Contrôle des phénotypes complexes par le microbiote

ED394 - www.ed394.upmc.fr
04/04/2016
Unité de recherche : Centre de Recherche des Cordeliers (Inserm UMRS1138)
Equipe de recherche : Influences environnementales et épigénétiques dans le diabète et l'obésité
Groupe d'Accueil de Doctorants : Influences environnementales et épigénétiques dans le diabète et l'obésité
Directeur de thèse porteur du projet : M. Gauguier Dominique ([email protected])
Co-encadrant(e) :
Nombre de doctorants accueillis dans l'équipe en 2015/2016 : 0
Nombre de doctorants encadrés par le porteur de projet / par le co-encadrant : 8 / 0
Unité : Centre de Recherche des Cordeliers
Équipe : Influences environnementales et épigénétiques dans le diabète et l'obésité
GAD : Influences environnementales et épigénétiques dans le diabète et l'obésité
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ED394 - www.ed394.upmc.fr
04/04/2016
Titre du sujet de thèse : Contrôle des phénotypes complexes par le microbiote intestinal et les métabolites
microbiens
Résumé du sujet :
Les maladies complexes, parmi lesquelles les maladies cardiovasculaires, inflammatoires, autoimmunes et
neurodégénératives tiennent une place centrale, trouvent leur cause dans des facteurs génétiques et des
influences environnementales (régime, activité physique). Des études récentes ont identifié des changements de la
structure du microbiote intestinal chez des patients atteints de diabète, d’obésité, de troubles comportementaux et
vasculaires et de maladies autoimmunues. Le microbiote intestinal est composé de milliards de bactéries qui
communiquent avec l’hôte dans un système symbiotique complexe. Il contribue à la maturation du système
immunitaire et transforme les nutriments en métabolites souvent essentiels (acides aminés branchés) absorbés par
l’organisme. Dans ce contexte, plusieurs études ont démontré l’association de métabolites d’origine bactérienne
avec des phénotypes caractéristiques de maladies complexes. L’objectif du projet est de déterminer le rôle
fonctionnel de métabolites transformés par les bactéries intestinales et identifiés par profilage métabiologique chez
l’Homme et dans des modèles expérimentaux. Ce projet appliquera des techniques in vivo chez l’animal pour
tester l’effet des métabolites candidats sur la régulation de l’équilibre glycémique et de la sécrétion d’insuline, de
la masse adipeuse, de marqueurs inflammatoires et de phénotypes comportementaux. Ces études seront couplées
à des analyses moléculaires (transcriptome par séquençage d’ARN) dans des tissus pertinents, et des tests in
vitro (par exemple transport du glucose, structures neuronales) sur lignées cellulaires (3T3, PC12) et cellules
primaires. Des analyses moléculaires viendront compléter ces études de manière à identifier les cibles (récepteurs,
kinases, etc…) de ces métabolites, médiatrices de leurs effets biologiques. Les résultats de ce projet fourniront les
éléments nécessaires à démontrer que ces composés métaboliques produits par la flore bactérienne intestinale
peuvent être considérés comme des biomarqueurs de maladies complexes, et avoir des applications dans des
projets pharmacologiques et cliniques.
Unité : Centre de Recherche des Cordeliers
Équipe : Influences environnementales et épigénétiques dans le diabète et l'obésité
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