La plateforme de génétique moléculaire des cancers d`Aquitaine

La plateforme de génétique moléculaire
des cancers d’Aquitaine
Lapeyrère N.1, Hostein I.2, Carrère N.3, Chibon F.2, Cappelen D.3, Dubus P.3, Coindre JM.2, Soubeyran I.2, Merlio JP.3
Réseau de Cancérologie d’Aquitaine, Bordeaux, 2 Département de pathologie, Institut Bergonié, Bordeaux, 3 Service de biologie des tumeurs, Hôpital du Haut
Levêque, CHU de Bordeaux
1
Action 21.2 de la Mesure 21 plan Cancer 2009-2013
soutenir 28 plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers (PGMC)
permettre l'accès aux tests moléculaires pour le diagnostic
permettre la prescription de traitements ciblés ou le suivi de des cancers et de leur traitement
PGMC d’Aquitaine regroupe 2 plateaux
• au CHU de Bordeaux : service de Biologie des Tumeurs (Pr Merlio), d’Hématologie Biologique (Pr Mahon) et de Pathologie (Pr A Vital)
• à l’Institut Bergonié : unité de Pathologie Moléculaire (Dr I Soubeyran), du département de Pathologie (Dr Mac Grogan) et le service
d’Hématologie
é
(Dr Durrieu)
Pathologiste
PGMC
Envoi d’un bloc + lame colorée + fiche de prescription
Inscrites à la
nomenclature
ou bénéficiant
d’un
d
u
financement
INCa
Analyses moléculaires sur :
• tumeurs solides (cancer du poumon,
poumon cancer colorectal,
colorectal cancer du sein
sein, cancer de l’estomac
l estomac, cancer gynécologique
gynécologique,
cancer de la thyroïde, glioblastome, tumeur gastro-intestinale, sarcomes)
• tumeurs hématologiques (leucémies, lymphomes et syndromes lymphoprolifératifs, syndromes myélodysplasiques et
myéloprolifératifs)
Nombre de patients ayant bénéficié d’une analyse moléculaire réalisée à la PGMC Aquitaine en 2010, selon le type de tumeurs
993
Tumeur onco-hématologique
5605
26
Tumeur digestive
2150
686
834
Tumeur conjonctive
53
Tumeur pulmonaire
1333
549
Tumeur mammaire
24
FISH
BIO MOL
126
43
Mélanome
12
Tumeur cérébrale
128
Tumeur de la thyroïde
3
41
Tumeur gynécologique
20
15
Mastocytose
10
0
1000
2000
3000
4000
5000
6000
Demande d’examens par
Activité 2010
 les établissements internes à la PGMC (57 %)
 des établissements privés aquitains (18 %)
dont les DOM-TOM = 9 % des demandes d’EGFR et
14 % des demandes de KRAS
 des centres hospitaliers aquitains (14 %)
 d’autres plateformes, notamment pour les sarcomes (11 %)
Cas non interprétables = 6% du total
Analyses KRAS (colon) et EGFR (poumon) : dédommagement du désarchivage et de l’envoi pour les pathologistes
privés et ceux des DOM-TOM de 29 € par cas
34 626 € en 2010
Délai médian de ll’analyse
analyse (entre la prescription et les résultats de ll’analyse
analyse ) = 15 jours (étendue : 7 à 78 j)
Analyses
KRAS 2009
Article en soumission
 Délai médian de désarchivage du matériel = 4 j (étendue : 0 à 8 j)
 Délai médian d’acheminement = 2 j (étendue : 1 à 5 j)
 Délai médian d’analyse moléculaire = 9 j (étendue : 7 à 11 j)
importance des étapes
pré-analytiques
La PGMC est également impliquée dans la formation en organisant le module 3 du DIU de Pathologie Moléculaire
http://www.canceraquitaine.org