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L2 Pharmacie Bactériologie N°1
07/01/14 – Pr Giard
Groupe 37 : Doriane et Pauline
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BACTERIOLOGIE
Introduction
I- Histoire
1) Première observation des bactéries, fin 17ème siècle
2) L’âge d’or de la microbiologie (fin 19ème – début 20ème siècle)
3) La microbiologie aux 20ème et 21ème siècles
4) Microbiologie : micro-organisme (cellules observées aux MO)
bactéries ++
5) Développement de la biologie moléculaire
II- Les Micro-Organismes dans le monde vivant
1) Définition des bactéries
2) Classification d’A. Haeckel
3) Classification de Whittaker
4) Woese : classification actuelle
III- Systématique bactérienne
1) Nomenclature
2) Taxonomie bactérienne
a. Critères de taxonomie
b. définition
IV- Application des bactéries et réglementation

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Introduction
Le plus important à la fin est de ne surtout pas confondre une bactérie et un virus!
Il y a surtout 5 bactéries pathogènes : celles responsables des infections urinaires, des angines,
des sinusites, des otites et de l’acné.
La maladie infectieuse bactérienne la plus répandue au monde est la carie dentaire, le
brossage de dent est donc un traitement contre les bactéries. L'hygiène est quelque chose de
récurent dans la lutte contre les bactéries.
Aucune bactérie ne touche 100 % de la population, même dans les grandes épidémies. Ce qui
fait la pathogénicité c'est autant l'agent (la bactérie), que l'hôte. C'est en fait une conjonction
de plein de choses.
Si elles existent, les bactéries pathogènes sont marginales.
Exemples :
E.coli, seulement quelques sous-espèces vont être pathogènes.
Staphylococcus aureus, si on faisait un sondage, environ 30 % d'entre nous en posséderions
dans notre cloison nasale, sans être malade pour autant.
Mycobacterium tuberculosis ou BK, pathogène dans certains cas.
3 outils pour lutter : l'hygiène, les antibiotiques et les vaccins.
I- Histoire :
1) Premières observations des bactéries, fin 17ème siècle
A. Van Leeuwenhoeck : il est à l'origine du 1er microscope. Il va voir des choses invisibles,
les « animalcules » (ce sont en fait des bactéries, mais il ne l’interprète pas comme ça).
2) L'âge d'or de la microbiologie (fin 19ème - début 20ème siècle)
L. Pasteur : père de la microbiologie
 Mise en évidence de la fermentation bactérienne. Il découvre comment on fait du vinaigre
(il s'agit d'une bactérie qui transforme l'alcool en acétate).
 Mise au point de la technique de pasteurisation, moyen de se débarrasser des micro-
organismes.
 Travaux sur le bacille du charbon, le virus de la rage (virus qu'il ne verra jamais puisqu'il
faut attendre la microscopie électronique. A cette époque on ne sait pas encore ce qu'est
un virus), le ver à soie...
 Réfute la théorie de la génération spontanée, notamment grâce à l'expérience du ballon
col de cygne, expérience majeure de Pasteur qui montre que l'air est contaminé. Il s'agit
d'un ballon de culture, avec un col de cygne. L'expérience consiste à le faire bouillir, ainsi
le milieu est tout à fait clair. Si on ouvre le ballon, puis le referme, celui-ci se trouble, car
le milieu est contaminé par les micro-organismes de l'air. Mais si on ouvre à l'extrémité du
col de cygne, le ballon ne se contamine pas. Ce qui montre bien que les bactéries sont

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dans l'air (car elles ne vont pas parcourir tout le col pour atteindre le ballon), ce n'est donc
pas spontané. De plus il les quantifie : l'air à 3000m est beaucoup plus stérile que l'air en
bas, car le ballon se trouble moins.
=> Pourquoi ne s'est-il rien passé entre ces deux périodes (entre Pasteur et Koch) ?
Principalement à cause de la religion. À cette époque on a du mal à appréhender ce qu'on ne
voit pas, on pense qu'il y a une génération spontanée. Il a fallu une révolution intellectuelle
pour réfuter cette théorie.
R.Koch
 Postulat : à partir d'études sur le charbon, « un organisme spécifique cause la maladie
spécifique ». Définit le terme de bactérie pathogène.
 Technique de culture des bactéries sur milieu solide en boîte de « Petri ».
 Travaux sur le bacille de Koch (BK) qui est le bacille de la Tuberculose. Mycobaterium
tuberculosis : bactérie qui infecte. Le vaccin est une autre sorte de mycobactérie.
 BCG (Bacille de Calmette et de Guérin)
 Il est le pionnier de la microbiologie médicale. Il obtiendra un prix Nobel (contrairement à
Pasteur).
3) La microbiologie au 20ème et 21ème siècle
On va commencer à voir vraiment les bactéries.
Les micro-organismes sont étudiés en microscopie électronique, par la biologie moléculaire
dont le développement révolutionne la microbiologie.
Un événement particulier marque le début de cette période : la découverte de la pénicilline,
premier antibiotique trouvé par Fleming, qui sera utilisé par Ashley et Chain pendant la 2nde
Guerre Mondiale.
Dans les années 50, découverte de l'ADN en tant que molécule à double-hélice.
Dans les années 60-70, arrivée de la biologie moléculaire, qui étudie principalement la
molécule d'ADN. Les premiers à travailler sur la régulation des gènes sont Jacob et Monod
avec l'opéron lactose.

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Puis fin du 20ème début du 21ème il y a une révolution : la génomique, séquençage du génome
(génome humain en 2003 et E.coli dans les années 90).
Au 21ème siècle, on est dans la post-génomique. (La séquence totale d'un micro-organisme
coûte à peu près 500€). Maintenant que fait-on de ces données génétiques ?
4) Microbiologie : micro-organisme (Cellule observées en MO)
bactéries+++
 Diversité : bactéries, certains champignons microscopiques, virus.
 Rôle (planète, société humaine, plantes...).
 Micro-organismes influent sur toutes les formes de vie → microbiologie importante.
 Science biologique fondamentale :
Outils pour la compréhension des processus de la vie. Bons modèles de compréhension des
fonctionnements cellulaires (biochimie, génétique).
 Sciences appliquées :
Médecine, industrie alimentaire, biotechnologie (ATB, protéines humaines).
Comment conserver les aliments ?
Pour la viande : charcuterie, par la salaison, ce qui protège des agents pathogènes.
Le lait : Yaourt ou Fromage, qui sont au départ des moyens de conservation.
→ On utilise des bonnes bactéries pour protéger des mauvaises.
5) Développement de la biologie moléculaire
 Un grand nombre de génomes bactériens séquencés depuis 1995, 2009 > 500 (NCBI
genbank).
Séquençage : intérêt +++, par exemple :
- Comparer des souches entre elles = taxonomie,
- Améliorer les techniques de diagnostic (sensible++, rapide++), on connaît la séquence
d'une bactérie, on peut donc la détecter par hybridation, par des sondes PCR.
- Études de gènes pour différencier les bactéries pathogènes et non pathogènes en
comparant leur séquence (ex : « facteurs de pathogénicité »).
- Synthétiser des protéines antigéniques pour un vaccin, puisqu'on connaît ce que la
molécule est susceptible de posséder.
 Les bactéries et génie génétique +++
- Outils de recherche relativement simple. Par exemple, on fait fabriquer des hormones
de croissance ou de l'insuline humaine, ou de la vanilline dans le domaine alimentaire,
par des micro-organismes (MGM : micro-organismes génétiquement modifiés).
- Génétique bactérienne + biologie moléculaire => bactéries vecteurs de gènes OGM.
- Thérapie génique.

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II- Les Micro-organismes dans le monde vivant
1) Définition des bactéries:
Les bactéries sont :
-des micro-organismes unicellulaires, au sens physiologique du terme.
-des procaryotes, caractérisées par l’absence d’un « vrai » noyau (pro=avant ;
karyon=noyau). Elles contiennent quand même de l’ADN : présence d’un chromosome mais
absence de membrane nucléaire).
-capables de se multiplier dans l’environnement qui leur est propice (différence des virus).
-ont un métabolisme propre.
PROCARYOTE
EUCARYOTE
Taille
En général >1 et <10µm
>10 µm
Noyau
-membrane nucléaire
-ADN (nombre de
chromosomes)
NON
1 (+exceptions)
OUI
Plusieurs
Cytoplasme
-mitochondries
-réticulum endoplasmique
-appareil de Golgi
-ribosomes
Organisation simple
Non
Non
Non
Libérés dans le cytoplasme
Pas de cytosquelette
Organisation plus complexe
Oui
Oui
Oui
Liés à la membrane
Un cytosquelette
Membrane plasmique
Oui sans stérols
(Sauf mycoplasme)
Oui avec stérols
Site de la respiration
(chaîne respiratoire)
Membrane plasmique
 (Pour bactéries aérobies)
Mitochondries
Flagelles
Chez certaines espèces
Structure simple
Chez certaines espèces
Structure complexe
Paroi rigide
OUI avec peptidoglycane
(sauf
mycoplasmes sans paroi)
Quelquefois protéines
NON pour les cellules
animales
OUI pour les
peptidoglycanes (chez
végétaux, algues, mycètes
(cellulose, pectine ou chitine)
Reproduction
Par scissiparité
Par mitose
Différenciation
Rudimentaire
Tissus et organes
Il n’y a qu’une seule membrane chez les bactéries, qui est celle de l’extérieur. Chez un
procaryote, il n’y a pas de noyau mais il n’y a pas non plus tous les autres organites qui
contiennent une membrane (mitochondries, réticulum endoplasmique…).