Infections INTRA-ABDOMINALES et TOXI

Dr Raphaël GUIHÉNEUF
Assistant Hospitalier-Universitaire
LABORATOIRE DE BACTÉRIOLOGIE - CENTRE DE BIOLOGIE HUMAINE
[e-mail]
FLORE DIGESTIVE & INFECTIONS
INTRA-ABDOMINALES
Amiens 12 octobre 2016
UE AGENTS INFECTIEUX & HYGIÈNE
DFGSM 3

OBJECTIFS
Composition et rôle de la flore digestive
Bases microbiologiques des infections intra-abdominales
Diagnostic bactériologique des péritonites & bases du traitement
Déséquilibre de la flore digestive et diarrhées post-antibiotiques
Items iECN :
N° 274. Lithiase biliaire et complications : diagnostiquer une lithiase biliaire et ses
complications.
N° 277. Ascite : argumenter les principales hypothèses diagnostiques et justifier les
examens complémentaires pertinents
N° 284. Diverticulose colique et diverticulite aiguë du sigmoïde
N° 326. Prescription et surveillance des classes de médicaments les plus courantes
chez l'adulte et chez l'enfant. Connaître […], les principaux effets indésirables et
interactions
N° 352. Péritonite aiguë chez l'enfant et chez l'adulte

PLAN
I. Composition et rôle du microbiote digestif
II. Agents digestifs à risque pathogène
Bactériologie
Sensibilité aux anti-infectieux
III. Péritonites :
Classifications
Péritonites primaires (ILA)
Péritonites secondaires
Péritonites tertiaires
IV. Diarrhée post-antibiotique :
•Infection à Clostridium difficile
•Autres déséquilibres de la flore

I. FLORE DIGESTIVE
Composition et quantité variable selon le niveau
Estomac : contenu stérile en théorie (barrière pH acide) - 102-105/ml
Duodénum-jéjunum : 102-104/ml
Iléon 104-107/ml
Colon 109-1011/g, prédominance anaérobies (1/1000)
Fécès : 109-1012/g (40% du poids)
Microbiote : ensemble micro-organismes formant un éco-système
chez un hôte
bactéries, virus, bactériophages, levures et archées
Cultivable et non cultivable
Fraction cultivable : flore

COMPOSITION DU MICROBIOTE DIGESTIF
Etage sus-duodénal : prédominance de bactéries à Gram positif,.,
Streptococcus spp. α-hémolytiques, Lactobacillus spp … (pH acide)
Etage sous-mésocolique :
Flore intestinale (duodénum-jéjunum): pH neutre, diminution O2
Prédominance espèces aéro-anaérobie facultatives (AAF) : E. coli (60-70%),
Enteroccocus spp. (10-30%), Lactobacillus spp.
Flore iléo-colique :
99% anaérobies, Bacteroides du groupe fragilis, Clostridiales (côlon +++)
1% flore sous-dominante AAF
Flore de portage : autres Enterobacteriaceae, Candida, Pseudomonas aeruginosa