Elle concernait 574 élevages de petits ruminants. Les données se rapportent ainsi à 563 élevages ovins et 11 élevages caprins, soit un total de 79 179 brebis, 98 036 agneaux, 777 chèvres et 973 chevreaux (Plateforme ESA, 2012b). Concernant les femelles (ovins) o Répartition des femelles à problème En moyenne, 16 % des femelles ayant mis bas présentent des problèmes pouvant être rapportés au SBV (écart-type 19%). Ce ratio se situe entre 10 et 19% dans plus d’un quart des lots concernés, mais cette proportion reste très variable selon les élevages (voir figure cidessous). En effet, dans 32 % des élevages la proportion de brebis à problème est inférieure à 10%, et à l’inverse, dans 23 % des élevages la proportion de brebis à problème est égale ou supérieure à 30%. Dans 3 % des cas, la proportion de brebis à problème dépasse 70 %. Figure 36 : Répartition de la proportion de femelles à problème pouvant être rapportées au SBV au sein des lots concernés par les troubles (560 élevages) (Plateforme ESA, 2012b) o Mise-bas avant terme Parmi les femelles ayant mis bas, 4.5 % ont mis bas avant terme (écart-type : 9.7%). Pour en moyenne 57% des femelles ayant mis bas avant terme, le ou les avorton(s) ne présent(en)t aucune malformation, avec une grande variabilité entre les lots (écart-type 44%). 88 o Mise-bas à terme En moyenne, 12% des femelles ont mis bas à terme un ou plusieurs agneaux présentant des malformations, des troubles, ou morts (écart-type 17.4%). Dans une majorité de lots (86.2%), moins de 30% des femelles ont mis bas à terme des agneaux présentant des troubles (voir figure ci-après). Figure 37 : Répartition de la proportion de femelles ayant mis bas à terme des agneaux présentant des troubles (559 élevages) (Plateforme ESA, 2012b) o Autres éléments remarquables En moyenne, 12 % des femelles à problème pouvant être rapportées au SBV sont mortes dans les 15 jours suivant la mise bas, des suites d’une mise bas à problème susceptible d’être liée au SBV (écart type : 21%). Ces résultats semblent confirmer que les mises-bas d’agneaux anormaux faisant suite à une infection par le SBV induisent des pertes significatives chez les mères. Ces pertes sont probablement liées aux manipulations obstétricales réalisées durant les mises-bas dystociques. Cette proportion, deux fois plus importantes chez les ovins que chez les bovins, pourrait provenir d’une intervention moins fréquente du vétérinaire en cas de mise bas dystocique chez les ovins par rapport aux bovins. Par ailleurs, parmi les femelles à problème pouvant être rapportées au SBV, en moyenne, 33 % des femelles ont mis bas deux produits ou plus dont l’un d’entre eux est parfaitement normal et au moins un autre est mort ou présente des troubles ou des malformations (écarttype : 36%). Ce chiffre reste très variable selon les élevages. 89 Concernant les produits (agneaux) o Répartition des agneaux à problème En moyenne, sur l’ensemble des agneaux nés à la date de renseignement du questionnaire (vivants ou morts, normaux ou non), 15% de produits à problème peuvent être rapportés au SBV (écart-type : 18%). En moyenne sur la totalité des naissances, 13% des produits naissent morts (avortons ou morts-nés) ou meurent très rapidement (dans les 12h) après la naissance (écart-type 16%). Parmi ces produits mort-nés ou mourant rapidement, 63% en moyenne présentent des malformations mais les chiffres restent variables d’un élevage à l’autre (écart-type : 33%). Parmi la totalité des naissances, en moyenne 2% des agneaux nés vivants avec des troubles ou des malformations sont encore vivants au bout de 12 heures (écart-type 7.3%). Dans la moitié des cas, la viabilité estimée de ces animaux reste assez faible. o Description globale des malformations et troubles observés sur les agneaux Le tableau ci-dessous montre les fréquences d’observation des anomalies sur les agneaux atteints de SBV congénital. Tableau 18 : Répartition des cheptels en fonction de la fréquence d’observation des différentes anomalies sur les agneaux atteints de SBV congénital (Plateforme ESA, 2012b) Anomalie Nombre de cheptels Fréquence d’observation de l’anomalie parmi les agneaux à problème du cheptel > 50 % 20-50 % 10-20% < 10 % Non observé Troubles nerveux 537 3% 5% 9% 20 % 63 % Agneaux putréfiés ou gangrenés avec arrachement des membres à la traction 536 5% 9% 16 % 25 % 46 % Anomalie de la colonne vertébrale 552 23 % 11 % 11 % 16 % 39 % Anomalie du port de la tête 556 29 % 17 % 13 % 21 % 21 % Déformation - blocage des articulations 560 60 % 10 % 10 % 16 % 4% Les anomalies de fréquences les plus élevées sont, par ordre décroissant : 1. déformation ou blocage des articulations ; 2. anomalie du port de la tête ; 3. anomalie de la colonne vertébrale. 90 Concernant les caprins Sur les 11 élevages enquêtés entre le 01/08/2011 et le 30/09/2011, 8 élevages présentent moins de 20% de femelles à problème pouvant être rapportées au SBV. A l’opposé, un des élevages rapporte plus de 90% des femelles à problème (petit effectif). Les mises-bas avant terme sont très peu ou pas rapportées. Sur ces naissances, aucune malformation n’a été observée. Sur les chevreaux, 8 élevages ont moins de 9% de chevreaux à problème pouvant être rapportées au SBV. L’enquête auprès d’un des élevages rapporte plus de 90% de chevreaux à problème (petit effectif). Lorsqu’il y a des naissances avant terme ou des chevreaux mort-nés ou morts dans les 12 heures, les chevreaux semblent pour moitié d’apparence normale mais il existe une grande variabilité entre élevages (moyenne de 59% ; écart-type 43%). Très peu de chevreaux malformés semblent survivre au-delà des 12h post-partum, ceci étant compatible comme pour les ovins avec une viabilité faible en cas de troubles ou de malformations. Dans ces 11 élevages, les anomalies observées ont été des déformations des articulations, des anomalies du port de tête et des troubles nerveux en proportion variable. Les autres anomalies ont été peu observées (anomalies de la colonne, arrachement des membres à la traction). 2.2.3.2.3. Bilan : comparaison bovin/ovin Les figures ci-après synthétisent la répartition des événements concernant les femelles gestantes, puis concernant les produits, au sein d’un cheptel touché par le SBV congénital. Femelle gestante présente dans un cheptel où le SBV a circulé Avortement Bovins 2 % Ovins 4,5 % Avorton d’apparence anormale Bovins 39 % Ovins 43 % Mise bas à terme Bovins 98 % Ovins 95,5 % Avorton d’apparence normale Bovins 61 % Ovins 57 % Au moins un produit présentant des troubles du comportement, des malformations, ou mourrant rapidement Bovins 4 % Ovins 12 % Produit(s) d’apparence normale Bovins 96 % Ovins 88 % Figure 38 : Répartition des événements concernant les femelles gestantes au sein d’un cheptel touché par le SBV congénital 91 Naissances dans un cheptel atteint par le SBV congénital Avortons morts-nés et morts dans les 12h Bovins 5 % Ovins 13 % Avortons d’apparence anormale Bovins 55 % Ovins 63 % Produits nés vivants avec des troubles du comportement ou des malformations, et encore vivant au bout de 12h Bovins 2 % Ovins 2 % Produits normaux Bovins 93 % Ovins 85 % Avortons d’apparence normale Bovins 45 % Ovins 37 % Figure 39 : Répartition des événements concernant les nouveaux nés au sein d’un cheptel touché par le SBV congénital Lorsque le SBV circule dans un élevage naïf, il semble entraîner plus de cas de SBV congénital dans un troupeau ovin que dans un troupeau bovin. Cette différence pourrait s’expliquer soit par une différence de sensibilité entre les deux espèces soit par une conduite de la reproduction différente entre les deux types d’élevage. En effet, en France, 50 % des vêlages ont lieu entre les mois d’octobre et de mars, contre 80 % des agnelages sur cette même période (annexe 2). Ainsi, les agnelages étant plus groupés que les vêlages, une plus forte proportion de femelles se trouvent au même stade de gestation dans les cheptels ovins que dans les cheptels bovins. En cas d’arrivée du SBV dans un troupeau, le virus infecterait alors plus de brebis gestantes à risque que de vaches gestantes à risque, entraînant une plus forte proportion de cas de SBV congénital dans le troupeau ovin. En général, malgré des différence de fertilité entre les deux espèces, ces dernières présentent des taux d’avortement comparables. Ainsi, pour ces deux espèces, un taux d’avortement est concidéré comme bon lorsqu’il est compris entre 2 et 5 %, et comme execellent lorsqu’il est inférieur à 2 % (Dubreuil, 2003). L’impact du SBV congénital apparrait donc, dans la plupart des cas, relativement faible dans les élevages bovins et modéré dans les élevages ovins. Cependant, dans certains élevage, le SBV peut être responsable de plus de 30 % d’avortements. 2.2.3.3. SBV congénital : bilan Pour rappel, le SBV, comme cela a été montré pour le virus Akabane, a un effet tératogène lorsque l’infection des femelles a lieu au cours d’une période sensible de la gestation. Cette période est propre à chaque espèce. 92 Points à retenir concernant le SBV congénital • • • • • Syndrôme arthrogrypose-hydranencéphalie Avortements Troubles du comportements (syndrome de dépérissement inéluctable) Impact généralement modéré à l’échelle d’un troupeau Impact dans un troupeau ovin supérieur à celui d’un troupeau bovin : sensibilité d’espèce ou conduite d’élevage ? En ce qui concerne le virus Akabane, il a été montré que plus l’infection a lieu tard pendant la gestation, moins les malformations sont importantes. Cela peut s’expliquer par le fait que le fœtus est de moins en moins sensible à l’infection par le SBV au fur et à mesure de la gestation notamment par le développement de son système immunitaire, par le développement de la barrière hémato-méningée9 et par la production d’anticorps neutralisants. Ainsi, dans l’ordre chronologique, il y aura tout d’abord des malformations de type hydranencéphalie, puis de type arthrogrypose et enfin de type polioencéphalomyélite. La figure ci-après résume les conséquences hypothétiques d’une infection in utero par le virus Schmallenberg chez les bovins et les petits ruminants, en se basant sur les connaissances du virus Akabane. Durée deNouveaux nés malformés Bovins Petits ruminants Durée de gestation HE / HG : hydranencéphalie / arthrogrypose * : prématurité, mort-nés, jeunes faibles, mortinatalité Figure 40 : Conséquences hypothétiques d’une infection in utero par le virus Schmallenberg chez les bovins et les petits ruminants (Martinelle, 2012) 9 Par exemple, chez le mouton, le développement de la barrière hémato-méningée commence vers 50-60 jours de gestation pour s’achever vers le 123ième jour. Ainsi, le virus accède facilement au SNC pendant une courte période allant du 28ème jour (moment où le placentome permet les échanges entre la mère et le fœtus chez les ruminants) au 50ème jour, lorsque la barrière hémato-méningée commence à se développer (Varela, 2013). 93 2.2.4. Expressions cliniques du SBV : résumé • Trois formes cliniques : inaparente, aigüe, congénitale • Passe, le plus souvent, cliniquement inapperçu chez les animaux adultes non gravides (même pour la forme aigüe) • Forme aigüe responsable d’un syndrome fébrile pendant quelques jours • Forme congénitale responsable d’un syndrôme d’arthrogrypose-hydranencéphalie et d’avortements 2.3. Diagnostic différentiel 2.3.1. Diagnostic différentiel chez les adultes 2.3.1.1. Affections à prendre en compte Face au grand polymorphisme du SBV aigu, les hypothèses diagnostiques sont nombreuses. En effet, toutes les causes possibles d’hyperthermie, de diarrhée, de baisse de production laitière et même d’avortement10 doivent être prises en compte. Le tableau ci-après récapitule les principales affections à prendre en compte dans le diagnostic différentiel de la forme aigüe du SBV. Il considère d’abord le diagnostic différentiel du syndrome fébrile associé à une entérite puis celui des avortements. Concernant les causes infectieuses, les dangers sanitaires de première et deuxième catégories ne doivent pas être oubliés. 10 Des avortements lors de SBV aigu ont été observés mais n’ont pas été confirmés comme étant directement imputable au SBV. 94 Tableau 19 : Liste non exhaustive des affections à prendre en compte dans le diagnostic différentiel du SBV aigu chez les ruminants Origine infectieuse Origine non infectieuse Infection bactérienne : • Fièvre charbonneuse • Peste des petits ruminants • Salmonellose • Anaplasmose Syndrome fébrile associé à une entérite Infection virale : • FCO • Fièvre aphteuse • Leucose bovine enzootique • BVD, border disease et autres pestivirus • Virus Akabane et autres bunyavirus du séogroupe Simbu • IBR et autres herpesvirus • Dysentrie hivernale • Fièvre de la vallée du Rift • Maladie hémorragique epizootique Métabolique : • Acidose ruminale Intoxication : • Fougère aigle • Glands • Mercuriale Infection parasitaire : • Strongylose • Coccidiose • Babésiose Avortement Infection bactérienne : • Brucellose • Listeriose • Chlamydiose • Fièvre Q • Mycoplasmose • Leptospirose • (Haemophilus, Actinomyces pyogenes,…) Infection virale : • BVD, border disease et autres pestivirus • IBR et autres herpesvirus • FCO • Fièvre de la vallée du Rift Alimentaire : • Carence en vitamine A • Mycotoxines • Phytooestrogènes Origine iatrogène : • Corticoïdes • Prostaglandines Autres causes : • Traumatisme Infection parasitaire : • Néosporose • Toxoplasmose Infection mycosique : • Aspergillose 95 2.3.1.2. Critères affections cliniques pour l’exclusion des principales Dans ce chapitre, les maladies non infectieuses ne seront plus considérées : les commémoratifs et l’anamnèse de ces maladies permettent le plus souvent d’en connaître l’origine. Les tableaux ci-après présentent les critères cliniques caractéristiques des maladies infectieuses retenues dans le diagnostic différentiel de la forme aigüe du SBV pour les bovins et pour les ovins. D’après ces tableaux, les signes cliniques observés en cas de SBV aigu chez les ruminants correspondent aux signes cliniques observés en début d’évolution pour de nombreuses maladies. Par exemple, dans le cas de la FCO, la phase précédant l’apparition des signes cliniques caractéristiques (ulcération, érosion de la muqueuse buccale) est en tout point comparable au SBV aigu (hyperthermie, anorexie, chute de production, etc.) (figure 41). SBV aigu Signes cliniques non spécifiques (hyperthermie, abattement, chute de production, diarrhée, etc.) Guérison Temps Quelques jours Infection Autres maladies infectieuses (ex : FCO) Signes cliniques non spécifiques (hyperthermie, abattement, chute de production, diarrhée, etc.) Développement de signes cliniques caractéristiques (ptyhalisme, atteinte podale, etc.) Guérison Temps Infection Figure 41 : Chronologie d’apparition des signes cliniques lors d’une infection aiguë par le SBV et par un autre agent infectieux (Deffontaines) Ainsi, pour diagnostiquer l’infection aiguë par le SBV, le suspicion clinique pourra se faire grâce au contexte épidémiologique mais la confirmation nécessitera des tests de laboratoire (RT-PCR, isolement viral, sérologie). 96 Tableau 20 : Diagnostic différentiel clinique de la forme du SBV aiguë chez les bovins Maladies peu ou pas présentes en Europe Maladies fréquentes en Europe Lésions et symptômes… …précoces Hyperthermie Abattement Chute de production Diarrhée Avortement …secondaires Atteinte buccale Ptyhalisme Jetage nasal – Epiphora Adénite Colique Atteinte podale – Boiterie Ictère Hématurie Hémoglobinurie Mort SBV WD Salm IBR FCO +++ ++ ++ + + +/++ +++ +++ +++ ++ ++ +++ + BVD, MD Bab, Anap FA FC EHD LBE FVR ++ ++ +++ ++ + ++ + ++ + ++ +++ +++ +++ + + ++ ++ ++ ++ +/+/++ +/- ++ + + + ++ +++ + ++ + ++ + + + + + ++ ++ + ++ ++ ++ + + + + + + ++ ++ +++ ++ + ++ ++ +/+++ + +/- SBV : Maladie de Shmallenberg WD : Dysentrie hivernale Salm : Salmonellose IBR : Rhinotrachéite infectieuse bovine FCO : Fièvre catarrale ovine BVD, MD : Diarrhée bovine virale, maladie des muqueuses FVR : Fièvre de la vallée du Rift +/+ + +/+/+ +/- + ++ ++ +/- ++ ++ + +++ + + + Bab, Anap : Babésiose, Anaplasmose FA : Fièvre aphteuse FC : Fièvre charbonneuse EHD : Maladie hémorragique épizootique LBE : Leucose bovine enzootique 97 Tableau 21 : Diagnostic différentiel clinique de la forme du SBV aiguë chez les ovins Maladies fréquentes en Europe Lésions et symptômes… …précoces Hyperthermie Abattement Chute de production Diarrhée Avortement …secondaires Atteinte buccale Ptyhalisme Jetage nasal – Epiphora Adénite Colique Atteinte podale – Boiterie Ictère Hématurie - Hémoglobinurie Mort SBV : Maladie de Shmallenberg Salm : Salmonellose FCO : Fièvre catarrale ovine BDV : Maladie des frontières FVR : Fièvre de la vallée du Rift 98 SBV Salm FCO BDV FA FC +++ ++ ++ + + ++ + + ++ +++ +++ ++ ++ +++ + + ++ ++ + + ++ + +++ +++ +++ +++ + +/+/- + + + + +++ +++ ++ Maladies peu ou pas présentes en Europe EHD PPR FVR +++ ++ ++ +++ + ++ + ++ +++ ++ ++ +++ +++ +++ ++ + + + ++ +/+/- ++ +/+/- + +++ ++ +/- +/- +/- ++ ++ +++ + + FA : Fièvre aphteuse FC : Fièvre charbonneuse EHD : Maladie hémorragique épizootique PPR : Peste des petits ruminants Remarque : l’annexe 4 développe certaines caractéristiques cliniques et épidémiologiques des maladies citées dans le diagnostic différentiel du SBV aigu. 2.3.2. Diagnostic différentiel chez le nouveau-né infecté in utero 2.3.2.1. Affections à prendre en compte Les principales affections qui entraînent des malformations de type arthrogryposehydranencéphalie et des troubles du comportement chez les ruminants nouveaux nés sont regroupées dans le tableau ci-après. Tableau 22 : Liste non exaustive des affections à prendre en compte dans le diagnostic différentiel du SBV congénital chez les ruminants Origine infectieuse Infection virale : • FCO • BVD, border disease et autres pestivirus Syndrome • Virus Akabane et autres bunyavirus du arthrogryposeséogroupe Simbu hydranencéphalie • IBR et autres herpesvirus et troubles du • Fièvre de la vallée du Rift comportements à la naissance Infection parasitaire : • Néosporose • Toxoplasmose Origine non infectieuse Carence : • Carence maternelle en vitamine A Intoxication : • Lupin, cidgüe Héréditaire : • Encéphalopathie héréditaire • Dysmyélinie • Abiotrophie des cellules de purkinje Remarque : l’annexe 5 développe certaines caractéristiques cliniques et épidémiologiques des maladies citées dans le diagnostic différentiel du SBV congénital. 2.3.2.1. Critères cliniques pour l’exclusion des principales affections La FCO, la BVD, la BDV et la maladie d’Akabane sont les maladies à retenir en priorité dans le diagnostic différentiel du SBV congénital. En effet, comme le montre le tableau ci-après, ces maladies entraînent des malformations proches de celles causées par le SBV. 99 Tableau 23 : Comparaison entre les signes cliniques du SBV congénital et les signes cliniques des maladies les plus fréquentes considérées dans le diagnostic différentiel du SBV congénital chez les ruminants SBV Crâne Membres FCO Hydrocéphalie Déformations du crâne Arthrogrypose Retard de croissance Hypoplasie musculaire Colonne vertébrale Torticolis Scoliose Cyphose Machoire inférieure Brachygnatie Déformations Peau et phanères Troubles du comportement Autre BVD (bovin) Anomalies osseuses Démarche non controlée Atteinte oculaire (amaurose) Maladie d’Akabane Front bombé Hydrocéphalie Courts et fins avec arthrogrypose des genoux et des jarrets ou trop longs et faiblesse paturons Arthrogrypose Hypoplasie musculaire Dos arqué Torticolis Scoliose Cyphose Brachygnatie Brachygnatie Brachygnatie Hypotrichose Coloration anormale (agneaux hirsutes) Alopécie Hypoactivité BDV (ovin) Dermatite Syndrome du veau faible Tremblements Atteinte oculaire (Atrophie et dysplasie rétinienne, névrite optique, cataracte, …) Atteinte oculaire (amaurose, nystagmus) Erosions du museau et interdigitées Cataracte La FVR, l’IBR, la néosporose et la toxoplasmose entraînent régulièrement des avortements. Ces maladies peuvent être à l’origine de malformations au niveau du crâne ou des membres chez les nouveaux nés mais cela reste un évènement peu fréquent. L’ingestion de plantes tératogènes est également un phénomène peu fréquent chez les ruminants. Enfin, les maladies héréditaires sont elles aussi rares. Il ne faut y penser qu’après avoir éliminer les autres causes de malformations congénitales. Ces origines héréditaires sont notamment à rechercher lorsque les malformations touchent une lignée en particulier. De même que pour l’infection aiguë, les signes cliniques ne suffisent pas à confirmer un cas de SBV. Il est nécessaire pour cela de recourir à des analyses de laboratoire. 100 2.4. Diagnostic de laboratoire 2.4.1. Examen lésionnel 2.4.1.1. Rappel : le système nerveux central Figure 42 : Vue latérale de l’encéphale de bovin (Budras, 2003) 2.4.1.2. Au niveau macroscopique D’après différents rapports, les lésions macroscopiques les plus rencontrées dans les cas de SBV congénitaux se trouvent au niveau de l’appareil musculo-squelettique et au niveau du système nerveux (Herder, 2012 ; Garigliany, 2012a ; Garigliany, 2012c ; Hahn, 2013). Lésions musculo-squelettiques A l’autopsie, ces lésions sont les plus fréquement rencontrées. Les déformations de la colonne vértébrale citées plus haut sont souvent associées à une atrophie musculaire spinale unilatérale ou à une décoloration musculaire. La rigidité articulaire qui, selon les cas, touche un ou plusieurs membres et une ou plusieurs articulations par membre, maintient ce dernier en flexion. Cette rigidité provient plus d’une contraction musculaire et d’un raccoursissement des tendons que d’une altération de l’articulation. Sur les muscles des membres, il est régulièrement noté une atrophie, une décoloration ainsi que des pétéchies (Garigliany, 2012). Lésions des grandes cavités Concernant les cavités abdominale et thoracique, aucune lésion spécifique n’est constatée. Une hypoplasie pulmonaire et des malformations cardiaques sont parfois observées. Chez les agneaux, l’œdème et des pétéchies au niveau du thymus sont parfois observés (Herder, 2012). 101 Lésions du système nerveux Contairement aux grandes cavités, le système nerveux montre souvent de sévères anomalies morphologiques (Herder, 2012 ; van den Brom, 2012). Les fréquences données ci-après sont issues d’une étude portant sur les lésions macroscopiques rencontrées à l’autopsie chez 16 veaux et 40 agneaux affectés par la forme congénitale du SBV. Un même animal peut présenter plusieurs lésions différentes (Herder, 2012). o Hydrocéphalie : 19 % des veaux et 65 % des agneaux Elle correspond à une accumulation excessive de liquide céphalo-rachidien dans les ventricules, associée à un élargissement de la boîte crânienne, un rétrécissement de l’aqueduc mésentérique et une hypoplasie du cervelet. o Hydranencéphalie : 12 % des veaux et 15 % des agneaux Elle se caractérise par une absence des hémisphères cérébraux qui sont remplacés par une cavité délimitée par les leptoméninges et contenant du LCR. La necrose des hémisphères cérébraux est totale. o Hypoplasie du cervelet : 38 % des veaux et 65 % des agneaux Le cervelet est de taille anormalement petite. Il peut y avoir diminution de la taille du cervelet avec raréfaction des cellules de la couche granuleuse, perte des cellules de Purkinje et amincissement de la couche moléculaire. Chez les veaux, l’hypoplasie du cervelet est moins fréquente que chez les agneaux. Par contre le cervelet est souvent déformé du fait de la contrainte mécanique imposée par la boite crânienne (Garigliany, 2012). Figure 43 : Hypoplasie du cervelet chez un veau infecté par le SBV (Herder, 2012) o Porencéphalie : 2 % des agneaux Elle se caractérise par la présence de kystes ou de cavités dans un ou plusieurs hémisphères cérébraux. La perte de substance observée est due à la destruction des neuroblastes immatures. 102 Figure 44 : Porencéphalie chez un veau infecté par le SBV (Herder, 2012) o Macrocéphalie : 2 % des agneaux Ce terme désigne de façon générale toute forme d’hypertrophie de la tête. o Hypoplasie du tronc cérébral : 19 % des veaux et 2 % des agneaux Le tronc cérébral présente une taille anormalement petite. o Micromyélie : 12 % des veaux Cela correspond à un diamètre anormalement petit de la moelle épinière. 2.4.1.3. Au niveau histologique D’après ce qui a été dit précédemment, le SBV se réplique dans les cellules nerveuses. C’est donc dans les tissus nerveux que les lésions histologiques causées par le SBVsont retrouvées. Ce sont des lésions inflammatoires et dégénératives. Les tissus musculo-squelettiques présentent des modifications histologiques qui sont probablement secondaires aux lésions nerveuses. Les organes et tissus suivants ne montrent pas de lésions histologiques significatives : la vessie, la thyroïde, le foie, le cœur et les vaisseaux cardiaques, l’utérus, les ovaires, les testicules, les nerfs périphériques, le placenta, l’œsophage, la caillette, le petit et le gros intestin, les glandes surénales, la trachée, la peau et le tissu adipeux (Herder, 2012). A noter que les organes du système lymphoïde peuvent être atteints malgré tout. Ainsi, une diminution de la quantité de cellules hématopoiétiques peut être observée dans la moelle osseue. Une atteinte du système lymphoïde peut être visible sur la rate, les nodules lymphatiques, ou le thymus (Herder, 2012). 103 2.4.1.3.1. Lésions du système nerveux Les lésions histologiques associées aux lésions macroscopiques de types hydranencéphalie, porencèphalie et hydroencéphalie sont inflammatoires et dégénératives. Le SBV entraîne les mêmes types de lésions histologiques que les autres virus tératogènes que sont le virus Akabane, le virus de la FCO, ou le virus de la BVD. Pour ces virus, l’histopathologie révèle également fréquemment des méningoencéphalomyélites non suppuratives associées à une nécrose du cerveau (Herder, 2013). Caractéristiques de l’inflammation Chez les fœtus ou nouveaux nés de ruminants infectés par le SBV, l’inflammation du sytème nerveux n’est pas systématique. En effet, une étude portant sur 82 fœtus et nouveaux nés infectés naturellement par le SBV (infection confirmée par PCR) et présentant des malformations a révélé la présence de cellules inflammatoires chez 15 d’entre eux, que ce soit dans le cerveau ou la moelle épinière (Herder, 2013). Ainsi, les malformations du SNC citées précédemment interviennent avec ou sans signes d’inflammation. De plus, ces malformations sont observées dans les mêmes proportions chez les animaux présentant une inflammation que chez les animaux ne présentant pas d’inflammation. L’encéphalite est caractérisée par une infiltration lymphohistiocytaire périvasculaire de la matière blanche et de la matière grise du cerveau et de la moelle épinière. Cette infiltration peut également être diffuse. Les cellules identifiées sont des lymphocytes T (type CD3 positif), et dans une moindre mesure, des lymphocytes B (type CD 79 alpha positif) et des macrophages (Herder, 2013). Figure 45 : Infiltration lymphohistiocytaire perivasculaire modérée dans un cerveau d’agneau infecté par le SBV (barre d’échelle : 20 µm) (Herder, 2013) 104 L’infiltration lymphohistiocytaire concerne également la moelle épinière. Figure 46 : infiltration lymphohistiocytaire multifocale de la moelle épinière d’un agneau infecté par le SBV (barre d’échelle : 1 000 µm) (Herder, 2013) L’inflammation est plus fréquente chez les petits ruminants que chez les bovins (Herder, 2013). Or, d’après ce qui a été dit précédemment, le délai entre l’infection et la mise bas est d’environ 3 mois chez les ovins et d’environ 5 mois chez les bovins. Ainsi, au moment de la naissance ou de l’avortement d’un veau, il se pourrait que, contrairement aux agneaux, les signes de l’inflammation ne soient plus visibles. Ce constat a également pu être fait expérimentalement pour le virus Akabane : l’infection de chèvres gestantes a entrainé une proportion d’encéphalites chez les nouveaux-nés plus importante que l’infection de vaches gestantes (Konno, 1982). Caractéristiques des lésions dégénératives Les lésions dégénèratives régulièrement observées sont la nécrose du parenchyme neuronal, la présence d’œdème et de multiples pores. Des hémorragies peuvent être égalements présentes. Une minéralisation et des dépôts d’hémosidérine ont été mis en évidence par des colorations spéciales : colorations de Von-Kossa et de Perls. o Lésions vasculaires et pertes tissulaires La minéralisation mise en évidence par la coloration de Von Kossa est, comme ce qui a été montré pour le virus Akabane, un signe de destruction tissulaire et de nécrose causées par le virus. L’hémosidérine mise en évidence par la coloration de Perls est probablement due à des hémorragies anciennes. La minéralisation et l’hémosidérine sont surtout mis en évidence dans les zones du SNC présentant des pertes tissulaires (porencéphalie notemment) (Herder, 2013). 105 La porencéphalie est caractérisée par de nombreux kystes allant de 1 mm à 1 cm. La présence au niveau histologique d’hémorragies et d’hémosidérines est un signe de troubles vasculaires. Par ailleurs, en médecine humaine, des pathologies hischémiques ou hypoxiques sont décrites comme étant responsables de la présence de nombreux kystes dans le cerveau (Garten, 2007). Ainsi, les lésions vasculaires sont supposées être à l’origine de la porencéphalie causée par de nombreuses infections virales. Cependant, la minéralisation et l’hémosidérine ne sont pas fréquemment observées. Cela suggére que les hémorragies et les pertes tissulaires importantes seraient des événements rares ou que ces événements n’auraient pas le temps de se mettre en place avant la mise bas ou l’avortement (Herder, 2013). o Lésions des neurones Les modifications observées au niveau des neurones sont une démyélinisation11 et une perte de densité axonale. De plus, des amas de macrophages comportant de la myéline dans leur cytoplasme sont observés. A noter que dans les régions du cerveau concernées uniquement par de l’inflammation, le mesencéphale et l’hippoccampe par exemple, la démyélinisation et la perte de densité axonale ne sont pas observées. Par contre, dans les zones adjacentes aux zones où il y a eu destruction de tissu (porencéphalie par exemple), la densité axonale est modérément à très fortement réduite, et la démyélinisation est importante. Cela suggère que l’axonopathie n’est pas directement reliée à l’infection par le SBV et à l’inflammation, mais qu’elle est secondaire à la destruction des tissus (Varela, 2013). Tableau 24 : Distribution des lésions dégénératives entre les zones du SNC concernées par une inflammation uniquement et les zones concernées par des malformations associées ou non à une inflammation Régions du SNC concernées par : Lésions histologiques Inflammation uniquement Malformations et +/- inflammation (exemple : porencéphalie, hydranencéphalie) Démyélinisation abs +++ Perte axonale abs +++ Minéralisation +/- + Hémosidérine +/- + 11 La démyélinisation est définie comme étant la disparition ou la destruction de la gaine de myéline qui entoure et protège les fibres nerveuses. 106 o Lésions de la moelle épinière Enfin, concernant la moelle épinière, la micromyélie est associée aussi bien à une réduction bilatérale sévère de la substance grise qu’à une réduction de la circonférence de la substance blanche avec une importante diminution du diamètre de la moelle épinière. Le sillon ventral est élargi par un tissu fibreux riche en collagène (Herder, 2012). Figure 47 : Moelle épinière cervicale d’un veau infecté par le SBV. Micromyélie avec réduction importante de la substance grise. (La flèche montre des neurones et l’astérisque une fibrose importante au niveau du sillon ventral) (Herder, 2012) Lésions histologiques nerveuses précoces chez des souris infectées par le SBV Concernant les cas de SBV congénitaux naturels chez les ruminants, la date d’infection des femelles gestantes n’est pas connue. Cependant, une étude portant sur l’infection intracérébrale de souris par le SBV permet d’observer l’évolution des lésions cérébrales au cours du temps (Varela, 2013). Le tableau suivant montre l’évolution des lésions au niveau du cerveau de souris. 107 Tableau 25 : Evolution des lésions au niveau du cerveau chez des souris infectées par le SBV12 (Varela, 2013) Temps après infection Observations 48 heures Hémorragies 72 heures Malacie et hémorragies (flèches) 120 heures Vacuoles réparties de façon aléatoire dans la matière blanche (flèches) Ainsi, par extrapolation des résultats obtenus chez la souris, l’évolution de la vacuolisation de la matière blanche pourrait être la cause, chez les agneaux et les veaux infectés in utero, des lésions cavitaires ainsi que de la minéralisation et de l’hémosidérine observées (Varela, 2013). 12 La barre d’echelle corespond à 2 µm. 108 Relation entre inflammation, malformations et antigènes viraux Les antigènes viraux, détectés par immunohistochimie, s’observent dans les neurones. Ils sont plus fréquemment rencontrés dans les zones touchées par la nécrose et l’inflammation. Nouveaux nés malformés (effectif total : 82) Avec encéphalite 18 % Présence d’antigènes viraux 93 % Sans encéphalite 82 % Absence d’antigènes viraux 7% Présence d’antigènes viraux 33 % Absence d’antigènes viraux 67 % Figure 48 : Distribution des cas d’encéphalites avec présence ou non d’antigènes viraux chez des nouveaux nés présentant des malformations (Herder, 2013) Ainsi, d’après la figure 48, voici quelques hypothèses : • Les cas pour lesquels la présence d’antigènes viraux est observée sans inflammation correspondraient à une infection fœtale antérieure à l’acquisition d’un système immunitaire compétent. • La réponse immunitaire (correspondant à l’inflammation) semble réduire la probabilité de malformation. Le système immunitaire fœtal se révélerait ainsi capable, à un moment donné, de se défendre contre le SBV. Cependant, pour confirmer cette hypothèse, il faudrait connaître la proportion de d’encéphalites chez les nouveaux-nés ne présentant pas de malformations (troubles du comportement). Enfin, les différentes zones du cerveau ne semblent pas avoir la même sensibilité à l’infection par le SBV. Ainsi, les lobes pariétaux et temporaux sont les zones où la détection des antigènes viraux est très fréquente, et ces zones sont généralement associées à de la porencéphalie avec peu d’inflammation. Le mésencéphale est également une zone où la détection des antigènes viraux est très fréquente, mais elle est généralement associée à une infiltration lymphohistiocytaire sans porencéphalie. Ces observations semblent montrer que certaines zones du cerveau sont plus aptes à se défendre contre l’infection par le SBV, expliquant ainsi la prédilection du SBV pour les zones plus sensibles (Herder, 2013). 109 2.4.1.3.2. Lésions musculo-squelettiques Les muscles squelettiques présentent une réduction du nombre de myofibrilles. De plus, ces dernières ont un diamètre plus petit. Dans le muscles hypolasiques, très peu de myofibrilles matures sont présentes (Herder, 2012). Figure 49 : Fibres musculaires d’un agneau infecté par le SBV. Fibres musculaires normales (astérisque). La plupart des fibres présentent une myofibrille hypoplasique (Herder, 2012) 2.4.1.4. Examen lésionnel : bilan Points à retenir • Ancune des lésions observées n’est spécifique au SBV. • Le SBV se réplique majoritairement dans les cellules nerveuses. • Les conséquences lésionnelles seraient plus importantes lors d’une infection fœtale précoce. • L’arthrogrypose est la lésion macroscopique la plus fréquente. • L’hydrocéphalie et l’hypoplasie du cervelet sont les lésions macroscopiques du cerveau les plus fréquentes. • • • • 110 Les lésions histologiques sont inflammatoires et dégénératives. La méningoencéphalomyélite non suppurative n’est pas systématique. L’inflammation est caractérisée par une infiltration lymphohistiocytaire. La perte tissulaire est marquée au niveau histologique par la présense de multiples pores de quelques millimètres de diamètre. L’infection fœtale par le SBV est un processus pathologique complexe dont les lésions dépendent de l’âge du fœtus au moment de l’infection et du niveau de développement de son système immunitaire ainsi que du lieu de réplication du virus. La figure suivante résume les conséquences lésionnelles d’une infection par le SBV ainsi que les facteurs modulant ces conséquences. Figure 50 : Conséquences lésionelles d’une infection par le SBV (Deffontaines) 111 2.4.2. Tests diagnostiques Le recours aux tests de laboratoire est nécessaire pour confirmer les cas cliniques de SBV congénital et les cas cliniques de SBV aigu. En effet, la clinique du SBV et les lésions entraînées sont peu spécifiques. Les tests directs permettent de mettre en évidence le SBV alors que les tests indirects mettent en évidence les anticorps anti-SBV. 2.4.2.1. Test directs 2.4.2.1.1. RT-PCR en temps réel Principe La Réaction de Polymérisation en Chaîne conventionnelle (PCR) permet d’obtenir, à partir d’un échantillon d’ADN complexe et peu abondant, d’importantes quantités d’un fragment d’ADN spécifique de longueur définie. La séquence du fragment à amplifier est connue. Cela permet d’utiliser des amorces spécifiques du fragment à obtenir en grande quantité. Le matériel génétique obtenu au final est le résutat d’une succession de 30 à 40 cycles. Chaque cycle comprend trois étapes successives : la dénaturation, l’hybridation ou appariement des amorces et la synthèse ou élongation. A la fin de chaque cycle, tous les produits générés sont utilisés pour le cycle suivant. Lorsque l’échantillon de départ correspond à de l’ARN, c’est de « Reverse TranscriptionPCR » (RT-PCR) qu’il s’agit. Une première étape consiste à obtenir l’ADN complémentaire (ADNc) au brin d’ARN étudié. Cette étape correspond à une transcription inverse. La PCR se fait ensuite sur l’ADNc selon les mêmes modalités que pour une PCR conventionnelle. La PCR en temps réel (rt-PCR) permet la quantification en temps réel du matériel génétique généré par détection d’un composé fluorescent lié à l’ADN ou l’ARN. Remarque : Pour la suite, le terme de PCR sera utilisé comme terme générique regroupant les différentes techniques de PCR, qui reposent sur le même principe et se différencient au niveau de la méthode. Utilisation de la rt-RT-PCR dans le cas du SBV Le Friedrich-Loeffler-Institute a mis au point la technique de RT-PCR pour identifier le SBV. Différents kits13, ciblant les segments S ou L sont désormais disponibles. Ces tests sont rapides, spécifiques et sensibles (Bilk, 2012 ; Hoffmann, 2012), mais d’un coût non négligeable. Les échantillons le plus souvent testés sont le cerveau des nouveaux nés malformés et le sang des adultes lors d’infections aiguës. 13 Adiavet™ Schmallenberg Virus,Adiagène® ; TaqVet™ Schmallenberg Virus – S G ene - kit (SBVS), LSI® ; AnDiaTec® BoVir® Schmallenbergvirus real time RT-PCR Kit,Andiatec® 112 La rt-RT-PCR est cependant limitée par la brièveté de la virémie présentée par les animaux atteints par le SBV. En effet, lors d’une atteinte congénitale, les malformations peuvent être constatées alors même que le virus a déjà été éliminé, rendant ainsi impossible la détection des acides nucléiques du virus. En cas d’atteinte post-natale chez les bovins, la virémie là aussi est brève, de 2 à 5 jours d’après les premières données expérimentales. Cela implique que les prélèvements pour ce type d’analyse doivent être effectués lorsque les animaux présentent encore des signes cliniques et plus particulièrement lorsqu’ils présentent de la fièvre. Lorsque la PCR est utilisée pour mettre en évidence le SBV chez des nouveaux nés malformés, il faut, de préférence, tester deux zones distinctes du cerveau (Hoffmann, 2012). La rate et le sang peuvent être également utilisés même si le virus est moins fréquemment mis en évidence sur ces derniers. De plus, il semblerait qu’il y ait une bonne corrélation entre la détection du SBV au niveau du cerveau et la détection du SBV au niveau des liquides amniotiques (Bilk, 2012). Ainsi, les liquides amniotiques, par exemple par l’intermédiaire d’écouvillons, mais aussi le méconium peuvent être également utilisés. Leur intérêt principal réside dans le fait que ces échantillons sont facilement réalisables. Remarque : Un résultat PCR négatif sur un veau malformé n’exclut pas automatiquement le SBV comme étant à l’origine de ces malformations. Dans ce cas, la détection d’anticorps dans un échantillon de sang prélevé avant la prise colostrale doit être réalisée. Cela peut correspondre à un prélèvement intracardiaque de liquide sanguin chez des veaux mort-nés. La détection d’anticorps spécifiques contre le SBV indique alors un passage transplacentaire du virus (Conraths, 2013). 2.4.2.1.2. Isolement viral L’isolement viral a, pour l’instant, été réussi à partir de sang de bovin adulte cliniquement atteint (Hoffmann, 2012). Il est probable que, comme c’est le cas pour le virus Akabane, cet isolement soit difficile en cas d’atteinte congénitale, à moins qu’il ne soit réalisé sur un avorton expulsé simultanément à l’atteinte de sa mère (ou peu de temps après) ou suite à une infection in utero proche du terme. Actuellement, l’isolement viral est réalisé après un premier passage en aveugle sur des cellules d’insectes (KC) suivi par l’inoculation de cellules de hamsters (BHK-21). Des cellules rénales de singes sont également utilisées (VERO). L’effet cytopathogène est manifeste après 5 jours d’incubation (Hoffmann, 2012). 2.4.2.2. Tests indirects Les tests sérologiques sont essentiels pour l’épidémiosurveillance et la conduite d’enquêtes épidémiologiques. Les anticorps peuvent être détectés par séroneutralisation ou immunofluorescence, mais ces techniques sont longues à mettre en œuvre, difficiles à réaliser sur un grand nombre d’échantillons et ne permettent pas une interprétation standardisée des résultats. 113 Les kits ELISA permettent la mise en œuvre d’enquêtes épidémiologiques à large échelle pour estimer l’ampleur et l’extension de l’infection dans les troupeaux de ruminants. Il est à noter que des réactions croisées avec des anticorps spécifiques d’autres virus du sérogroupe Simbu est possible. Cependant, ces virus ne sont actuellement pas présents dans les zones géographiques concernées par le SBV. 2.4.2.2.1. Séroneutralisation La séroneutralisation correspond à l’inhibition du pouvoir pathogène du virus par un antisérum neutralisant spécifique. Elle permet d’évaluer le pouvoir neutralisant de l’antisérum vis-à-vis du virus. Le sérum à tester est d’abord mis en présence d’une dose calibrée de virus. Après incubation, l’ensemble est alors déposé sur la culture cellulaire. En présence d’anticorps neutralisants, l’effet cytopathogène du virus est inhibé. En pratique, elle est utilisable mais nécessite des cultures cellulaires. La spécificité est de 99% et la sensibilité est supérieure à 92 %. 2.4.2.2.2. Immunofluorescence indirecte Cette méthode n’est, en routine, pas utilisée pour la détection des anticorps dans le cadre de la maladie de Schmallenberg. 2.4.2.2.3. ELISA Un kit ELISA indirect pour le diagnostic sérologique SBV a été validé par le Laboratoire de Santé Animale de l’Anses Maisons-Alfort début avril 2012. D’autres kits14 sont depuis disponibles. Le test validé par l’Anses est basé sur une protéine recombinante du SBV. Les échantillons testés peuvent être du sérum ou du plasma. Les résultats sont obtenus en 90 minutes. Les études de validation externes de ce test indiquent une excellente spécificité (99,% - IC 95 % : [99,26 % ; 99,92 %] – n = 1 179), et une très bonne sensibilité (96% - IC 95 % : [93,43 % ; 98,13 %] – n = 255) (Bréard, 2013). Il existe également un Kit ELISA pour la détection des anticorps contre le SBV dans le lait15. 2.4.2.3. Conclusions sur les tests de laboratoire L’isolement viral et la RT-PCR sont les tests les plus adaptés pour confirmer la présence du SBV, mais ces techniques, du fait de la période de virémie très courte, entraînent une sousestimation du nombre de cas. 14 ID screen® Schmallenberg virus competition multi-spicies, ID screen® Schmallenberg virus indirect multispicies. 15 ID screen® Schmallenberg virus milk indirect 114 De plus, alors que le génome du SBV est régulièrement détecté par PCR dans le cerveau et les autres tissus d’agneaux présentant un syndrome de type arthrogrypose-hydranencéphalie, il l’est beaucoup moins chez les veaux présentant les mêmes malformations. C’est également le cas pour le virus Akabane16. C’est pourquoi, une sérologie sur sérum pré-colostral ou sur liquide de ponction cardiaque serait plus indiquée en cas de suspicion de SBV congénital chez les veaux qu’une PCR sur le tissu nerveux. Pour déterminer la prévalence le plus justement possible, les tests sérologiques sont plus adaptés, mais la séroneutralisation et l’immunofluorescence indirecte ne sont pas utilisables à grande échelle. Ces méthodes sont chronophages – la séroneutralisation prend cinq jours – et ne peuvent pas être automatisées. Pour déterminer la séroprévalence du SBV par pays mais aussi pour déterminer facilement le statut sérologique d’un individu vis-à-vis du SBV, le test ELISA est le plus rapide et le plus facile à mettre en œuvre (Bréard, 2013). 2.4.2.4. Démarche diagnostique Suspicion d’atteinte clinique causée par le SBV chez les adultes L’étiologie pourra être confirmée par rt-RT-PCR ou par isolement du virus sur culture cellulaire. Une ARNémie négative, en raison de la brièveté de la virémie, ne permet pas d’écarter définitivement le SBV. Le suivi des anticorps spécifiques du SBV par sérologie couplée à trois semaines d’intervalle (test ELISA ou séroneutralisation) peut s’avérer nécessaire pour compléter le diagnostic. Suspicion d’atteinte congénitale ou d’avortement causé par le SBV Les premiers examens à réaliser seront : - la détection d’anticorps spécifiques du SBV dans le sérum des avortons ou des nouveaux-nés avant prise de colostrum (ELISA ou séroneutralisation) ; - la détection de l’ARN du SBV par rt-RT-PCR à partir d’un morceau de placentome et si possible de l’encéphale des avortons ou nouveau-nés. À défaut, le sang prélevé sur EDTA et la rate peuvent être également testés par rt-RT-PCR, bien que le virus soit moins fréquemment détecté dans ces organes que dans le SNC. Diagnostic d’avortement sans suspicion particulière de SBV Si la démarche s’inscrit dans un diagnostic d’avortement sans suspicion particulière de SBV, il peut être utile de tester le sérum de la mère pour détecter les anticorps spécifiques du SBV. Leur absence permettra d’écarter ce virus de l’étiologie de l’avortement. 16 L’explication pourrait venir d’une période généralement plus longue entre le moment d’infection du fœtus et sa naissance chez les bovins par rapport aux ovins. 115 Tableau 26 : Prélèvements et analyses à réaliser en fonction du contexte Contextes Infection aiguë chez l’animal vivant Infection congénitale chez le nouveau né Enquête épidémiologique 116 Objectifs Prélèvements Analyses Détection du virus • Sang sur EDTA • Sérum sur tube sec • RT-PCR en temps réel • Isolement sur culture cellulaire Détection du virus • Tissus encéphaliques (cerveau et tronc cérébral) • Liquide amniotique • Placenta • Méconium • RT-PCR en temps réel • Isolement sur culture cellulaire Détection des anticorps • Liquide péricardique • Sérum sur tube sec (de préférence précolostral) • ELISA • Séroneutralisation • Immunofluorescence indirecte Détection des lésions • Système nerveux central (avec la moelle épinière) après fixation • Histopathologie Détection des anticorps • Sang sur EDTA • Sérum sur tube sec • Lait • ELISA • Séroneutralisation • Immunofluorescence indirecte 3. L’émergence du SBV : moyens de lutte, conséquences et perspectives 3.1. Moyens de lutte contre le SBV A l’heure actuelle, aucun traitement médical n’existe contre le SBV. Les moyens de lutte contre cette maladie, comme pour la plupart des maladies virales, sont uniquement préventifs. 3.1.1. Vaccination Les vaccins L’Agence Française du Médicament Vétérinaire a accordé le 29 juillet 2013 une Autorisation de Mise sur le Marché (AMM) pour le vaccin Bovilis® SBV suspension injectable pour bovins et ovins. Ainsi, après la mise sur le marché d’un vaccin, le 21 mai 2013 au Royaumeuni, la France a été le deuxième pays au monde à se doter d’un vaccin contre la maladie de Schmallenberg. Un deuxième vaccin a bénéficié d’une AMM à circonstances exceptionnelles. Il s’agit du SBVVAX® suspension injectable pour bovins et ovins. Les indications de ces vaccins viraux inactivés sont les suivantes (Index des Médicaments vétérinaires autorisés en France, 2013) : • primovaccination avec une seule injection (chez les ovins uniquement) : réduction de la virémie causée par le SBV ; • primovaccination en deux injections espacées de quatre semaines environ (chez les ovins et les bovins) : prévention de la virémie causée par le SBV. La présence d’anticorps neutralisants serait effective trois semaines après la seconde administration pour les bovins et les ovins primovaccinés avec deux doses, et après trois semaines chez les ovins primovaccinés avec une seule dose. La durée de l’immunité n’a en revanche pas encore été établie. Stratégies de vaccination La vaccination contre le SBV est destinée aux femelles reproductrices afin de prévenir l’infection transplacentaire des fœtus. Il faudrait donc vacciner toutes les femelles reproductrices un mois avant la reproduction, afin de permmettre la production d’anticorps neutralisants. Il pourrait également être enviseageable de vacciner les mâles reproducteurs puisque du génome viral a été retrouvé dans de la semence de taureau (ProMed-mail, 2012b ; ProMedmail, 2012c ; ProMed-mail, 2013). Des investigations supplémentaires sont cependant nécéssaires pour déterminer la possibilité d’une transmission vénérienne du SBV. Toutefois, il est possible de cibler les troupeaux à vacciner et ceux qui ne le sont pas. Le passage du SBV dans un troupeau entraîne la séroconversion de la plupart des animaux. 117 Ainsi, en effectuant un sondage sérologique sur un échantillon de femelles reproductrices, il serait possible d’en déduir la séroprévalence de tout le troupeau. Dans le cas d’un troupeau où la séroprévalence est forte, la vaccination n’apparaîtrait alors pas indispensable. Enfin, il a été montré que le virus a continué de circuler dans un troupeau ovin où la séroprévalence était élevée (99,5 % des brebis étaient séropositives) et qu’il infectait alors les agnelles de renouvellement puisque celles-ci étaient restées naïves vis-à-vis du SBV (Claine, 2013). Au minimum, il apparaîtrait donc intéressant de vacciner le troupeau de renouvellement chez les ovins. Concernant les bovins, cette stratégie vaccinale doit être pondérée par le fait que la mise à la reproduction des génisses de renouvellement est plus tardive (les vêlages les plus précoces se font à 24 mois chez les bovins alors qu’il se font à 12 mois chez les ovins). De ce fait, la probabilité qu’une génisse soit séropositive est plus forte que la probabilité qu’une agnelle le soit. 3.1.2. Adaptation de la gestion de la reproduction Pour minimiser les risques de contamination fœtale, il faut éviter que la période de gestation à risque des femelles (Pour rappel, entre 60 et 180 jours de gestations chez les bovins et entre 30 et 50 jours chez les petits ruminants) ne coïncide avec les pics d’activité du vecteur (printemps et automne). Ainsi, deux leviers sont possibles : • décaler la période de la mise à la reproduction des femelles ; • étaler dans le temps la mise à la reproduction afin qu’un minimum de femelles, au moment de l’activité du vecteur, ne se trouve au stade de gestation critique. 3.1.3. Lutte contre le vecteur La lutte contre les insectes, et plus particulièrement les Culicoïdes, peut s’envisager sous trois perspectives : la lutte écologique, la lutte mécanique et la lutte chimique. D’une manière générale, ces trois méthodes devraient être associées pour obtenir une efficacité maximale. Cependant compte tenu du manque de connaissances actuel concernant la biologie du vecteur, cette lutte se révèle généralement peu efficace. 3.1.3.1. La lutte écologique Il s’agit de mesures permettant de limiter la croissance des populations de vecteurs en agissant sur leur environnement et en perturbant ainsi le cycle de vie de l’insecte. L’objectif est d’éliminer les gîtes larvaires, notamment en réduisant au maximum les sources d’humidité. Par exemple, pour lutter contre les Culicoïdes, la gestion raisonnée des fumiers de fermes, un drainage efficace et un assèchement des points d’eau contribuent à éliminer les habitats larvaires. 118 3.1.3.2. La lutte mécanique Il s’agit de mesures permettant de limiter le nombre de contacts entre l’hôte et le vecteur. Dans le cas du SBV, cela consiste par exemple à maintenir les animaux enfermés (certains Culicoïdes vont peu dans les bâtiments), au moins la nuit, à l’aube et au crépuscule (périodes de piqûre privilégiées pour de nombreuses espèces de Culicoïdes). 3.1.3.3. La lutte chimique La lutte chimique, ou désinsectisation, consiste en l’emploi de répulsifs naturels, à la pulvérisation traitements insecticides dans l’environnement ou d’applications d’insecticides sur les animaux. Les pyréthrinoïdes et les organophosphorés sont les deux familles d’insecticides principalement employées, bien que leur efficacité sur la diminution du risque de transmission d’un arbovirus ne soit pas démontrée (Carpenter, 2008). Traitements insecticides dans l’environnement L’emploi de traitements insecticides dans l’environnement peut viser soit la destruction des larves soit la destruction des adultes. o Traitement des gîtes larvaires Les conclusions d’études portant sur la sensibilité des larves de différentes espèces de Culicoïdes à certains larvicides, comme les organophosphorés et les pyréthrinoïdes, ainsi que les résultats de différents essais de terrain, indiquent que le traitement contre les gîtes larvaires présente des risques écologiques alors même que son efficacité reste non démontrée (Carpenter, 2008). Les habitats larvaires sont en effet encore mal connus et difficilement accessibles. A cela s’ajoutent des contraintes réglementaires liées à l’épandage des insecticides. Enfin, le caractère non sélectif des différents insecticides entraînerait une toxicité importante à l’égard de la faune naturelle non ciblée. Ainsi, la lutte contre les formes larvaires de Culicoïdes ne présente pas d’intérêt dans le contexte européen de la transmission du SBV. o Traitement de l’environnement contre Culicoïdes adultes Ce type de traitement peut être appliqué dans les bâtiments d’élevage, dans leurs environs et sur les moyens de transports. Les données font défaut pour en évaluer pleinement son efficacité. L’effet de l’application d’organophosphorés ou de pyréthrinoïdes par traitement au sol ou aérien s’est avéré limité et transitoire vis-à-vis de Culicoïdes furens (Carpenter, 2008). De même, l’épandage de pyréthrinoïdes autour des bâtiments d’élevage en Sardaigne n’a entrainé aucune diminution des populations de Culicoïdes (Satta, 2004). Aucune étude n’a été conduite pour tester l’efficacité de l’application d’insecticides dans les bâtiments d’élevage ou dans les véhicules de transport d’animaux. 119 Toutefois, selon une étude australienne, le traitement des bâtiments au fenvéralate permettrait de réduire le taux d’attaque de Culicoïdes brevitaris et de C. wadai jusqu’à 52 heures après le traitement (Doherty, 2004). L’application d’adulticides dans l’environnement et les abords des exploitations n’est pas recommandée en raison de sa faible efficacité sur les populations d’insectes vecteurs et de ses possibles conséquences écologiques (toxicité potentielle pour la faune naturelle non ciblée). Application d’insecticides sur les animaux Les insecticides chimiques à appliquer sur les animaux sont des médicaments vétérinaires soumis à prescription vétérinaire. Les traitements doivent être consignés sur le carnet sanitaire. Cela concerne les molécules de la famille des pyréthrinoïdes et également celles de la famille des avermectines. Remarque : Des répulsifs extraits de l’eucalyptus, l’huile de neem et la picaridine semblent avoir une activité protectrice chez l’homme contre Culicoïdes impunctatus (présent en Ecosse). Ils ne sont pour l’instant pas évalués chez les ruminants (Carpenter, 2008). o Utilisation de pyréthrinoïdes Le traitement des animaux de production avec des pyréthrinoïdes de synthèses est un moyen de lutte fréquemment utilisé dans la lutte contre les arboviroses (Eisler, 2003). Ce sont des insecticides de contact qui pénètrent à travers la cuticule des insectes et les paralysent par action sur leur système nerveux. Ils sont : • très lipophiles, ils diffusent dans les corps gras de la peau et le sébum sur tout le corps de l’animal ; • très peu diffusés à travers la peau des ruminants et ne s’accumulent pas dans les tissus, ce qui permet des temps d’attente faibles ; • très peu toxiques pour les animaux à sang chaud. Les pyréthrinoïdes sont disponibles sous plusieurs formes : plaquettes auriculaires, pour-on, pulvérisation et spray aérosol (tableau 27 page 121). Les études portent plus fréquemment sur les spécialités pour-on que sur les solutions externes (bain, lotion) ou les sprays aérosols. Des études de laboratoire portant sur des poils de ruminants traités par des pyréthrinoïdes (deltaméthrine, cyperméthrine) montrent un effet mortel de cette famille d’insecticides sur les Culicoïdes adultes (Carpenter, 2008). 120 Tableau 27 : Pyréthrinoïdes de synthèse disponibles sur le marché pour les bovins et les ovins : indications principales du RCP Mode d’administration Plaquette auriculaire Médicament Principe actif Dose Durée d’action Délais d’attente Viande Lait Cyperméthrine Flectron® Bovin 1 plaquette / bovin De 24 à 48 heures après la pose à 4 mois Cyperméthrine Ectotrine® Bovin 10 mL / bovin 7à8 semaines 28j Butox® 7,5% Bovin et Ovin 10 à 30 mL/ bovin 10 mL/ ovin 8 à 10 semaines 18j (bv) 2j (ov) Versatrine® Bovin 10 mL/ bovin 4à6 semaines 18 j 0j Deltaméthrine Butox® 50 pour mile Bovin et Ovin 50mL por 100L d’eau Non précisée 28 j (bv) 28 j (ov) 24 j (bv) 24 j (ov) Fenvalérate Acadrex® 60 Bovin 100 mL pour 6 L d’eau 3à4 semaines 28 j 7j Fenvalérate Arkofly® Bovin Pulvérisation 5 secondes 2à4 semaines 28 j 7j Pour on Deltaméthrine Pulvérisation Spray aérosol Nom déposé Espèces cibles 0j 0j 9j 0j 12h (ov) En Australie, une étude a testé l’aptitude de quatre traitements à réduire la séroconversion des bovins vis-à-vis de la FCO. Les traitements insecticides qui ont été utilisés sont les suivants : boucle auriculaire (Diazinon®), deltaméthrine en pour-on (25 g/L à 4 mL/100 kg), fluméthrine en pour-on (75 g/L à 10 mL/100 kg) et application de fenvalérate (200 g/L). Aucune différence significative concernant la séroconversion des bovins vis-à-vis de la FCO n’a été mise en évidence entre ces quatre lots et des lots contrôles non traités. Cependant, il a été démontré que ces traitements avaient bien entraîné une diminution de la population de Culicoïdes, la deltaméthrine apparaissant comme le plus efficace des traitements (Carpenter, 2008). Ainsi, le traitement aux pyréthrinoïdes, notamment à la deltaméthrine, semble avoir un pouvoir insecticide contre les Culicoïdes sans pour autant réduire significativement le risque de transmission du virus au sain du lot traité. o Utilisation des avermectines Chez les bovins, seule la forme pour-on existe avec une AMM pour la lutte et la prévention contre les mouches (Haematobia irritans). Après diffusion à travers la peau, le principe actif se retrouve dans la circulation systémique. Son élimination est principalement fécale. Leur efficacité sur les Culicoïdes est variable. Ainsi, l’utilisation d’ivermectine par voie souscutanée à la dose de 200 µg/kg : • provoque la mortalité de Culicoides brevitarsis (Australie) après un repas sanguin sur l’animal traité : la mortalité des insectes piqueurs est de 99% sur une durée de 10 jours 121 après le traitement et est supérieure à 40 % jusqu’à 18 jours après traitement (Standfast, 1984) ; • n’a aucune action sur Culicoides sonorensis, aux Etats Unis (Holbrook, 1994) ; • donne des résultats variables sur Culicoides variipennis (Carpenter, 2008). Il n’existe aucune référence sur les espèces de Culicoides présentes en Europe. L’intérêt des traitements aux avermectines résiderait dans le fait que ces molécules pourraient avoir au delà de leur action sur les adultes, une activité larvicide pour des espèces comme Culicoides dewulfi dont les larves sont présentes dans les bouses ou le fumier (car le principe actif est éliminé par voie fécale). Cependant, concernant les adultes, l’insecte doit d’abord piquer l’animal traité et se nourrir (ingestion du sang véhiculant l’insecticide) avant de mourir. Le cycle de transmission du virus n’est donc pas forcément bloqué. De plus, l’atout que représente une possible activité larvicide doit être pondéré par les impacts écologiques négatifs qui en découlent : en particulier, destruction de la faune coprophile (coléoptères coprophages) essentielle à la décomposition de la matière organique. Bilan sur l’efficacité de la lutte chimique Au vu de l’ensemble des données bibliographiques disponibles à ce jour sur l’efficacité des traitements insecticides sur l’environnement, les bâtiments d’élevage et le matériel d’élevage, l’utilisation de tels produits semblerait peu efficace pour prévenir le risque d’infection par le SBV. De plus, l’impact de ces produits sur la faune naturelle et sur l’environnement ne serait pas négligeable. L’utilisation d’insecticides sur les animaux pourrait être considérée comme efficace contre les Culicoïdes si elle pouvait être réalisée de façon régulière et si une concentration suffisante en insecticides était atteinte dans les parties fines du corps, là où les vecteurs piquent de façon préférentielle. Cependant, une répartition non homogène de ces insecticides sur le cuir des différentes espèces concernées (Carpenter, 2008) et l’utilisation ponctuelle de ces produits rendent cette mesure de lutte peu efficace contre la transmission du SBV. De plus, en mai 2009, l’AFSSA a publié un avis sur l’efficacité de la protection des animaux à l’occasion de l’utilisation d’insecticides au moment de l’épidémie de FCO, dans lequel elle considère que les insecticides peuvent être utilisés au mieux qu’en complément d’autres mesures de lutte antivectorielle (AFSSA, 2009). Ainsi, les insecticides pourraient trouver une utilité principale au printemps, afin de retarder la résurgence de la maladie en fin de période hivernale, et lors de transports et transactions commerciales, pour limiter l’extension de la maladie. Cependant, ces traitements se révélant peu efficaces contre la transmission du virus de la FCO (Mullens, 2001), il apparaît fortement probable qu’il en soit de même dans la maladie de Schmallenberg. 122 3.2. Conséquences liées à l’émergence du SBV 3.2.1. La gestion publique de la maladie de Schmallenberg Les mesures de surveillance et de contrôle prises dans le cadre de la gestion publique de la maladie de Schmallenberg ont pour partie été élaborées à partir de l’expérience acquise lors de la gestion de l’épizootie de FCO. 3.2.1.1. La gestion de l’épizootie de FCO en Europe Comparaison entre le virus responsable de la FCO et le SBV Le virus responsable de la FCO et le SBV présentent beaucoup de similarités : • les espèces sensibles sont identiques ; • ce sont deux virus à génome segmenté ; • ils sont responsables d’anomalies congénitales ; • ils ne sont pas zoonotiques ; • ces virus sont apparus dans une même zone géographique ; • ils sont transmis par le même genre de moucheron. Cependant, l’impact du BTV sur la santé des animaux, son impact économique et l’importance du nombre de foyers observés ne sont pas comparables avec le cas de la maladie de Schmallenberg. Enfin, l’émergence de la FCO en Europe correspond à l’apparition d’une maladie déjà connue alors que l’émergence de la maladie de Schmallenberg a été causée par un agent infectieux inconnu jusqu’alors. Description de la situation La FCO est une maladie présente sur tous les continents mais n’a fait son apparition en Europe qu’au cours de la seconde moitié du XXème siècle, avec d’abord des apparitions ponctuelles en Espagne et au Portugal, puis une introduction plus large dans le bassin méditerranéen. L’émergence du sérotype 8 de la FCO dans le nord de l’Europe a eu lieu aux Pays-Bas en août 2006. L’origine de son émergence demeure encore incertaine. A partir de ce foyer identifié dans la région de Maastricht, la FCO s’est ensuite rapidement étendue affectant de nombreux pays comme l’Allemagne, la Belgique, l’Italie ou le RoyaumeUni. 123 Tableau 28 : Nombre de foyers de FCO (ovins et bovins) déclarés par la France entre 2006 et 2011 (Bricq, 2008) 2006 2007 2008 2009 2010 2011 Sérotype 8 30 15 257 26 919 77 0 0 Sérotype 1 0 3 4 932 9 1 0 Relativement épargnée par la première vague de la maladie en 2006, la France a été très touchée par la reprise épizootique du mois de juillet 2007. Entre 2007 et 2008, le sérotype 8 s’est étendu depuis le nord-est de la France vers le reste du territoire. Le sérotype 1 s’est étendu au cours de l’année 2008 depuis le sud-ouest de la France vers le reste du territoire. Le nombre de foyers déclarés a diminué de façon importante en 2009 et 2010 et fin 2012, après deux années sans observations de foyer de FCO, la France a été déclarée de nouveau indemne de FCO. Moyens de lutte mis en œuvre La FCO, d’un point de vue réglementaire, est une maladie réputée contagieuse (devenu danger sanitaire de 1ère catégorie). Les réglementations nationale et européenne prévoient la mise en œuvre d’un ensemble de mesures de police sanitaire en cas d’apparition de la maladie sur le territoire français. Avant 2006 et l’arrivée du sérotype 8 dans le nord de l’Europe, la FCO était considérée comme une maladie exotique. Les dispositions réglementaires prévues permettaient de faire face à une introduction ponctuelle de la maladie, et reposaient sur des actions de type sanitaire (arrêté préfectoral de mise sous surveillance, arrêté préfectoral portant déclaration d’infection, zones de surveillance, zones de protection, abattage des animaux infectés,…). Au cours du second semestre 2006, la maladie est apparue sur une partie nord-est géographiquement peu étendue du territoire français. Aucune mesure d’abattage systématique des animaux atteints n’a été mise en œuvre, notamment du fait du contexte épidémiologique en Belgique et aux Pays-Bas. Des mesures de traitement et de restriction des mouvements des animaux ont cependant été appliquées, comme l’interdiction de sortie des animaux des périmètres interdits, la désinsectisation des animaux, des bâtiments et des véhicules, l’obligation de réaliser des tests de dépistage pour sortir d’une zone réglementée, ou encore, la réalisation d’enquêtes dans les exploitations infectées et dans la zone réglementée. Malgré le maintien de ces mesures de police sanitaire, la FCO a poursuivi son extension vers le sud et vers l’ouest du territoire français au cours de l’année 2007. Les traitements insecticides mis en œuvre sur les animaux et les moyens de transport, en particulier, n’ont pas permis à eux seuls de maîtriser l’avancée de la maladie. Au vu de l’évolution épidémiologique de la maladie dans le courant de l’année 2007, l’AFSSA a recommandé une vaccination obligatoire, en France, de tous les ovins, bovins et caprins afin de limiter l’incidence de la FCO à sérotype 8 et de limiter le risque d’extension de la FCO sérotype 1. De plus, l’AFSSA a préconisé une logique centripète de la vaccination, 124 c’est-à-dire vacciner, dans un premier temps, les zones périphériques indemnes et remonter progressivement vers les zones infectées pour contenir la maladie. Cependant, le Ministère de l’agriculture a choisi de donner la priorité aux régions du nord-est de la France, durablement touchées en 2006 et 2007, ainsi qu’aux animaux destinés aux échanges. Suite à la mise en œuvre de la vaccination obligatoire au cours de la campagne vaccinale de l’hiver 2008-2009, les restrictions aux mouvements des animaux ont été adaptées : de nombreux états membres de l’Union européenne n’acceptant de recevoir que des animaux vaccinés. Les mesures de confinement et de traitement des animaux infectés dans les foyers sont restées obligatoires, mais la vaccination permet d’alléger l’interdiction de sortie de ces foyers. A partir de novembre 2010, seule la vaccination des animaux destinés à l’exportation est restée obligatoire. Depuis décembre 2012, la France a retrouvé son statut indemne de FCO et plus aucune vaccination n’est obligatoire. Bilan sur la gestion de la FCO en France Il apparaît que les mesures de lutte à caractère strictement sanitaire ont du faire l’objet au cours du temps de différentes adaptations. Telles qu’elles étaient prévues, elles auraient permis de faire face à une introduction ponctuelle de FCO, mais ne suffisaient pas au contrôle d’une épizootie. Nécessaires mais insuffisantes pour contrôler l’extension de la maladie au cours des années « sans vaccin », elles sont devenues complémentaires de la vaccination qui constitue la mesure de lutte majeure contre la FCO. L’expérience de la crise FCO au service de la gestion de l’émergence de la maladie de Schmallenberg L’expérience acquise au cours de l’épizootie européenne de FCO a permis d’optimiser la gestion de l’émergence de la maladie de Schmallenberg par l’intermédiaire des points suivants : • La coordination nationale et européenne pour les différentes recherches (outils diagnostiques, vaccins,…) s’est montrée d’emblée plus efficace dans le cas du SBV que dans le cas de la FCO. Ainsi, la technique d’identification du SBV rapidement mise au point en Allemagne et diffusée largement par le FLI a permis ensuite le développement rapide de tests ELISA en France, rendant le diagnostic de la maladie plus rapide et moins coûteux. • L’épizootie de FCO a permis le développement de la RT-PCR en temps réel, technique de diagnostic largement utilisée dans le cas du SBV (Doceul, 2013). • La constitution d’un réseau de 66 laboratoires capables d’identifier le SBV en mars 2012, sur le même modèle que celui établi pour l’identification du virus responsable de la FCO, a permis d’augmenter considérablement le nombre d’échantillons testés (Doceul, 2013). • L’épisode de FCO a conduit à la mise en place d’un système de surveillance des populations de Culicoïdes en France. De plus, depuis 2006, de nombreuses études portent sur ces vecteurs, améliorant ainsi la connaissance de la biologie du moucheron responsable de la transmission du SBV. 125 • L’épisode de FCO a permis une prise de conscience sur le fait que les maladies dites « exotiques » peuvent émerger en Europe et notamment en France. De plus, cela a amené les chercheurs à se poser la question des portes d’entrées existantes en Europe pour ces maladies. En ce qui concerne le SBV, cela a permis une très bonne réactivité de tous les acteurs. 3.2.1.2. La gestion de l’épizootie de la maladie de Schmallenberg aux niveaux européen et international Statut réglementaire de la maladie de Schmallenberg Les législations nationales et européenne se fondent principalement sur les lignes directrices et recommandations internationales de l’Organisation Internationale pour la Santé Animale (OIE). Cette dernière établit une liste de maladies à déclaration obligatoire ou « à notifier » par les Etats à l’OIE (rage, peste bovine, fièvre aphteuse…) et prévoit que les maladies émergentes doivent, elles aussi, être notifiées à l’OIE. Une maladie est classée dans la liste des maladies à notifier si elle répond à l’un des critères fixés par l’OIE (annexe 6). Ce principe constitue ainsi la base du système d’alerte précoce sur les potentiels dangers sanitaires dans le monde. Après une phase d’interrogation, sinon d’inquiétude sur le risque d’épizootie, au cours de laquelle les Etats procèdent à cette notification de façon spontanée, l’OIE décide de maintenir, ou non, la nouvelle maladie en tant que maladie émergente. L’OIE a décidé, lors de son Assemblée Générale en mai 2012, de déclasser la maladie de Schmallenberg de maladie émergente en maladie d’élevage. Les notifications spontanées par les Etats ont, dès lors, été abandonnées. Réglementation pour la commercialisation du bétail L’Union européenne et l’OIE estiment en février 2012 que prendre des mesures de restrictions sur la commercialisation des animaux vivants est injustifié, puisque ils considèrent que : • Contrairement au virus responsable de la FCO, le SBV a un impact limité sur la santé animale ; • Le risque zoonotique est peu probable. • Aucunes des infections et des maladies causées par des virus de ce sérogroupe n’est incluse dans la liste des maladies soumises à des notifications, ou des normes internationales sur le commerce, établies par l’OIE. • Les données disponibles suggèrent que l’infection par le virus Schmallenberg ne mérite pas une approche différente de celle adoptée pour la maladie d’Akabane. Cette dernière, bien qu’endémique dans certaines régions du globe, n’est pas sujette à des restrictions particulières de la part de l’OIE. • Les données disponibles sur le risque de transmission du virus à partir d’animaux ou de leur produits provenant de zones touchées par le SBV montrent que ce risque est négligeable si certaines conditions sont respectées (voir encadré ci après). 126 Estimation du risque de transmission du SBV lors de la commercialisation d’animaux vivants, de leur matériel génétique et de leurs produits (OIE, 2013a) Animaux vivants non gravides Données importantes : La période virémique est très courte. Des signes cliniques discrets peuvent survenir. La transmission est vectorielle. Risque de transmission : Il est négligeable pour : • les animaux négatifs à la PCR après 7 jours dans un environnement exempt de vecteurs ; • les animaux à sérologie positive et à PCR négative. Animaux vivants gravides Données importantes : Le virus peut persister chez le fœtus, d’où la naissance possible de veaux, d’agneaux ou de chevreaux positifs à la recherche du virus. Le stade de la gestation pouvant donner lieu à des nouveaux-nés virémiques reste inconnu. Risque de transmission : • négligeable pour la descendance des animaux à sérologie négative contrôlés à deux reprises (en 28 jours) dans un environnement exempt de vecteurs ; • négligeable pour la descendance des animaux à sérologie positive avant l’insémination ; • non déterminé pour la descendance de tous les animaux non mentionnés dans les paragraphes ci-dessus. Semences Données importantes : Les résultats de plusieurs études montrent que la semence de taureaux infectés naturellement par le SBV pourrait être infectieuse ( ProMed-mail, 2012b ; ProMed-mail, 2012c ; ProMed-mail, 2013). Cela suggère également que le SBV et le Virus Akabane auraient des comportements différents en terme d’excrétion. En effet, le sperme de taureaux infectés expérimentalement par le virus Akabane n’est pas infectieux (Parsonson, 1981). Risque de transmission aux animaux : Selon les connaissances actuelles, le risque est négligeable pour : • les lots de semences collectés avant le 31 mai 2011 ; • les lots de semences provenant d’animaux dont le statut sérologique négatif a été vérifié au moins 28 jours après la collecte de semence ; • les lots de semences pour lesquels le génome du SBV a été recherché par une méthode d’extraction de l’ARN approuvée et une RT-PCR quantitative. Embryons Données importantes : Les embryons ne doivent être prélevés que sur des animaux cliniquement sains. Le virus Akabane est classé en catégorie 4 ( = maladies ou agents pathogènes pour lesquels les études réalisées ou en cours indiquent soit qu’aucune conclusion n’est encore possible sur le niveau de risque de transmission, soit que le risque de 127 transmission par transfert embryonnaire pourrait ne pas être négligeable, même si les embryons sont manipulés correctement entre la collecte et le transfert). Risque de transmission : D’après les connaissances actuelles, le risque lié aux animaux donneurs à sérologie négative est négligeable. Les animaux donneurs à sérologie positive et PCR négative le jour de l’insémination doivent également être considérés comme à risque négligeable. Viande Données importantes : Seuls des animaux cliniquement sains doivent être abattus. Risque de transmission à l’homme et aux animaux : Négligeable Lait Données importantes : Le lait ne doit être collecté que sur des animaux cliniquement sains. Risque de transmission à l’homme et aux animaux : Négligeable 3.2.1.3. La gestion de l’épizootie de la maladie de Schmallenberg au niveau français En France, le SBV ne fait à ce jour pas partie d’un classement réglementaire faisant l’objet de prévention, surveillance ou lutte obligatoire. La surveillance de la maladie de Schmallenberg est réalisée par un groupe de travail de la Plateforme nationale d’Epidémiosurveillance en Santé Animale (Plateforme ESA)17. Cette surveillance porte uniquement sur les foyers de SBV congénital. A sa mise en place en janvier 2012, à la suite de l’alerte européenne relative à l’émergence du SBV, cette surveillence avait pour but d’exercer une vigilance vis-à-vis d’une éventuelle introduction de ce virus sur le territoire francais. Actuellement, cette surveillence permet de suivre l’évolution de la distribution géographique de la maladie en identifiant les foyers de SBV congénital chez les ruminants domestiques (bovins, ovins, caprins) et de récolter et d’analyser des informations épidémiologiques sur les cheptels et les animaux atteints. Remarque : L’autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) récolte les données des différents pays concernés et permet de suivre la situation épidémiologique du SBV à l’échelle de l’Europe. Au cours des premiers mois de l’année 2012, une fiche de commémoratifs à renseigner et à adresser à la plateforme ESA a été mise à disposition des vétérinaires faisant face à des suspicions de SBV congénital. Les prélèvements à réaliser pour la confirmation des cas ont évolué au fur et à mesure du développement de nouvelles techniques diagnostiques (validation du test ELISA pour la détection des anticorps anti-SBV en avril 2012). De plus, à partir de mars 2012, un réseau de laboratoires agréés pour le diagnostic du SBV par RT-PCR est constitué. Cette surveillance, liée à la première vague de circulation virale sur le territoire français, a pris fin le 31 mai 2012 pour les petits ruminants, le 31 août 2012 pour les bovins. 17 Le groupe de suivi de la maladie de Schmallenberg, coordonnée par GDS France, réunit des représentants de la DGAL, l’Anses, la SNGTV, l’Adilva, Coop de France, Races de France et l’UNCEIA. 128 L’activité des populations de vecteurs en mai 2012 (bien que relativement faible par rapport à 2011), associée à l’apparition de nouveaux foyers de SBV congénital dans plusieurs départements à partir du mois de septembre 2012, a motivé une reprise de la surveillence du SBV congénital en France à partir du 1er septembre 2012. Pour cette deuxième année, la surveillance a été coordonnée par GDS France. Deux zones géographiques ont été définies : la zone 1 comprend les départements où plus de 20 foyers de SBV congénital (toutes espèces confondues) ont été identifiés au 15 juin 2012 alors que la zone 2 comprend les départements où moins de 20 foyers ont été identifiés à cette date. La déclaration des cas se fait alors suivant des modalités différentes selon les départements (Plateforme ESA, 2012c). La date de fin de surveillance du SBV congénital lié à la seconde vague de circulation virale a été fixée au 31 août 2013 sur proposition du groupe de suivi de la Plateforme ESA, d’après les données de surveillance du SBV congénital. En septembre 2013, bien que la reprise de la circulation virale au printemps 2013 n’a pas été formellement prouvée, le groupe de suivi de la Plateforme ESA a proposé la poursuite de la surveillance des formes congénitales à partir du 1er septembre 2013, selon des modalités allégées (tableau 29). En effet, cette reprise de circulation apparaît très probable, en lien avec la reprise d’activité des vecteurs (Plateforme ESA, 2013b). Le tableau ci-après rèsume l’évolution des modalités de la déclaration des cas de SBV congénital en France depuis l’emergence de ce virus. Tableau 29 : Evolution des modalité de renseignements des cas de SBV congénital en France Saison 2012/2013 (Plateforme ESA, 2013) 2013/2014 (Plateforme ESA, 2013) Modalité de déclaration Renseignement de la fiche de commémoratifs par le vétérinaire en fonction de la situation géographique du troupeau concerné. Renseignement de la fiche de commémoratifs par l’éleveur, le vétérinaire ou le GDS. Tests diagnostiques Zone 1 : • Sérologie (à privilégier) : sang du nouveau né (avant prise de colostrum) ou de l’avorton (sang cardiaque) • PCR : cerveau Zone 2 : • Sérologie (à privilégier) : sang du nouveau né (avant prise de colostrum) ou de l’avorton (sang cardiaque) • Sérologie : sang de la mère Facultatif dans tous les départements de France 129 3.2.2. Conséquences économiques de la maladie Les pertes économiques directes correspondent à une perte de production immédiate causée par le virus (chute de la production de lait, veaux ou agneaux morts-nés, etc.). Les pertes économiques indirectes correspondent à la production attendue mais non réalisée en raison de l’infection du troupeau par le virus. Contrairement aux pertes économiques directes, les pertes indirectes se mesurent sur le long terme. 3.2.2.1. Pertes économiques directes 3.2.2.1.1. Résultats économiques dans les exploitations touchées par le SBV congénital et facteurs de variations La maladie entraîne de la fièvre et de la diarrhée chez les animaux adultes ainsi que des malformations chez les fœtus. Il y a donc une perte de production directe, notamment de production laitière mais également une diminution du nombre d’animaux destinés à la vente pour l’abattoir et pour l’engraissement. Une étude, réalisée en novembre 2012 (Institut de l'élevage, 2012), portant sur 348 troupeaux ovins affectés par la forme congénitale du SBV montre que les conséquences économiques sont faibles pour la plupart des élevages. La simulation économique a été réalisée en prenant en compte la mortalité des agneaux, l’augmentation du taux de renouvellement (afin de compenser la mort de certaines brebis suite à des mise-bas dystociques) et la diminution des charges alimentaires, notamment en concentrés (du fait d’un nombre moins important d’agneaux). Les simulations réalisées indiquent que les pertes économiques moyennes imputables au SBV correspondent à une diminution de la marge brute par brebis de 2 à 19 %. Dans plus de 70% des exploitations, la diminution de la marge brute par brebis est de moins de 3 %. L’importance des pertes économiques varie en fonction (Institut de l'élevage, 2012) : 130 • de la prévalence de la forme congénitale du SBV dans le troupeau. Pour rappel, la forme congénitale du SBV concerne en moyenne 15 % des agneaux d’un troupeau et 7 % des veaux d’un troupeau. Pour les deux espèces, une majorité des élevages est faiblement à modérément atteinte par la forme congénitale (90%) mais certains élevages sont très fortement impactés (10%). • de la répartition des mises-bas sur l’année. Une période restreinte de mise-bas entraîne un fort risque de contamination d’un grand nombre de femelles, si une forte activité vectorielle correspond au moment de la gestation où le passage transplacentaire du SBV est possible. • de l’importance du troupeau dans le revenu de l’exploitation. Les exploitations de type polyculture-élevage sont généralement moins pénalisées au niveau économique. 3.2.2.1.2. Indemnisation des éleveurs En Allemagne, même si l’impact du SBV a été relativement fort18, avec 3 598 foyers confirmés au 30 avril 2013, les pertes économiques au niveau des exploitations étant relativement faibles, aucun éleveur n’a demandé de compensation (Bourzai, 2012). En France, il existe un système d’indemnisation des élevages ayant perdu des agneaux ou des veaux suite à la circulation du virus Schmallenberg. Il s’agit de la Caisse de Solidarité Santé Animale des GDS (CSSA) (Plateforme ESA, 2012d). Les élevages éligibles à une indemnisation doivent répondre aux conditions suivantes : • être adhérents au GDS et à la CSSA. • avoir été identifiés comme foyers SBV confirmés dans le cadre de la surveillance de la maladie mis en place par de la Plateforme nationale d’épidémiosurveillance en santé animale. Une fiche de commémoratifs, complètement renseignée par le vétérinaire, est indispensable. La confirmation telle que définie dans le cadre de la surveillance n’est nécessaire que pour un seul animal. • avoir été fortement impactés. Le seuil de pertes pour être éligible à une indemnisation est fixé à 10% de mortalité imputable au SBV parmi les agneaux ou les veaux nés sur l'année. La base d’indemnisation était en 2012 de : • 42,5 euros par agneau allaitant, • 12,4 euros par agneau laitier, • 60 euros par veau laitier, • 150 euros par veau croisé, • 275 euros par veau allaitant. Le montant de l'indemnisation est plafonné à 50% des pertes de l’élevage. 3.2.2.1.3. Prise en charge des analyses En cas d’avortement au sens réglementaire du terme (naissance avant terme ou mort dans les 48 heures, ce qui est le plus souvent le cas pour les formes congénitales de SBV), la surveillance de la brucellose prévoit la réalisation d’investigations par le vétérinaire sanitaire, avec prise en charge de la rémunération par l’Etat. En revanche, dans le cas où la suspicion de SBV n’entre pas dans le cadre réglementaire d’un avortement, et si l’éleveur décide de faire appel à son vétérinaire, l’ensemble des frais (honoraires, frais de déplacement du vétérinaire et réalisation de prélèvements) reste à la charge de l’éleveur. Dans tous les cas, le financement des analyses SBV reste à la charge de l’éleveur. 18 L’Allemagne est le deuxième pays le plus touché. La France est le premier avec 7 705 foyers confirmé entre décembre 2011 et avril 2013. 131 3.2.2.2. Pertes économiques indirectes 3.2.2.2.1. A l’échelle internationale Si les conséquences directes semblent globalement faibles, le SBV a aussi des conséquences indirectes très pénalisantes, en particulier pour les pays exportateurs de bétail. L’arrivée d’un nouveau virus entraîne une suspicion sur l’état sanitaire du cheptel du pays concerné. Bien que l’OIE juge injustifiable les mesures de restriction concernant la commercialisation du bétail vivant et de leurs produits, 27 états importateurs, hors de l’UE, ont imposé des restrictions sur les échanges d’animaux d’élevage et de matériels génétiques (semences, embryons) provenant des pays européens touchés par le SBV. Ces restrictions peuvent prendre différentes formes. Il peut s’agir soit d’embargo total sur les animaux, soit de demandes de tests virologiques et/ou sérologiques, soit, enfin, d’attestations certifiant que le bétail est indemne de toute contamination ou provient d’élevages non atteints cliniquement. Dans quelques cas, les restrictions peuvent même porter sur les productions (le lait et la viande) voire sur d’autres espèces indemnes de toute contamination comme le porc. Tableau 30 : Restrictions d’importations liées au SBV en 2012 (ProMed-mail, 2012a) Pays 132 Date Février Février Mai Mars Animaux vivants Matériel génétique + Algérie Argentine Australie Biélorussie Bosnie Brésil Canada Chili Chine Egypte Equateur Japon Jordanie Kazakhstan Corée Koweït Liban Mexique Maroc Oman Pérou Mars/mai Mai Mai Mai Janvier/mai Avril Février Février Février Avril Mars Février Janvier Février Mai Avril + + Russie Janvier + + Turquie Ukraine Emirats arabes unis Uruguay USA Février Février + + + Mars + Mars Février Remarque + + + + + + + + + + + + + + + Restrictions étendues au lait et à la viande + + + + + + + + + + + Interdiction levée le 21 août 2012 Interdiction provisoirement étendue aux porcs 3.2.2.2.2. A l’échelle de l’exploitation Aucun rapport ou étude n’est disponible concernant les conséquences indirectes du SBV dans une exploitation. Outre les difficultés à la commercialisation des animaux citées précédemment, les points suivants sont à l’origine de pertes économiques pour une exploitation : • Dégradation des résultats de reproduction lors de SBV aigu. En effet, le syndrome fébrile occasioné peut entraîner une dégradation du cycle de reproduction, notamment au moment des chaleurs (chaleurs mon exprimées, retard de chaleurs) ou juste après la mise à la reproduction (mortalité embryonnaire précoce). • Surveillance et assistance des femelles au moment des mises bas. Cela apparaît comme la seule préconisation pertinente pour limiter les impacts sur les femelles puisque, pour rappel, lors d’une mise bas à problème imputable au SBV, en moyenne 12 % des brebis meurent dans les jours suivants. Cette moyenne est de 5 % pour les vaches. Ce surcoût de temps passé à la surveillance et au soin des femelles est difficilement quantifiable sur le plan économique. • Dégradation des résutats de reproduction l’année suivant une première mise bas dystocique due au SBV avec une réduction de la fértilité et des difficulté de mise bas. Ainsi, la mise bas dystocique se traduirait par une diminution de 6 % du taux de gestation en première insémination chez les bovins (Hanzen , 2005). De plus, une mise bas dystocique peut entraîner la formation de tissus cicatriciels au niveau du col de l’utérus ou de la vulve qui seront, à nouveau, à l’origine de problèmes lors de la mise bas suivante (Hanzen, 2013 ; Blancard, 2010). 3.3. Perspectives 3.3.1. Evolution attendue de la maladie de Schmallenberg 3.3.1.1. A l’echelle d’un troupeau Immunisation du troupeau La comparaison des répartitions des foyers en France en août 2013 et août 2012, montre que les troupeaux atteints en 2013 se situent dans des zones géographiques peu concernées par des cas de SBV congénital en 2012. Au contraire, les zones géographiques fortements atteintes en 2012 comportent très peu de foyers de SBV congénital en 2013 (voir partie 1). Cela est très certainement du au fait que le passage du SBV induit une immuité de troupeau le rendant séropositif envers le SBV. Par exemple, aux Pays-Bas, 233 foyers de SBV congénital ont été confirmés entre août 2011 et mai 2012, alors que seulement 4 foyers ont été confirmés entre mai 2012 et avril 2013 (EFSA, 2013). Une étude sérologique a révèlé que 72,5% du cheptel bovin néerlandais était séropositif vis-à-vis du SBV en janvier 2012 (Elbers, 2012). Il semblerait donc que d’une année sur l’autre, l’immunité humorale des animaux ayant été en contact avec le SBV prévienne la réémergence du SBV. 133 Remarque : Les moyens de lutte contre la maladie de Schmallenberg précédemment décrits ne semblent donc appropriés que dans le cas de troupeaux non immunisés. Ainsi, lorsqu’un troupeau n’a jamais présenté de cas de SBV, aigu ou congénital, il convient de déterminer le statut sérologique du troupeau vis-à-vis du virus avant l’application de mesures préventives. Risques de réapparition de la maladie Un étude portant sur un troupeau ovin belge de 400 brebis dans lequel le virus à circulé en fin d’année 2011 a montré que 99,5% des brebis étaient séropositives en janvier 2012 mais que le SBV a tout de même circulé dans l’élevage en 2012 (Claine, 2013). Le suivi, tous les 15 jours, des résultats des tests sérologiques et des RT-PCR réalisés sur les prélèvements sanguins des des 50 agnelles de renouvellement nées en automne 2011 et en janvier 2012 atteste de cette circulation virale. Tableau 31 : Circulation du SBV chez des agnelles appartenant à un troupeau immunisé contre ce virus (Claine, 2013) Date du prélévement sanguin 11 juil 25 juil 8 aout 22 aout 5 sept 17 sept 3 oct 17 oct Nombre (%) cumulatif de résultats RT-PCR positifs Agnelles nées en automne 2011 (n=38) 0 3 (8) 5 (13) 11 (29) 25 (66) 30 (79) 36 (95) 38 (100) Agnelles nées en janvier 2012 (n=12) 0 0 0 5 (42) 9 (75) 11 (92) 12 (100) 12 (100) Nombre (%) cumulatif d’échantilllons séropositifs Agnelles nées en automne 2011 (n=38) 0 0 3 (8) 8 (21) Agnelles nées en janvier 2012 (n=12) 0 0 0 0 18 (47) 22 (58) 2 (17) 2 (17) 33 (87) 35 (92) 6 (50) 8 (67) Les résultats de cette étude amènent à penser que même dans une région avec une forte séroprévalence vis à vis du SBV, la circulation virale est possible, de même que l’infection primaire d’animaux naïfs. Cela n’entraîne pas de conséquences importantes au niveau de l’élevage tant que les animaux demeurant naïfs ne sont pas mis à la reproduction. Le seul danger face à cette circulation virale est l’introduction d’une femelle gestante non immunisée dont le stade de gestation correspond à la période à risque de tératogénicité. 3.3.1.2. A l’échelle européenne Suite à l’émergence du SBV, les chercheurs ont envisagé que : • l’infection toucherait dans un futur proche les régions où la séroprévalence est faible, c'est-à-dire là où la plupart des animaux sont restés naïfs vis-à-vis du SBV ; 134 • • au vu de la rapidité d’expansion de la maladie, il faudrait s’attendre à ce qu’un nombre de pays plus important soit touché dans le cas du SBV que dans le cas du virus de la FCO ; en prenant en compte l’exemple du virus Akabane, il ne serait pas exclu de voir le SBV atteindre des pays hors de l’Europe. Les deux premières hypothèses se sont vérifiées, mais, à ce jour, le SBV n’a pas été identifié ailleurs qu’en Europe. De plus, les connaissances actuelles sur l’épidémiologie de ce nouveau virus et sur l’ensemble des virus du sérogroupe Simbu ne sont pas assez larges pour déterminer si le SBV va plutôt devenir enzootique en Europe ou si il va être amené à disparaître dans un futur proche, lorsque tout le troupeau européen sera immunisé. La circulation enzootique du SBV dépend de l’activité de la population vectorielle compétente et de la présence d’animaux naïfs. Dans un contexte de vaccination non obligatoire, la présence d’animaux naïfs est inéluctable. La circulation enzootique du SBV repose alors essentiellement sur l’activité de la population vectorielle compétente. Puisque celle-ci est majoritairement dépendante des conditions climatiques, deux cas de figure sont envisageables : • si les conditions climatiques sont favorables pour les Culicoïdes, la circulation endémique du SBV semble possible, permettant l’immunisation des animaux naïfs avant la mise à la reproduction et renforçant l’immunité précédemment acquise pour les animaux séropositifs. Le nombre de cas de SBV congénital serait alors faible. • si les conditions climatiques ne sont pas favorables pour les Culicoïdes, la circulation enzootique du virus marquerait alors un arrêt entraînant une baisse de la protection immunitaire du troupeau européen. Le risque est alors de voir apparaître une épizootie de cas de SBV congénital lors de la reprise de la circulation du virus. C’est pourquoi, afin d’éviter toute nouvelle vague de cas cliniques, certains auteurs préconisent une vaccination active contre le SBV en s’appuyant notamment sur la réussite de la vaccination contre le virus de la FCO et en avançant le fait que la vaccination est le moyen de lutte le plus facile à mettre en place (Beer, 2013). Cependant, les connaissances sur la vaccination contre le SBV sont limitées, notamment en ce qui concerne la pérsistance des anticorps au cours du temps. De plus, des études récentes mettent en évidence des mutations concernant le génome du SBV (Fischer, 2013 ; Coupeau, 2013). Ces mutations ne sont pas aléatoirement distribuées puisque 50% d’entre elles sont concentrées dans seulement 10% de la séquence totale du génome. Ces 10% se situent au niveau des glycoprotéines de surface codées par le segment M. La principale hypothèse avancée est que, puisque les mutations ce concentrent au niveau des protéines qui permettent la reconnaissance et l’attachement du virus à la cellule cible, cela permettrait au virus d’étendre son éventail d’interactions à d’autres types cellulaires. Cela pourrait également être un mécanisme d’échappement du SBV à la réponse immunitaire et notamment à la réponse immunitaire de type humorale. Ces résultats montrent que le SBV n’est pas si stable au niveau génétique et remettent en question l’intêret de la vaccination. De plus, ils suscitent des inquiétudes quant à une future augmentation du nombre de cas de SBV congénital. 135 3.3.2. Adaptation de la gestion de l’épizootie L’exemple du virus Akabane permet d’apporter des pistes pour l’amélioration de la gestion de la maladie de Schmallenberg en Europe. 3.3.2.1. L’exemple de la maladie d’Akabane en Australie (Kirkland, 2012) Description de la situation En Australie, la circulation du virus Akabane est liée au vecteur C. brevitarsis. Depuis plus de 35 ans, elle est annuelle, régulière d’une année sur l’autre, et prévisible. De plus, le virus circule uniquement dans les régions du nord est du continent. L’infection par le virus Akabane concerne surtout les jeunes animaux. L’immunité des troupeaux de ces régions est forte et durable et les animaux de cette région sont immunisés avant la mise à la reproduction. La maladie n’est observée que lorsque le cycle endémique permettant une immunisation des femelles avant la reproduction est perturbé. C’est le cas dans les conditions suivantes : • une réduction de la taille « normale » de la zone où circule habituellement le virus. Des conditions climatiques non favorables au vecteur comme la sécheresse peuvent en être à l’origine. • une distribution géographique plus large du vecteur grâce à des conditions climatiques favorables. Le virus circule alors dans une zone plus large que celle de l’année précédente. • une introduction d’animaux naïfs dans la zone où circule habituellement le virus. Ainsi, des « flambées épizootiques » ne sont observées que tous les 10 à 15 ans. Un changement climatique en est souvent à l’origine. Moyens de surveillance et de lutte contre le virus Akabane La distribution du vecteur et les modes de transmission étant bien connus, une surveillance est en place depuis plus de 30 ans par l’intermédiaire d’un programme national de surveillance des arbovirus (NAMP). Ce programme vise en particulier trois virus ayant un impact important sur la santé du bétail australien : le virus Akabane, le virus responsable de la FCO (il y a 10 sérotypes présents en Australie) et le virus de la Fièvre éphémère bovine. Toutes les populations de Culicoïdes sont également suivies. Cette surveillance s’appuie sur des prélèvements réguliers de jeunes bovins sentinelles répartis sur tout le continent australien et sur le piégeage des vecteurs. Des tests sérologiques (ELISA ou séroneutralisation) sont effectués sur les prélèvements sanguins des animaux sentinelles et les insectes piégés sont triés par espèce et compté. L’objectif de ce programme est triple. Il vise à : • fournir un appui à la commercialisation des animaux en apportant des données dans le cadre des protocoles à l’exportation et des exigences de certification ; 136 • • constituer un système d’alerte précoce en matière de détection de nouveaux virus ou de nouveaux vecteurs sur le continent australien ; gérer les risques en détectant les modifications de distribution des virus et de leurs vecteurs pouvant conduire à l’émergence des maladies. Les conséquences d’une infection peuvent être minimisées en limitant l’introduction de femelles en début de gestation dans les régions où le vecteur est présent ou en décalant la mise à la reproduction lors d’introduction d’animaux concomitante à l’activité vectorielle. Les vaccins, autrefois utilisés en frontière de la zone d’endémie ne sont plus aujourd’hui commercialisés. Bilan de la gestion de la maladie d’Akabane En Australie, le contrôle de la maladie d’Akabane repose sur la connaissance des zones d’endémie et sur la distribution géographique du vecteur. La prévention du risque de transmission transplacentaire du virus passe par une gestion adaptée de la saison de mise à la reproduction. Cependant, malgré la connaissance de la distribution géographique du vecteur, la connaissance du mode de transmission du virus et le peu de manifestations cliniques de la maladie, les éleveurs font encore face à des pertes économiques liées aux restrictions à l’exportation. En conséquent, des tests sont réalisés sur les animaux vivants et leurs matériels génétiques. Enfin, les régions indemnes de vecteurs ne sont pas reconnues par les pays importateurs, de même que l’absence de risque de transmission du virus à certaines saisons. 3.3.2.2. Enseignements pour la gestion de la maladie de Schmallenberg en Europe Il semble y avoir beaucoup d’éléments communs entre le SBV et le virus Akabane. Ainsi, dans le cas du SBV, il serait intéressant pour améliorer la gestion de la maladie de préciser : • le comportement des vecteurs par rapport aux conditions climatiques, • l’origine de son introduction, • les éléments d’épidémiologie permettant d’aboutir à une situation éventuellement équilibrée et prévisible. 3.3.3. Emergence de nouvelles maladies Le SBV a émergé en 2011 dans les mêmes régions que les sérotypes 8, 6 et 11 du virus de la FCO il y a quelques années de cela. Il semblerait donc qu’il y ait un ensemble de facteurs favorables à l’émergence de maladies vectorielles exotiques au centre de l’Europe. Dans ce contexte, les caractéristiques remarquables de cette région sont : • la présence d’aéroports internationaux (Amsterdam, Bruxelles, Cologne), • la présence d’un port international (Rotterdam), 137 • • • une forte densité de population associée à une importation journalière importante de produits frais, de fruits, de légumes et de fleurs depuis le monde entier, une forte densité d’ovins et de bovins, ce qui représente une cible pour les maladies infectieuses émergentes, une population de Culicoïdes compétente pour la transmission du virus de la FCO, du SBV et probablement d’autres arboviroses comme la maladie hémorragique épizootique. Ainsi, l’introduction de futures maladies vectorielles est très probable dans cette région. Le travail de Jones et de ses collaborateurs montre que les maladies émergentes infectieuses sont très fortement corrélées à des facteurs environnementaux, socio-économiques et écologiques. Cela permet de définir des « points chauds » (ou « hot spots ») où la combinaison des différents facteurs cités précédemment laisse à penser que ces régions sont de bons candidats à l’émergence de nouvelles maladies infectieuses. C’est pourquoi, la combinaison de fortes densités humaines et animales associée à des importations massives et fréquentes fait de l’Europe du nord ouest un « point chaud » potentiel pour l’introduction de nouvelles maladies infectieuses (Jones, 2008). Ni le virus de la FCO ni le SBV ne sont des agents zoonotiques. Cependant, des virus proches comme le virus responsable de la fièvre de la vallée du Rift pourraient être introduits et profiteraient alors des conditions favorables précédemment décrites qui permettent alors une dissémination rapide et efficace de la maladie zoonotique. Certains auteurs recommandent les mesures suivantes dans le but de détecter précocement toute émergence de nouvelles maladies (Beer, 2013) : • L’installation d’un programme de surveillance des vecteurs et d’une population animale sentinelle dans les régions où le risque d’introduction d’arboviroses est important, suivant les mêmes modalités que pour le virus Akabane en Australie. Les régions concernées seraient alors les Pays-Bas, la Belgique, et la partie ouest de l’Allemagne. • L’optimisation des nouvelles technologies comme les analyses métagénomiques ou l’utilisation de puces à ADN, afin de pouvoir les utiliser en cas de suspicion de maladies exotiques. • Que les éleveurs et les vétérinaires gardent à l’esprit la possible introduction de maladies à notifier comme la fièvre aphteuse. Plus le premier échantillon est prélevé et est analysé rapidement, plus vite les mesures de contrôle peuvent être mises en place si cela est nécessaire. • Une coopération nationale et internationale la plus efficace possible. La collaboration entre les médecins, les vétérinaires et les autres professions liées à l’environnement ou à la santé tient une place majeure dans le combat contre les maladies émergentes. Dans un souci d’efficacité maximale, il est important de faire en sorte que les différentes mesures de surveillance ne « pénalisent » pas une politique de transparence et que la découverte précoce d’une maladie dans un pays n’entraîne pas des mesures de restrictions injustifiées sur les échanges commerciaux. 138 Conclusion Thèse de M. DEFFONTAINES Martin 139 140 Bibliographie AFSSA 2009. Avis de l’Agence française de sécurité sanitaire des aliments sur l’intérêt de la mise en oeuvre des mesures de désinsectisation dans le protocole de lutte contre la fièvre catarrhale ovine. 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Le SBV aigu est responsable de symptômes non spécifiques chez les ruminants adultes qui sont semblables à ceux observés en début d’évolution de nombreuses maladies. De ce fait, lorsque les signes cliniques spécifiques des maladies entrant dans le diagnostic différentiel du SBV aigu apparaissent, il est aisé de les exclure. Avant l’apparition de ces signes, il n’est généralement pas possible de le faire en se basant uniquement sur la clinique. Il faut alors avoir recours au contexte épidémiologique voire à certaines analyses de laboratoire. 1. La fièvre catarrhale ovine La FCO (ou « bluetongue ») appartient à la liste des dangers sanitaires de 1ère catégorie, pour lesquels des mesures de surveillance et de police sanitaire sont définies par les autorités sanitaires. Jusqu’en 1998, la FCO était considérée comme une maladie exotique avec une répartition tropicale. Elle a alors fait son apparition au Sud de l’Europe (Grèce, Italie, Espagne, Corse) où plusieurs sérotypes ont été identifiés (1, 2, 4, 9 et 16). Un nouveau sérotype, le sérotype 8 est apparu à l’été 2006 dans le Nord de l’Europe (Allemagne, Belgique, Pays-Bas et France continentale) et s’est largement répandu en 2007 sur le territoire de l’Union européenne. L’année 2007 a également vu l’apparition du sérotype 1 en France continentale. Le 14 décembre 2012, la France a été déclarée indemne de FCO. L’agent responsable de la fièvre catarrhale ovine est un virus de la famille des Reoviridae, du genre Orbivirus. C’est un virus non enveloppé à ARN double brin segmenté. Le virus de la FCO peut se transmettre à tous les ruminants domestiques ou sauvages. Comme pour le SBV, la transmission de ce virus est majoritairement vectorielle, par l’intermédiaire de diptères hématophages du genre Culicoïdes. Chez la majorité des animaux adultes, l’expression clinique de la FCO se limite à une courte période (quelques jours) d’hyperthermie (en moyenne 40 °C avec des pics à 42 °C). Certains présentent une dysorexie voire une anorexie entrainant une perte de poids et une chute de production laitière. Dans certains cas, les animaux peuvent développer une dyspnée assez importante liée à un œdème pulmonaire. Dans les cas cités ci-dessus, il n’est pas possible de faire la distinction entre la FCO et la maladie de Schmallenberg. Cependant, le virus résponsable de la FCO peut entraîner des signes cliniques qui lui sont spécifiques. Ainsi, une étude a démontré qu’une combinaison de ces signes cliniques était nécessaire pour suspecter la maladie chez les bovins avec une bonne sensibilité (67%) et une bonne spécificité (72%). L’animal doit alors présenter au moins un signe clinique de chaque catégorie présentée dans le tableau suivant. 160 Tableau 32 : Diagnostic clinique de la FCO (Elbers, 2008) Catégorie 1 Catégorie 2 Catégorie 3 Catégorie 4 1.Ulcération et/ou érosion de la muqueuse buccale 1.Protrusion de la langue 1.Raideur des membres 1.Prostration 2.Erosion des lèvres, croûtes dans ou autour des narines 2.Inflammation du bourrelet coronaire 2.Torticolis 2.Difficulté ou refus de se déplacer 3.Anoestrus 3.Apathie, fatigue 3.Œdème du nez 4.Erythème ou coloration violette de la langue 4.Nécrose musculaire Suivant les signes cliniques observés, différentes formes peuvent être définies. Ainsi, sont distinguées la forme classique, la forme podale, la forme pulmonaire, la forme généralisée, la forme de type coryza et la forme génitale. 2. La diarrhée virale bovine (BVD) et la border disease Le virus de la BVD appartient au genre Pestivirus de la famille des Flaviridae qui affecte les bovins. Il est classé dans la liste des dangers sanitaires de 2ème catégorie. Il existe deux types de souches : la souche cytopathogène (CP) et la souche non cytopathogène (NCP). Les souches NCP sont les plus fréquentes et les plus importantes : elles sont responsables de la quasi-totalité des manifestations cliniques chez l’animal immunocompétent. Les souches CP interviennent lors de l’évolution de la maladie des muqueuses chez les individus infectés permanents immunotolérants (IPI). La répartition de la BVD est mondiale. La séroprévalence varie considérablement d’un troupeau à l’autre (de 0 à 100 %). Le pourcentage d’IPI dans la population bovine est faible : il est compris entre 1 et 2 %. La source de virus est l’ensemble des animaux IPI. Les infectés transitoires sont également source de virus mais dans une moindre mesure. Le plus souvent la maladie apparaît dans un troupeau après introduction d'un animal atteint d'une infection inapparente ou par voisinage. Les matières virulentes sont les produits des sécrétions et des excrétions (sperme, sécrétions utérines, liquide amniotique, lait, salive, larmes, jetage, urine, fèces lors de maladie clinique). La contamination s'effectue surtout par ingestion et inhalation ou par voie utérine lors de la saillie ou de l'insémination artificielle. 161 Plusieurs formes de BVD sont décrites (Holliman, 2005 ; Ali, 2012) : • Le BVD subclinique : l’infection par le BVD reste le plus souvent subclinique. Cela se traduit par un passage diarrhéique transitoire, sans altération importante de la production laitière. Le syndrome fébrile associé est faible avec une légère hyperthermie (39-39.5°C). L’immunodépression induite par le passage viral peut cependant aggraver le tableau clinique, surtout chez les animaux jeunes : ils sont alors plus sensibles aux autres agents pathogènes. • Le BVD aigu : il s’exprime sur des animaux immunocompétents, séronégatifs pour le BVD. Ils ont le plus souvent entre 6 et 24 mois d’âge. Après une incubation de 5 à 7 jours, les signes cliniques observés sont une hyperthermie, un abattement, une perte d’appétit, du jetage nasal et du larmoiement, des érosions buccales (présentes dans seulement 30 à 50 % des cas), des érosions digitées, de la diarrhée, une diminution de production laitière chez les femelles en lactation. Dans la plupart des cas, l’animal guérit. Il reste virémique pendant 15 jours voire 28 jours. • La forme néonatale : elle est responsable d’une immunodépression des jeunes animaux. Ils deviennent plus sensibles aux autres agents pathogènes. Le BVD assombrit donc le tableau clinique chez des jeunes individus présentant une entérite néonatale ou une pathologie respiratoire par exemple. • La forme génitale du BVD : cela peut se traduire par le phénomène de repeat-breeding ou par des avortements. Si la gestation va à son terme, le veau peut naître IPI, séropositif ou présenter des malformations. La maladie des muqueuses n’atteint que les animaux IPI. Elle survient brutalement sur des animaux entre 6 et 24 mois et peut être de forme aigüe ou chronique (Holliman, 2005). • La forme aigüe : elle entraîne un syndrome fébrile intense avec une hyperthemie importante (autour de 41°C), une tachypnée, une tachycardie et de l’anorexie. Il y a prostration intense, jetage muco-nécrotique, sialhorée et arumination. L’animal présente également une diarrhée aqueuse profuse et du tenesme. Il est possible d’observer des érosions circulaires dans la cavité buccale (palais, gencive, langue) mais aussi dans l’espace interdigité, au niveau du mufle, de la cavité nasale, de la vulve et des trayons. Pour 90% des cas, l’évolution est fatale dans un délai de 3 à 15 jours sans aucune réponse aux traitements mis en place. Pour les 10% restants, il y a passage à la chronicité. • La forme chronique : elle se caractérise par une alternance de diarrhée / constipation, de l’anorexie, un poil piqué, une mauvaise pousse de sabot. L’animal est dans un mauvais état général et meurt dans un délai de quelques mois dans un état de misère physiologique. Les lésions d’érosions n’apparaissent qu’en fin d’évolution. L’animal ne répond à aucun traitement. La Border disease est une maladie également due à un pestivirus de la famille des Flaviridae. Il est très proche du virus de la maladie des muqueuses des bovins et les matières virulentes ainsi que les modes de contamination et de transmission du virus sont identiques. Il existe plusieurs sérotypes. La pathogénicité varie d'une souche à l'autre. 162 Les symptômes observés chez les adultes dépendent du type de souche du virus (OIE, 2005) : • Pour les souches virulentes, les animaux présentent une asthénie générale, une baisse d'appétit et de production lactée. Certains animaux présentent une hyperthermie (> 41°) pendant 2 à 5 jours puis une hypothermie qui précéde la mort. Les signes cliniques généralement observés sont une diarrhée profuse et très liquide, nauséabonde, noirâtre et parfois hémorragique. Il peut y avoir du jetage et une pistaxis (3 % des cas). Le taux de mortalité est compris entre 5 et 20 %. • Pour les souches moins virulentes, des troubles de la reproduction sont observés. Ainsi, il peut y avoir des pertes embryonnaires précoces, caractérisées par des écoulements brunâtres au niveau de la vulve et entrainant un fort taux de brebis vides, mais des avortements peuvent survenir également dans le dernier tiers de la gestation avec expulsion de foetus plus ou moins momifiés. 3. La rhinotrachéite infectieuse bovine (IBR) L’IBR est une maladie virale du bétail provoquée par l’herpèsvirus bovin de type 1 (BoH-1). C’est un virus à ADN bicaténaire et à enveloppe lipoprotéique. Il appartient à la sous-famille des α-herpesvirinae qui ont la capacité d’entrer en latence dans les cellules nerveuses. Ces virus ont un cycle réplicatif court et une progression rapide. Il est classé dans la liste des dangers sanitaires de 2ème catégorie. En France, la situation épidémiologique au regard de l’IBR n’est pas homogène. Le pourcentage de troupeaux (laitiers et allaitants) infectés varie nettement en fonction des départements, la prévalence moyenne nationale étant de moins de 9% en 2011 (suite à la campagne annuelle 2010 - 2011). Le taux de prévalence de la maladie est sensiblement plus bas dans les régions à vocation laitière. En Europe, la situation est tout aussi variable puisque le Danemark, l’Autriche, la Finlande, la Suède, la province de Bolzano en Italie et certaines régions d’Allemagne (Haut-Palatinat et Haute-Franconie dans le Land de Bavière) sont officiellement indemnes, alors que les PaysBas ou la Belgique ont des taux de prévalence élevés. Au sein de l’Union Européenne, les pays ou régions indemnes peuvent imposer aux autres Etats membres des garanties spécifiques avant l’introduction de bovins sur leur territoire (contrôle sérologique individuel avant l’expédition). L’affection, qui touche essentiellement les bovins, se traduit par une atteinte des voies respiratoires supérieures, mais peut éventuellement prendre la forme d’encéphalites (veaux), de conjonctivites, d’avortements et de métrites. L’IBR n’est pas transmissible à l’homme. La contamination se fait de proche en proche par voie respiratoire et génitale. L’IBR peut se présenter sous plusieurs formes cliniques (Maillard, 2007 ; Williamson, 2008 ; Ali, 2012) : • La forme subclinique est très fréquente. • La forme respiratoire est fréquente. Elle apparaît 2 à 4 jours après l’infection de l’animal. Les principaux signes sont une fièvre importante (>40°), un abattement et un 163 écoulement nasal séreux puis mucopurulent. Des ulcérations de la muqueuse nasale et des surinfections bactériennes peuvent se développer. En l’absence de complications, la disparition des signes cliniques intervient généralement 15 jours après l’infection. L’évolution est souvent brève (24 à 36h) ou subaiguë (8 à 10j). Dans la plupart des cas il y a guérison. Dans de rares cas, s’il y a eu des complications pulmonaires avec des agents co-infectants (BVD ou Manhemia haemolytica), la maladie peut conduire à la mort de l’animal. • Autres formes. A noter une forme nerveuse, une forme oculaire, deux formes génitales (vulvo-vaginite pustuleuse et avortements) et une forme infectieuse généralisée qui touche les nouveaux nés de moins de 10 jours. Ces formes sont beaucoup plus rares que les formes subclinique et respiratoire. La réaction immunitaire, qui apparaît entre 10 et 35 jours après l’infection, fait cesser les symptômes et l’excrétion virale, mais conduit à une phase de latence du virus. Les animaux infectés deviennent alors porteurs asymptomatiques du virus. A l’occasion d’un stress ou d’un traitement médical, tout animal infecté est susceptible de réactiver et de réexcréter le virus et de contaminer ainsi les autres animaux du troupeau. En France, l’IBR est une maladie réglementée par l’Etat depuis 2006. Il est obligatoire de : • réaliser un dépistage sérologique à l’introduction pour l’ensemble des bovins quel que soit leur âge, • réaliser un dépistage sérologique des effectifs bovins, semestriel sur lait de tank dans les élevages laitiers, et annuel sur prélèvement sanguin des bovins de plus de 24 mois dans les élevages allaitants, • vacciner les bovins pour lesquels un résultat sérologique s’est révélé positif ; cette vaccination doit être réalisée dans les 2 mois suivant la notification du résultat à l’éleveur. 4. La fièvre aphteuse La fièvre aphteuse est une maladie appartenant à la liste des dangers sanitaires de 1ère catégorie. Elle est causée par un picornavirus du genre des Aphtovirus qui comprend 7 sérotypes et 60 sous-types. Elle touche tous les mammifères bi-ongulés (bovin, ovin, caprin et porcin). La contagion est très rapide et la morbidité dans les zones naïves est très élevée. La mortalité sur les jeunes veaux est une caractéristique de la maladie. La virémie initiale entraîne hyperthermie, anorexie et apathie. A ce stade d’évolution de la fièvre aphteuse, les signes cliniques sont semblables au SBV aigu. Ensuite, elle se caractérise par l’apparition de vésicules caractéristiques et d’érosions sur les muqueuses buccales, nasales, mammaires et sur les onglons (au niveau du bourrelet coronaire et entre les espaces interdigités). L’animal manifeste alors des signes qui dépendent de la localisation des lésions. Ceux-ci sont répertoriés dans le tableau suivant. 164 Tableau 33 : Signes observés sur les animaux en fonction de la localisation des lésions (Du Terrail, 2008) Localisation des lésions Conséquences Espaces interdigités, talons, bourrelet coronaires • Boiteries sévères • Difficultés à se déplacer Muqueuses nasales • Ecoulement nasal • Tendance à se lécher le mufle Muqueuses buccales • Salivation • Difficulté à la préhension de nourriture Trayons • Augmentation du temps de traite (mammite) La régression des lésions est en général rapide, laissant place à des plages décolorées sur l’épithélium. 5. La leucose bovine enzootique La leucose bovine enzootique (LBE) est une maladie contagieuse des bovins due à un virus de la famille des Retroviridae. Elle est classée dans la liste des dangers sanitaires de 2ème catégorie. La France est officiellement indemne de LBE depuis 2003. Dans les conditions naturelles, elle affecte exclusivement les bovins. La maladie est inconstante, survient sur un faible nombre d'animaux infectés (1 à 5 animaux atteints de tumeurs pour 100 bovins infectés), toujours sur des bovins âgés de plus de 2 ans, avec un pic d'incidence entre 5 et 8 ans. Elle présente deux formes (Gourreau, 2008) : • Une forme classique : elle débute par des symptômes généraux non spécifiques (asthénie, amaigrissement, polypnée, tachycardie, anémie, tarissement de la sécrétion lactée, parfois légère hyperthermie). Ensuite, la phase d'état est marquée par l'aggravation des symptômes généraux et surtout l’apparition des symptômes locaux matérialisés par l'hypertrophie (parfois considérable) des ganglions superficiels et profonds. Ces hypertrophies peuvent provoquer des symptômes fonctionnels variés (dyspnée, dysphagie, stase jugulaire et/ou œdème lors d'atteinte des ganglions trachéobronchiques ou médiastinaux et iliaques, parésie après compression par les ganglions iliaques, etc.) et des symptômes liés à l'infiltration tumorale de différents viscères (stase veineuse, insuffisance cardiaque en cas d’atteinte du myocarde, diarrhée avec melæna en cas d’atteinte de la caillette, exophtalmie en cas d’atteinte du conjonctif rétro-orbitaire, paraplégie en cas d’atteinte épidurale, etc.). La mort inexorable survient en quelques semaines. • Des formes atypiques : dans ces cas, seuls apparaissent les symptômes généraux et les symptômes fonctionnels liés à certaines localisations tumorales isolées. 165 6. La peste des petits ruminants La peste des petits ruminants (PPR) est une maladie contagieuse affectant les caprins et les ovins, due à un virus de la famille des Paramyxoviridae. Elle se traduit par une atteinte fébrile de l’état général et des lésions inflammatoires et ulcéro-nécrotiques des muqueuses superficielles et profondes associées notamment à une stomatite et une gastroentérite. En France, elle est classée dans la liste des dangers sanitaires de 1ère catégorie. Elle est reconnue actuellement dans tous les pays d'Afrique sahélienne, au Moyen Orient (Arabie Saoudite, Sultanat d'Oman) et en Inde. La sensibilité des ovins et des caprins n'est pas identique : les chèvres sont plus sensibles (formes graves) que les ovins (formes subaiguës ou inapparentes). L’infection est inapparente chez les bovins. Plusieurs formes sont décrites (Holliman, 2005 ; Williamson, 2008) : • Une forme suraigüe (chèvres) caractérisée par une forte hyperthermie (41-42° C), un état typhique, une congestion et une nécrose des muqueuses buccales avec une salivation importante, une inflammation des muqueuses nasales (jetage) et oculaires (larmoiement) et une diarrhée profuse (non hémorragique). La mort survient en 5 à 10 jours. • Une forme aiguë caractérisée par les mêmes signes cliniques que la forme suraigüe mais l’évolution est plus lente (8 à 10 jours) et la guérison est possible. Il y a de nombreuses complications possibles comme les avortements ou les bronchopneumonies. • Forme chronique caractérisée par des symptômes identiques mais moins prononcés ainsi que par une éruption papulo-pustuleuse à la périphérie de la cavité buccale et des narines. 7. La dysenterie hivernale La dysenterie hivernale, également appelée entérite hémorragique ou entérite hivernale ou en anglais « winter dysentery », est une maladie virale infectieuse due à un coronavirus. Elle est très contagieuse chez les bovins adultes avec un tropisme digestif, évoluant sur un mode épizootique. En effet, jusqu’à 70% des animaux d’un troupeau sont touchés en une semaine, et cela peut aller jusqu’à 100%. Elle est de répartition mondiale. C’est une maladie affectant surtout les bovins adultes à la rentrée à l’étable en hiver. Elle est due à la multiplication virale dans la paroi intestinale. C’est une maladie peu grave et de guérison spontanée. Au niveau clinique, elle est caractérisée par un syndrome fébrile qui précède l’apparition d’une diarrhée aqueuse, très abondante, fétide, plus ou moins hémorragique (sang en nature) pendant 5 à 6 jours ainsi qu’une anorexie et un abattement. La chute de la production laitière est importante sur plusieurs jours (L'institut de l'élevage, 2008). Les symptômes occasionnels sont du jetage nasal et une toux légère. 166 8. La maladie hémorragique epizootique La maladie hémorragique épizootique du cerf est une maladie infectieuse transmise exclusivement par des arthropodes piqueurs du genre Culicoïdes et due à un virus de la famille des Reoviridae. Dans les conditions naturelles elle affecte essentiellement les cervidés. L'infection est le plus souvent inapparente chez les bovins et les ovins. Elle n'affecte pas l'Homme. Cette maladie concerne les Etats-Unis (où dominent les sérotypes 1 et 2), le Canada (sérotype 1 essentiellement) le Nigeria et l’Australie. L’Europe est indemne (Ali, 2012). Elle se traduit cliniquement par une atteinte fébrile de l’état général associée à une stomatite et des boiteries Son importance réside dans ses analogies avec la FCO. En France, elle est classée dans la liste des dangers sanitaires de 2ème catégorie. Il existe différentes formes cliniques de la maladie avec des symptôme identiques à ceux de la FCO : • une forme suraiguë caractérisée par une hyperthermie (41°C), une atteinte importante de l'état général, parfois un œdème de la tête et du cou. Des symptômes liés à l'inflammation des muqueuses buccales (stomatite avec hypersalivation) nasale (jetage) et oculaire (conjonctivite, larmoiement) finissent par apparaître. L’évolution est mortelle en 8 à 36 heures, avec éventuellement un œdème aigu du poumon et avec apparition, au bout de quelques jours, de symptômes podaux ou musculaires. • une forme aiguë et une forme subaiguë caractérisées par les mêmes symptômes que la forme suraigüe. L’évolution est plus lente et les symptômes locaux sont plus nets. Les lésions hémorragiques sont suivies d'ulcérations, d’une glossite nécrotique, de complications respiratoires (pneumonie) ou digestives (diarrhée). Enfin, une boiterie consécutive à une atteinte podale (coronite, pododermatite) et musculaire (myosite) peut apparaître. L’amaigrissement est important et des avortements sont possibles. La guérison est possible. • une forme inapparente. C’est la forme la plus fréquente chez de nombreux cervidés et chez les bovins (atteinte clinique possible, mais rare) et les ovins. Cette maladie est cliniquement indifférenciable de la fièvre catarrhale ovine. Il faut alors avoir recours à des tests virologiques ou sérologiques (Ali, 2012). 9. La fièvre de la vallée du Rift La fièvre de la vallée du Rift est une maladie infectieuse affectant en particulier les ruminants et l’Homme. Transmise par une grande variété de moustiques, elle est due à un virus de la famille des Bunyaviridae. C'est un arbovirus qui comporte un seul sérotype. La maladie se traduit chez les ruminants par différents tableaux cliniques, en particulier des septicémies rapidement mortelles chez les jeunes et des avortements chez les adultes. Au plan anatomo-clinique, elle est caractérisée par une hépatite nécrosante et des lésions hémorragiques. 167 La maladie s’exprime essentiellement chez les petits ruminants (ovins, caprins) et les bovins. D’autres espèces domestiques (camélidés, chevaux, carnivores, porcs) peuvent être infectées, mais de façon inapparente (virémie transitoire). De nombreuses espèces sauvages sont aussi réceptives. Elle affecte l’Homme. La maladie est aujourd’hui enzootique dans la plupart des pays africains situés au sud du Sahara où elle est responsable d'épizooties meurtrières, en particulier chez les ovins. La morbidité peut atteindre 90 à 100%. La mortalité peut atteindre 90 à 100 % chez les très jeunes animaux et 10 à 20 % chez les adultes (100 000 ovins morts en Afrique du Sud en 1950, 60 000 au Zimbabwe en 1978) avec de nombreux avortements (jusqu’à 80% des femelles gestantes). C’est une zoonose majeure souvent mortelle (plusieurs milliers de personnes atteintes et plus de 600 cas mortels lors de l'épizootie d'Egypte en 1977). En France, elle est classée dans la liste des dangers sanitaires de 1ère catégorie et elle est considérée comme maladie possiblement émergente dans le bassin méditerranéen. Il existe trois formes (Gerdes, 2004) : • une forme suraigüe, qui concerne les nouveaux-nés et les jeunes de moins de 3 semaines. Elle entraîne une hyperthermie (41°-42°C) qui est suivie d'un coma et de la mort en 12 à 36 heures. Certains animaux présentent un ictère, une diarrhée hémorragique, de l’hématurie et un jetage. • une forme aigüe, qui concerne les adultes et les jeunes de plus de 3 semaines. Elle entraîne une hyperthermie et des avortements. Sur certains animaux il est possible d’observer un jetage, une diarrhée, de l’anorexie, une asthénie et parfois un ictère. Le taux de mortalité peut atteindre 20 à 30%. De plus, il peut y avoir des séquelles d'infécondité après la guérison. • une forme subaigüe caractérisée par des avortements 2 semaines après l’infection. 10. La salmonellose La salmonellose est une maladie infectieuse inoculable et contagieuse due à une entérobactérie ubiquitaire du genre Salmonella. C’est une zoonose. La salmonellose bovine se caractérise par un grand polymorphisme. L’expression clinique et la gravité des symptômes diffèrent essentiellement selon les conditions d’élevage et le sérovar contaminant. Plusieurs formes peuvent être observées chez les adultes (L'institut de l'élevage, 2008) : • 168 Une forme digestive : les adultes, essentiellement des vaches laitières très productives, présentent avant même les signes digestifs de l’hyperthermie (41°C), une diminution de l’appétit et de la rumination. La diarrhée est profuse et fait suite à une incubation d’un à quatre jours après l’exposition. Des coliques et une dysenterie sévère sont en général observées avec S. enteritidis sérovar Dublin ou sérovar Typhimurium. L’entérite salmonellique est toujours accompagnée d’une baisse de la sécrétion lactée. Le taux de morbidité peut atteindre 25% et la mortalité est élevée en l’absence de traitement. • Une forme abortive : cette forme est essentiellement liée à l’infection par Salmonella Dublin. Ce sérovar entraîne des avortements survenant entre le 124ème et le 270ème jour de gestation et plus généralement entre le 160ème et le 180ème jour. Il est à noter qu’il existe également une forme respiratoire chez les adultes. Cependant, elle reste rare. 11. La fièvre charbonneuse La fièvre charbonneuse (FC) (ou charbon bactéridien) est une maladie infectieuse d'origine tellurique affectant les mammifères, principalement les herbivores, et transmissible à l'Homme. Elle est due à une bactérie, Bacillus anthracis, et appartient à la liste des dangers sanitaires de 1ère catégorie. Chez les ruminants, elle se présente généralement sous la forme d'une maladie aiguë, septicémique, évoluant rapidement vers la mort avec des symptômes généraux, circulatoires, digestifs et urinaires. Les lésions principales sont celles d'une septicémie hémorragique associée, en particulier, à une hypertrophie et un ramollissement de la rate et une modification de l'aspect du sang devenu noir et incoagulable. C’est une maladie spécifique à certaines régions de France qui est susceptible de provoquer des pertes importantes par mortalité du bétail. Elle est souvent jugulée par la pratique de la vaccination. Des foyers sont régulièrement diagnostiqués en France (114 foyers dénombrés entre 1980 et 2000 dans 23 départements). Chez les bovins, plusieurs formes sont décrites (L'institut de l'élevage, 2008) : • Une forme aiguë appelée charbon septicémique : elle est caractérisée par une atteinte brusque de l'état général avec des frissons, une hyperthermie (41-42°C) et un arrêt de la sécrétion lactée. En 12 à 24 heures, il y a développement de troubles respiratoires et circulatoires (dyspnée, accélération du rythme cardiaque, congestion puis cyanose des muqueuses et parfois ecchymoses), éventuellement digestifs (coliques et diarrhée avec selles sanguinolentes, épreintes, ténesme) et plus tardivement urinaires ("pissement de sang"). La mort survient en 2 à 3 jours. • Des formes suraiguës : les mêmes symptômes que pour la forme aigüe sont observés mais ils sont plus intenses et la mort survient en 6 à 12 h. • Des formes subaiguës : le charbon "externe" ou charbon "à tumeur" débute par une réaction œdémateuse atteignant en quelques heures 20 à 30 cm de diamètre, chaude, douloureuse, non crépitante, localisée le plus souvent à la gorge ou à l'entrée de la poitrine. Les mêmes symptômes que pour la forme aigüe sont observés mais ils sont moins intenses et la mort survient généralement en 4 à 5 jours. La guérison est rare. • Des formes frustes : caractérisées par une atteinte fébrile transitoire. Les symptômes de la fièvre charbonneuse chez les ovins sont similaires à ceux des bovins. Cependant, les formes suraiguës sont plus fréquentes et les signes urinaires plus marqués et plus précoces. 169 La fièvre charbonneuse entre donc dans le diagnostic différentiel des affections rapidement mortelles. Cependant, en début d’évolution, les signes cliniques observés sont comparables à ceux observés en cas de SBV aigu. Pour ce dernier, les symptômes sont tout de même bien moins intenses et ne provoquent pas la mort. 12. Les maladies transmises par les tiques Ces maladies sont majoritairement transmises en France par des tiques du genre Ixodes ricinus. Elles sont toutes à l’origine d’un syndrome fébrile caractérisé par un appétit capricieux, une hyperthermie, de l’abattement et une chute de production lactée. Cependant, comme le montre le tableau ci-après, elles entrainent également des symptômes plus spécifiques. Le tableau suivant regroupe les symptômes observés pour chaque maladie. Tableau 34 : conséquences cliniques des maladies transmises par les tiques chez les ruminants Maladie Babésiose Agent(s) Babesia responsable(s) divergens Signes cliniques 170 • • • • • anémie hématurie ictère diarrhée avortement possible Anaplasmose Erlichiose Maladie de Lyme Chez les bovins : Anaplasma marginale, A. centrale Chez les ovins : A. ovis Anaplasma phagocytophilum Borelia burdorferi • anémie • ictère • avortement possible • engorgement des pâturons (dans 10 % des cas) • dyspnée • toux • jetage nasal mucopurulent • avortement possible • arthrite • diarrhée • avortement possible Annexe 5 : Affections à prendre en compte dans le diagnostic différentiel du SBV congénital chez les ruminants Cette annexe présente quelques caractéristiques cliniques et épidémiologiques de certaines affections entrant dans le diagnostic différentiel du SBV congénital chez les ruminants. 1. La diarrhée virale bovine (BVD) et la border disease La BVD Chez le veau infecté in-utéro, il faut prendre en compte la forme congénitale du SBV. Elle peut se traduire par des avortements ou, si la gestation va à son terme, par la naissance de veaux IPI, de veaux séropositifs ou de veaux présentant des malformations. Cela dépend du stade de gestation au moment où la femelle gestante non immunisée contre le BVD est inféctée. Les veaux malformés peuvent présenter des signes nerveux avec des tremblements, une ataxie, une démarche ébrieuse. Les lésions nerveuses peuvent être de type microencéphalie, hypoplasie cérébelleuse, hydranencéphalie, hydrocéphalie, myélinisation défectueuse. Ils peuvent également présenter des signes oculaires avec une cataracte, une dégénérescence rétinienne, une névrite du nerf optique et des anomalies du poil (hypothrichose, alopécie) (Smith, 2009). La border disease Concernant la border disease chez les ovins, il faut également considérer sa forme congénitale dans le diagnostic différentiel du SBV congénital. Elle peut se manifester par des avortements dans le dernier tiers de la gestation avec expulsion de foetus plus ou moins momifiés, ou par la naissance d’agneaux normaux, de mort-nés et d’agneaux faibles et petits qui présentent certaines anomalies (OIE, 2005). Il est à noter que l’animal qui présente des malformations congénitales est exceptionnellement IPI. Il est le plus souvent séropositif, vironégatif. 171 Tableau 35 : Anomalies rencontrées chez le veau lors de BVD congénital et chez l’agneau lors de border disease congénital (Smith, 2009) Manifestations Organes BVD Système nerveux • • • • • • Microencéphalie Porencéphalie Hydrocéphalie Hydranencéphalie Hypoplasie cérébelleuse Myélinisation défectueuse Œil • Atrophie et dysplasie rétinienne • Névrite optique • Cataracte • Microphtalmie • Kératite interstitielle Système immunitaire • Hypoplasie thymique Peau Système musculosquelettique Appareil respiratoire Border disease • Tremblements • Amaurose • Nystagmus • Hypotrichose • Alopécie • Coloration anormale (agneaux hirsutes) • Dermatite • • • • • Membres courts et fins avec arthrogrypose des genoux et des jarrets • Membres trop longs et faiblesse des paturons • Dos arqué • Mâchoire inférieure raccourcie • Front bombé Brachygnatie Retard de croissance Anomalies osseuses Syndrome du veau faible • Hypoplasie pulmonaire 2. La fièvre catarrhale ovine La forme congénitale de la FCO se manifeste à la fois chez les bovins et chez les ovins. Les signes cliniques les plus fréquemment observés chez les nouveaux nés sont : l’opisthotonos, la naissance d’animaux aveugles, des postures anormales avec déformation des membres, une démarche non contrôlée avec marche en cercle et des anomalies du comportement (veaux mous). 172 Le comportement des ces veaux a été décrit récemment comme « dummy syndrome » ou « veau mou » ou « veau idiot » en français. Cette description regroupe tous les signes d’hébétitude, d’hypoactivité, de cécité et d’aréflexie de la tétée. Cela est également valable pour les agneaux (Vercauteren, 2008). A l’autopsie, la plupart de ces animaux montrent une hydranencéphalie ou, a minima, une encéphalopathie cavitaire. Les lésions nerveuses primaires entraînent parfois des lésions généralisées secondaires : diarrhée et émaciation, pneumonie par fausse déglutition, etc. (Vercauteren, 2008). Comme le montre le tableau ci-après, les manifestations de la forme congénitale de la FCO dépendent du stade de gestation au moment de l’infection. Tableau 36 : Effets de l’infection in-utero du fœtus bovin par le virus de la FCO en fonction du stade de gestation (Belbis, 2009) Stade de gestation Lésions macroscopiques Avortement ou naissance avec de graves troubles du comportement et de la locomotion entrainant un décès rapide ou l’euthanasie Virologie : - (ou +) Sérologie : - Nécrose cérébrale massive, malformations du SNC (hydranencéphalie ou encéphalopathie cavitaire, destruction du cervelet et du tronc cérébral) Avortement ou naissance avec de graves troubles du comportement et de la locomotion variables Virologie : - (ou +) Sérologie : - Destruction séléctive des cellules gliales entraînant des kystes cérébraux et une dilatation des ventricules latéraux Naissance d’un veau asymptomatique ou avec des déficits mineurs Virologie : + (ou -) Sérologie : - avant 175 jours et + après 175 jours Naissance d’un veau normal Virologie : + Entre 70 et 85 Malformation du SNC (Hydranencéphalie) jours Après 130 jours Statut immunitaire Mortalité embryonnaire ou foetale Avant 70 jours Entre 85 et 130 jours Conséquences cliniques Encéphalite modérée, Près du terme absence de malformations 173 3. La maladie d’Akabane Le virus Akabane est un virus du même sérogroupe que le SBV et qui a également un mode de transmission vectorielle. Le virus n’est actuellement pas présent en Europe. L’infection du bovin après sa naissance est asymptomatique mais le passage transplacentaire du virus à certains stades de gestation est responsable d’avortement, de mortinatalité, de naissance prématurée et de malformations congénitales. Les malformations observées dépendent du stade de gestation où survient l’infection (Ali, 2012). L’arthrogrypose est observée après une infection entre 4 et 6 mois de gestation. Elle touche 30 à 50% des veaux infectés. Les veaux meurent en période néonatale. L’hydranencéphalie est observée après une infection entre 3 et 4 mois de gestation. Ceci est une conséquence de l’encéphalomyélite, de la polymyosite, de l’hydrocéphalie, des lésions spongiformes et de l’atteinte de neurones moteurs. Les veaux ne présentant que cette pathologie peuvent survivre quelques semaines à quelques mois. 4. L’IBR et autres herpesvirus La forme génitale de l’IBR peut entraîner des avortements mais cela reste peu fréquent. Les avortements interviennent alors à la jonction entre le deuxième et le troisième tiers de gestation (Ali, 2012). L’herpèsvirus bovin de type 4 (BoH-4) semble également jouer un rôle dans les avortements chez les bovins. En effet, même si la plupart des isolements de BoH-4 sont considérés comme peu ou pas pathologiques, des anticorps contre ce virus sont retrouvés plus fréquemment chez les animaux ayant avorté que chez les animaux cliniquement normaux (Ali, 2012). 5. La fièvre de la vallée du Rift Chez l’adulte, lors d’épisodes cliniques, le virus peut entraîner des avortements. Ils sont fréquents (40 à 100% de prévalence) avec des fœtus souvent autolysés et présentant une hépatite sévère. Certaines lignées virales sont susceptibles d’entrainer des malformations fœtales (Gerdes, 2004). 6. La néosporose à Neospora caninum La néosporose est une maladie causée par un protozoaire du groupe des Apicomplexa : Neospora caninum. L’inféction par N. caninum est particulièrement répandue chez les bovins. Elle est associée à des avortements et des infections congénitales dans de nombreux pays. La seule expression clinique observée chez la vache infectée est le retour prématuré en chaleurs ou un avortement apyrétique et sans rétention placentaire. Les avortements semblent se produire plus fréquemment entre 5 et 7 mois de gestation. Dans de rares cas le fœtus arrive à terme. Si le veau n’est pas mort-né, l’infection congénitale est le plus souvent asymptomatique. Elle se traduit occasionnellement par des troubles 174 nerveux dont les principaux signes cliniques sont : parésie, paralysie, faiblesse des membres postérieurs, ataxie, anomalies de développement (petite taille, arthrogrypose, malformation de la moelle, déviation de la colonne vertébrale, déviation ventro-médiale des yeux). Les signes cliniques peuvent être présents dès la naissance ou apparaître plus tard (entre 3 jours et 2 semaines) (Marquer, 2000). Pour le diagnostic, certaines méthodes permettent la mise en évidence du parasite comme l’histologie, l’immunohistochimie et la PCR. Des analyses sérologiques sont également réalisables telles l’immunofluorescence indirecte, les tests ELISA et l’agglutination directe. 7. La toxoplasmose à Toxoplasma gondii Toxoplasma gondii est un protozoaire intracellulaire obligatoire appartenant au phylum des Apicomplexa, responsable d’avortements chez les ovins et caprins, plus rarement chez les bovins. Les fœtus présentent des lésions d’encéphalomyélite non suppurée, aboutissant dans certains cas à des malformations du SNC comme l’hydranencéphalie et l’hydrocéphalie. Certains fœtus peuvent présenter une pneumonie, une myocardite ou une hépatite (Smith, 2009). 8. Les substances toxiques Lupinus sp. Certaines espèces de lupin renferment des alcaloïdes toxiques et tératogènes. L’intoxication chez les bovins entraîne de la faiblesse musculaire et de l’ataxie. Chez une vache gestante, cela peut provoquer de la mortalité embryonnaire. Si l’ingestion a lieu entre le 40ème et le 100ème jour de gestation, cela entraîne des malformations fœtales telles que de l’arthrogrypose, des torticolis, des scolioses et des fentes palatines (Panter, 1999). La ciguë, Conium maculatum La ciguë contient des alcaloïdes pipéridines. Les effets toxiques et tératogènes de cette plante sont similaires à ceux du lupin. Les malformations fœtales surviennent lorsque l’intoxication a lieu entre le 55ème et le 75ème jour de gestation (Panter, 1999) Nicotina sp. L’ingestion de Nicotina sp., en particulier N. tabacum et N. glauca, a également un effet toxique et tératogène, du à la présence d’alcaloïdes pipéridines. Expérimentalement, l’alimentation de vaches par N. glauca pendant leur gestation entraîne la survenue de fentes palatines et d’arthrogrypose sur les fœtus. L’intoxication naturelle est très peu fréquente (Panter, 1999). Astragalus et Oxytropis sp. Elles provoquent une contracture des membres chez les veaux, et sont également responsables de mort fœtale et d’avortement. 175 Sorghum sp. L’ingestion de Sorghum sp. par les femelles en fin de gestation peut entraîner des anomalies congénitales sur le fœtus. Les animaux atteints ont les membres thoraciques et pelviens en extension permanente. Intoxication par les champignons L’ingestion de paille de céréale moisie ou de foin moisi peut provoquer de la mortalité chez les adultes. L’ingestion par des femelles gestantes peut donner naissance à des veaux présentant des anomalies. Parmi ces anomalies, à noter la parésie ou paralysie postérieure congénitale, un raccourcissement des membres avec une laxité articulaire, un brachygnatisme et des déformations du crâne. Certains veaux sont normaux à la naissance mais développent en deux semaines à deux mois une ataxie postérieure progresive. Les analyses des fourrages incrimminés aboutissent généralement à l’isolement de champignons du genre Penicillium, Fusarium ou Acremonium. L’affection est probablement causée par la présence d’une ou plusieurs mycotoxines (Ribble, 1993). 9. Carence maternelle en vitamine A Il s’agit d’une carence alimentaire en vitamine A (aussi appelée rétinol) ou en β-carotène (son précurseur). Elle est rare. Pour les ruminants, la meilleure source de carotène est l’herbe verte. L’affection est plus fréquente en cas de ration hivernale non supplémentée, de ration d’engraissement ou de pâturage estival prolongé. Dans de rares cas, une mère gestante peut être concernée par cette carence et donner naissance à un nouveau-né carencé lui aussi. La plupart des nouveaux-nés sont mort-nés, mais ceux qui naissent vivants sont aveugles, avec les pupilles très dilatées. Les réflexes photomoteurs sont absents à cause d’une dégénerescence de la rétine et du nerf II. La majorité des veaux aveugles présentent un bombement du front. La plupart sont faibles, incapables de téter et de se lever. Occasionnellement, ils peuvent présenter une exophtalmie, de l’incoordination, du nystagnus ou des convulsions. Généralement, les veaux meurent dans les 3 premiers jours (Smith, 2009). 10. Origine héréditaire : encéphalopathie héréditaire, dysmyélinies, abiotrophie des cellules de purkinje Ces maladies sont rares. Il ne faut y penser qu’après avoir éliminer les autres causes de malformations congénitales telles la BVD et la néosporose. Ces origines héréditaires sont notamment à rechercher lorsque les malformations touchent certaines lignées. 176 Annexe 6: Critères applicables à l’inscription des maladies, des infections et des infestations listées par l’OIE (OIE, 2013b) Une maladie, une infection ou une infestation doit répondre à chacun des critères suivants pour être inscrite sur la liste des maladies à déclaration obligatoire déterminée par l’OIE. 1 Une propagation internationale de l'agent pathogène (par l'intermédiaire d'animaux vivants ou de produits qui en sont issus, de vecteurs ou d’objets inanimés contaminés) a été prouvée. 2 Au moins un pays a démontré l'absence effective ou imminente de la maladie, de l'infection ou de l’infestation dans les populations d'animaux sensibles, en vertu des dispositions du Code terrestre sur la surveillance de la santé animale, notamment de celles du chapitre 1.4. • Une transmission naturelle à l'homme a été prouvée, et l'infection humaine est associée à des conséquences graves. • L'expérience indique que la maladie a provoqué une morbidité ou une mortalité significative chez les animaux domestiques au niveau d'un pays ou d'une zone. • Il a été montré que la maladie provoquait une morbidité ou une mortalité significative dans les populations d'animaux sauvages, ou bien il existe des informations scientifiques en ce sens. • Il existe une méthode de détection et de diagnostic fiable ainsi qu'une définition de cas suffisamment explicite pour identifier clairement la maladie, l'infection ou l’infestation et la distinguer des autres. • Il s'agit d'une maladie ou d'une infection émergente présentant des caractères zoonotiques manifestes, ou se propageant rapidement, ou produisant une morbidité ou une mortalité significative, et il existe une définition de cas qui permet d'identifier clairement cette maladie ou infection et de la distinguer des autres. ou 3 ou ou 4 177 178 179 DEFFONTAINES MARTIN Le virus Schmallenberg : conditions d'émergence et de dissémination ; épidémiologie de la maladie induite par ce nouveau virus ; conséquences cliniques, lésionnelles et moyens de lutte. Thèse d’Etat de Doctorat Vétérinaire : Lyon, 8 novembre 2013 RESUME : L’Europe a vu l’émergence d’un nouvel arbovirus appartenant à la famille des Bunyavirus au cours de l’été 2011. Ce virus, nommé virus Schmallenberg, s’est disséminé rapidement à travers de nombreux pays et a été à l’origine de vagues de malformations congénitales chez les ruminants domestiques. L’apparition de ce virus a entraîné la mise en place d’une surveillance épidémiologique de la maladie et de nombreuses études portant sur le sujet ont été menées afin d’apporter des connaissances sur la biologie du virus. Ce travail rassemble les connaissances actuelles sur l’épidémiologie, la biologie et les conséquences de ce virus, deux ans après son émergence. MOTS CLES : - Orthobunyavirus - Epidémiologie - Maladies infectieuses - Relations virus-vecteur - Arthrogrypose multiple congénitale JURY : Président : Monsieur le Professeur BERLAND 1er Assesseur : 2ème Assesseur : Monsieur le Professeur PEPIN Monsieur le Professeur GUERIN DATE DE SOUTENANCE : 8 novembre 2013 ADRESSE DE L’AUTEUR : 12 rue de la Molaise - Bourbilly 21140 Vic de Chassenay 180