La plateforme de génétique moléculaire des cancers d`Aquitaine

La plateforme de génétique moléculaire
des cancers d’Aquitaine
Lapeyrère N.1, Hostein I.2, Carrère N.3, Chibon F.2, Cappelen D.3, Dubus P.3, Coindre JM.2, Soubeyran I.2, Merlio JP.3
1Réseau de Cancérologie d’Aquitaine, Bordeaux, 2Département de pathologie, Institut Bergonié, Bordeaux, 3Service de biologie des tumeurs, Hôpital du Haut
Levêque, CHU de Bordeaux
PGMC d’Aquitaine regroupe 2 plateaux
•au CHU de Bordeaux : service de Biologie des Tumeurs (Pr Merlio), d’Hématologie Biologique (Pr Mahon) et de Pathologie (Pr A Vital)
•à l’Institut Bergonié : unité de Pathologie Moléculaire (Dr I Soubeyran), du département de Pathologie (Dr Mac Grogan) et le service
é
Action 21.2 de la Mesure 21 plan Cancer 2009-2013 soutenir 28 plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers (PGMC)
permettre l'accès aux tests moléculaires pour le diagnostic
permettre la prescription de traitements ciblés ou le suivi de des cancers et de leur traitement
d’H
é
matolo
g
ie (Dr Durrieu)
Pathologiste Envoi d’un bloc + lame colorée + fiche de prescription PGMC
Analyses moléculaires sur :
•
tumeurs solides (cancer du poumon cancer colorectal cancer du sein cancer de l
’
estomac cancer gynécologique
Inscrites à la
nomenclature
ou bénéficiant
d
’
u
n
Nombre de patients ayant bénéficié d’une analyse moléculaire réalisée à la PGMC Aquitaine en 2010, selon le type de tumeurs
•
tumeurs
solides
(cancer
du
poumon
,
cancer
colorectal
,
cancer
du
sein
,
cancer
de
lestomac
,
cancer
gynécologique
,
cancer de la thyroïde, glioblastome, tumeur gastro-intestinale, sarcomes)
• tumeurs hématologiques (leucémies, lymphomes et syndromes lymphoprolifératifs, syndromes myélodysplasiques et
myéloprolifératifs)
du
financement
INCa
2150
5605
26
993
Tumeur digestive
Tumeur onco-hématologique
128
43
24
1333
834
2150
3
12
126
549
53
686
Tumeur de la thyroïde
Tumeur cérébrale
Mélanome
Tumeur mammaire
Tumeur pulmonaire
Tumeur conjonctive
FISH
BIO MOL
Demande d’examens par
les établissements internes à la PGMC (57 %)
des établissements privés aquitains (18 %)
dont les DOM-TOM = 9 % des demandes d’EGFR et
14 % des demandes de KRAS
Activité 2010
10
15
41
20
0 1000 2000 3000 4000 5000 6000
Mastocytose
Tumeur gynécologique
Tumeur
de
la
thyroïde
des centres hospitaliers aquitains (14 %)
d’autres plateformes, notamment pour les sarcomes (11 %)
Cas non interprétables = 6% du total
Analyses KRAS (colon) et EGFR (poumon) : dédommagement du désarchivage et de l’envoi pour les pathologistes
privés et ceux des DOM-TOM de 29 € par cas 34 626 € en 2010
Analyses
Délai médian de l
’
analyse
(entre la prescription et les résultats de l
’
analyse ) = 15 jours (étendue : 7 à 78 j)
La PGMC est également impliquée dans la formation en organisant le module 3 du DIU de Pathologie Moléculaire
http://www.canceraquitaine.org
Délai médian de désarchivage du matériel = 4 j (étendue : 0 à 8 j)
Délai médian d’acheminement = 2 j (étendue : 1 à 5 j)
Délai médian d’analyse moléculaire = 9 j (étendue : 7 à 11 j)
Analyses
KRAS 2009
Article en soumission
Délai
médian
de
l analyse
(entre
la
prescription
et
les
résultats
de
lanalyse
)
=
15
jours
(étendue
:
7
à
78
j)
importance des étapes
pré-analytiques